| Definition | Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008312 |
| Length | 7,750,108 |
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The map label for this gene is 113475286
Identifier: 113475286
GI number: 113475286
Start: 2440188
End: 2441573
Strand: Reverse
Name: 113475286
Synonym: Tery_1595
Alternate gene names: NA
Gene position: 2441573-2440188 (Counterclockwise)
Preceding gene: 113475289
Following gene: 113475283
Centisome position: 31.5
GC content: 31.82
Gene sequence:
>1386_bases ATGATTACAGAAAAGTTTCGTCACCAACTCCGCCAAGAAGTTAAATTATGGCAAACAGAAGGATTAATTGATAATTATCT CTATGAACAATTATCAGAGCGTTATCAATTTGATTATTTAGAAAAAACTGCTAGCTCTCGTTTTATTACGATCCTTATTT CTCTGGGTGCTATTCTCCTGGGATTAGGTATGATAACTTTTGTTTCTGCTAACTGGCAAGAATGGTCAAGGGAATTAAAA ATAGTTATTTTGTTAACTTTATTTATTGGAGTTAATACGACTGGTTTTTATTTATGGCGACAGCCAAATACTCTGGCAAA TACTAGCAATAAAAAACAAAGATTAGGTCACGGACTCTTAATATTTGGAGCCTTAATTTTAGGGGCAAATATAACACTAA TGGCTCAAATGTTTCATATTGGCGACTCTCCCTACGGATTATATATTGTTTGGGGATTAGGAGTTTTGGTAATGGCTTAT AGTTTACAACTAGCTTCTCTTGGAGTTATTGCTATTTTATTGATGGGATTAGGCTATTTAATAGGGTTATCAAGTTTATT TTACCCGGGAGAAGTTTCCTGGTTACAGTTGATAATAGAATATATGTCTTTGGTGGGGGTATTGTTGTTTATTCCCCTAG CTTACTGGTGCAATTCTCGAGTAATTTTCTTTGTAGCTACATTGATAATATTACTAGCTTTAGAAATTAGTCTGTTCCGA GTTTTTAATTTATCAAATAATGGTGTTTGGGGAGCGATCGCTTTAACTTTACCTCCTGCTTTATTGTGGGGATATGATGA TATTGTCTGGCATAAAGTAGATAGCAGAATTTTTCAATCTCTAGCAAAAAATTTAGCTATTTGGTATTTAAGTATTGGAT TTTTTTGTTTATCTTATCAAATATTTTGGCAGGATTTTTTATTAGAAAATTTTTATGGTACATCATCAAAAATTCAATGG TTCACTTTAGTTGAAGTTTTATTTTTTGTGGGATTAACTATCTGGGAATGGTTGTTTTTAGCAAGGCAAAATAAAAGAGA TGTTCAGAGTTGGCGATTAGATTCTGTGAGTGGTATGGTTTTGGGTTTTATTGTTGTAACAGCCATATTATGTTTCTGGC ATTTGAGTATTAATAAAATTTCAGAAATAGCTACTTTGATCATAAATATAGAAATGTTTATTTTGGCAACAGGTTTAATT AGGATTGGATTAGTACAAGGAATTAAAAGTACTTTTTGGGGTGGTTTGATATTGTTGACTTTACAAATTGTTAGTCGTAC TTTTGAGTATAATACTGGATTATTATTAAAGTCTTTAGTGTTTATTTTATGTGGTTTAGGAGTTATAGCTGCTGGTTTGT GGTATGAACGTCTTGTCAAAAAGTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TTTTAAGCGATTTTTTTTAAGAAAAACTGAAGTTTTTGTTATCAAAAAAACTTATAATTTATAACTTGGTTCAGATTTTA TAATTTATTTTTTCAATACA
Downstream 100 bases:
>100_bases TTGATAGCAATGATGTGTCAAGCAGATCTGAATCTTTCTTACAACGATGCCCTGCACGATAATTTGTGATGCATGTATCG GGAGGATGTGAAATCATTTA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 461; Mature: 461
Protein sequence:
>461_residues MITEKFRHQLRQEVKLWQTEGLIDNYLYEQLSERYQFDYLEKTASSRFITILISLGAILLGLGMITFVSANWQEWSRELK IVILLTLFIGVNTTGFYLWRQPNTLANTSNKKQRLGHGLLIFGALILGANITLMAQMFHIGDSPYGLYIVWGLGVLVMAY SLQLASLGVIAILLMGLGYLIGLSSLFYPGEVSWLQLIIEYMSLVGVLLFIPLAYWCNSRVIFFVATLIILLALEISLFR VFNLSNNGVWGAIALTLPPALLWGYDDIVWHKVDSRIFQSLAKNLAIWYLSIGFFCLSYQIFWQDFLLENFYGTSSKIQW FTLVEVLFFVGLTIWEWLFLARQNKRDVQSWRLDSVSGMVLGFIVVTAILCFWHLSINKISEIATLIINIEMFILATGLI RIGLVQGIKSTFWGGLILLTLQIVSRTFEYNTGLLLKSLVFILCGLGVIAAGLWYERLVKK
Sequences:
>Translated_461_residues MITEKFRHQLRQEVKLWQTEGLIDNYLYEQLSERYQFDYLEKTASSRFITILISLGAILLGLGMITFVSANWQEWSRELK IVILLTLFIGVNTTGFYLWRQPNTLANTSNKKQRLGHGLLIFGALILGANITLMAQMFHIGDSPYGLYIVWGLGVLVMAY SLQLASLGVIAILLMGLGYLIGLSSLFYPGEVSWLQLIIEYMSLVGVLLFIPLAYWCNSRVIFFVATLIILLALEISLFR VFNLSNNGVWGAIALTLPPALLWGYDDIVWHKVDSRIFQSLAKNLAIWYLSIGFFCLSYQIFWQDFLLENFYGTSSKIQW FTLVEVLFFVGLTIWEWLFLARQNKRDVQSWRLDSVSGMVLGFIVVTAILCFWHLSINKISEIATLIINIEMFILATGLI RIGLVQGIKSTFWGGLILLTLQIVSRTFEYNTGLLLKSLVFILCGLGVIAAGLWYERLVKK >Mature_461_residues MITEKFRHQLRQEVKLWQTEGLIDNYLYEQLSERYQFDYLEKTASSRFITILISLGAILLGLGMITFVSANWQEWSRELK IVILLTLFIGVNTTGFYLWRQPNTLANTSNKKQRLGHGLLIFGALILGANITLMAQMFHIGDSPYGLYIVWGLGVLVMAY SLQLASLGVIAILLMGLGYLIGLSSLFYPGEVSWLQLIIEYMSLVGVLLFIPLAYWCNSRVIFFVATLIILLALEISLFR VFNLSNNGVWGAIALTLPPALLWGYDDIVWHKVDSRIFQSLAKNLAIWYLSIGFFCLSYQIFWQDFLLENFYGTSSKIQW FTLVEVLFFVGLTIWEWLFLARQNKRDVQSWRLDSVSGMVLGFIVVTAILCFWHLSINKISEIATLIINIEMFILATGLI RIGLVQGIKSTFWGGLILLTLQIVSRTFEYNTGLLLKSLVFILCGLGVIAAGLWYERLVKK
Specific function: Unknown
COG id: COG4872
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 52566; Mature: 52566
Theoretical pI: Translated: 8.75; Mature: 8.75
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.9 %Cys (Translated Protein) 2.0 %Met (Translated Protein) 2.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.9 %Cys (Mature Protein) 2.0 %Met (Mature Protein) 2.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MITEKFRHQLRQEVKLWQTEGLIDNYLYEQLSERYQFDYLEKTASSRFITILISLGAILL CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH GLGMITFVSANWQEWSRELKIVILLTLFIGVNTTGFYLWRQPNTLANTSNKKQRLGHGLL HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHCCHHH IFGALILGANITLMAQMFHIGDSPYGLYIVWGLGVLVMAYSLQLASLGVIAILLMGLGYL HHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IGLSSLFYPGEVSWLQLIIEYMSLVGVLLFIPLAYWCNSRVIFFVATLIILLALEISLFR HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VFNLSNNGVWGAIALTLPPALLWGYDDIVWHKVDSRIFQSLAKNLAIWYLSIGFFCLSYQ HEECCCCCCEEEEHHHHCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IFWQDFLLENFYGTSSKIQWFTLVEVLFFVGLTIWEWLFLARQNKRDVQSWRLDSVSGMV HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH LGFIVVTAILCFWHLSINKISEIATLIINIEMFILATGLIRIGLVQGIKSTFWGGLILLT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LQIVSRTFEYNTGLLLKSLVFILCGLGVIAAGLWYERLVKK HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MITEKFRHQLRQEVKLWQTEGLIDNYLYEQLSERYQFDYLEKTASSRFITILISLGAILL CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH GLGMITFVSANWQEWSRELKIVILLTLFIGVNTTGFYLWRQPNTLANTSNKKQRLGHGLL HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHCCHHH IFGALILGANITLMAQMFHIGDSPYGLYIVWGLGVLVMAYSLQLASLGVIAILLMGLGYL HHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IGLSSLFYPGEVSWLQLIIEYMSLVGVLLFIPLAYWCNSRVIFFVATLIILLALEISLFR HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VFNLSNNGVWGAIALTLPPALLWGYDDIVWHKVDSRIFQSLAKNLAIWYLSIGFFCLSYQ HEECCCCCCEEEEHHHHCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IFWQDFLLENFYGTSSKIQWFTLVEVLFFVGLTIWEWLFLARQNKRDVQSWRLDSVSGMV HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH LGFIVVTAILCFWHLSINKISEIATLIINIEMFILATGLIRIGLVQGIKSTFWGGLILLT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LQIVSRTFEYNTGLLLKSLVFILCGLGVIAAGLWYERLVKK HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA