| Definition | Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008312 |
| Length | 7,750,108 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is wcaA [C]
Identifier: 113475084
GI number: 113475084
Start: 2081009
End: 2086984
Strand: Reverse
Name: wcaA [C]
Synonym: Tery_1360
Alternate gene names: 113475084
Gene position: 2086984-2081009 (Counterclockwise)
Preceding gene: 113475085
Following gene: 113475083
Centisome position: 26.93
GC content: 34.02
Gene sequence:
>5976_bases ATGAAAACAACAGCTTTGATTATTGCCGGAATGCACCGTTCAGGAACCTCCTTAACTGCTTCTTTATTTCAAAGTTTAGG AGTGAATATAGGAGAAAAATTACTCGGTCCTGAATTGGGAAATATTAGAGGGCATTTTGAAGATATTGAGTTTGTAGAAC TCCATAAAAAAATATTGCGGTCGCAACATATAGATGACCTCGGTAGTAACTTAGAAACTCAAGAAATTGTAGTCAAGAAG CCAAACTTAAAAATAGCAAGAAAACTTATAAAAAATCGTCAAGAAGAAAATGAAAAATCTCACAAAATATGGGGATGGAA AGACCCTAGGACTACATTATTTTTAAACTTTTGGTTAAAGTTATTGCCCGATGCTAAATTTATTTTTGTTTATCGTTCTC CTTGGGAAGTAGTAGACTCTCTTTATCGACGAAGTACAGATAAAAAGTTATTGGATCAACCAGAAATAGCTGTAAAAATG TGGTTGAATTACAATCAGAGAATATTAGACTTTTATCAACAATGTTCAGCAAAATGTTTAATAGGTAAAGTTGATATTAT TGGTAGAGATCCTGAAAGCTTTATCCAGGCAGTTAACGAAAAATTTGAAATGAATTTACCAGCACCTTCTCCTGAGATTT TTGCTGAATCATTATTGGTGAAAGACATTAGCCAAACCAATAAACCTAGTCTCATAGAAAAATATTTTCCAGAAACATTA GAAACTTATCAGCAACTAGAAAAAAATGGCATAGGTGGAGATTTAGAGGTCAACATCCAAGAGTCGAAGGTTAAAAGTGA ATCAGAATTATGGGAGTTTAGGGATTGGTTCAATATTCGATGTTTAGAAAAACAAGTTAGTAGTTTAGAAACAGATGTAG AAAAATGGCAAAAAATATTTAAAGAAGCACAAAAAAAGGTAGGAAAATTAGAATCCGAATTAGGTGAAACTCAGCAACAA ATTAATATTAGGTCAGTTAAGCTCGAAGAGTCTAGTAAAAAGATAGAATTACTAGAAATAGAATTAGGTAAAACTCAAGT TCAACTCGAAGGTAAAGTAAAAAATTTACAAGCATCTCAAACTAAAGTAGTCACATTAGAAAGAACACTAGGGCAGACTC AATCTCAACTGGAAAATAATCAAACAAAATTACAAGAGTCTCAACAGAAAATTATTAGATTAGAAGTAGACTTAGGGCAA ACTCAGACACAATTTAATAACTCAAAAACTAGGTTTAAAGAAGCTTTAGTCAAAATATTTAGTTTAGAAACAGAATTAGG AAAAACTCAAGTTCAACTAGAAGGTACTCAGATTAAATTTACTGAATCTCAGAAAAAATTATTAGGAGTAGAAACTGACT TTGGGCAAAGTCAAATGAAACTTGAGAGAAATCAAATTAAGTTAGGAGAGTCTCAGGAAAAAATTGGAATATTAGAAACT AAGTTAGGTCAGACTACACTACGACTTAATGGCAATATTCTGAAATTACAAGAGTCTCAAACTAAAATTCAACTGTTAGA AACAGAATTTGGAGAAGCTCAAAGATTACTCGATGGTACTCAGATAAAATTATTAGAATCTCAAAATAAAATTCAATTCC TAGAAACAGAATTCGGAGAAGCTCAAAGATTACTCGATGGTACTCAGGTAAAATTATTAGAATCTCAAAATAAAATTCAA TTCCTGGAAACAGAATTAGGGCAAACTCAAGGAGTATTGGGACAAACTCAAGCCACTCTCCAAGAAACTCAAGCTACTCT CCAAGAAACTCAAACCACTCTCCAAGAAACTCAAACCACTCTCCAAGAAACTCAAACCACTCTCCAAGAAACTCAAACCA CTCTCCAAGAAACTCAAGCCACTCTCCAACAAACTCAAGCTCAATTAGATGCTCAACACTACGAAACAGAAATGCTTAGG GCAGAAATTTCTGGGATGAAATCTTCCAAATTCTGGAAACTACGAGAAAAGTGGTTTAGTTTGAAAGGAAAACTAAAAAA GAAACTGAAAAATTTACGAGGGCGCTTCATTTTTTCTATCGACTCCCCTATTAATTGGAAAATTTCCAACTCCCAAATAG AAATAGTAGGTTGGTGTTTCCACAATAGTATTCTCAAGATCCAAAATATTCGTGCCAGAGTAGGAACCGAAGTTTTTTTT GGTAAGTATGGTATCCCACGACCAGATGTTGCCCAACAATATAATGATATTTCTACTGCTCAAAATTCTGGCTTTCAAAT ATCTGTACAACTTTCCCCAGGAAATTACCAATTAATACTTGAAGTAGAAGAAAAGAAAGGAAAGTGGCATGAATTGGTAA CCTACCCCATATCAATATCTACCGTCGAAGCAAATTTTGATGCTCCCACAAACTGGCAACAAAGGGAGGGAGTAATTTTA TTTGCTGGTTGGTGTTGCCATCGAGAAGAGAAAATTACCAAATTAGTTCTTAAATATGGGGATATTTCTGTAGACTGCGC TTATGGTTTGCGTCGGAAAGATGTAGAGGAAATTTTCCCAAATTGGGTAGGAAGTGGCCATAGTGGCTTTGAAGTAACCG TTGAACTTCCACCCGGAAAATGGCAAGTTAGTTTAGAAGCATATTTGGAAAGTGGGGAAATAGTTGGTTTTCCTTGCTCA GAAGTTTTGCAACTAAAACGTTATGGTTTTTGGGAAAAAGCTAAAGATAAATTTCGGCAATTATCCAAATTTACTCAAGC TATTCAAAAACGAATTTCCGAAAGAAAACAAAGATTAGGTCGCATCATCCCCCTACCTTCAGAATTACCTAGTATTGCCC GACAAATATTAGCAATATATAGACAGCAGCAAAAACAAGGGGGAGATTTATTGCTTCCCCCTGGGTTTGTCCTACCAGAA ACTGTAGATGTTTATGATGCTTGGTTGGCAGTAAATAACTGGGGCGATCGCTCCCGTCAATATTTAATATCCCGTTTAGA AAGTTGTCGGACTCCTTTGCCAAAAATTTCTGTGGTTATGCCAGTTTATGATCCTCCTCTAAAATTTTTGCATCAGGGAA TATCCAGTGTACTAAATCAAGTATACCAAAATTGGGAATTTTGTATAGCCGATGATTGTAGTAGTAATCCGAAAATTCGG GAAATTCTGACAGAAAGAGCTAAGACTGATTCCCGTATTAAACTTACATTCCGCTCTGAAAATGGCAATATTAGTGCTGC GACTAATTCCGCCGCCGAATTGGCCACGGGAGATTTTCTTCTCTTTTTGGATAATGATGATGAACTTACTCCGGATGCTT TGGGGGAAGTTGCTTTATATATAAGTCAAAATTCAGAGATAGATTTTCTTTATTCCGATGACGATAAAATTAGTACGGAA GGCAAAAGATTCGACCCTCAATTTAAACCAGAATATTCTCCAGAATTATTACTTTCCTATATGTATATAGGTCATTTGTG TGTAGTGAGAAAAGAAATTTTCGACAAAATAGGAGGATTTAGAATTGGTTTTGAAGGTTCTCAAGATTATGATTTTGCTT TAAGAGCAACAGAAATTTCTCGTCAAGTCGGACATTTACCTTTAGTGTTATATCATTGGCGAACAACTCCAGGTTCGACT GCTATTTCTGGAGGGGAAAAACCGAAAAGTTTTCTAGCAGGTCAAAAAGCACTTCAAGAAAGTTTAATTCGTCGAGGTGT GGCAGGAAATATTTATCAACCAGACTGGGCAGTGCGGGAAAAGTTAGGAATTTTTAAACCAACTTTTCCCGATCAAGGTG ACTCAGTAACTATTATTATTCCAACGAAAAATCAGGTTAAGTTATTGAAAGCTTGTGTGGAGTCTTTGAGAAAGACAACC TATCAGAATTATCAAATTTTTGTGATTGATAATGAAAGTGATGAACCTGAAACTTTAGAATATTTGGCAGGTTTAAAATG TTTGTATTCTGGGGAAGATAATATATTAGTTTTTCCGATGAAAAATACTGATGGAAAATTTAATTTTGCTGCTATAAACA ACCGCGCTGTCGAACAGGTAAAAACTGAGTATATTCTATTTCTAAATAATGACACAGAAATTATTTCTCCCTACTGGTTA AGTCAAATGATGGGATATGCAAAAATTCCTGGAGTCGGTGCGGTGGGTGCTAAGTTGATTTATCCGGATAAAAGAATTCA ACATGCTGGTGTAATTCATGGTTTACACCATGGTTTAGCAGGTCATGCTTTTAAATTATTACATAGTGAAAATAGGGGTT ATCTTTCCCAAGCGTTTGTTTCAAAAAATTATTCGGCAGTAACCGCAGCTTGTATGTTAACTCCCCGAAAATTATTTTTA GAATTAGGTGGTTTTGATGAGGAAAATTTTGCTGTTGCTTATAATGATGCTGACTATGGTTATCGACTTTTAAAAAGTGG TTATCGTTCGGTTTATTGTGCAGATGCTGAATTAATTCATAAGGAAGGAACGAGTCGGGGTTATTCTGATAATCCTCAAG AAGAGGCAAATTATCGTAGGAAATATTCTCAGATGATAGATGGGTTTTATAGTCCTCATTTGTCTCTAGAAAGTGATTGT TTTCAAATTCAACCGAGAAGATATTTTATTAGAAATTTAGAAGTCAGAAGTCAAAAGCCAGAAGTTTTTATGAATTCAGG TAGTTCTAAGAAAGAGCCGGAAATAAATACTCAAGTAAAAGTCGATAAATCTGATAAAGAGTCAGAAATAAATAATCAGA CATTAGAGAAAAATTATCCAAATGAATCAGAAATAAATAATCAGATTAGTTATAGTACAGAAAACTTCTATACTTCTCAA AAAGAAGCTTTTCCCAGAATTAAAATATTGATGTGTAGTAATTCTTTAGACCTAACTGGTGCCCCACTTCATCAATTAGA AATAGCTCTAAAGTTAGCAAAAGATGGAATTGTTGAACCAATAATATTTTCCGTAAATGATGGGGAGTTAAGAGAAATTT ATCAACAACAAAATATTCAAGTTATTGTTAAAGATAATCCTCTAGAACATATTTACGAAAGACATGCTTATGATACAGCT TTAACTACTTTTGCTCAAGAAATAAAATCTCTAAATATTGATGTGATGTATATCAATACTTTAGAAAATTTTTTTATGGT AGATGTGGCTCAAATGTTAAATATTCCCAGTGTCTGGAATGTGCATGAAAGTGAACCTTGGCAAACTTATTTTAATCGTT TTGGAAATGAGATAGCTGCCAGAGCATTAGAATGTTTCCGTTATCCTTATCGCATAATTTTTGTTTCTGATGCTACTCGA AATAGGTATCTTCCTTTAAATAGTCATCACAATTTTACAGTCATTCATAATGGACTAGATTTAGAATTATTAAAAAAAGC CAGCGCTAAATGGTCTAGACAAGAAGCAAGGTCAGTTTTAGGAGTAAAAGAAGATGAAATAGTTATTCTATTATTAGGTA CTGTCTGTGAAAGGAAAGGTCAACATGACTTAATAAGAGCCCTATCATTTATGCCAGAAGAAGAAAGACAAAAAATTAAA TGTTTTCTAGTAGGTGATCGCCCCAACCTTTACAGCTTAAAATTACACGAGCTTGTCAAAAACTTACCAGAAGAAATTCA ACAAAGAGTAGAAATAGTAGGAGAAACTCCAGAAACAGCAAAATATTATCAAGCAGCAGATATATTTGTTTGTACTTCTC GCATAGAAAGTTTCCCCAGAGTAATATTAGAAGCAATGTCTTATAGTTTACCTATAGTTACTACTCCAGTTTTTGGCATA GTTGAACAAGTCAAGCCAAATATTAACGGTTTATTCTATACTCCTGAAAACCCAGAAGAATTAGCAAATGTTTTGACGTC TTTATTGATAGATGAAGAGTTACGTCATAAATTTGCTACTAATGCTAAATATGTATTGGAGTCATTAAATAACTTTGCAG AAATGACTGAAACTTACGGTCAAATATTCCAAGAAGCTTACTTTTGTAGAGTGTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases AAAACTGTAATTACTGATAGAATCACTTTACCACCAGAACAAGAAGTATTAGTATCTTGGAATTTTGCAAACTTTGCTTA ATATTAAGGAGGAAAATTAG
Downstream 100 bases:
>100_bases AAGTTATCTAAAGTCAGGACTTATGCAATGGTAATATATATAGATTTCAAAAGCTATAACGTTATATTTTAAAAGCTATA TGTATGGTTTATGCGTAACT
Product: group 1 glycosyl transferase
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1991; Mature: 1991
Protein sequence:
>1991_residues MKTTALIIAGMHRSGTSLTASLFQSLGVNIGEKLLGPELGNIRGHFEDIEFVELHKKILRSQHIDDLGSNLETQEIVVKK PNLKIARKLIKNRQEENEKSHKIWGWKDPRTTLFLNFWLKLLPDAKFIFVYRSPWEVVDSLYRRSTDKKLLDQPEIAVKM WLNYNQRILDFYQQCSAKCLIGKVDIIGRDPESFIQAVNEKFEMNLPAPSPEIFAESLLVKDISQTNKPSLIEKYFPETL ETYQQLEKNGIGGDLEVNIQESKVKSESELWEFRDWFNIRCLEKQVSSLETDVEKWQKIFKEAQKKVGKLESELGETQQQ INIRSVKLEESSKKIELLEIELGKTQVQLEGKVKNLQASQTKVVTLERTLGQTQSQLENNQTKLQESQQKIIRLEVDLGQ TQTQFNNSKTRFKEALVKIFSLETELGKTQVQLEGTQIKFTESQKKLLGVETDFGQSQMKLERNQIKLGESQEKIGILET KLGQTTLRLNGNILKLQESQTKIQLLETEFGEAQRLLDGTQIKLLESQNKIQFLETEFGEAQRLLDGTQVKLLESQNKIQ FLETELGQTQGVLGQTQATLQETQATLQETQTTLQETQTTLQETQTTLQETQTTLQETQATLQQTQAQLDAQHYETEMLR AEISGMKSSKFWKLREKWFSLKGKLKKKLKNLRGRFIFSIDSPINWKISNSQIEIVGWCFHNSILKIQNIRARVGTEVFF GKYGIPRPDVAQQYNDISTAQNSGFQISVQLSPGNYQLILEVEEKKGKWHELVTYPISISTVEANFDAPTNWQQREGVIL FAGWCCHREEKITKLVLKYGDISVDCAYGLRRKDVEEIFPNWVGSGHSGFEVTVELPPGKWQVSLEAYLESGEIVGFPCS EVLQLKRYGFWEKAKDKFRQLSKFTQAIQKRISERKQRLGRIIPLPSELPSIARQILAIYRQQQKQGGDLLLPPGFVLPE TVDVYDAWLAVNNWGDRSRQYLISRLESCRTPLPKISVVMPVYDPPLKFLHQGISSVLNQVYQNWEFCIADDCSSNPKIR EILTERAKTDSRIKLTFRSENGNISAATNSAAELATGDFLLFLDNDDELTPDALGEVALYISQNSEIDFLYSDDDKISTE GKRFDPQFKPEYSPELLLSYMYIGHLCVVRKEIFDKIGGFRIGFEGSQDYDFALRATEISRQVGHLPLVLYHWRTTPGST AISGGEKPKSFLAGQKALQESLIRRGVAGNIYQPDWAVREKLGIFKPTFPDQGDSVTIIIPTKNQVKLLKACVESLRKTT YQNYQIFVIDNESDEPETLEYLAGLKCLYSGEDNILVFPMKNTDGKFNFAAINNRAVEQVKTEYILFLNNDTEIISPYWL SQMMGYAKIPGVGAVGAKLIYPDKRIQHAGVIHGLHHGLAGHAFKLLHSENRGYLSQAFVSKNYSAVTAACMLTPRKLFL ELGGFDEENFAVAYNDADYGYRLLKSGYRSVYCADAELIHKEGTSRGYSDNPQEEANYRRKYSQMIDGFYSPHLSLESDC FQIQPRRYFIRNLEVRSQKPEVFMNSGSSKKEPEINTQVKVDKSDKESEINNQTLEKNYPNESEINNQISYSTENFYTSQ KEAFPRIKILMCSNSLDLTGAPLHQLEIALKLAKDGIVEPIIFSVNDGELREIYQQQNIQVIVKDNPLEHIYERHAYDTA LTTFAQEIKSLNIDVMYINTLENFFMVDVAQMLNIPSVWNVHESEPWQTYFNRFGNEIAARALECFRYPYRIIFVSDATR NRYLPLNSHHNFTVIHNGLDLELLKKASAKWSRQEARSVLGVKEDEIVILLLGTVCERKGQHDLIRALSFMPEEERQKIK CFLVGDRPNLYSLKLHELVKNLPEEIQQRVEIVGETPETAKYYQAADIFVCTSRIESFPRVILEAMSYSLPIVTTPVFGI VEQVKPNINGLFYTPENPEELANVLTSLLIDEELRHKFATNAKYVLESLNNFAEMTETYGQIFQEAYFCRV
Sequences:
>Translated_1991_residues MKTTALIIAGMHRSGTSLTASLFQSLGVNIGEKLLGPELGNIRGHFEDIEFVELHKKILRSQHIDDLGSNLETQEIVVKK PNLKIARKLIKNRQEENEKSHKIWGWKDPRTTLFLNFWLKLLPDAKFIFVYRSPWEVVDSLYRRSTDKKLLDQPEIAVKM WLNYNQRILDFYQQCSAKCLIGKVDIIGRDPESFIQAVNEKFEMNLPAPSPEIFAESLLVKDISQTNKPSLIEKYFPETL ETYQQLEKNGIGGDLEVNIQESKVKSESELWEFRDWFNIRCLEKQVSSLETDVEKWQKIFKEAQKKVGKLESELGETQQQ INIRSVKLEESSKKIELLEIELGKTQVQLEGKVKNLQASQTKVVTLERTLGQTQSQLENNQTKLQESQQKIIRLEVDLGQ TQTQFNNSKTRFKEALVKIFSLETELGKTQVQLEGTQIKFTESQKKLLGVETDFGQSQMKLERNQIKLGESQEKIGILET KLGQTTLRLNGNILKLQESQTKIQLLETEFGEAQRLLDGTQIKLLESQNKIQFLETEFGEAQRLLDGTQVKLLESQNKIQ FLETELGQTQGVLGQTQATLQETQATLQETQTTLQETQTTLQETQTTLQETQTTLQETQATLQQTQAQLDAQHYETEMLR AEISGMKSSKFWKLREKWFSLKGKLKKKLKNLRGRFIFSIDSPINWKISNSQIEIVGWCFHNSILKIQNIRARVGTEVFF GKYGIPRPDVAQQYNDISTAQNSGFQISVQLSPGNYQLILEVEEKKGKWHELVTYPISISTVEANFDAPTNWQQREGVIL FAGWCCHREEKITKLVLKYGDISVDCAYGLRRKDVEEIFPNWVGSGHSGFEVTVELPPGKWQVSLEAYLESGEIVGFPCS EVLQLKRYGFWEKAKDKFRQLSKFTQAIQKRISERKQRLGRIIPLPSELPSIARQILAIYRQQQKQGGDLLLPPGFVLPE TVDVYDAWLAVNNWGDRSRQYLISRLESCRTPLPKISVVMPVYDPPLKFLHQGISSVLNQVYQNWEFCIADDCSSNPKIR EILTERAKTDSRIKLTFRSENGNISAATNSAAELATGDFLLFLDNDDELTPDALGEVALYISQNSEIDFLYSDDDKISTE GKRFDPQFKPEYSPELLLSYMYIGHLCVVRKEIFDKIGGFRIGFEGSQDYDFALRATEISRQVGHLPLVLYHWRTTPGST AISGGEKPKSFLAGQKALQESLIRRGVAGNIYQPDWAVREKLGIFKPTFPDQGDSVTIIIPTKNQVKLLKACVESLRKTT YQNYQIFVIDNESDEPETLEYLAGLKCLYSGEDNILVFPMKNTDGKFNFAAINNRAVEQVKTEYILFLNNDTEIISPYWL SQMMGYAKIPGVGAVGAKLIYPDKRIQHAGVIHGLHHGLAGHAFKLLHSENRGYLSQAFVSKNYSAVTAACMLTPRKLFL ELGGFDEENFAVAYNDADYGYRLLKSGYRSVYCADAELIHKEGTSRGYSDNPQEEANYRRKYSQMIDGFYSPHLSLESDC FQIQPRRYFIRNLEVRSQKPEVFMNSGSSKKEPEINTQVKVDKSDKESEINNQTLEKNYPNESEINNQISYSTENFYTSQ KEAFPRIKILMCSNSLDLTGAPLHQLEIALKLAKDGIVEPIIFSVNDGELREIYQQQNIQVIVKDNPLEHIYERHAYDTA LTTFAQEIKSLNIDVMYINTLENFFMVDVAQMLNIPSVWNVHESEPWQTYFNRFGNEIAARALECFRYPYRIIFVSDATR NRYLPLNSHHNFTVIHNGLDLELLKKASAKWSRQEARSVLGVKEDEIVILLLGTVCERKGQHDLIRALSFMPEEERQKIK CFLVGDRPNLYSLKLHELVKNLPEEIQQRVEIVGETPETAKYYQAADIFVCTSRIESFPRVILEAMSYSLPIVTTPVFGI VEQVKPNINGLFYTPENPEELANVLTSLLIDEELRHKFATNAKYVLESLNNFAEMTETYGQIFQEAYFCRV >Mature_1991_residues MKTTALIIAGMHRSGTSLTASLFQSLGVNIGEKLLGPELGNIRGHFEDIEFVELHKKILRSQHIDDLGSNLETQEIVVKK PNLKIARKLIKNRQEENEKSHKIWGWKDPRTTLFLNFWLKLLPDAKFIFVYRSPWEVVDSLYRRSTDKKLLDQPEIAVKM WLNYNQRILDFYQQCSAKCLIGKVDIIGRDPESFIQAVNEKFEMNLPAPSPEIFAESLLVKDISQTNKPSLIEKYFPETL ETYQQLEKNGIGGDLEVNIQESKVKSESELWEFRDWFNIRCLEKQVSSLETDVEKWQKIFKEAQKKVGKLESELGETQQQ INIRSVKLEESSKKIELLEIELGKTQVQLEGKVKNLQASQTKVVTLERTLGQTQSQLENNQTKLQESQQKIIRLEVDLGQ TQTQFNNSKTRFKEALVKIFSLETELGKTQVQLEGTQIKFTESQKKLLGVETDFGQSQMKLERNQIKLGESQEKIGILET KLGQTTLRLNGNILKLQESQTKIQLLETEFGEAQRLLDGTQIKLLESQNKIQFLETEFGEAQRLLDGTQVKLLESQNKIQ FLETELGQTQGVLGQTQATLQETQATLQETQTTLQETQTTLQETQTTLQETQTTLQETQATLQQTQAQLDAQHYETEMLR AEISGMKSSKFWKLREKWFSLKGKLKKKLKNLRGRFIFSIDSPINWKISNSQIEIVGWCFHNSILKIQNIRARVGTEVFF GKYGIPRPDVAQQYNDISTAQNSGFQISVQLSPGNYQLILEVEEKKGKWHELVTYPISISTVEANFDAPTNWQQREGVIL FAGWCCHREEKITKLVLKYGDISVDCAYGLRRKDVEEIFPNWVGSGHSGFEVTVELPPGKWQVSLEAYLESGEIVGFPCS EVLQLKRYGFWEKAKDKFRQLSKFTQAIQKRISERKQRLGRIIPLPSELPSIARQILAIYRQQQKQGGDLLLPPGFVLPE TVDVYDAWLAVNNWGDRSRQYLISRLESCRTPLPKISVVMPVYDPPLKFLHQGISSVLNQVYQNWEFCIADDCSSNPKIR EILTERAKTDSRIKLTFRSENGNISAATNSAAELATGDFLLFLDNDDELTPDALGEVALYISQNSEIDFLYSDDDKISTE GKRFDPQFKPEYSPELLLSYMYIGHLCVVRKEIFDKIGGFRIGFEGSQDYDFALRATEISRQVGHLPLVLYHWRTTPGST AISGGEKPKSFLAGQKALQESLIRRGVAGNIYQPDWAVREKLGIFKPTFPDQGDSVTIIIPTKNQVKLLKACVESLRKTT YQNYQIFVIDNESDEPETLEYLAGLKCLYSGEDNILVFPMKNTDGKFNFAAINNRAVEQVKTEYILFLNNDTEIISPYWL SQMMGYAKIPGVGAVGAKLIYPDKRIQHAGVIHGLHHGLAGHAFKLLHSENRGYLSQAFVSKNYSAVTAACMLTPRKLFL ELGGFDEENFAVAYNDADYGYRLLKSGYRSVYCADAELIHKEGTSRGYSDNPQEEANYRRKYSQMIDGFYSPHLSLESDC FQIQPRRYFIRNLEVRSQKPEVFMNSGSSKKEPEINTQVKVDKSDKESEINNQTLEKNYPNESEINNQISYSTENFYTSQ KEAFPRIKILMCSNSLDLTGAPLHQLEIALKLAKDGIVEPIIFSVNDGELREIYQQQNIQVIVKDNPLEHIYERHAYDTA LTTFAQEIKSLNIDVMYINTLENFFMVDVAQMLNIPSVWNVHESEPWQTYFNRFGNEIAARALECFRYPYRIIFVSDATR NRYLPLNSHHNFTVIHNGLDLELLKKASAKWSRQEARSVLGVKEDEIVILLLGTVCERKGQHDLIRALSFMPEEERQKIK CFLVGDRPNLYSLKLHELVKNLPEEIQQRVEIVGETPETAKYYQAADIFVCTSRIESFPRVILEAMSYSLPIVTTPVFGI VEQVKPNINGLFYTPENPEELANVLTSLLIDEELRHKFATNAKYVLESLNNFAEMTETYGQIFQEAYFCRV
Specific function: Slime polysaccharide colanic acid biosynthesis. [C]
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasm [C]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1788372, Length=187, Percent_Identity=31.0160427807487, Blast_Score=74, Evalue=8e-14, Organism=Escherichia coli, GI1790061, Length=179, Percent_Identity=29.0502793296089, Blast_Score=66, Evalue=2e-11,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR001173 [H]
Pfam domain/function: PF00535 Glycos_transf_2 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 228084; Mature: 228084
Theoretical pI: Translated: 6.10; Mature: 6.10
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.2 %Cys (Translated Protein) 1.1 %Met (Translated Protein) 2.3 %Cys+Met (Translated Protein) 1.2 %Cys (Mature Protein) 1.1 %Met (Mature Protein) 2.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKTTALIIAGMHRSGTSLTASLFQSLGVNIGEKLLGPELGNIRGHFEDIEFVELHKKILR CCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH SQHIDDLGSNLETQEIVVKKPNLKIARKLIKNRQEENEKSHKIWGWKDPRTTLFLNFWLK HHCHHHHCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH LLPDAKFIFVYRSPWEVVDSLYRRSTDKKLLDQPEIAVKMWLNYNQRILDFYQQCSAKCL HCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCEEE IGKVDIIGRDPESFIQAVNEKFEMNLPAPSPEIFAESLLVKDISQTNKPSLIEKYFPETL EEEEEEECCCHHHHHHHHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCHHHH ETYQQLEKNGIGGDLEVNIQESKVKSESELWEFRDWFNIRCLEKQVSSLETDVEKWQKIF HHHHHHHHCCCCCCEEEEEEHHHCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KEAQKKVGKLESELGETQQQINIRSVKLEESSKKIELLEIELGKTQVQLEGKVKNLQASQ HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCEEEEEECCCCCCEEEEEEEECCEEEEECCHHHCCCCCC TKVVTLERTLGQTQSQLENNQTKLQESQQKIIRLEVDLGQTQTQFNNSKTRFKEALVKIF EEEEEEHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHH SLETELGKTQVQLEGTQIKFTESQKKLLGVETDFGQSQMKLERNQIKLGESQEKIGILET HHHHHCCCEEEEEECCEEEEECCHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCHHHH KLGQTTLRLNGNILKLQESQTKIQLLETEFGEAQRLLDGTQIKLLESQNKIQFLETEFGE CCCCEEEEECCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCEEEEHHHHHH AQRLLDGTQVKLLESQNKIQFLETELGQTQGVLGQTQATLQETQATLQETQTTLQETQTT HHHHHCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LQETQTTLQETQTTLQETQATLQQTQAQLDAQHYETEMLRAEISGMKSSKFWKLREKWFS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH LKGKLKKKLKNLRGRFIFSIDSPINWKISNSQIEIVGWCFHNSILKIQNIRARVGTEVFF HHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCEEEECCCEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCEEEE GKYGIPRPDVAQQYNDISTAQNSGFQISVQLSPGNYQLILEVEEKKGKWHELVTYPISIS CCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCEEEEEEEECCCCCEEEEEEEEEEEE TVEANFDAPTNWQQREGVILFAGWCCHREEKITKLVLKYGDISVDCAYGLRRKDVEEIFP EEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEECHHCCHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCCCCHHHHHH NWVGSGHSGFEVTVELPPGKWQVSLEAYLESGEIVGFPCSEVLQLKRYGFWEKAKDKFRQ HHCCCCCCCEEEEEEECCCCEEEEEEHHHCCCCEEECCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH LSKFTQAIQKRISERKQRLGRIIPLPSELPSIARQILAIYRQQQKQGGDLLLPPGFVLPE HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCCCCC TVDVYDAWLAVNNWGDRSRQYLISRLESCRTPLPKISVVMPVYDPPLKFLHQGISSVLNQ HHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHH VYQNWEFCIADDCSSNPKIREILTERAKTDSRIKLTFRSENGNISAATNSAAELATGDFL HHCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCEEECCCCCHHHCCCCEE LFLDNDDELTPDALGEVALYISQNSEIDFLYSDDDKISTEGKRFDPQFKPEYSPELLLSY EEECCCCCCCHHHHCCEEEEEECCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHH MYIGHLCVVRKEIFDKIGGFRIGFEGSQDYDFALRATEISRQVGHLPLVLYHWRTTPGST HHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCCCCEEEHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCC AISGGEKPKSFLAGQKALQESLIRRGVAGNIYQPDWAVREKLGIFKPTFPDQGDSVTIII CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEE PTKNQVKLLKACVESLRKTTYQNYQIFVIDNESDEPETLEYLAGLKCLYSGEDNILVFPM ECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHCCEEEECCCCCEEEEEE KNTDGKFNFAAINNRAVEQVKTEYILFLNNDTEIISPYWLSQMMGYAKIPGVGAVGAKLI CCCCCCEEEEEECHHHHHHHCCEEEEEECCCCCEECHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEE YPDKRIQHAGVIHGLHHGLAGHAFKLLHSENRGYLSQAFVSKNYSAVTAACMLTPRKLFL CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCHHHHHH ELGGFDEENFAVAYNDADYGYRLLKSGYRSVYCADAELIHKEGTSRGYSDNPQEEANYRR HHCCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHH KYSQMIDGFYSPHLSLESDCFQIQPRRYFIRNLEVRSQKPEVFMNSGSSKKEPEINTQVK HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEECCHHHHHHCCHHCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCCEEE VDKSDKESEINNQTLEKNYPNESEINNQISYSTENFYTSQKEAFPRIKILMCSNSLDLTG ECCCCCCHHHCCCHHHCCCCCHHHCCCCCCCCCHHHCCCHHHCCCEEEEEEECCCCCCCC APLHQLEIALKLAKDGIVEPIIFSVNDGELREIYQQQNIQVIVKDNPLEHIYERHAYDTA CCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHH LTTFAQEIKSLNIDVMYINTLENFFMVDVAQMLNIPSVWNVHESEPWQTYFNRFGNEIAA HHHHHHHHHHCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH RALECFRYPYRIIFVSDATRNRYLPLNSHHNFTVIHNGLDLELLKKASAKWSRQEARSVL HHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GVKEDEIVILLLGTVCERKGQHDLIRALSFMPEEERQKIKCFLVGDRPNLYSLKLHELVK CCCCCCEEEEEECHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEECCCCEEEEHHHHHHH NLPEEIQQRVEIVGETPETAKYYQAADIFVCTSRIESFPRVILEAMSYSLPIVTTPVFGI HHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCHHHHH VEQVKPNINGLFYTPENPEELANVLTSLLIDEELRHKFATNAKYVLESLNNFAEMTETYG HHHHCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QIFQEAYFCRV HHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MKTTALIIAGMHRSGTSLTASLFQSLGVNIGEKLLGPELGNIRGHFEDIEFVELHKKILR CCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH SQHIDDLGSNLETQEIVVKKPNLKIARKLIKNRQEENEKSHKIWGWKDPRTTLFLNFWLK HHCHHHHCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH LLPDAKFIFVYRSPWEVVDSLYRRSTDKKLLDQPEIAVKMWLNYNQRILDFYQQCSAKCL HCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCEEE IGKVDIIGRDPESFIQAVNEKFEMNLPAPSPEIFAESLLVKDISQTNKPSLIEKYFPETL EEEEEEECCCHHHHHHHHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCHHHH ETYQQLEKNGIGGDLEVNIQESKVKSESELWEFRDWFNIRCLEKQVSSLETDVEKWQKIF HHHHHHHHCCCCCCEEEEEEHHHCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KEAQKKVGKLESELGETQQQINIRSVKLEESSKKIELLEIELGKTQVQLEGKVKNLQASQ HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCEEEEEECCCCCCEEEEEEEECCEEEEECCHHHCCCCCC TKVVTLERTLGQTQSQLENNQTKLQESQQKIIRLEVDLGQTQTQFNNSKTRFKEALVKIF EEEEEEHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHH SLETELGKTQVQLEGTQIKFTESQKKLLGVETDFGQSQMKLERNQIKLGESQEKIGILET HHHHHCCCEEEEEECCEEEEECCHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCHHHH KLGQTTLRLNGNILKLQESQTKIQLLETEFGEAQRLLDGTQIKLLESQNKIQFLETEFGE CCCCEEEEECCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCEEEEHHHHHH AQRLLDGTQVKLLESQNKIQFLETELGQTQGVLGQTQATLQETQATLQETQTTLQETQTT HHHHHCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LQETQTTLQETQTTLQETQATLQQTQAQLDAQHYETEMLRAEISGMKSSKFWKLREKWFS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH LKGKLKKKLKNLRGRFIFSIDSPINWKISNSQIEIVGWCFHNSILKIQNIRARVGTEVFF HHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCEEEECCCEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCEEEE GKYGIPRPDVAQQYNDISTAQNSGFQISVQLSPGNYQLILEVEEKKGKWHELVTYPISIS CCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCEEEEEEEECCCCCEEEEEEEEEEEE TVEANFDAPTNWQQREGVILFAGWCCHREEKITKLVLKYGDISVDCAYGLRRKDVEEIFP EEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEECHHCCHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCCCCHHHHHH NWVGSGHSGFEVTVELPPGKWQVSLEAYLESGEIVGFPCSEVLQLKRYGFWEKAKDKFRQ HHCCCCCCCEEEEEEECCCCEEEEEEHHHCCCCEEECCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH LSKFTQAIQKRISERKQRLGRIIPLPSELPSIARQILAIYRQQQKQGGDLLLPPGFVLPE HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCCCCC TVDVYDAWLAVNNWGDRSRQYLISRLESCRTPLPKISVVMPVYDPPLKFLHQGISSVLNQ HHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHH VYQNWEFCIADDCSSNPKIREILTERAKTDSRIKLTFRSENGNISAATNSAAELATGDFL HHCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCEEECCCCCHHHCCCCEE LFLDNDDELTPDALGEVALYISQNSEIDFLYSDDDKISTEGKRFDPQFKPEYSPELLLSY EEECCCCCCCHHHHCCEEEEEECCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHH MYIGHLCVVRKEIFDKIGGFRIGFEGSQDYDFALRATEISRQVGHLPLVLYHWRTTPGST HHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCCCCEEEHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCC AISGGEKPKSFLAGQKALQESLIRRGVAGNIYQPDWAVREKLGIFKPTFPDQGDSVTIII CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEE PTKNQVKLLKACVESLRKTTYQNYQIFVIDNESDEPETLEYLAGLKCLYSGEDNILVFPM ECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHCCEEEECCCCCEEEEEE KNTDGKFNFAAINNRAVEQVKTEYILFLNNDTEIISPYWLSQMMGYAKIPGVGAVGAKLI CCCCCCEEEEEECHHHHHHHCCEEEEEECCCCCEECHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEE YPDKRIQHAGVIHGLHHGLAGHAFKLLHSENRGYLSQAFVSKNYSAVTAACMLTPRKLFL CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCHHHHHH ELGGFDEENFAVAYNDADYGYRLLKSGYRSVYCADAELIHKEGTSRGYSDNPQEEANYRR HHCCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHH KYSQMIDGFYSPHLSLESDCFQIQPRRYFIRNLEVRSQKPEVFMNSGSSKKEPEINTQVK HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEECCHHHHHHCCHHCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCCEEE VDKSDKESEINNQTLEKNYPNESEINNQISYSTENFYTSQKEAFPRIKILMCSNSLDLTG ECCCCCCHHHCCCHHHCCCCCHHHCCCCCCCCCHHHCCCHHHCCCEEEEEEECCCCCCCC APLHQLEIALKLAKDGIVEPIIFSVNDGELREIYQQQNIQVIVKDNPLEHIYERHAYDTA CCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHH LTTFAQEIKSLNIDVMYINTLENFFMVDVAQMLNIPSVWNVHESEPWQTYFNRFGNEIAA HHHHHHHHHHCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH RALECFRYPYRIIFVSDATRNRYLPLNSHHNFTVIHNGLDLELLKKASAKWSRQEARSVL HHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GVKEDEIVILLLGTVCERKGQHDLIRALSFMPEEERQKIKCFLVGDRPNLYSLKLHELVK CCCCCCEEEEEECHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEECCCCEEEEHHHHHHH NLPEEIQQRVEIVGETPETAKYYQAADIFVCTSRIESFPRVILEAMSYSLPIVTTPVFGI HHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCHHHHH VEQVKPNINGLFYTPENPEELANVLTSLLIDEELRHKFATNAKYVLESLNNFAEMTETYG HHHHCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QIFQEAYFCRV HHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9163424 [H]