Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 113475074

Identifier: 113475074

GI number: 113475074

Start: 2057447

End: 2059189

Strand: Reverse

Name: 113475074

Synonym: Tery_1349

Alternate gene names: NA

Gene position: 2059189-2057447 (Counterclockwise)

Preceding gene: 113475075

Following gene: 113475073

Centisome position: 26.57

GC content: 30.29

Gene sequence:

>1743_bases
ATGCGAAAAATATTTTCCCGAACCAGAATATTATTAGTAACCCTATATATTTTTCCAGTCTTATTACTCCTTTGGTTTCT
CGCTAATTTTAGTGTCAATGTTCCCTACTGGGACCAATGGAGATTAACCCCTATATTTGAGAAAGTTGCTGAAGGAAACG
CCACATTTTTTGACTTTTTCACAGTACACGGACATCACAGAATATTAATACCAAAATTAATCATTACTGCCTTAGCTTTT
GCCACTAAATGGAACACTCAAGCTGAAATAATTTGTAGTGTAATTTTTGTCATCATCACATTTTTTGCTGTTTGTAAAAT
AGCCCAAATTAACTTTCATAATCAAAATCAAAATATTATAAATATAGCAAATATTTTAAGCTGTCTATTTTTATTTTCCC
TAGTACAACATCAGAACTGGTTATGGGGATTTACTCTATTTTGGTTTCTCACAAACTTATGTTTAATAATGGCGGTATAT
TTGATTCATGTCTTAGAGAATATATCGGCAAAAAGAAGAATATTTCTAGCAGCAATATTTTGTTTTATCGGAAGTTTTAC
ATTAATACAAGGATTATTTTCTTGGCTAGTTTTAATTCCGTCAATATTGTCTATAGAAGGGAAAGCTAAACAAAAAATTA
CTAGACTAGTGATCTGGAGCTTACTGTTTGTAGTTTCATGTATTATCTACGCAATTAACTTCAATCCAATTCGCGAACCA
AAACCATTTTTATTTACAGAAAAACCATTTTTGATAATAAATTATTTTTTAGCCGTTATAGGTTTACCTCTAGTTAGACT
TCCCATACCTGCAATTTTAACAGGATTAATATTATTCTCTAGTTTCCTATTTTTTACATATTACTTTCTCAAGAAACCTT
TGTATAAACTAACTTTTTTTCCTCCTACTATTCCTTGGTTAACAATAGGTACATTTTCTATAATTTCTGCTCTATCTATT
TCTGTAGGTAGAGCAGAATATGGGGTGGAAAATGCTATGACTTCTTCCCGATATACAACCACATCAATATTATTAATTAT
CTCTTTAGTTTATCTCTTGGCTTTGTTTATACAAAAGCAACAAAAATATTTATTAATATATAAAATTTTAGCTGTTGCAA
TCACAGGAATTATGCTCATAAACTCCCTCTATGTTGTGAGGAATATTAAATTAAGTTTTCCCTATATTGAGAGTCGGAAA
GAATGTCTAGAAATAATTAACTATTTAGAAGATTCAGAATTTATAAAAACATCTCCAGATAGTTGTTTAGTGTTAATGAA
TGGCAAAACTTGGCTAGTCAGACGAGGTGCAGAAATTATGGCAAAACTCGGATGGCGAGAATTTCCTCAAAATCTACAAT
TTATCAAACAACCAAAACAAAATTATGGTTATTTAGATCATCCTCAAACAACTGCAAAACCTCTAATTATTAAAGGTGAA
GAAACTCTAAATTTGGGAGGTTGGGCAATTCAACCTGATGGAAAAGAACAACCTAACTTAGTGTTACTTTCTTCTGGTAA
TAATCAAGATTTTTTTGCTAATGCTATTGTTAACTTAGAGAGTTATGATATTGCTAAAGTTATGAAGTCAAAACTTTATA
GTAGAGCCAGATGGAAAGTAAAATTTTCAGCGAAATCTTTACCTGTAGGAGAAACTGTTATTAAAGCTTGGGTTTATAAC
CCTAATAAACAAGAATTTGTTAAATTAAACAATGAAGTTAATGTCAGGGTAGAAAAGTCTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATTTGATTTAGCTATATTGCTATATAGCTCTAAAGAGACGGGACTTTCAAGTTCGCTTTAAGGTAATATTTATAAAAGC
TATCTGCCAACTTTTGAATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTAGTATTTTAATTTAAACAGATAAGATAATAATAACCACCAAAATTTCCCATAAATGAACTTCAGGGCTAATAGCAGAA
GTCTCTGAAAAGTGGCTGAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 580; Mature: 580

Protein sequence:

>580_residues
MRKIFSRTRILLVTLYIFPVLLLLWFLANFSVNVPYWDQWRLTPIFEKVAEGNATFFDFFTVHGHHRILIPKLIITALAF
ATKWNTQAEIICSVIFVIITFFAVCKIAQINFHNQNQNIINIANILSCLFLFSLVQHQNWLWGFTLFWFLTNLCLIMAVY
LIHVLENISAKRRIFLAAIFCFIGSFTLIQGLFSWLVLIPSILSIEGKAKQKITRLVIWSLLFVVSCIIYAINFNPIREP
KPFLFTEKPFLIINYFLAVIGLPLVRLPIPAILTGLILFSSFLFFTYYFLKKPLYKLTFFPPTIPWLTIGTFSIISALSI
SVGRAEYGVENAMTSSRYTTTSILLIISLVYLLALFIQKQQKYLLIYKILAVAITGIMLINSLYVVRNIKLSFPYIESRK
ECLEIINYLEDSEFIKTSPDSCLVLMNGKTWLVRRGAEIMAKLGWREFPQNLQFIKQPKQNYGYLDHPQTTAKPLIIKGE
ETLNLGGWAIQPDGKEQPNLVLLSSGNNQDFFANAIVNLESYDIAKVMKSKLYSRARWKVKFSAKSLPVGETVIKAWVYN
PNKQEFVKLNNEVNVRVEKS

Sequences:

>Translated_580_residues
MRKIFSRTRILLVTLYIFPVLLLLWFLANFSVNVPYWDQWRLTPIFEKVAEGNATFFDFFTVHGHHRILIPKLIITALAF
ATKWNTQAEIICSVIFVIITFFAVCKIAQINFHNQNQNIINIANILSCLFLFSLVQHQNWLWGFTLFWFLTNLCLIMAVY
LIHVLENISAKRRIFLAAIFCFIGSFTLIQGLFSWLVLIPSILSIEGKAKQKITRLVIWSLLFVVSCIIYAINFNPIREP
KPFLFTEKPFLIINYFLAVIGLPLVRLPIPAILTGLILFSSFLFFTYYFLKKPLYKLTFFPPTIPWLTIGTFSIISALSI
SVGRAEYGVENAMTSSRYTTTSILLIISLVYLLALFIQKQQKYLLIYKILAVAITGIMLINSLYVVRNIKLSFPYIESRK
ECLEIINYLEDSEFIKTSPDSCLVLMNGKTWLVRRGAEIMAKLGWREFPQNLQFIKQPKQNYGYLDHPQTTAKPLIIKGE
ETLNLGGWAIQPDGKEQPNLVLLSSGNNQDFFANAIVNLESYDIAKVMKSKLYSRARWKVKFSAKSLPVGETVIKAWVYN
PNKQEFVKLNNEVNVRVEKS
>Mature_580_residues
MRKIFSRTRILLVTLYIFPVLLLLWFLANFSVNVPYWDQWRLTPIFEKVAEGNATFFDFFTVHGHHRILIPKLIITALAF
ATKWNTQAEIICSVIFVIITFFAVCKIAQINFHNQNQNIINIANILSCLFLFSLVQHQNWLWGFTLFWFLTNLCLIMAVY
LIHVLENISAKRRIFLAAIFCFIGSFTLIQGLFSWLVLIPSILSIEGKAKQKITRLVIWSLLFVVSCIIYAINFNPIREP
KPFLFTEKPFLIINYFLAVIGLPLVRLPIPAILTGLILFSSFLFFTYYFLKKPLYKLTFFPPTIPWLTIGTFSIISALSI
SVGRAEYGVENAMTSSRYTTTSILLIISLVYLLALFIQKQQKYLLIYKILAVAITGIMLINSLYVVRNIKLSFPYIESRK
ECLEIINYLEDSEFIKTSPDSCLVLMNGKTWLVRRGAEIMAKLGWREFPQNLQFIKQPKQNYGYLDHPQTTAKPLIIKGE
ETLNLGGWAIQPDGKEQPNLVLLSSGNNQDFFANAIVNLESYDIAKVMKSKLYSRARWKVKFSAKSLPVGETVIKAWVYN
PNKQEFVKLNNEVNVRVEKS

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 66857; Mature: 66857

Theoretical pI: Translated: 10.08; Mature: 10.08

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.4 %Cys     (Translated Protein)
1.2 %Met     (Translated Protein)
2.6 %Cys+Met (Translated Protein)
1.4 %Cys     (Mature Protein)
1.2 %Met     (Mature Protein)
2.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRKIFSRTRILLVTLYIFPVLLLLWFLANFSVNVPYWDQWRLTPIFEKVAEGNATFFDFF
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCEEEEEE
TVHGHHRILIPKLIITALAFATKWNTQAEIICSVIFVIITFFAVCKIAQINFHNQNQNII
EECCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCH
NIANILSCLFLFSLVQHQNWLWGFTLFWFLTNLCLIMAVYLIHVLENISAKRRIFLAAIF
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
CFIGSFTLIQGLFSWLVLIPSILSIEGKAKQKITRLVIWSLLFVVSCIIYAINFNPIREP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
KPFLFTEKPFLIINYFLAVIGLPLVRLPIPAILTGLILFSSFLFFTYYFLKKPLYKLTFF
CCCEECCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEEEC
PPTIPWLTIGTFSIISALSISVGRAEYGVENAMTSSRYTTTSILLIISLVYLLALFIQKQ
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QKYLLIYKILAVAITGIMLINSLYVVRNIKLSFPYIESRKECLEIINYLEDSEFIKTSPD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCCCC
SCLVLMNGKTWLVRRGAEIMAKLGWREFPQNLQFIKQPKQNYGYLDHPQTTAKPLIIKGE
CEEEEECCCEEEECCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCCCCCCCCCCEEEECC
ETLNLGGWAIQPDGKEQPNLVLLSSGNNQDFFANAIVNLESYDIAKVMKSKLYSRARWKV
CEEECCCEEECCCCCCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEEE
KFSAKSLPVGETVIKAWVYNPNKQEFVKLNNEVNVRVEKS
EECCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHEEECCEEEEEEECC
>Mature Secondary Structure
MRKIFSRTRILLVTLYIFPVLLLLWFLANFSVNVPYWDQWRLTPIFEKVAEGNATFFDFF
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCEEEEEE
TVHGHHRILIPKLIITALAFATKWNTQAEIICSVIFVIITFFAVCKIAQINFHNQNQNII
EECCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCH
NIANILSCLFLFSLVQHQNWLWGFTLFWFLTNLCLIMAVYLIHVLENISAKRRIFLAAIF
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
CFIGSFTLIQGLFSWLVLIPSILSIEGKAKQKITRLVIWSLLFVVSCIIYAINFNPIREP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
KPFLFTEKPFLIINYFLAVIGLPLVRLPIPAILTGLILFSSFLFFTYYFLKKPLYKLTFF
CCCEECCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEEEC
PPTIPWLTIGTFSIISALSISVGRAEYGVENAMTSSRYTTTSILLIISLVYLLALFIQKQ
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QKYLLIYKILAVAITGIMLINSLYVVRNIKLSFPYIESRKECLEIINYLEDSEFIKTSPD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCCCC
SCLVLMNGKTWLVRRGAEIMAKLGWREFPQNLQFIKQPKQNYGYLDHPQTTAKPLIIKGE
CEEEEECCCEEEECCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCCCCCCCCCCEEEECC
ETLNLGGWAIQPDGKEQPNLVLLSSGNNQDFFANAIVNLESYDIAKVMKSKLYSRARWKV
CEEECCCEEECCCCCCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEEE
KFSAKSLPVGETVIKAWVYNPNKQEFVKLNNEVNVRVEKS
EECCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHEEECCEEEEEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA