Definition Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome, complete genome.
Accession NC_008312
Length 7,750,108

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The map label for this gene is 113474489

Identifier: 113474489

GI number: 113474489

Start: 1036276

End: 1038555

Strand: Direct

Name: 113474489

Synonym: Tery_0636

Alternate gene names: NA

Gene position: 1036276-1038555 (Clockwise)

Preceding gene: 113474488

Following gene: 113474490

Centisome position: 13.37

GC content: 31.58

Gene sequence:

>2280_bases
ATGGAAAATGAACTTAATTTTCAAAAAAAAAGTAGCTATGAACTCCTACTCTATTTGGCTTTAAATATAAAAAACTTTCA
AATATCGCCTAAAATAAAATTAGAAACTGACTTACCCCAGAAAGTTAGAGACGATATCAAAACTTATTTTTGTACTTATA
AGTCTGCTTGTCAATTTGCTAATCAAATATTTTTAGAAGTTTATCAACCAGGAGCGATTAAAAAGTACTGTCAACAAAGT
AAAATAGGGAAAAAATTACCAACTGCTCTTTATATTCATATTTCTGCAGTTGAACAACTTCATCCCTTACTGCGACTCTA
CGAAAATTTAGCTCATCATTTATATTATAAAGCAGTTTCTAGAGAAAAAACTGATGCTAAAATTACCACATTAATAAAGT
TTAATTTTGACAAACCAACAATTTCTTATTTACATTATCCAGATTTTGATATTGACCCTCATCCTGCCTTAAAAACTAGC
ATTTCCATTAATATGAATAATGGAAAAGTTGAGCATAGAAACTACAGTAATCATAAAAACCCTCCCGTTTTGCATCGGAA
AGAAACTTTTGTTACTCCTAAATATCCCCAATACGAAAAATTCGCTAAGTTAACTTCTGATGAGGTTCAACTAGGACTAT
TAGATAATACTTGTTTAATTGGTACTCGTCAAGGATGGTTAACGCACCTCAAAAATCATGGAATAGAAATTCAAGATCAT
CATGTTATTCAGCATACTATTGAGATGCCAATTCCTCAAATAAAACGTCATAAAGCTGCTATAGTTCGTAAACAAATTTC
TAAACCAGTACGTTTAGCTATAGAAGCAAATCTATTTACAGAAGGTAGAACTTTTTTTGACTATGGTTGTGGCTATGGTG
AGGATATCAAATATATTGCTAAAAAAGGTTATTTAAGTGCGGGTTGGGACCCCTATTATTTGCCAGAAACTCCTTGTATT
GCTGCTGATATTGTTAATCTTGGTTATGTAATTAATGTAATAGAATCTTTGACAGAACGTAGGGAAGCTTTGATTAAATC
TTGGGGGTTAACTAAACAAATTTTAATTGTTTCTGCTATGGTGCTAATTGATGATAGTAAAACTGAGGGAAAACTTGCTT
ATGGAGATGGCATAATTACAGCTCGTAAGACTTTTCAAAAATATTATGAACAGGAAGAATTAAAATCTTATATTGACCAA
GTGTTGAATGTAGATTCGATTCCTATTGATTTAGGAATTTTCTTTGTTTTTAAAGATGAAGCAGAAGCTCAAAATTTTCG
GGCTTCTCGCTTAAAAAGTCGTTTATTAACCCCAAGAATAAGTTGCAAAAATAAGCGGTTTGAAGATTATGAAGAACAGC
TTATTCCTTTAATGAATTTTATGAGCGATCGCGGTCGTCTACCATTCAGGGGAGAACTTGTGGAAGAGACAGATTTAATT
GCAGAGTTTGGTACTTTTCGTCGTGCATTTCAAGTGATTATGCAAGTAACAAACTATCAAGAATGGGATGAAATAACAGA
TAAACGTCGTCAAGATTTGTTGGTATATATAGCCTTGACTAAGTTTGGTAATAGACCTAAGTTTTCCCAATTATCAGTAG
TAGTCAGAAATGATATTAAAGCTTTATTTGGTAGTTACACTAAAGCCTGTACTTTAGGTGATTTAATGTTATTTAGTTTG
GGTAATTCTGACTTGATAAGTAAATGTTGTAAAAATAGTTTTATTGGTTATAAATATACTAATTCTCTATTGGTTCATAT
TTCTGCTGTTCCAAAACTTGATCCCTTGCTGCGACTTTATGAAGGTTGTGCTAATCGAACAATTGGTAGGTTAAATGAGG
CAACTATCGTTAAATTTTATTATAAATTACCAATAATATCTTATTTATTTTACCCCGATTTTGATACGGAAGCTCATCCA
GTTTTACGTACAAGAATGAATATTGATTTGCGAGACTTGAGTGTTAGCTATGAGGATTATAAAAATGAATATAATCCACC
AATTTTGCACAGAAAAGATGCTTTAGTAACTTCAGATTATCCCCACTATGAAAAGTTTACTAAACTTACATTACAAGAAG
AAGATAGAGGGCTTTTAAATAATTTAAAACAAATTCAAAATAGACTGGGATGGCTAAAATGTTTAGAGGAAAATTTTGCA
GAAATTAAAGGTCATCGTGTTTATTGGCGTACTAATGTTGACCCTTATCAGTTAAAAATATTAAAGTCTGCTGATGCTGC
TCGGAAGCGCAGAAGAAAACAACAACTAAATCAGAAATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTATAGTGTTGCTCAAGTTACTGGAATACAGTTTTTTTCTTCTTTTCTATTCCCTGCTTCTCAAATTACTATTCCCTATT
CCTTACTCCCTAAAATAGCA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAATTTAGCAGTTGAAGATGTTTTATACCAAGCGTCAAAAAGAATGTTATAAGTAGTTTCAAACTATATATATCGAATAA
CTTCCTCAAATGACTGAGAG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 759; Mature: 759

Protein sequence:

>759_residues
MENELNFQKKSSYELLLYLALNIKNFQISPKIKLETDLPQKVRDDIKTYFCTYKSACQFANQIFLEVYQPGAIKKYCQQS
KIGKKLPTALYIHISAVEQLHPLLRLYENLAHHLYYKAVSREKTDAKITTLIKFNFDKPTISYLHYPDFDIDPHPALKTS
ISINMNNGKVEHRNYSNHKNPPVLHRKETFVTPKYPQYEKFAKLTSDEVQLGLLDNTCLIGTRQGWLTHLKNHGIEIQDH
HVIQHTIEMPIPQIKRHKAAIVRKQISKPVRLAIEANLFTEGRTFFDYGCGYGEDIKYIAKKGYLSAGWDPYYLPETPCI
AADIVNLGYVINVIESLTERREALIKSWGLTKQILIVSAMVLIDDSKTEGKLAYGDGIITARKTFQKYYEQEELKSYIDQ
VLNVDSIPIDLGIFFVFKDEAEAQNFRASRLKSRLLTPRISCKNKRFEDYEEQLIPLMNFMSDRGRLPFRGELVEETDLI
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GNSDLISKCCKNSFIGYKYTNSLLVHISAVPKLDPLLRLYEGCANRTIGRLNEATIVKFYYKLPIISYLFYPDFDTEAHP
VLRTRMNIDLRDLSVSYEDYKNEYNPPILHRKDALVTSDYPHYEKFTKLTLQEEDRGLLNNLKQIQNRLGWLKCLEENFA
EIKGHRVYWRTNVDPYQLKILKSADAARKRRRKQQLNQK

Sequences:

>Translated_759_residues
MENELNFQKKSSYELLLYLALNIKNFQISPKIKLETDLPQKVRDDIKTYFCTYKSACQFANQIFLEVYQPGAIKKYCQQS
KIGKKLPTALYIHISAVEQLHPLLRLYENLAHHLYYKAVSREKTDAKITTLIKFNFDKPTISYLHYPDFDIDPHPALKTS
ISINMNNGKVEHRNYSNHKNPPVLHRKETFVTPKYPQYEKFAKLTSDEVQLGLLDNTCLIGTRQGWLTHLKNHGIEIQDH
HVIQHTIEMPIPQIKRHKAAIVRKQISKPVRLAIEANLFTEGRTFFDYGCGYGEDIKYIAKKGYLSAGWDPYYLPETPCI
AADIVNLGYVINVIESLTERREALIKSWGLTKQILIVSAMVLIDDSKTEGKLAYGDGIITARKTFQKYYEQEELKSYIDQ
VLNVDSIPIDLGIFFVFKDEAEAQNFRASRLKSRLLTPRISCKNKRFEDYEEQLIPLMNFMSDRGRLPFRGELVEETDLI
AEFGTFRRAFQVIMQVTNYQEWDEITDKRRQDLLVYIALTKFGNRPKFSQLSVVVRNDIKALFGSYTKACTLGDLMLFSL
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VLRTRMNIDLRDLSVSYEDYKNEYNPPILHRKDALVTSDYPHYEKFTKLTLQEEDRGLLNNLKQIQNRLGWLKCLEENFA
EIKGHRVYWRTNVDPYQLKILKSADAARKRRRKQQLNQK
>Mature_759_residues
MENELNFQKKSSYELLLYLALNIKNFQISPKIKLETDLPQKVRDDIKTYFCTYKSACQFANQIFLEVYQPGAIKKYCQQS
KIGKKLPTALYIHISAVEQLHPLLRLYENLAHHLYYKAVSREKTDAKITTLIKFNFDKPTISYLHYPDFDIDPHPALKTS
ISINMNNGKVEHRNYSNHKNPPVLHRKETFVTPKYPQYEKFAKLTSDEVQLGLLDNTCLIGTRQGWLTHLKNHGIEIQDH
HVIQHTIEMPIPQIKRHKAAIVRKQISKPVRLAIEANLFTEGRTFFDYGCGYGEDIKYIAKKGYLSAGWDPYYLPETPCI
AADIVNLGYVINVIESLTERREALIKSWGLTKQILIVSAMVLIDDSKTEGKLAYGDGIITARKTFQKYYEQEELKSYIDQ
VLNVDSIPIDLGIFFVFKDEAEAQNFRASRLKSRLLTPRISCKNKRFEDYEEQLIPLMNFMSDRGRLPFRGELVEETDLI
AEFGTFRRAFQVIMQVTNYQEWDEITDKRRQDLLVYIALTKFGNRPKFSQLSVVVRNDIKALFGSYTKACTLGDLMLFSL
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VLRTRMNIDLRDLSVSYEDYKNEYNPPILHRKDALVTSDYPHYEKFTKLTLQEEDRGLLNNLKQIQNRLGWLKCLEENFA
EIKGHRVYWRTNVDPYQLKILKSADAARKRRRKQQLNQK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 88444; Mature: 88444

Theoretical pI: Translated: 9.34; Mature: 9.34

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.6 %Cys     (Translated Protein)
1.2 %Met     (Translated Protein)
2.8 %Cys+Met (Translated Protein)
1.6 %Cys     (Mature Protein)
1.2 %Met     (Mature Protein)
2.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MENELNFQKKSSYELLLYLALNIKNFQISPKIKLETDLPQKVRDDIKTYFCTYKSACQFA
CCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCEEECCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NQIFLEVYQPGAIKKYCQQSKIGKKLPTALYIHISAVEQLHPLLRLYENLAHHLYYKAVS
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
REKTDAKITTLIKFNFDKPTISYLHYPDFDIDPHPALKTSISINMNNGKVEHRNYSNHKN
CCCCCCEEEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCEEECCCCCCCCC
PPVLHRKETFVTPKYPQYEKFAKLTSDEVQLGLLDNTCLIGTRQGWLTHLKNHGIEIQDH
CCCEECCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCEEEEEECCEEEEECCHHHHHHHHHCCCEEECC
HVIQHTIEMPIPQIKRHKAAIVRKQISKPVRLAIEANLFTEGRTFFDYGCGYGEDIKYIA
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEEEECCCEEEECCCCCCCCHHHHH
KKGYLSAGWDPYYLPETPCIAADIVNLGYVINVIESLTERREALIKSWGLTKQILIVSAM
HCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
VLIDDSKTEGKLAYGDGIITARKTFQKYYEQEELKSYIDQVLNVDSIPIDLGIFFVFKDE
HEEECCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEECCC
AEAQNFRASRLKSRLLTPRISCKNKRFEDYEEQLIPLMNFMSDRGRLPFRGELVEETDLI
CHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHH
AEFGTFRRAFQVIMQVTNYQEWDEITDKRRQDLLVYIALTKFGNRPKFSQLSVVVRNDIK
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
ALFGSYTKACTLGDLMLFSLGNSDLISKCCKNSFIGYKYTNSLLVHISAVPKLDPLLRLY
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EGCANRTIGRLNEATIVKFYYKLPIISYLFYPDFDTEAHPVLRTRMNIDLRDLSVSYEDY
HHHHCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCHHHEECCHHHH
KNEYNPPILHRKDALVTSDYPHYEKFTKLTLQEEDRGLLNNLKQIQNRLGWLKCLEENFA
HCCCCCCCEECCCCEEECCCCCHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EIKGHRVYWRTNVDPYQLKILKSADAARKRRRKQQLNQK
HHCCCEEEEECCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
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CCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCEEECCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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REKTDAKITTLIKFNFDKPTISYLHYPDFDIDPHPALKTSISINMNNGKVEHRNYSNHKN
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KKGYLSAGWDPYYLPETPCIAADIVNLGYVINVIESLTERREALIKSWGLTKQILIVSAM
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HCCCCCCCEECCCCEEECCCCCHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EIKGHRVYWRTNVDPYQLKILKSADAARKRRRKQQLNQK
HHCCCEEEEECCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA