| Definition | Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008312 |
| Length | 7,750,108 |
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The map label for this gene is 113474489
Identifier: 113474489
GI number: 113474489
Start: 1036276
End: 1038555
Strand: Direct
Name: 113474489
Synonym: Tery_0636
Alternate gene names: NA
Gene position: 1036276-1038555 (Clockwise)
Preceding gene: 113474488
Following gene: 113474490
Centisome position: 13.37
GC content: 31.58
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases AAATTTAGCAGTTGAAGATGTTTTATACCAAGCGTCAAAAAGAATGTTATAAGTAGTTTCAAACTATATATATCGAATAA CTTCCTCAAATGACTGAGAG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 759; Mature: 759
Protein sequence:
>759_residues MENELNFQKKSSYELLLYLALNIKNFQISPKIKLETDLPQKVRDDIKTYFCTYKSACQFANQIFLEVYQPGAIKKYCQQS KIGKKLPTALYIHISAVEQLHPLLRLYENLAHHLYYKAVSREKTDAKITTLIKFNFDKPTISYLHYPDFDIDPHPALKTS ISINMNNGKVEHRNYSNHKNPPVLHRKETFVTPKYPQYEKFAKLTSDEVQLGLLDNTCLIGTRQGWLTHLKNHGIEIQDH HVIQHTIEMPIPQIKRHKAAIVRKQISKPVRLAIEANLFTEGRTFFDYGCGYGEDIKYIAKKGYLSAGWDPYYLPETPCI AADIVNLGYVINVIESLTERREALIKSWGLTKQILIVSAMVLIDDSKTEGKLAYGDGIITARKTFQKYYEQEELKSYIDQ VLNVDSIPIDLGIFFVFKDEAEAQNFRASRLKSRLLTPRISCKNKRFEDYEEQLIPLMNFMSDRGRLPFRGELVEETDLI AEFGTFRRAFQVIMQVTNYQEWDEITDKRRQDLLVYIALTKFGNRPKFSQLSVVVRNDIKALFGSYTKACTLGDLMLFSL GNSDLISKCCKNSFIGYKYTNSLLVHISAVPKLDPLLRLYEGCANRTIGRLNEATIVKFYYKLPIISYLFYPDFDTEAHP VLRTRMNIDLRDLSVSYEDYKNEYNPPILHRKDALVTSDYPHYEKFTKLTLQEEDRGLLNNLKQIQNRLGWLKCLEENFA EIKGHRVYWRTNVDPYQLKILKSADAARKRRRKQQLNQK
Sequences:
>Translated_759_residues MENELNFQKKSSYELLLYLALNIKNFQISPKIKLETDLPQKVRDDIKTYFCTYKSACQFANQIFLEVYQPGAIKKYCQQS KIGKKLPTALYIHISAVEQLHPLLRLYENLAHHLYYKAVSREKTDAKITTLIKFNFDKPTISYLHYPDFDIDPHPALKTS ISINMNNGKVEHRNYSNHKNPPVLHRKETFVTPKYPQYEKFAKLTSDEVQLGLLDNTCLIGTRQGWLTHLKNHGIEIQDH HVIQHTIEMPIPQIKRHKAAIVRKQISKPVRLAIEANLFTEGRTFFDYGCGYGEDIKYIAKKGYLSAGWDPYYLPETPCI AADIVNLGYVINVIESLTERREALIKSWGLTKQILIVSAMVLIDDSKTEGKLAYGDGIITARKTFQKYYEQEELKSYIDQ VLNVDSIPIDLGIFFVFKDEAEAQNFRASRLKSRLLTPRISCKNKRFEDYEEQLIPLMNFMSDRGRLPFRGELVEETDLI AEFGTFRRAFQVIMQVTNYQEWDEITDKRRQDLLVYIALTKFGNRPKFSQLSVVVRNDIKALFGSYTKACTLGDLMLFSL GNSDLISKCCKNSFIGYKYTNSLLVHISAVPKLDPLLRLYEGCANRTIGRLNEATIVKFYYKLPIISYLFYPDFDTEAHP VLRTRMNIDLRDLSVSYEDYKNEYNPPILHRKDALVTSDYPHYEKFTKLTLQEEDRGLLNNLKQIQNRLGWLKCLEENFA EIKGHRVYWRTNVDPYQLKILKSADAARKRRRKQQLNQK >Mature_759_residues MENELNFQKKSSYELLLYLALNIKNFQISPKIKLETDLPQKVRDDIKTYFCTYKSACQFANQIFLEVYQPGAIKKYCQQS KIGKKLPTALYIHISAVEQLHPLLRLYENLAHHLYYKAVSREKTDAKITTLIKFNFDKPTISYLHYPDFDIDPHPALKTS ISINMNNGKVEHRNYSNHKNPPVLHRKETFVTPKYPQYEKFAKLTSDEVQLGLLDNTCLIGTRQGWLTHLKNHGIEIQDH HVIQHTIEMPIPQIKRHKAAIVRKQISKPVRLAIEANLFTEGRTFFDYGCGYGEDIKYIAKKGYLSAGWDPYYLPETPCI AADIVNLGYVINVIESLTERREALIKSWGLTKQILIVSAMVLIDDSKTEGKLAYGDGIITARKTFQKYYEQEELKSYIDQ VLNVDSIPIDLGIFFVFKDEAEAQNFRASRLKSRLLTPRISCKNKRFEDYEEQLIPLMNFMSDRGRLPFRGELVEETDLI AEFGTFRRAFQVIMQVTNYQEWDEITDKRRQDLLVYIALTKFGNRPKFSQLSVVVRNDIKALFGSYTKACTLGDLMLFSL GNSDLISKCCKNSFIGYKYTNSLLVHISAVPKLDPLLRLYEGCANRTIGRLNEATIVKFYYKLPIISYLFYPDFDTEAHP VLRTRMNIDLRDLSVSYEDYKNEYNPPILHRKDALVTSDYPHYEKFTKLTLQEEDRGLLNNLKQIQNRLGWLKCLEENFA EIKGHRVYWRTNVDPYQLKILKSADAARKRRRKQQLNQK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 88444; Mature: 88444
Theoretical pI: Translated: 9.34; Mature: 9.34
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.6 %Cys (Translated Protein) 1.2 %Met (Translated Protein) 2.8 %Cys+Met (Translated Protein) 1.6 %Cys (Mature Protein) 1.2 %Met (Mature Protein) 2.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MENELNFQKKSSYELLLYLALNIKNFQISPKIKLETDLPQKVRDDIKTYFCTYKSACQFA CCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCEEECCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NQIFLEVYQPGAIKKYCQQSKIGKKLPTALYIHISAVEQLHPLLRLYENLAHHLYYKAVS HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH REKTDAKITTLIKFNFDKPTISYLHYPDFDIDPHPALKTSISINMNNGKVEHRNYSNHKN CCCCCCEEEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCEEECCCCCCCCC PPVLHRKETFVTPKYPQYEKFAKLTSDEVQLGLLDNTCLIGTRQGWLTHLKNHGIEIQDH CCCEECCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCEEEEEECCEEEEECCHHHHHHHHHCCCEEECC HVIQHTIEMPIPQIKRHKAAIVRKQISKPVRLAIEANLFTEGRTFFDYGCGYGEDIKYIA HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEEEECCCEEEECCCCCCCCHHHHH KKGYLSAGWDPYYLPETPCIAADIVNLGYVINVIESLTERREALIKSWGLTKQILIVSAM HCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH VLIDDSKTEGKLAYGDGIITARKTFQKYYEQEELKSYIDQVLNVDSIPIDLGIFFVFKDE HEEECCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEECCC AEAQNFRASRLKSRLLTPRISCKNKRFEDYEEQLIPLMNFMSDRGRLPFRGELVEETDLI CHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHH AEFGTFRRAFQVIMQVTNYQEWDEITDKRRQDLLVYIALTKFGNRPKFSQLSVVVRNDIK HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHH ALFGSYTKACTLGDLMLFSLGNSDLISKCCKNSFIGYKYTNSLLVHISAVPKLDPLLRLY HHHCCHHHHHHHHHHHEEECCCHHHHHHHHHCCCCCEEECCEEEEEEECCCCHHHHHHHH EGCANRTIGRLNEATIVKFYYKLPIISYLFYPDFDTEAHPVLRTRMNIDLRDLSVSYEDY HHHHCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCHHHEECCHHHH KNEYNPPILHRKDALVTSDYPHYEKFTKLTLQEEDRGLLNNLKQIQNRLGWLKCLEENFA HCCCCCCCEECCCCEEECCCCCHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EIKGHRVYWRTNVDPYQLKILKSADAARKRRRKQQLNQK HHCCCEEEEECCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure MENELNFQKKSSYELLLYLALNIKNFQISPKIKLETDLPQKVRDDIKTYFCTYKSACQFA CCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCEEECCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NQIFLEVYQPGAIKKYCQQSKIGKKLPTALYIHISAVEQLHPLLRLYENLAHHLYYKAVS HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH REKTDAKITTLIKFNFDKPTISYLHYPDFDIDPHPALKTSISINMNNGKVEHRNYSNHKN CCCCCCEEEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCEEECCCCCCCCC PPVLHRKETFVTPKYPQYEKFAKLTSDEVQLGLLDNTCLIGTRQGWLTHLKNHGIEIQDH CCCEECCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCEEEEEECCEEEEECCHHHHHHHHHCCCEEECC HVIQHTIEMPIPQIKRHKAAIVRKQISKPVRLAIEANLFTEGRTFFDYGCGYGEDIKYIA HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEEEECCCEEEECCCCCCCCHHHHH KKGYLSAGWDPYYLPETPCIAADIVNLGYVINVIESLTERREALIKSWGLTKQILIVSAM HCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH VLIDDSKTEGKLAYGDGIITARKTFQKYYEQEELKSYIDQVLNVDSIPIDLGIFFVFKDE HEEECCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEECCC AEAQNFRASRLKSRLLTPRISCKNKRFEDYEEQLIPLMNFMSDRGRLPFRGELVEETDLI CHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHH AEFGTFRRAFQVIMQVTNYQEWDEITDKRRQDLLVYIALTKFGNRPKFSQLSVVVRNDIK HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHH ALFGSYTKACTLGDLMLFSLGNSDLISKCCKNSFIGYKYTNSLLVHISAVPKLDPLLRLY HHHCCHHHHHHHHHHHEEECCCHHHHHHHHHCCCCCEEECCEEEEEEECCCCHHHHHHHH EGCANRTIGRLNEATIVKFYYKLPIISYLFYPDFDTEAHPVLRTRMNIDLRDLSVSYEDY HHHHCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCHHHEECCHHHH KNEYNPPILHRKDALVTSDYPHYEKFTKLTLQEEDRGLLNNLKQIQNRLGWLKCLEENFA HCCCCCCCEECCCCEEECCCCCHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EIKGHRVYWRTNVDPYQLKILKSADAARKRRRKQQLNQK HHCCCEEEEECCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA