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The map label for this gene is 109948216

Identifier: 109948216

GI number: 109948216

Start: 1523344

End: 1524891

Strand: Reverse

Name: 109948216

Synonym: Hac_1749

Alternate gene names: NA

Gene position: 1524891-1523344 (Counterclockwise)

Preceding gene: 109948217

Following gene: 109948215

Centisome position: 98.13

GC content: 40.96

Gene sequence:

>1548_bases
ATGAAAAAAACCATTCTCTTTGCATTGAGCTTGTTGTGCGGTAGTTTTTTAAACGCTGTGGATGAAAACCCTAAAAATAT
CCAAGAAAAAACCAAGCCTTCTTCTTTGAGCTTGGCTGAAAATAATGCACCTTTTAACAACCATAACGCTCAAAAACTCT
CTTTGAAAAACGCATGGGGTAGGGTGTTGTCTAGCCATGAGGGCTTGCATGCACAAGAATACGCGATTAAGCGTGCAGGC
AAAATGAAATCAGCGGCCAAGCTTTCTTTTTTGCCTCAAATTGATTTGAGCGCTTTTTATGTGTATCTTTCTAACCCCAT
TAAAGTGGATTTTGCTAGTCAAAAACAAGCCGGCGTTCAAAAAGCCACCAACCAGATCCATCAAGGCTTGCAAAATATCC
AAAATGGTGTCCCTCCCCAACTCATCACGCCTCAAATCCAAGCGGGCATACAAGGGGTGATGCAAGGCTTTGGGGCGTTG
GGTAGCGCTTTAGGCACTCCTTTTTTATTTTCCAAGCAAAATGTTGTGCTTGGGGCTTTGAGCATTATTTACCCTATTTA
TATGGGTGGGACACGATTCACGATGGTGCGCATTGCGGATTTGATGCAAAAGGACGCCAATGAAGTGTATCGCTTGAAAA
AGCTTTCCACTTTTCAAGAGCTCGTGGGCGTGTATTATGGCATGGTGCTAAACACTGAAGTGGCTGAAACTTTAGAAGAG
GTAGAAAAAGGCCATTACAAGCATTTCCAAAACGCTTTAAAAATGCAACAAGCAGGGCAAATCGCTAGGGTAGAAACCTT
GAGCGCTCAAGTGGCTTACGATAAGGCTCATATCGCTAGCGTTAAGGCTAAAGATGTGTTAGAGATTTCACAACTCTCGT
TTAATTCTATTTTATCCAGCAAAGACGATTTATCGCCCTCTAGTAAATTAGAGATCCACACGGAAAAAAATTTACCCGAT
TTGAGCTTTTTTGTTTCTTCTACGCTCAATTCTTACCCAGCTTTAAAAACTTTAGAAAATCAGGTTCAAATCTCTAAAGA
AAACACGAAATTACAGATCGCTAAATTCTTACCTCAAGTGCATTTTTTTGGCTCTTATATCATGAAGCAAAACAATTCGG
TGTTTGAAGACATGATCCCTAACTGGTTTGTGGGTGTGGCAGGGCGCATGCCTATCCTCTCCCCTACAGGGCGCATCCAA
AAATACCAAGCGAGCAAATTAGCTGAGTTGCAAGCCAGTAGCGAGAAAATCCAAGCCAGAAAAAACATGGAATTGTTAGT
GAATAAGACTTATAAAGAGACGCTCTCTTATTTGAAAGAATACGAGAGCTTGCTTTCTAGCGTGGAATTGGCTAAGGAAA
ACCTCAAACTCCAAGAGCAGGCTTTTTTGCAAGGCTTAAGCACGAACGCGCAAGTCATTGACGCAAGGAATACGCTTTCT
TCTATTAGCGTGGAGCAAAAGAGCGTGGCTTATAAATACATCGTTTCATTAGCGAATTTAATGGCATTAAGCGATCACAT
TGATTTATTTTATGAATTTGTTTATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ACCATCATTTCGCATGGGTATGCCTTTGAAGTTTTAAGCGTGGATGGAGCGAGGATAAAACGCTTGAAAGCGATTAAAGA
AAATAAGGAAGAAGATTAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAGGAAAAACCATGTTAAGAAAAATCATGTTAAACAGCAAGTTGGATCAAAAGAAAGCCGCTTTTATAGGGGGTGGGGTT
TTATTGTTGGGGCTTATCGT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Outer Membrane Protein; Outer Membrane Efflux Family Protein; Outer Membrane Efflux Protein Domain Protein; Type I Secretion Outer Membrane Protein

Number of amino acids: Translated: 515; Mature: 515

Protein sequence:

>515_residues
MKKTILFALSLLCGSFLNAVDENPKNIQEKTKPSSLSLAENNAPFNNHNAQKLSLKNAWGRVLSSHEGLHAQEYAIKRAG
KMKSAAKLSFLPQIDLSAFYVYLSNPIKVDFASQKQAGVQKATNQIHQGLQNIQNGVPPQLITPQIQAGIQGVMQGFGAL
GSALGTPFLFSKQNVVLGALSIIYPIYMGGTRFTMVRIADLMQKDANEVYRLKKLSTFQELVGVYYGMVLNTEVAETLEE
VEKGHYKHFQNALKMQQAGQIARVETLSAQVAYDKAHIASVKAKDVLEISQLSFNSILSSKDDLSPSSKLEIHTEKNLPD
LSFFVSSTLNSYPALKTLENQVQISKENTKLQIAKFLPQVHFFGSYIMKQNNSVFEDMIPNWFVGVAGRMPILSPTGRIQ
KYQASKLAELQASSEKIQARKNMELLVNKTYKETLSYLKEYESLLSSVELAKENLKLQEQAFLQGLSTNAQVIDARNTLS
SISVEQKSVAYKYIVSLANLMALSDHIDLFYEFVY

Sequences:

>Translated_515_residues
MKKTILFALSLLCGSFLNAVDENPKNIQEKTKPSSLSLAENNAPFNNHNAQKLSLKNAWGRVLSSHEGLHAQEYAIKRAG
KMKSAAKLSFLPQIDLSAFYVYLSNPIKVDFASQKQAGVQKATNQIHQGLQNIQNGVPPQLITPQIQAGIQGVMQGFGAL
GSALGTPFLFSKQNVVLGALSIIYPIYMGGTRFTMVRIADLMQKDANEVYRLKKLSTFQELVGVYYGMVLNTEVAETLEE
VEKGHYKHFQNALKMQQAGQIARVETLSAQVAYDKAHIASVKAKDVLEISQLSFNSILSSKDDLSPSSKLEIHTEKNLPD
LSFFVSSTLNSYPALKTLENQVQISKENTKLQIAKFLPQVHFFGSYIMKQNNSVFEDMIPNWFVGVAGRMPILSPTGRIQ
KYQASKLAELQASSEKIQARKNMELLVNKTYKETLSYLKEYESLLSSVELAKENLKLQEQAFLQGLSTNAQVIDARNTLS
SISVEQKSVAYKYIVSLANLMALSDHIDLFYEFVY
>Mature_515_residues
MKKTILFALSLLCGSFLNAVDENPKNIQEKTKPSSLSLAENNAPFNNHNAQKLSLKNAWGRVLSSHEGLHAQEYAIKRAG
KMKSAAKLSFLPQIDLSAFYVYLSNPIKVDFASQKQAGVQKATNQIHQGLQNIQNGVPPQLITPQIQAGIQGVMQGFGAL
GSALGTPFLFSKQNVVLGALSIIYPIYMGGTRFTMVRIADLMQKDANEVYRLKKLSTFQELVGVYYGMVLNTEVAETLEE
VEKGHYKHFQNALKMQQAGQIARVETLSAQVAYDKAHIASVKAKDVLEISQLSFNSILSSKDDLSPSSKLEIHTEKNLPD
LSFFVSSTLNSYPALKTLENQVQISKENTKLQIAKFLPQVHFFGSYIMKQNNSVFEDMIPNWFVGVAGRMPILSPTGRIQ
KYQASKLAELQASSEKIQARKNMELLVNKTYKETLSYLKEYESLLSSVELAKENLKLQEQAFLQGLSTNAQVIDARNTLS
SISVEQKSVAYKYIVSLANLMALSDHIDLFYEFVY

Specific function: Unknown

COG id: COG1538

COG function: function code MU; Outer membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 57375; Mature: 57375

Theoretical pI: Translated: 9.59; Mature: 9.59

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
2.5 %Met     (Translated Protein)
2.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
2.5 %Met     (Mature Protein)
2.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKKTILFALSLLCGSFLNAVDENPKNIQEKTKPSSLSLAENNAPFNNHNAQKLSLKNAWG
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH
RVLSSHEGLHAQEYAIKRAGKMKSAAKLSFLPQIDLSAFYVYLSNPIKVDFASQKQAGVQ
HHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCCCHHEEEEEECCCEEEEECCHHHHHHH
KATNQIHQGLQNIQNGVPPQLITPQIQAGIQGVMQGFGALGSALGTPFLFSKQNVVLGAL
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCHHHHHH
SIIYPIYMGGTRFTMVRIADLMQKDANEVYRLKKLSTFQELVGVYYGMVLNTEVAETLEE
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VEKGHYKHFQNALKMQQAGQIARVETLSAQVAYDKAHIASVKAKDVLEISQLSFNSILSS
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCC
KDDLSPSSKLEIHTEKNLPDLSFFVSSTLNSYPALKTLENQVQISKENTKLQIAKFLPQV
CCCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHH
HFFGSYIMKQNNSVFEDMIPNWFVGVAGRMPILSPTGRIQKYQASKLAELQASSEKIQAR
HHHHHHHHHCCCCHHHHHCCHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KNMELLVNKTYKETLSYLKEYESLLSSVELAKENLKLQEQAFLQGLSTNAQVIDARNTLS
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHHHHH
SISVEQKSVAYKYIVSLANLMALSDHIDLFYEFVY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MKKTILFALSLLCGSFLNAVDENPKNIQEKTKPSSLSLAENNAPFNNHNAQKLSLKNAWG
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH
RVLSSHEGLHAQEYAIKRAGKMKSAAKLSFLPQIDLSAFYVYLSNPIKVDFASQKQAGVQ
HHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCCCHHEEEEEECCCEEEEECCHHHHHHH
KATNQIHQGLQNIQNGVPPQLITPQIQAGIQGVMQGFGALGSALGTPFLFSKQNVVLGAL
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCHHHHHH
SIIYPIYMGGTRFTMVRIADLMQKDANEVYRLKKLSTFQELVGVYYGMVLNTEVAETLEE
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VEKGHYKHFQNALKMQQAGQIARVETLSAQVAYDKAHIASVKAKDVLEISQLSFNSILSS
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCC
KDDLSPSSKLEIHTEKNLPDLSFFVSSTLNSYPALKTLENQVQISKENTKLQIAKFLPQV
CCCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHH
HFFGSYIMKQNNSVFEDMIPNWFVGVAGRMPILSPTGRIQKYQASKLAELQASSEKIQAR
HHHHHHHHHCCCCHHHHHCCHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KNMELLVNKTYKETLSYLKEYESLLSSVELAKENLKLQEQAFLQGLSTNAQVIDARNTLS
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHHHHH
SISVEQKSVAYKYIVSLANLMALSDHIDLFYEFVY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA