Definition Helicobacter acinonychis str. Sheeba chromosome, complete genome.
Accession NC_008229
Length 1,553,927

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The map label for this gene is dld [C]

Identifier: 109948080

GI number: 109948080

Start: 1392256

End: 1395096

Strand: Reverse

Name: dld [C]

Synonym: Hac_1598

Alternate gene names: 109948080

Gene position: 1395096-1392256 (Counterclockwise)

Preceding gene: 109948116

Following gene: 109948079

Centisome position: 89.78

GC content: 37.59

Gene sequence:

>2841_bases
GTGGAAGAAAATTACCATGCTTTTTTTATTGAAGCGAGCAAATTTTTAAGCGAACGGATTTTTAAGGACTACTTACGCCG
TTTGGCTTATGGCATTGATGCGTCATGCTATCGTTATATCCCTAAAATAGTCGTTTGGGTGAAAAATGAAGAAGAAGTTC
AAAAACTTTGCATTTTAGCTCAAAAACACAGCGTTACTTTGACTTTTAGAGCGGCTGGGAGCTCCTTATCAGGGCAGGCG
AGTTGCGATGGGGTGCTAGTGGTGGCTACGCATTTTTTTAAAGACGCTCACATTTTAGATAACGCTAAAAGCATTAAGCT
AGCATGCGGGGTGATAGGGAGCAATGCGAACGCTTTATTAAAACCTTATCGTAAAAAAATAGGCCCCGATCCTGCTACGA
TAAACACCGCTATGATAGGGGGGATTGTCGCTAATAACGCTAGTGGGATGTGTTGTGGGGTGGAGCAAAATAGCTATAAA
ACCCTAAAATCCTTAAGAGTCATTTTAATGGATGGCACGCTTTTAGACACGGCCAATCAAGAGAGCGTTGAGAGTTTCAA
AAACACGCACAAAAATTTGATTGAAGGGGTTTTAAACTTAAGAAAAGAAATTTTAAAAGACCGAGTATTGCACGCTCTCA
TTAAGAAAAAATACGAGATCAAAAACACCACCGGTTATAGTTTAAACGCTTTGATTGATTTTGAAGATCCTATTGAAATC
GTTAGCCATTTATTCATAGGCTCTGAGGGGACTTTAGGCTTTATTTCAAGCGTGGAATTAGAATGCGTGAAAGACTACGC
TTATAAAACTTGCGCGTTATTGTTTTATGAAAATTTAGAGCAATGCACCAAAGCCGCGCAAATTTTAGCCGCCTTAAAAA
CCAAACAACCTGAAATGATTTCTTCAGCAGAGCTTATGGATTATGCATCCTTAAAGAGCGTGAAAAACTTGGAGGGCATG
CCTAGCGTGATTTTAGAAATCAAAGAGCCTAACGCATGCTTACTCATTCAAAGCGAGAGCGATGAAATAGCCATTTTAGA
AAACAACATGCAAACGATTTTAGACGCCTTGAATACCATCCCTGTCGTTTTAGACACTCAGATTAGTAATGATCCTAGCA
TTTATCAATCGTGGTGGAAGATCAGAAAAGGCATTTTCCCCATCGCAGCATCTCAAAGAAAAAGCCAAAGTTCTGTAATC
ATTGAAGATGTGTGCTTTAGTCAAGAGGATTTTGTAGAAGGGACAAAAGCGATTGAAGGGCTTTTAAAAAAACATGGCTT
TAAGGATAATAGCATTATTTTTGGGCATGCGTTAAGTGGGAATTTGCATTTTGTCGTTACGCCGATTTTAGAAAATGAAA
CCGAAAGGAAAGCGTTTGAAAAACTGGCTTATGACATGTTTTTAATGGTGAGCAAAAGTTCTGGCTCTATTAAAGCCGAA
CATGGCACAGGCAGGATGGTAGCCCCTTTTGTAGAAATGGAATGGGGAGAAAAAGCTTATAAAATCCATAAGCAAATCAA
AGCGTTGTTTGATCCTAAGGGTATTTTGAACCCTGATGTGATCATTACTGATGATAAAGAAATCCACACTAAAAATTTAA
AAAGCATTTACCCTATTGAAGAGCATTTGGACATGTGTATGGAATGCGGGTTTTGTGAAAGGATTTGCCCTAGTAAAGAC
TTGTCTTTAACGCCACGACAACGCATCGTCATTCACAGAGAGATAGAGCGTTTAAAAGAAAGAGCAAATCAAGGCTATAA
TGAAGAGCAAGCTTTATTAGATGAGCTTTTAAAAGAGTCTGAATATTTAGCACACACAACTTGTGCGGTGTGTCATATGT
GCTCTACTTTATGCCCTTTAGGAATTGATACTGGAAGCATCGCCTTAAATCATTATCAAACAAACCCTAAAGGTGAAAAG
ATTGCTTCAAAGATTCTTAATCACATGCAAACAACCACAAGCACGGCTCGTTTTTCTTTAAAAAGCGCTGTCGTGGTTCA
AAACCTCATAGGCTCTAATAATTTAGTAAGCCTGACTAAAAAGATTAAAAAATTCATCAAGCCTTTTCCTAAAGCCTTTC
ATTACATGCCTAAAAACAACGCCTATGCATTAGAAAATAAAACGCTTAAGAGCGGAGAAAAAGTCATTTATTTCAGCACC
TGTATCAACCGCTCGTTCGCTCCATCAACAAGAATGGCGGATAAACGAAGCGTTCAAGAAGTGTTTGAATCCTTATGCCA
AAAAGCCAAAGTTTCTGTAATGTATCCTAATGAATTGAATGCACTTTGTTGCGGGAAAGCTTTTATCAATTACACCCAAT
TGACTGAGCAAAAGAATGAAAAAAACCATGCGATTTTTTTAAAATTAAGCGATAATGGCAAAATACCGATCGTTTTGGAC
CATAGTGCATGTTCGACGCATTTTTTCAAACAAATGAAAGCTTATAAGAATTTAAAAGTCTATGATTTGAGCGTTTATAT
TGAAGAAGTTTTAAGCCCAAAATTAAAATTTAACCCCATTAATGAAGACATAGGCTTATACACGATGTGTGCTTTAAAGC
TAGAAAATAAAGAAGAGTTGTTATTGAATTTGGCTAAAAAATGCACTTTGGGTGAGATTGTTATCCATAAAGAGACGGGT
TGTTGCGCTTTTGCGGGGAATAAGGGCTTTTTTACCCCTGAACTAAACGAGAGTGCTTTGAATGGCTTTAAAACATTTTA
TCAATCTTATAATCTTAAAAGGGGTTTTTCAACTTCTAGCACTTGCGAGATTGGCTTGAGTGAAAAAACCCAATTTTCTT
GGCAACATATCGCTTATTTAGTGGATGCTTGCACGCTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCTAAACTGATTGCATAATCTTCAAGCATGTTTATCCTTAATTTTTAAAGTAAGGTTATGTTACAATGATTTGATAAATA
GGAATGTTTAGGGAGCGGTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATGGTGTATAATTTTAAAGATTTTCTTTAAAAGGTAAAGGCATTGGATAACACTCTCAAACATCTTGCCATTATTATGGA
TGGTAATGGCAGGTGGGCTA

Product: D-lactate dehydrogenase

Products: pyruvate; ferrocytochrome c

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 946; Mature: 946

Protein sequence:

>946_residues
MEENYHAFFIEASKFLSERIFKDYLRRLAYGIDASCYRYIPKIVVWVKNEEEVQKLCILAQKHSVTLTFRAAGSSLSGQA
SCDGVLVVATHFFKDAHILDNAKSIKLACGVIGSNANALLKPYRKKIGPDPATINTAMIGGIVANNASGMCCGVEQNSYK
TLKSLRVILMDGTLLDTANQESVESFKNTHKNLIEGVLNLRKEILKDRVLHALIKKKYEIKNTTGYSLNALIDFEDPIEI
VSHLFIGSEGTLGFISSVELECVKDYAYKTCALLFYENLEQCTKAAQILAALKTKQPEMISSAELMDYASLKSVKNLEGM
PSVILEIKEPNACLLIQSESDEIAILENNMQTILDALNTIPVVLDTQISNDPSIYQSWWKIRKGIFPIAASQRKSQSSVI
IEDVCFSQEDFVEGTKAIEGLLKKHGFKDNSIIFGHALSGNLHFVVTPILENETERKAFEKLAYDMFLMVSKSSGSIKAE
HGTGRMVAPFVEMEWGEKAYKIHKQIKALFDPKGILNPDVIITDDKEIHTKNLKSIYPIEEHLDMCMECGFCERICPSKD
LSLTPRQRIVIHREIERLKERANQGYNEEQALLDELLKESEYLAHTTCAVCHMCSTLCPLGIDTGSIALNHYQTNPKGEK
IASKILNHMQTTTSTARFSLKSAVVVQNLIGSNNLVSLTKKIKKFIKPFPKAFHYMPKNNAYALENKTLKSGEKVIYFST
CINRSFAPSTRMADKRSVQEVFESLCQKAKVSVMYPNELNALCCGKAFINYTQLTEQKNEKNHAIFLKLSDNGKIPIVLD
HSACSTHFFKQMKAYKNLKVYDLSVYIEEVLSPKLKFNPINEDIGLYTMCALKLENKEELLLNLAKKCTLGEIVIHKETG
CCAFAGNKGFFTPELNESALNGFKTFYQSYNLKRGFSTSSTCEIGLSEKTQFSWQHIAYLVDACTL

Sequences:

>Translated_946_residues
MEENYHAFFIEASKFLSERIFKDYLRRLAYGIDASCYRYIPKIVVWVKNEEEVQKLCILAQKHSVTLTFRAAGSSLSGQA
SCDGVLVVATHFFKDAHILDNAKSIKLACGVIGSNANALLKPYRKKIGPDPATINTAMIGGIVANNASGMCCGVEQNSYK
TLKSLRVILMDGTLLDTANQESVESFKNTHKNLIEGVLNLRKEILKDRVLHALIKKKYEIKNTTGYSLNALIDFEDPIEI
VSHLFIGSEGTLGFISSVELECVKDYAYKTCALLFYENLEQCTKAAQILAALKTKQPEMISSAELMDYASLKSVKNLEGM
PSVILEIKEPNACLLIQSESDEIAILENNMQTILDALNTIPVVLDTQISNDPSIYQSWWKIRKGIFPIAASQRKSQSSVI
IEDVCFSQEDFVEGTKAIEGLLKKHGFKDNSIIFGHALSGNLHFVVTPILENETERKAFEKLAYDMFLMVSKSSGSIKAE
HGTGRMVAPFVEMEWGEKAYKIHKQIKALFDPKGILNPDVIITDDKEIHTKNLKSIYPIEEHLDMCMECGFCERICPSKD
LSLTPRQRIVIHREIERLKERANQGYNEEQALLDELLKESEYLAHTTCAVCHMCSTLCPLGIDTGSIALNHYQTNPKGEK
IASKILNHMQTTTSTARFSLKSAVVVQNLIGSNNLVSLTKKIKKFIKPFPKAFHYMPKNNAYALENKTLKSGEKVIYFST
CINRSFAPSTRMADKRSVQEVFESLCQKAKVSVMYPNELNALCCGKAFINYTQLTEQKNEKNHAIFLKLSDNGKIPIVLD
HSACSTHFFKQMKAYKNLKVYDLSVYIEEVLSPKLKFNPINEDIGLYTMCALKLENKEELLLNLAKKCTLGEIVIHKETG
CCAFAGNKGFFTPELNESALNGFKTFYQSYNLKRGFSTSSTCEIGLSEKTQFSWQHIAYLVDACTL
>Mature_946_residues
MEENYHAFFIEASKFLSERIFKDYLRRLAYGIDASCYRYIPKIVVWVKNEEEVQKLCILAQKHSVTLTFRAAGSSLSGQA
SCDGVLVVATHFFKDAHILDNAKSIKLACGVIGSNANALLKPYRKKIGPDPATINTAMIGGIVANNASGMCCGVEQNSYK
TLKSLRVILMDGTLLDTANQESVESFKNTHKNLIEGVLNLRKEILKDRVLHALIKKKYEIKNTTGYSLNALIDFEDPIEI
VSHLFIGSEGTLGFISSVELECVKDYAYKTCALLFYENLEQCTKAAQILAALKTKQPEMISSAELMDYASLKSVKNLEGM
PSVILEIKEPNACLLIQSESDEIAILENNMQTILDALNTIPVVLDTQISNDPSIYQSWWKIRKGIFPIAASQRKSQSSVI
IEDVCFSQEDFVEGTKAIEGLLKKHGFKDNSIIFGHALSGNLHFVVTPILENETERKAFEKLAYDMFLMVSKSSGSIKAE
HGTGRMVAPFVEMEWGEKAYKIHKQIKALFDPKGILNPDVIITDDKEIHTKNLKSIYPIEEHLDMCMECGFCERICPSKD
LSLTPRQRIVIHREIERLKERANQGYNEEQALLDELLKESEYLAHTTCAVCHMCSTLCPLGIDTGSIALNHYQTNPKGEK
IASKILNHMQTTTSTARFSLKSAVVVQNLIGSNNLVSLTKKIKKFIKPFPKAFHYMPKNNAYALENKTLKSGEKVIYFST
CINRSFAPSTRMADKRSVQEVFESLCQKAKVSVMYPNELNALCCGKAFINYTQLTEQKNEKNHAIFLKLSDNGKIPIVLD
HSACSTHFFKQMKAYKNLKVYDLSVYIEEVLSPKLKFNPINEDIGLYTMCALKLENKEELLLNLAKKCTLGEIVIHKETG
CCAFAGNKGFFTPELNESALNGFKTFYQSYNLKRGFSTSSTCEIGLSEKTQFSWQHIAYLVDACTL

Specific function: Unknown

COG id: COG0277

COG function: function code C; FAD/FMN-containing dehydrogenases

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasm [C]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To mammalian alkyldihydroxyacetonephosphate synthases, to yeast AIP2 and DLD1 and to E.coli ygcU [H]

Homologues:

Organism=Homo sapiens, GI119964728, Length=387, Percent_Identity=25.8397932816537, Blast_Score=84, Evalue=9e-16,
Organism=Escherichia coli, GI1787977, Length=666, Percent_Identity=22.2222222222222, Blast_Score=132, Evalue=1e-31,
Organism=Caenorhabditis elegans, GI17534361, Length=280, Percent_Identity=30, Blast_Score=104, Evalue=2e-22,
Organism=Caenorhabditis elegans, GI71992373, Length=499, Percent_Identity=20.6412825651303, Blast_Score=83, Evalue=6e-16,
Organism=Caenorhabditis elegans, GI71992392, Length=402, Percent_Identity=21.1442786069652, Blast_Score=78, Evalue=2e-14,
Organism=Caenorhabditis elegans, GI71992381, Length=404, Percent_Identity=21.039603960396, Blast_Score=78, Evalue=3e-14,
Organism=Saccharomyces cerevisiae, GI6320023, Length=421, Percent_Identity=23.9904988123515, Blast_Score=94, Evalue=8e-20,
Organism=Saccharomyces cerevisiae, GI6320027, Length=508, Percent_Identity=23.0314960629921, Blast_Score=87, Evalue=1e-17,
Organism=Saccharomyces cerevisiae, GI6320764, Length=423, Percent_Identity=21.2765957446809, Blast_Score=74, Evalue=1e-13,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR017896
- InterPro:   IPR017900
- InterPro:   IPR016166
- InterPro:   IPR016167
- InterPro:   IPR016164
- InterPro:   IPR016168
- InterPro:   IPR004113
- InterPro:   IPR012285
- InterPro:   IPR009051
- InterPro:   IPR006094 [H]

Pfam domain/function: PF02913 FAD-oxidase_C; PF01565 FAD_binding_4 [H]

EC number: 1.1.2.4

Molecular weight: Translated: 106180; Mature: 106180

Theoretical pI: Translated: 7.86; Mature: 7.86

Prosite motif: PS00198 4FE4S_FERREDOXIN

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

3.2 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
5.4 %Cys+Met (Translated Protein)
3.2 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
5.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MEENYHAFFIEASKFLSERIFKDYLRRLAYGIDASCYRYIPKIVVWVKNEEEVQKLCILA
CCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHH
QKHSVTLTFRAAGSSLSGQASCDGVLVVATHFFKDAHILDNAKSIKLACGVIGSNANALL
CCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEHHHHCCHHHHCCCCEEEEEEEEECCCCHHHH
KPYRKKIGPDPATINTAMIGGIVANNASGMCCGVEQNSYKTLKSLRVILMDGTLLDTANQ
HHHHHHCCCCCCEEHHHHHCCEEECCCCCEEECCCCCHHHHHHHEEEEEECCEEECCCCH
ESVESFKNTHKNLIEGVLNLRKEILKDRVLHALIKKKYEIKNTTGYSLNALIDFEDPIEI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCHHHH
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HHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCEEEEEECCCCCEEEEECCHHHHHHHHCCC
PVVLDTQISNDPSIYQSWWKIRKGIFPIAASQRKSQSSVIIEDVCFSQEDFVEGTKAIEG
CEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCHHCCCCEEEEEEE
CINRSFAPSTRMADKRSVQEVFESLCQKAKVSVMYPNELNALCCGKAFINYTQLTEQKNE
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
KNHAIFLKLSDNGKIPIVLDHSACSTHFFKQMKAYKNLKVYDLSVYIEEVLSPKLKFNPI
CCCEEEEEECCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHCCCEEECCC
NEDIGLYTMCALKLENKEELLLNLAKKCTLGEIVIHKETGCCAFAGNKGFFTPELNESAL
CCCCCEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCEEEEECCCCCCCCCCCHHHH
NGFKTFYQSYNLKRGFSTSSTCEIGLSEKTQFSWQHIAYLVDACTL
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MEENYHAFFIEASKFLSERIFKDYLRRLAYGIDASCYRYIPKIVVWVKNEEEVQKLCILA
CCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHH
QKHSVTLTFRAAGSSLSGQASCDGVLVVATHFFKDAHILDNAKSIKLACGVIGSNANALL
CCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEHHHHCCHHHHCCCCEEEEEEEEECCCCHHHH
KPYRKKIGPDPATINTAMIGGIVANNASGMCCGVEQNSYKTLKSLRVILMDGTLLDTANQ
HHHHHHCCCCCCEEHHHHHCCEEECCCCCEEECCCCCHHHHHHHEEEEEECCEEECCCCH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCHHHH
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HHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
SSAELMDYASLKSVKNLEGMPSVILEIKEPNACLLIQSESDEIAILENNMQTILDALNTI
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCEEEEEECCCCCEEEEECCHHHHHHHHCCC
PVVLDTQISNDPSIYQSWWKIRKGIFPIAASQRKSQSSVIIEDVCFSQEDFVEGTKAIEG
CEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
LLKKHGFKDNSIIFGHALSGNLHFVVTPILENETERKAFEKLAYDMFLMVSKSSGSIKAE
HHHHCCCCCCCEEEEEEECCCEEEEEEEHHCCCHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCEEEE
HGTGRMVAPFVEMEWGEKAYKIHKQIKALFDPKGILNPDVIITDDKEIHTKNLKSIYPIE
CCCCCEEECHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCHHHHCCCCCCCCHH
EHLDMCMECGFCERICPSKDLSLTPRQRIVIHREIERLKERANQGYNEEQALLDELLKES
HHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH
EYLAHTTCAVCHMCSTLCPLGIDTGSIALNHYQTNPKGEKIASKILNHMQTTTSTARFSL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KSAVVVQNLIGSNNLVSLTKKIKKFIKPFPKAFHYMPKNNAYALENKTLKSGEKVIYFST
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCHHCCCCEEEEEEE
CINRSFAPSTRMADKRSVQEVFESLCQKAKVSVMYPNELNALCCGKAFINYTQLTEQKNE
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
KNHAIFLKLSDNGKIPIVLDHSACSTHFFKQMKAYKNLKVYDLSVYIEEVLSPKLKFNPI
CCCEEEEEECCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHCCCEEECCC
NEDIGLYTMCALKLENKEELLLNLAKKCTLGEIVIHKETGCCAFAGNKGFFTPELNESAL
CCCCCEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCEEEEECCCCCCCCCCCHHHH
NGFKTFYQSYNLKRGFSTSSTCEIGLSEKTQFSWQHIAYLVDACTL
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: (R)-lactate; ferricytochrome c

Specific reaction: (R)-lactate + 2 ferricytochrome c = pyruvate + 2 ferrocytochrome c

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800; 10675023 [H]