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The map label for this gene is cstA [H]

Identifier: 109947015

GI number: 109947015

Start: 353235

End: 355298

Strand: Direct

Name: cstA [H]

Synonym: Hac_0409

Alternate gene names: 109947015

Gene position: 353235-355298 (Clockwise)

Preceding gene: 109947009

Following gene: 109947017

Centisome position: 22.73

GC content: 42.44

Gene sequence:

>2064_bases
ATGCAAAAAAGTTTAGTTTCTTTGGCTTGGGTTTTTGTCGCTATTTTAGGGGCGATTTGTTTAGGGGTGCTAGCCCTACA
TAAGGGTGAGAGCATCAACACACTATGGCTTGTAGTAGCGAGCGCTTGTATTTATAGCATAGGCTATCGTTTTTATAGCC
ATTTTATTGCTTATAGGGTGTTAAAGCTAGATGACAACAGAGCCACGCCTGCATGCATAAGAAATGATGGCAAGGACTTT
GTGCCTACGGATAAAGCGATCACTTTTGGGCATCATTTTGCCGCTATTGCTGGGGCTGGCCCTTTAGTAGGTCCGATACT
AGCCGCTCAAATGGGTTACTTGCCCTCTATTTTATGGATTTTGATAGGCTCGGTTTTAGGGGGTTGTGTGCATGATTTTG
TCGTGCTTTTTGCGTCCATTAGGCACGATGGCAAGTCTTTAGGCGAAATGATCAAGCTTGAAATGGGTAAATTCGTAGGA
ATGATCGCCAGTTTAGGCATTTTGGGGATCATGCTTATTATCATTGCGATTTTAGCGATGGTGGTCGTCAAGGCTTTAGC
GCATTCGCCTTGGGGCTTTTTTACGATTGCAATGACTATTCCCATTGCGATTCTTATGGGGATTTACATGCGATTTTTCA
GACCGCATAAGATTTTAGAAGTTTCTGTTATTGGCTTTGTGCTGTTGCTTATAGCGATTTATGCGGGTAAATATGTTTCT
TTAGATCCTAAATTAGCGTCAATCTTCACTTTTGACGCTAGCTCTTTAGCGTGGATGATCATGGGTTATGGTTTTGTGGC
TTCTATTTTGCCGGTATGGTTTTTACTCGCTCCACGAGATTATTTAAGCACTTTTTTAAAAATTGGCGTTATAGGGGTGT
TGGTTGTAGCTATTATTTTTGTCGCTCCACCCTTACAAATCCCTAAAATCACGCCCTTTGTAGATGGCAGTGGACCTGTG
TTTGCAGGAAGTGTGTTCCCTTTCTTGTTTATCACGGTGGCTTGCGGGACAATTAGTGGCTTTCATGCCTTAATTTCTTC
AGGCACGACCCCTAAAATACTCGCTAAAGAAAGCGATGCAAGGCTAGTGGGCTATGGCTCTATGGTGATGGAGAGTATTG
TGGCTCTTATGGCGTTAGTGTGTGCAGGGATTTTGCACCCAGGGCTTTATTTCGCTATCAATTCGCCAGAAGTGAGCATT
GGTAAAGATATAGCTGATGCGGCTTCGGTGATTAGCTCATGGGGTTTTAGCATTAGTGCTGAAGAAATCAATGAAATGAC
CAAAAACATTGGCGAAAGCTCTATTTTGAGCCGCACCGGTGGGGCACCCACTTTTGCGATTGGTTTAGCGATGATCGTGT
ATCACATTTTAGGGGATCCAAGCGTGATGGCGTTTTGGTATCATTTTGCGATTTTGTTTGAAGCTTTATTTATTTTAACC
GCCGTGGATGCAGGCACACGAACCGCTCGCTTTATGATTCAAGATTTGCTCGGTAATGTTTATAAGCCTTTGGGCGATCT
TAGCTCTTATAAGGCTGGGATTTTTGCCACTCTTTTGTGCGTGGTAGGGTGGGGGTATTTCTTGTATCAAGGCACGATTG
ACCCTAAAGGGGGGATTTATACGCTATGGCCTTTATTTGGCGTGAGTAATCAGATGTTAGCGGGCATGGCGTTGTTGTTG
GTTACGGTGGTGTTGTTTAAAATGGGGCGTTTTAAAGGGGCGATGATAAGCGTTTTGCCGGCAGTCTTGATTTTGGCTAT
CACTTTTTATAGCGGTATTTTAAAGGTGATGCCAAAGAGTGATGATAGCGTGCTTAATAATGTTTCGCATGTGGCTCAAA
TGCAAATCATTAAAGAAAAAATAGCGATCACTACCGATGAAAAAGCGCTCAAAACACTCCAAAAATCCTTTTTTAACCAC
ATGATTGATGCAATTTTGTGCGTGTTTTTCATGTTTGTAGCGTTGTTGGTGTTAGTTGTAAGCGTTAGGATTTGTTCAAA
CGCGTATTTTAAAAATAAAATTTATCCACCGCTGGCTGAAACCCCTTATATTAAAGCCACTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAAAAAATCCATGAGCTATCTTTTGCTTCTACTCCAAAGAAAATCTGAATTATAATAAAAAAACGGCTGAAAGCAACAAC
AATCATTAAATGGAGAGGAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATAAAGGGGGTTTAAACCCCCTTATTGCAAACCTATAAAATCTTATAAAGAGCTATAAAATCATTTAAACTTTTGCTATA
TTTGTAACCTTTTTATAACC

Product: carbon starvation protein A

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 687; Mature: 687

Protein sequence:

>687_residues
MQKSLVSLAWVFVAILGAICLGVLALHKGESINTLWLVVASACIYSIGYRFYSHFIAYRVLKLDDNRATPACIRNDGKDF
VPTDKAITFGHHFAAIAGAGPLVGPILAAQMGYLPSILWILIGSVLGGCVHDFVVLFASIRHDGKSLGEMIKLEMGKFVG
MIASLGILGIMLIIIAILAMVVVKALAHSPWGFFTIAMTIPIAILMGIYMRFFRPHKILEVSVIGFVLLLIAIYAGKYVS
LDPKLASIFTFDASSLAWMIMGYGFVASILPVWFLLAPRDYLSTFLKIGVIGVLVVAIIFVAPPLQIPKITPFVDGSGPV
FAGSVFPFLFITVACGTISGFHALISSGTTPKILAKESDARLVGYGSMVMESIVALMALVCAGILHPGLYFAINSPEVSI
GKDIADAASVISSWGFSISAEEINEMTKNIGESSILSRTGGAPTFAIGLAMIVYHILGDPSVMAFWYHFAILFEALFILT
AVDAGTRTARFMIQDLLGNVYKPLGDLSSYKAGIFATLLCVVGWGYFLYQGTIDPKGGIYTLWPLFGVSNQMLAGMALLL
VTVVLFKMGRFKGAMISVLPAVLILAITFYSGILKVMPKSDDSVLNNVSHVAQMQIIKEKIAITTDEKALKTLQKSFFNH
MIDAILCVFFMFVALLVLVVSVRICSNAYFKNKIYPPLAETPYIKAT

Sequences:

>Translated_687_residues
MQKSLVSLAWVFVAILGAICLGVLALHKGESINTLWLVVASACIYSIGYRFYSHFIAYRVLKLDDNRATPACIRNDGKDF
VPTDKAITFGHHFAAIAGAGPLVGPILAAQMGYLPSILWILIGSVLGGCVHDFVVLFASIRHDGKSLGEMIKLEMGKFVG
MIASLGILGIMLIIIAILAMVVVKALAHSPWGFFTIAMTIPIAILMGIYMRFFRPHKILEVSVIGFVLLLIAIYAGKYVS
LDPKLASIFTFDASSLAWMIMGYGFVASILPVWFLLAPRDYLSTFLKIGVIGVLVVAIIFVAPPLQIPKITPFVDGSGPV
FAGSVFPFLFITVACGTISGFHALISSGTTPKILAKESDARLVGYGSMVMESIVALMALVCAGILHPGLYFAINSPEVSI
GKDIADAASVISSWGFSISAEEINEMTKNIGESSILSRTGGAPTFAIGLAMIVYHILGDPSVMAFWYHFAILFEALFILT
AVDAGTRTARFMIQDLLGNVYKPLGDLSSYKAGIFATLLCVVGWGYFLYQGTIDPKGGIYTLWPLFGVSNQMLAGMALLL
VTVVLFKMGRFKGAMISVLPAVLILAITFYSGILKVMPKSDDSVLNNVSHVAQMQIIKEKIAITTDEKALKTLQKSFFNH
MIDAILCVFFMFVALLVLVVSVRICSNAYFKNKIYPPLAETPYIKAT
>Mature_687_residues
MQKSLVSLAWVFVAILGAICLGVLALHKGESINTLWLVVASACIYSIGYRFYSHFIAYRVLKLDDNRATPACIRNDGKDF
VPTDKAITFGHHFAAIAGAGPLVGPILAAQMGYLPSILWILIGSVLGGCVHDFVVLFASIRHDGKSLGEMIKLEMGKFVG
MIASLGILGIMLIIIAILAMVVVKALAHSPWGFFTIAMTIPIAILMGIYMRFFRPHKILEVSVIGFVLLLIAIYAGKYVS
LDPKLASIFTFDASSLAWMIMGYGFVASILPVWFLLAPRDYLSTFLKIGVIGVLVVAIIFVAPPLQIPKITPFVDGSGPV
FAGSVFPFLFITVACGTISGFHALISSGTTPKILAKESDARLVGYGSMVMESIVALMALVCAGILHPGLYFAINSPEVSI
GKDIADAASVISSWGFSISAEEINEMTKNIGESSILSRTGGAPTFAIGLAMIVYHILGDPSVMAFWYHFAILFEALFILT
AVDAGTRTARFMIQDLLGNVYKPLGDLSSYKAGIFATLLCVVGWGYFLYQGTIDPKGGIYTLWPLFGVSNQMLAGMALLL
VTVVLFKMGRFKGAMISVLPAVLILAITFYSGILKVMPKSDDSVLNNVSHVAQMQIIKEKIAITTDEKALKTLQKSFFNH
MIDAILCVFFMFVALLVLVVSVRICSNAYFKNKIYPPLAETPYIKAT

Specific function: Peptide Utilization During Carbon Starvation. [C]

COG id: COG1966

COG function: function code T; Carbon starvation protein, predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the CstA family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786814, Length=688, Percent_Identity=55.0872093023256, Blast_Score=739, Evalue=0.0,
Organism=Escherichia coli, GI87082431, Length=709, Percent_Identity=51.4809590973202, Blast_Score=694, Evalue=0.0,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003706 [H]

Pfam domain/function: PF02554 CstA [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 74316; Mature: 74316

Theoretical pI: Translated: 8.92; Mature: 8.92

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
3.9 %Met     (Translated Protein)
5.2 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
3.9 %Met     (Mature Protein)
5.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MQKSLVSLAWVFVAILGAICLGVLALHKGESINTLWLVVASACIYSIGYRFYSHFIAYRV
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LKLDDNRATPACIRNDGKDFVPTDKAITFGHHFAAIAGAGPLVGPILAAQMGYLPSILWI
HEECCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIGSVLGGCVHDFVVLFASIRHDGKSLGEMIKLEMGKFVGMIASLGILGIMLIIIAILAM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VVVKALAHSPWGFFTIAMTIPIAILMGIYMRFFRPHKILEVSVIGFVLLLIAIYAGKYVS
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE
LDPKLASIFTFDASSLAWMIMGYGFVASILPVWFLLAPRDYLSTFLKIGVIGVLVVAIIF
CCCCHHHHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VAPPLQIPKITPFVDGSGPVFAGSVFPFLFITVACGTISGFHALISSGTTPKILAKESDA
HCCCCCCCCCCCEECCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCC
RLVGYGSMVMESIVALMALVCAGILHPGLYFAINSPEVSIGKDIADAASVISSWGFSISA
CEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCH
EEINEMTKNIGESSILSRTGGAPTFAIGLAMIVYHILGDPSVMAFWYHFAILFEALFILT
HHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AVDAGTRTARFMIQDLLGNVYKPLGDLSSYKAGIFATLLCVVGWGYFLYQGTIDPKGGIY
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCEE
TLWPLFGVSNQMLAGMALLLVTVVLFKMGRFKGAMISVLPAVLILAITFYSGILKVMPKS
EEHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
DDSVLNNVSHVAQMQIIKEKIAITTDEKALKTLQKSFFNHMIDAILCVFFMFVALLVLVV
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SVRICSNAYFKNKIYPPLAETPYIKAT
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MQKSLVSLAWVFVAILGAICLGVLALHKGESINTLWLVVASACIYSIGYRFYSHFIAYRV
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LKLDDNRATPACIRNDGKDFVPTDKAITFGHHFAAIAGAGPLVGPILAAQMGYLPSILWI
HEECCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIGSVLGGCVHDFVVLFASIRHDGKSLGEMIKLEMGKFVGMIASLGILGIMLIIIAILAM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VVVKALAHSPWGFFTIAMTIPIAILMGIYMRFFRPHKILEVSVIGFVLLLIAIYAGKYVS
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE
LDPKLASIFTFDASSLAWMIMGYGFVASILPVWFLLAPRDYLSTFLKIGVIGVLVVAIIF
CCCCHHHHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VAPPLQIPKITPFVDGSGPVFAGSVFPFLFITVACGTISGFHALISSGTTPKILAKESDA
HCCCCCCCCCCCEECCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCC
RLVGYGSMVMESIVALMALVCAGILHPGLYFAINSPEVSIGKDIADAASVISSWGFSISA
CEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCH
EEINEMTKNIGESSILSRTGGAPTFAIGLAMIVYHILGDPSVMAFWYHFAILFEALFILT
HHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AVDAGTRTARFMIQDLLGNVYKPLGDLSSYKAGIFATLLCVVGWGYFLYQGTIDPKGGIY
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCEE
TLWPLFGVSNQMLAGMALLLVTVVLFKMGRFKGAMISVLPAVLILAITFYSGILKVMPKS
EEHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
DDSVLNNVSHVAQMQIIKEKIAITTDEKALKTLQKSFFNHMIDAILCVFFMFVALLVLVV
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SVRICSNAYFKNKIYPPLAETPYIKAT
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9923682 [H]