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The map label for this gene is yoeA [H]

Identifier: 109947001

GI number: 109947001

Start: 337807

End: 339192

Strand: Direct

Name: yoeA [H]

Synonym: Hac_0394

Alternate gene names: 109947001

Gene position: 337807-339192 (Clockwise)

Preceding gene: 109947000

Following gene: 109947002

Centisome position: 21.74

GC content: 38.53

Gene sequence:

>1386_bases
ATGGCCATGCTCAAAAAAAAGATTGATTTGCATAAAGATTCTATTGGGAAGCTCTTTTTTTATTACTTTATCCCTTTAGC
TTTTTCTATGATTTCACTTTCCACTTATTCTATGATAGACGGCATGTTTGTGGGCAAGAAACTGGGTAAAGAAGCTATTG
CAGCGGTCAATATCGCATGGCCTATTTTTCCGGCTTTAATAGCGTATGAATTGCTTTTTGGTTTTGGGGCAGCGAGCATT
GTGGGGTATTTTTTAGGTCAAAATAAAACCCATAGAGCTAGGCTTGTGTTTAGCAGCGTGTTTTATTTTGTCGCCATTAG
CACCTTTATTTTGAGCATGATTTTACTGCCTTTTAGTGAAAATATCGCGCGCCTTTTTGGGAGTAGTGACGCTTTATTAA
GCATGTCTAAACGCTATATTGAAATCATTTTAATGGGTGCGGTTTTTATGGTTTTGCACCCTTTGGCGGATGTTTTTGTG
GTGAATGACAAACGACCGATTTTAGCGATGGTGGCGATGTTGATTGGCTCGTTAGTGAATGTTTTTTTCAACTACTTGTT
TATTTTTGTTTTGGAAGTGGGGGTTCAAGGCAGTGCGATAGCCACGGTGATAGGGCATGCGATAGGCTTTTTAGTCTTAA
TGCAGCATTTTTGGTTTAAAAAAGGGCAGTTGTATTTTATCAAGCGTTTTTCTTTGTCTTCAATCATTTCTTCAACCAAA
AGCGGTGTGCCTCAAAGCACGGCAGAATTTAGTGCCTCTATTATGATTTTATTGTTTAATACCGCTATCATACACACTGC
AGGGGAGAGGTTTGTGAGTATGTATGGGATTATCATGTATAATGCGGTGATCTTTTTCACGACTTTGTTTGCGATTTCTC
AAGGCATCCAACCTATTGCGAGTTTTAGTTATGGGGCTAAAAGTTTAAAGCGCGTCAAAGAGGTGTTTGTTTTTGGTTTG
AAGGTGGCGTTTTGCGTGGGGATTCTTTTCTATGGCGTTTATTATTTCTTAGATGAATTTTTAATCAAGCTTTATTTGCA
ACCAAGCGATCAGGATGCACTTTTTATGCAAGAGACTAAAAGGGCGATGAATATTTATTATACCGGTTATGTTTTTTTAG
GCATGACTTTGTTGTGCGCGGTGTTTTTCCAATCTATTCAGCGCACTAGAAGTTCGTTTATTATCACTATTTCGCACACG
CTAGGGTTTATGGTGGTTTTACTACCGATTTTAAGCTATTTCTATGGGATTGATGGGATTTGGGCGACTTACCCTATCGC
ACAATTTTTGGCGTTTTTGACCGCGTTAGGGGTGACTTATTATGAAATCAAAAAAGGGGTTTTCACCACTTACAAAGAGA
AAAACCCTATCGCTGTGAAAACTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GAAAATCTCTCCTTAAATTGAGCGGTATTTAACTGATAAATTGTCTCTTTCTTTATGTTAAAATAACAAAATTTGTCACA
TTTTTTAAACAACAAGCGAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
CCAATATTAGGGTAAAATTAAGCCATGCATGCAGAATTTTTCACTTTCGCGCTCATTATGCTTTTAATTGTGATAGCCCC
TTATGTTTCTGGGTTCTTTC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 461; Mature: 460

Protein sequence:

>461_residues
MAMLKKKIDLHKDSIGKLFFYYFIPLAFSMISLSTYSMIDGMFVGKKLGKEAIAAVNIAWPIFPALIAYELLFGFGAASI
VGYFLGQNKTHRARLVFSSVFYFVAISTFILSMILLPFSENIARLFGSSDALLSMSKRYIEIILMGAVFMVLHPLADVFV
VNDKRPILAMVAMLIGSLVNVFFNYLFIFVLEVGVQGSAIATVIGHAIGFLVLMQHFWFKKGQLYFIKRFSLSSIISSTK
SGVPQSTAEFSASIMILLFNTAIIHTAGERFVSMYGIIMYNAVIFFTTLFAISQGIQPIASFSYGAKSLKRVKEVFVFGL
KVAFCVGILFYGVYYFLDEFLIKLYLQPSDQDALFMQETKRAMNIYYTGYVFLGMTLLCAVFFQSIQRTRSSFIITISHT
LGFMVVLLPILSYFYGIDGIWATYPIAQFLAFLTALGVTYYEIKKGVFTTYKEKNPIAVKT

Sequences:

>Translated_461_residues
MAMLKKKIDLHKDSIGKLFFYYFIPLAFSMISLSTYSMIDGMFVGKKLGKEAIAAVNIAWPIFPALIAYELLFGFGAASI
VGYFLGQNKTHRARLVFSSVFYFVAISTFILSMILLPFSENIARLFGSSDALLSMSKRYIEIILMGAVFMVLHPLADVFV
VNDKRPILAMVAMLIGSLVNVFFNYLFIFVLEVGVQGSAIATVIGHAIGFLVLMQHFWFKKGQLYFIKRFSLSSIISSTK
SGVPQSTAEFSASIMILLFNTAIIHTAGERFVSMYGIIMYNAVIFFTTLFAISQGIQPIASFSYGAKSLKRVKEVFVFGL
KVAFCVGILFYGVYYFLDEFLIKLYLQPSDQDALFMQETKRAMNIYYTGYVFLGMTLLCAVFFQSIQRTRSSFIITISHT
LGFMVVLLPILSYFYGIDGIWATYPIAQFLAFLTALGVTYYEIKKGVFTTYKEKNPIAVKT
>Mature_460_residues
AMLKKKIDLHKDSIGKLFFYYFIPLAFSMISLSTYSMIDGMFVGKKLGKEAIAAVNIAWPIFPALIAYELLFGFGAASIV
GYFLGQNKTHRARLVFSSVFYFVAISTFILSMILLPFSENIARLFGSSDALLSMSKRYIEIILMGAVFMVLHPLADVFVV
NDKRPILAMVAMLIGSLVNVFFNYLFIFVLEVGVQGSAIATVIGHAIGFLVLMQHFWFKKGQLYFIKRFSLSSIISSTKS
GVPQSTAEFSASIMILLFNTAIIHTAGERFVSMYGIIMYNAVIFFTTLFAISQGIQPIASFSYGAKSLKRVKEVFVFGLK
VAFCVGILFYGVYYFLDEFLIKLYLQPSDQDALFMQETKRAMNIYYTGYVFLGMTLLCAVFFQSIQRTRSSFIITISHTL
GFMVVLLPILSYFYGIDGIWATYPIAQFLAFLTALGVTYYEIKKGVFTTYKEKNPIAVKT

Specific function: Unknown

COG id: COG0534

COG function: function code V; Na+-driven multidrug efflux pump

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the multi antimicrobial extrusion (MATE) (TC 2.A.66.1) family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002528
- InterPro:   IPR015522 [H]

Pfam domain/function: PF01554 MatE [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 51839; Mature: 51707

Theoretical pI: Translated: 9.88; Mature: 9.88

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
4.1 %Met     (Translated Protein)
4.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
3.9 %Met     (Mature Protein)
4.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
AMLKKKIDLHKDSIGKLFFYYFIPLAFSMISLSTYSMIDGMFVGKKLGKEAIAAVNIAW
CHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PIFPALIAYELLFGFGAASIVGYFLGQNKTHRARLVFSSVFYFVAISTFILSMILLPFSE
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NIARLFGSSDALLSMSKRYIEIILMGAVFMVLHPLADVFVVNDKRPILAMVAMLIGSLVN
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHH
VFFNYLFIFVLEVGVQGSAIATVIGHAIGFLVLMQHFWFKKGQLYFIKRFSLSSIISSTK
HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHH
SGVPQSTAEFSASIMILLFNTAIIHTAGERFVSMYGIIMYNAVIFFTTLFAISQGIQPIA
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH
SFSYGAKSLKRVKEVFVFGLKVAFCVGILFYGVYYFLDEFLIKLYLQPSDQDALFMQETK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHH
RAMNIYYTGYVFLGMTLLCAVFFQSIQRTRSSFIITISHTLGFMVVLLPILSYFYGIDGI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
WATYPIAQFLAFLTALGVTYYEIKKGVFTTYKEKNPIAVKT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]