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The map label for this gene is 108563859

Identifier: 108563859

GI number: 108563859

Start: 1490492

End: 1493026

Strand: Direct

Name: 108563859

Synonym: HPAG1_1434

Alternate gene names: NA

Gene position: 1490492-1493026 (Clockwise)

Preceding gene: 108563858

Following gene: 108563860

Centisome position: 93.37

GC content: 39.25

Gene sequence:

>2535_bases
GTGCTGAATGAAGAGCAAAATTCATTAGAAGAAAAAGGGGGCGAAAACAAAAACGAAAAAGAAACCCCCCTAAAGGGCAT
TCATTCTAAAATTCCCTCTTTGAAGCAGGCTTTAGAGCAGACGATTAATAAAATCAAAAGCTCTAAAGAGTTTTTTAAAC
AGATTTTACACAATAAAAAAAAGCTTTATATCGCGCTTGGAATATTGCTTTCACTCATCGCGCTCATTGTGGCTTTGAGT
TTGTTGCTAGGGCATAAAAAAGAAAATAAACAAACTTCTTTACAAACTAATACCATCGCCACCAATAACGAAACGCCTAA
TAACACCAACAACGCTAACAACACACAAGCCGAGGGGCAAATAGAGAATTTAGACTTACCCGATTTAATCGGCAAGGACT
CCCTCAGACGAAGCGATGAGAATCAAGTGGATGCGATGATGAAAAAAGCGAGCCTTTTGTATGAACAAGGGCAAAAAGAT
GAAGCTTTGCATTTGTTTGACAAGGCCGCTTCTTTTTCGCAAGGGATTGCGAGCCATAATTTAGGGGTGATTAAGTTTAA
GGAAAAGGATTTTAATGGGGCGTTGGATTTGTTTGATTCTAGCATCGCTTCTAAAGAAAATGCGAGCGTGAGCGCGATTG
ATGCGTTAGTGAGCGCTTATCATTTGCAAGACGCGGATTTGTATTATCATTATCTAAAAATTGCGAGAGACACTTTGTAT
AAAGACTATAAAAAGTCTTTTTATTCCTACGCTTACGCGCTCAAATCCTATTACGCTGGGGAGTATTTTGAAGCCCTTTC
GCCTTTAATGCACCCTAATTCCAACGCCTTTTTAAAGCCTAACGCGCGCCTAGCGTCTAAATTGTTTTTGATGTTTAAAG
ATGAAACGAACGCTTACAAGCAATTACAAAAAAGCGCAAACGCCCAAGATGAGCTCGCTTTAGGGCTTTTGCAGGCGCGT
TTGGGCCATTACAAGCAGGCTTTGGAGCATTTGCAGCATTATTTGCACAACTACCCTAAAGATTTAAACGCTTTAATGGC
TTTGGAATTGGTGAGTTTGAAAAAAGGCGACACCCTTAAAGCGAGCGAAGCCTTAAAATTAGCCAGCCACACCAAAGAAG
ACACGCTATTAGCCAACTCTTTTTACCCCATCAAGCCCACGATAAACCCTGTTTTTTTGGATAAAGAAAGAGCCAAAGAG
CGTTTTTGGAACACGCAATATTTTGAAGGCAAAAGGGATTTTATCTACCGCTTGCTCTTTTATTACGCCCCTTTTAAGGT
TTTAGACTCTAAAGAAACCTTAGGCGTGATTGAAGAGGGGCTGTTTCTTTTAGACTCTGATGCACAAAAGGATTTAGAGG
GGGCAAGCCTTGCTTTTAAAAGGGGGCGTTTGATGGCGATAGCGGATAAAAACGCGCTTCAAGGGTTGAAAGCGTTAGAA
AACAAGCGCTTAAAAAAAGCCCTTTCTTTTTTTGATTTGTCTTTGAAAAATAGCCCCAATAACGCGCTCCTCCATTATAA
TACGGGCTTGATTTATGCGCAATTGGAAAATTACCACAAAGCCTATTTCCATTTTTTAAGGGCTTTCCATTTGAATTCTG
CGGATTATTTGAGCGCGATTTTTGCAATTTTAGCTTCGCATTTCACCCACGAAGACACCACAGAGTTTTTAAGAGAAATC
ACAGAGAATTTTTATAGTCAGGATTTTTCTAGCCCCACGCAAAAAGCTTTACTCTCTTCACTCATCGCTTATTTAAATTA
CCGCACCAATTGGGATATGGACTGGCTTAAAAACGCCCCTAAAAAGCTCCCTTTTTATTACGCGCTAGAAGCGGTGTTCG
CTAAAGAGAGCAAGGATAAAAAATTGATGGTGCAATCTTTTGGGAATTTAAAAAAAATGCTCCCTAAAGACCTCATCTCT
AATATTTTTTATGAAATCGTCTCGTATTATGATGCGAGCATCCGCCACACTTTAAGCATTTACACCCTTTTAGATTCGCA
TAAAATCAGTTGGGATCAAACCATGCAAGGGCCAATTTTGGGGCGTCATTTCTACACTTACATGGGATTTATGGTCAATG
ATTTGGATCATCAAGAAAGATTATTAGAGCAAAAAATCGCCAGTTTAGAAGAGGGCGAATCCCCTAACGATTGGTTAGAA
AATTTAGCGCTAGTGAGTTTGTTTCAAGGCCAGTATGAAAAAGCGAGCGCGTTGTATCAAAACTTAATTAGCGGGCTTAA
GGATAATGAGACGCGTTTAAAAATCCTAGCGGGTTTGACTTATATCGCGCAAAGTAATTACAATAACGCCGCTTTATGGC
TAGAGCTTGGGAAATTAGATGATCCTAATAATGAAAATATCCGTTACGCTTTAGGGTTGTTGTATCAAAGAAAAGGGGAC
TTGAAATCAGCACTAAACCATTTTTTAGCCATTAAAACCTCTGATTTTTCGTCGCCTTATTTTGATTTTGAAATTGATAC
TAACCTTTTAAAAGAGCGTTTAAACCAAGAAGAAAAGGGCGAGTTTTTAGAATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGTAGGCAGGACGATGGTCGCTTTAATGGAAAACCACCAGCAAGAAGATGGGAGCATCCACATTCCTAAGGCGTTAGAAA
AATACCTTTAAGGATAGTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGGATTTTGAAAAAAGCATTTTAGGCAATTTAAACGGGGTGCAAAAAATCGCTGCAAGCCATATTCAAGGGCCATTGCTC
ATTTTAGCAGGAGCTGGGAG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 844; Mature: 844

Protein sequence:

>844_residues
MLNEEQNSLEEKGGENKNEKETPLKGIHSKIPSLKQALEQTINKIKSSKEFFKQILHNKKKLYIALGILLSLIALIVALS
LLLGHKKENKQTSLQTNTIATNNETPNNTNNANNTQAEGQIENLDLPDLIGKDSLRRSDENQVDAMMKKASLLYEQGQKD
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NLALVSLFQGQYEKASALYQNLISGLKDNETRLKILAGLTYIAQSNYNNAALWLELGKLDDPNNENIRYALGLLYQRKGD
LKSALNHFLAIKTSDFSSPYFDFEIDTNLLKERLNQEEKGEFLE

Sequences:

>Translated_844_residues
MLNEEQNSLEEKGGENKNEKETPLKGIHSKIPSLKQALEQTINKIKSSKEFFKQILHNKKKLYIALGILLSLIALIVALS
LLLGHKKENKQTSLQTNTIATNNETPNNTNNANNTQAEGQIENLDLPDLIGKDSLRRSDENQVDAMMKKASLLYEQGQKD
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LGHYKQALEHLQHYLHNYPKDLNALMALELVSLKKGDTLKASEALKLASHTKEDTLLANSFYPIKPTINPVFLDKERAKE
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LKSALNHFLAIKTSDFSSPYFDFEIDTNLLKERLNQEEKGEFLE
>Mature_844_residues
MLNEEQNSLEEKGGENKNEKETPLKGIHSKIPSLKQALEQTINKIKSSKEFFKQILHNKKKLYIALGILLSLIALIVALS
LLLGHKKENKQTSLQTNTIATNNETPNNTNNANNTQAEGQIENLDLPDLIGKDSLRRSDENQVDAMMKKASLLYEQGQKD
EALHLFDKAASFSQGIASHNLGVIKFKEKDFNGALDLFDSSIASKENASVSAIDALVSAYHLQDADLYYHYLKIARDTLY
KDYKKSFYSYAYALKSYYAGEYFEALSPLMHPNSNAFLKPNARLASKLFLMFKDETNAYKQLQKSANAQDELALGLLQAR
LGHYKQALEHLQHYLHNYPKDLNALMALELVSLKKGDTLKASEALKLASHTKEDTLLANSFYPIKPTINPVFLDKERAKE
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LKSALNHFLAIKTSDFSSPYFDFEIDTNLLKERLNQEEKGEFLE

Specific function: Unknown

COG id: COG0457

COG function: function code R; FOG: TPR repeat

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 96615; Mature: 96615

Theoretical pI: Translated: 7.08; Mature: 7.08

Prosite motif: PS50005 TPR L=RR ; PS50293 TPR_REGION L=RR

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
1.5 %Met     (Translated Protein)
1.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
1.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLNEEQNSLEEKGGENKNEKETPLKGIHSKIPSLKQALEQTINKIKSSKEFFKQILHNKK
CCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
KLYIALGILLSLIALIVALSLLLGHKKENKQTSLQTNTIATNNETPNNTNNANNTQAEGQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHCCEECEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
IENLDLPDLIGKDSLRRSDENQVDAMMKKASLLYEQGQKDEALHLFDKAASFSQGIASHN
CCCCCCCHHHCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
LGVIKFKEKDFNGALDLFDSSIASKENASVSAIDALVSAYHLQDADLYYHYLKIARDTLY
CCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
KDYKKSFYSYAYALKSYYAGEYFEALSPLMHPNSNAFLKPNARLASKLFLMFKDETNAYK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCCHHHHHHHHHEECCCHHHHH
QLQKSANAQDELALGLLQARLGHYKQALEHLQHYLHNYPKDLNALMALELVSLKKGDTLK
HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
ASEALKLASHTKEDTLLANSFYPIKPTINPVFLDKERAKERFWNTQYFEGKRDFIYRLLF
HHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCEEECHHHHHHHHCCCHHCCCHHHHHHHHHH
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HHCCHHHCCCCHHHHHHHHCCEEECCCHHHCCCHHHHHHHCCCEEEEECHHHHHHHHHHH
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HHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YTLLDSHKISWDQTMQGPILGRHFYTYMGFMVNDLDHQERLLEQKIASLEEGESPNDWLE
HHHHHCCCCCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH
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HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCC
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CCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHEEEEECCCCCCCEEEECCHHHHHHHCCHHCCC
EFLE
CCCC
>Mature Secondary Structure
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CCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
KLYIALGILLSLIALIVALSLLLGHKKENKQTSLQTNTIATNNETPNNTNNANNTQAEGQ
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CCCCCCCHHHCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
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QLQKSANAQDELALGLLQARLGHYKQALEHLQHYLHNYPKDLNALMALELVSLKKGDTLK
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HHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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DPNNENIRYALGLLYQRKGDLKSALNHFLAIKTSDFSSPYFDFEIDTNLLKERLNQEEKG
CCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHEEEEECCCCCCCEEEECCHHHHHHHCCHHCCC
EFLE
CCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA