| Definition | Streptococcus pyogenes MGAS10750 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008024 |
| Length | 1,937,111 |
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The map label for this gene is rexA [H]
Identifier: 94994076
GI number: 94994076
Start: 654630
End: 658298
Strand: Direct
Name: rexA [H]
Synonym: MGAS10750_Spy0680
Alternate gene names: 94994076
Gene position: 654630-658298 (Clockwise)
Preceding gene: 94994075
Following gene: 94994077
Centisome position: 33.79
GC content: 36.39
Gene sequence:
>3669_bases GTGCTTTTTAACATTAATGAGAAAGGAGAGCCACTTGTGATTTCTTTTGCCCCATTTTTAAGCCCCGAAGCTATTAAACA TTTACAAGAAAACGAAAGGTGCAGTGATCAGTCTCAAAAACGCACAGCTCAACAAATTGAAGCAATTTATACTAGTGGCC AAAATATACTTGTATCAGCTTCTGCTGGTTCAGGAAAAACCTTTGTAATGGTCGAACGCATACTTGATAAAATTTTGAGA GGTGTTTCAATTGATCGGCTTTTTATCTCAACCTTTACTGTTAAAGCAGCTACAGAACTGCGTGAACGGATTGAAAACAA ATTATACTCACAAATTGCTCAAACTACAGATTTTCAAATGAAAGTTTATTTAACAGAACAATTGCAATCTCTTTGTCAAG CTGATATTGGTACTATGGATGCTTTTGCACAGAAAGTAGTAAGTCGCTATGGTTATAGCATTGGCATTTCATCCCAATTT CGTATCATGCAGGATAAAGCAGAACAAGGTGTTTTAAAGCAAGAGGTGTTTAGCAAACTCTTTAGTGAGTTTATGAATCA AAAAGAGGCACCGGTGTTTAGGGCTCTTGTGAAAAATTTTTCTGGTAACTGTAAAGACACTTCAGCTTTTAGAGAGTTAG TTTATACTTGTTATTCTTTTAGCCAATCGACAGAAAATCCCAAAATATGGTTGCAAGAAAATTTTCTAAGCGCTGCTAAA ACTTACCAAAGACTTGAAGATATCCCGGATCATGATATTGAACTCTTACTTTTGGCAATGCAAGACACTGCAAATCAGCT AAGAGATGTGACTGATATGGAAGATTATGGGCAGCTGACTAAGGCAGGTAGCCGATCTGCTAAATACACTAAACACTTAA CGATCATAGAAAAGTTGTCTGATTGGGTGCGTGATTTTAAATGTTTGTATGGAAAAGCCGGATTGGATCGATTGATCAGA GATGTGACAGGCCTTATACCATCTGGGAATTATGTTACAGTCTCGAAGGTAAAATACCCTGTTTTTAAGACCTTGCATCA AAAATTAAAACAATTTAGGCATTTAGAAACAATTTTAATGTATCAGAAAGACTGTTTTCCCTTATTGGAACAGTTACAAG ATTTTGTGCTTGCGTTTTCAGAAGCTTATTTAGCTGTCAAAATACAAGAAAGTGCTTTTGAATTTTCAGATATTGCACAC TTTGCAATCAAAATTTTAGAGGAAAATACGGATATTCGCCAATCCTATCAGCAACACTATCATGAGGTGATGGTTGATGA ATATCAAGATAACAATCATATGCAAGAGCGACTCCTGACCTTACTATCGAACGGTCATAATCGCTTTATGGTAGGAGATA TCAAACAATCGATCTATCGATTTCGGCAAGCCGATCCTCAGATTTTTAATCAAAAGTTTAGAGACTATCAAAAAAAACCT GAGCAGGGGAAAGTGATTTTACTCAAAGAAAACTTTCGTAGCCAATCAGAGGTGTTAAATGTCAGCAACGCTGTTTTTAG TCACTTAATGGACGAATCAGTAGGAGACGTCTTATACGATGAGCAACATCAGTTAATAGCAGGTAGTCATGCTCAAACAG TCCCCTATCTAGACCGTCGTGCTCAGTTATTGCTATATAATAGCGATAAAGATGATGGCAACGCCCCTTCAGATAGTGAG GGTATTTCATTTAGCGAGGTTACAATTGTTGCCAAAGAAATTATTAAGCTTCACAATGATAAGGGTGTCCCTTTTGAAGA CATTACGTTACTCGTTTCTTCAAGAACAAGAAATGATATCATTTCTCATACATTCAATCAATATGGTATTCCTATAGTAA CAGATGGTGGGCAGCAAAACTATCTTAAATCTGTTGAAGTGATGGTTATGTTAGATACATTACGCACCATTAATAACCCA AGAAATGATTATGCCCTTGTGGCTTTACTGCGCTCACCGATGTTTGCCTTTGATGAGGATGATTTAGCAAGAATAGCACT TCAAAAAGACAATGAGCTAGATAAAGATTGCCTATATGACAAGATACAAAGGGCTGTGATTGGAAGAGGTGCTCATCCTG AATTGATTCACGATACCTTGCTTGGCAAGTTAAATGTTTTTTTAAAGACGTTGAAAAGCTGGCGTCGATACGCTAAGCTA GGGTCGTTGTATGACTTGATTTGGAAAATTTTTAATGATCGTTTTTATTTTGATTTTGTAGCTAGTCAAGCAAAAGCAGA ACAAGCACAAGCTAATCTATACGCATTAGCTCTACGTGCTAATCAGTTTGAAAAATCGGGCTATAAAGGGCTATACCGTT TTATTAAAATGATTGATAAGGTACTTGAGACGCAAAATGACTTAGCTGATGTGGAAGTGGCTGCTCCTAAACAAGCTGTT AATTTAATGACCATTCACAAGTCTAAAGGTTTACAATTTCCGTATGTATTTATCCTTAATTGTGACAAGCGCTTCTCAAT GACAGATATTCATAAATCATTTATTCTGAATCGGCAGCACGGTATCGGTATCAAGTACCTTGCAGATATCAAAGGTTTAC TTGGTGAAACAACACTCAATTCTGTTAAAGTAAGCATGGAAACCTTACCTTATCAATTGAACAAACAAGAGTTGCGCTTA GCAACTTTATCAGAACAAATGCGCTTACTGTATGTTGCTATGACACGAGCTGAAAAAAAAGTTTATTTTATTGGTAAAGC TAGTAAGAGCAAAAGTCAAGAAATCACAGATCCTAAAAAGTTAGACAAACTTTTGCCGCTGGCTTTACGAGAACAGTTAT TGACATTCCAAGATTGGCTATTAGCAATAGCAGATATATTTTCAACTGAAGATCTTTATTTTGATGTTCGCTTTATTGAA GATAGTGATTTGACACAAGAGTCAGTCGGACGACTTCAAACACCACAGTTATTAAATCCAGATGATCTTAAAGATAATCG TCAATCAGAAACAATTGCACGGGCTTTAGATATGTTAGAAGCAGTGTCTCAATTGAATGCCAATTATGAAGCAGCTATTC ATTTGCCAACAGTTCGAACGCCTAGCCAACTTAAGGCAGCTTACGAGCCTTTATTAGAACCCATTGGTGTAGATATTATA GAGAAATCTTCTCGATCGCTATCTGATTTTACTTTGCCACATTTTTCAAAAAAAGCAAAAGTTGAAGCAAGTCATATTGG ATCAGCTCTTCATCAGTTGATGCAGGTGCTCCCTTTGTCAAAACCGATAAATCAACAAACGCTTTTAGACGCTTTAAGAG GAATTGATAGTAACGAAGAGGTAAAAACAGCTCTTGATCTCAAAAAAATAGAGTCGTTCTTTTGTGATACAAGCCTAGGC CAATTTTTTCAGACTTACCAAAAACACTTGTATCGAGAAGCACCATTTGCTATTTTAAAAGTTGACCCTATTAGTCAAGA AGAATATGTCCTACGTGGTATTATAGATGCCTACTTTTTGTTTGATGATCATATTGTATTAGTGGACTATAAAACAGATA AATACAAGCAGCCCATTGAGTTAAAAAAGCGTTACCAACAACAGTTGGAGTTATATGCAGAAGCTCTCACTCAAACGTAT AAACTTCCTGTGACTAAGCGCTATCTTGTTTTAATGGGAGGTGGAAAGCCAGAAATTGTCGAAGTTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTCAAGGAGATCAATTAAAAGCCATTACCCGTTTTGAAGCAGATCTTGACATGGGACAGGCAAGGCGACTAGTGACTCTC CCTGCTAAGGAGAAAAAAGA
Downstream 100 bases:
>100_bases GGTTGTTGTGACACAAGGGTATTTTGCAAATGATAATAGTAGAGTTGAGGATTTTACGAAATGCTTGAAAAGCTATTGAC CTTTGAATAATAATACAATA
Product: ATP-dependent nuclease subunit A
Products: NA
Alternate protein names: ATP-dependent helicase/nuclease AddA [H]
Number of amino acids: Translated: 1222; Mature: 1222
Protein sequence:
>1222_residues MLFNINEKGEPLVISFAPFLSPEAIKHLQENERCSDQSQKRTAQQIEAIYTSGQNILVSASAGSGKTFVMVERILDKILR GVSIDRLFISTFTVKAATELRERIENKLYSQIAQTTDFQMKVYLTEQLQSLCQADIGTMDAFAQKVVSRYGYSIGISSQF RIMQDKAEQGVLKQEVFSKLFSEFMNQKEAPVFRALVKNFSGNCKDTSAFRELVYTCYSFSQSTENPKIWLQENFLSAAK TYQRLEDIPDHDIELLLLAMQDTANQLRDVTDMEDYGQLTKAGSRSAKYTKHLTIIEKLSDWVRDFKCLYGKAGLDRLIR DVTGLIPSGNYVTVSKVKYPVFKTLHQKLKQFRHLETILMYQKDCFPLLEQLQDFVLAFSEAYLAVKIQESAFEFSDIAH FAIKILEENTDIRQSYQQHYHEVMVDEYQDNNHMQERLLTLLSNGHNRFMVGDIKQSIYRFRQADPQIFNQKFRDYQKKP EQGKVILLKENFRSQSEVLNVSNAVFSHLMDESVGDVLYDEQHQLIAGSHAQTVPYLDRRAQLLLYNSDKDDGNAPSDSE GISFSEVTIVAKEIIKLHNDKGVPFEDITLLVSSRTRNDIISHTFNQYGIPIVTDGGQQNYLKSVEVMVMLDTLRTINNP RNDYALVALLRSPMFAFDEDDLARIALQKDNELDKDCLYDKIQRAVIGRGAHPELIHDTLLGKLNVFLKTLKSWRRYAKL GSLYDLIWKIFNDRFYFDFVASQAKAEQAQANLYALALRANQFEKSGYKGLYRFIKMIDKVLETQNDLADVEVAAPKQAV NLMTIHKSKGLQFPYVFILNCDKRFSMTDIHKSFILNRQHGIGIKYLADIKGLLGETTLNSVKVSMETLPYQLNKQELRL ATLSEQMRLLYVAMTRAEKKVYFIGKASKSKSQEITDPKKLDKLLPLALREQLLTFQDWLLAIADIFSTEDLYFDVRFIE DSDLTQESVGRLQTPQLLNPDDLKDNRQSETIARALDMLEAVSQLNANYEAAIHLPTVRTPSQLKAAYEPLLEPIGVDII EKSSRSLSDFTLPHFSKKAKVEASHIGSALHQLMQVLPLSKPINQQTLLDALRGIDSNEEVKTALDLKKIESFFCDTSLG QFFQTYQKHLYREAPFAILKVDPISQEEYVLRGIIDAYFLFDDHIVLVDYKTDKYKQPIELKKRYQQQLELYAEALTQTY KLPVTKRYLVLMGGGKPEIVEV
Sequences:
>Translated_1222_residues MLFNINEKGEPLVISFAPFLSPEAIKHLQENERCSDQSQKRTAQQIEAIYTSGQNILVSASAGSGKTFVMVERILDKILR GVSIDRLFISTFTVKAATELRERIENKLYSQIAQTTDFQMKVYLTEQLQSLCQADIGTMDAFAQKVVSRYGYSIGISSQF RIMQDKAEQGVLKQEVFSKLFSEFMNQKEAPVFRALVKNFSGNCKDTSAFRELVYTCYSFSQSTENPKIWLQENFLSAAK TYQRLEDIPDHDIELLLLAMQDTANQLRDVTDMEDYGQLTKAGSRSAKYTKHLTIIEKLSDWVRDFKCLYGKAGLDRLIR DVTGLIPSGNYVTVSKVKYPVFKTLHQKLKQFRHLETILMYQKDCFPLLEQLQDFVLAFSEAYLAVKIQESAFEFSDIAH FAIKILEENTDIRQSYQQHYHEVMVDEYQDNNHMQERLLTLLSNGHNRFMVGDIKQSIYRFRQADPQIFNQKFRDYQKKP EQGKVILLKENFRSQSEVLNVSNAVFSHLMDESVGDVLYDEQHQLIAGSHAQTVPYLDRRAQLLLYNSDKDDGNAPSDSE GISFSEVTIVAKEIIKLHNDKGVPFEDITLLVSSRTRNDIISHTFNQYGIPIVTDGGQQNYLKSVEVMVMLDTLRTINNP RNDYALVALLRSPMFAFDEDDLARIALQKDNELDKDCLYDKIQRAVIGRGAHPELIHDTLLGKLNVFLKTLKSWRRYAKL GSLYDLIWKIFNDRFYFDFVASQAKAEQAQANLYALALRANQFEKSGYKGLYRFIKMIDKVLETQNDLADVEVAAPKQAV NLMTIHKSKGLQFPYVFILNCDKRFSMTDIHKSFILNRQHGIGIKYLADIKGLLGETTLNSVKVSMETLPYQLNKQELRL ATLSEQMRLLYVAMTRAEKKVYFIGKASKSKSQEITDPKKLDKLLPLALREQLLTFQDWLLAIADIFSTEDLYFDVRFIE DSDLTQESVGRLQTPQLLNPDDLKDNRQSETIARALDMLEAVSQLNANYEAAIHLPTVRTPSQLKAAYEPLLEPIGVDII EKSSRSLSDFTLPHFSKKAKVEASHIGSALHQLMQVLPLSKPINQQTLLDALRGIDSNEEVKTALDLKKIESFFCDTSLG QFFQTYQKHLYREAPFAILKVDPISQEEYVLRGIIDAYFLFDDHIVLVDYKTDKYKQPIELKKRYQQQLELYAEALTQTY KLPVTKRYLVLMGGGKPEIVEV >Mature_1222_residues MLFNINEKGEPLVISFAPFLSPEAIKHLQENERCSDQSQKRTAQQIEAIYTSGQNILVSASAGSGKTFVMVERILDKILR GVSIDRLFISTFTVKAATELRERIENKLYSQIAQTTDFQMKVYLTEQLQSLCQADIGTMDAFAQKVVSRYGYSIGISSQF RIMQDKAEQGVLKQEVFSKLFSEFMNQKEAPVFRALVKNFSGNCKDTSAFRELVYTCYSFSQSTENPKIWLQENFLSAAK TYQRLEDIPDHDIELLLLAMQDTANQLRDVTDMEDYGQLTKAGSRSAKYTKHLTIIEKLSDWVRDFKCLYGKAGLDRLIR DVTGLIPSGNYVTVSKVKYPVFKTLHQKLKQFRHLETILMYQKDCFPLLEQLQDFVLAFSEAYLAVKIQESAFEFSDIAH FAIKILEENTDIRQSYQQHYHEVMVDEYQDNNHMQERLLTLLSNGHNRFMVGDIKQSIYRFRQADPQIFNQKFRDYQKKP EQGKVILLKENFRSQSEVLNVSNAVFSHLMDESVGDVLYDEQHQLIAGSHAQTVPYLDRRAQLLLYNSDKDDGNAPSDSE GISFSEVTIVAKEIIKLHNDKGVPFEDITLLVSSRTRNDIISHTFNQYGIPIVTDGGQQNYLKSVEVMVMLDTLRTINNP RNDYALVALLRSPMFAFDEDDLARIALQKDNELDKDCLYDKIQRAVIGRGAHPELIHDTLLGKLNVFLKTLKSWRRYAKL GSLYDLIWKIFNDRFYFDFVASQAKAEQAQANLYALALRANQFEKSGYKGLYRFIKMIDKVLETQNDLADVEVAAPKQAV NLMTIHKSKGLQFPYVFILNCDKRFSMTDIHKSFILNRQHGIGIKYLADIKGLLGETTLNSVKVSMETLPYQLNKQELRL ATLSEQMRLLYVAMTRAEKKVYFIGKASKSKSQEITDPKKLDKLLPLALREQLLTFQDWLLAIADIFSTEDLYFDVRFIE DSDLTQESVGRLQTPQLLNPDDLKDNRQSETIARALDMLEAVSQLNANYEAAIHLPTVRTPSQLKAAYEPLLEPIGVDII EKSSRSLSDFTLPHFSKKAKVEASHIGSALHQLMQVLPLSKPINQQTLLDALRGIDSNEEVKTALDLKKIESFFCDTSLG QFFQTYQKHLYREAPFAILKVDPISQEEYVLRGIIDAYFLFDDHIVLVDYKTDKYKQPIELKKRYQQQLELYAEALTQTY KLPVTKRYLVLMGGGKPEIVEV
Specific function: The heterodimer acts as both an ATP-dependent DNA helicase and an ATP-dependent, dual-direction single-stranded exonuclease. Recognizes the chi site generating a DNA molecule suitable for the initiation of homologous recombination. The AddA nuclease domai
COG id: COG1074
COG function: function code L; ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit (contains helicase and exonuclease domains)
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasm [C]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 uvrD-like helicase C-terminal domain [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI48994965, Length=549, Percent_Identity=22.040072859745, Blast_Score=96, Evalue=1e-20,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR014152 - InterPro: IPR014017 - InterPro: IPR000212 - InterPro: IPR011604 - InterPro: IPR014016 - InterPro: IPR011335 [H]
Pfam domain/function: PF00580 UvrD-helicase [H]
EC number: =3.6.4.12 [H]
Molecular weight: Translated: 140253; Mature: 140253
Theoretical pI: Translated: 6.65; Mature: 6.65
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 2.0 %Met (Translated Protein) 2.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 2.0 %Met (Mature Protein) 2.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLFNINEKGEPLVISFAPFLSPEAIKHLQENERCSDQSQKRTAQQIEAIYTSGQNILVSA CEECCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEE SAGSGKTFVMVERILDKILRGVSIDRLFISTFTVKAATELRERIENKLYSQIAQTTDFQM CCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE KVYLTEQLQSLCQADIGTMDAFAQKVVSRYGYSIGISSQFRIMQDKAEQGVLKQEVFSKL EEHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHH FSEFMNQKEAPVFRALVKNFSGNCKDTSAFRELVYTCYSFSQSTENPKIWLQENFLSAAK HHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHHHHHHHH TYQRLEDIPDHDIELLLLAMQDTANQLRDVTDMEDYGQLTKAGSRSAKYTKHLTIIEKLS HHHHHHCCCCCCHHEEEEHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHH DWVRDFKCLYGKAGLDRLIRDVTGLIPSGNYVTVSKVKYPVFKTLHQKLKQFRHLETILM HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YQKDCFPLLEQLQDFVLAFSEAYLAVKIQESAFEFSDIAHFAIKILEENTDIRQSYQQHY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH HEVMVDEYQDNNHMQERLLTLLSNGHNRFMVGDIKQSIYRFRQADPQIFNQKFRDYQKKP HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCC EQGKVILLKENFRSQSEVLNVSNAVFSHLMDESVGDVLYDEQHQLIAGSHAQTVPYLDRR CCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCCCCHHHCC AQLLLYNSDKDDGNAPSDSEGISFSEVTIVAKEIIKLHNDKGVPFEDITLLVSSRTRNDI CEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHEECCCCHHHH ISHTFNQYGIPIVTDGGQQNYLKSVEVMVMLDTLRTINNPRNDYALVALLRSPMFAFDED HHHHHHHCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCC DLARIALQKDNELDKDCLYDKIQRAVIGRGAHPELIHDTLLGKLNVFLKTLKSWRRYAKL HHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GSLYDLIWKIFNDRFYFDFVASQAKAEQAQANLYALALRANQFEKSGYKGLYRFIKMIDK HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH VLETQNDLADVEVAAPKQAVNLMTIHKSKGLQFPYVFILNCDKRFSMTDIHKSFILNRQH HHHCCCCCCCEEECCCHHHHHEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHCCCC GIGIKYLADIKGLLGETTLNSVKVSMETLPYQLNKQELRLATLSEQMRLLYVAMTRAEKK CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCE VYFIGKASKSKSQEITDPKKLDKLLPLALREQLLTFQDWLLAIADIFSTEDLYFDVRFIE 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VDPISQEEYVLRGIIDAYFLFDDHIVLVDYKTDKYKQPIELKKRYQQQLELYAEALTQTY ECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KLPVTKRYLVLMGGGKPEIVEV CCCCCEEEEEEEECCCCCEEEC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 11296296 [H]