Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is ktrB [H]

Identifier: 93006659

GI number: 93006659

Start: 2265109

End: 2266869

Strand: Reverse

Name: ktrB [H]

Synonym: Pcryo_1835

Alternate gene names: 93006659

Gene position: 2266869-2265109 (Counterclockwise)

Preceding gene: 93006660

Following gene: 93006658

Centisome position: 74.08

GC content: 41.57

Gene sequence:

>1761_bases
ATGTATGTGGGCATACCGTATCGGTTATTAAATAAATTTATCGTTGTAATAAGCCTTATTGGTGTCGGTGTTGCCTTAAT
TGACAGTGGTTTTACATTGTCCGCATGGTTACAACAAGTGTTTCACCTGTTTTATCTGAGTATAATTTTACTCAGTTTTG
TCACTACGCTAAGACGTTATATACGTCCAAAAATACGCCTGACGGTCAATAAAGTAGCTGTCTTTGATTTGCTGACCAGC
ATTGCCATTTTAATCTTGCTCGTCCTACATTTTACTGAATTGTTTCAATCGGGGTTGTCTACGCCCGCTGATGGTTTTAT
TGCCATCAAGATTGCCGTACTAGTCACTTTCATCCGTGAAATATCAGATAATAATTTTAGTCTTAACCGAGCCTTTTTAA
ACCCCGGTCAATTTTTTATCTTAAGTTTTTTATCAGTGATACTAGTCGGATCATTATTGCTAATGATGCCAAATGCTACA
AATCAACCCATCTCCTTTATAGACGCCTTATTTACCGCGACCAGTGCCGTCTGTGTAACTGGATTGATTGTTGTCGATAC
CGCAACCCATTTCACTACCTTTGGGCAAGTGATTATCCTAGGTCTTATCCAAATTGGCGGTCTTGGCATCCTAACGTTTG
TGACTTATTTTAGTTACTTCTTTAAGGGTGGTATCAGTTACGAGACCCAGCTTAGTATCAGTGAGATGACATATTCGCCA
CGTATGGGCGATATGGTGACAACCTTAAAGTCTATTTTATATGTCACCTTTGGTATTGAGGCACTGGCAGCAATACTGAT
TTATATAAGTGTTTATGATTTGGCAGGCATGAGCATATTTGAGCGTTTATTCTTCTCTGTATTTCATGCCGTTTCGGCAT
TCTGCAATGCTGGATTCTCTACTTTTAGTGCAGGGTTATACGATGAATCACTGCGCTTTAATTATCCTTTACAGCTGATT
ATCAGTATTACCTTTTTATTTGGCGGTATGGGCTTTTTGATTGTCGTTAACTTGCTCCGCTATCTGCGTCACCGTATGCA
AAGAGCGCTGTGTCGTGATGGACAGCGCTATGCCTACCAGCCGTGGCTGTTGAGTATCAATAGTCGGATCACTTTAATCA
CCTCTGGCGCTTTGCTGTTAGTAGGGCTGATTGGGGTGATGATGTTTGAATATCATGGTGTGTTGGCTGAGCACAGCAGC
TGGTATGGCAAGCTGGTAGCGGGGCTTTTTACTGCTGCGACACCGCGAACCGCAGGCTTTAACAATATCGATATGAATGC
CTTGGCTTTTCCAACCATCATGCTGACCATTTTTTTGATGTGGATTGGGGCATCTCCAAACTCTACTGGTGGTGGTATTA
AAACCAGCACCTTTGCCATTGCTTTCCTAAATACGTTGAGTTTGGCACGTGGACAGACCAAAGTTGAAGTGTTCAAACGC
GAAATTGCAGATAACTCAATTCGCCGTGCGTTTTCTGTTATGTGGTTGTCCTTATTGGTCATTGGGCTGGGCGTGACTTT
GATCAGTTATGATCAGCCTGAGCTTGATTTGATTAAAGTGATATTTGAGTGTTTTTCAGCTTATAGCACGGTGGGCTTAA
GCTTGAACCTGACCACGGAGCTGTCTACTTTTAGCAAGCTTGTGGTGTCATTCATTATGTTTGTTGGGCGTGTCAGTATG
CTGACGATTTTTATTGCCTTACTCAAAAATAGACATGAGCGTAACTACCGTTATCCAACGGAAGAGATTACTATTAACTA
A

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAGAGCACATAACTGGTTACGATTATCTAAAACCACGCTTAGTATATGACAGAAAAAAGGAGTATAAGTATTCTGGTTAT
TCCTTTTCTGGACCTAAGCT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CCCGTCCCATCACTACCACTATAGTATAGAGGTGAGTGAAAAGGAGTATTATGAAATTCATTATCGCAGGTTTGGGCAGT
TTTGGCTCTTCGCTTGGTAT

Product: cation transporter

Products: Proton [Cytoplasm]; K (I) [Cytoplasm] [C]

Alternate protein names: K(+)-uptake protein ktrB [H]

Number of amino acids: Translated: 586; Mature: 586

Protein sequence:

>586_residues
MYVGIPYRLLNKFIVVISLIGVGVALIDSGFTLSAWLQQVFHLFYLSIILLSFVTTLRRYIRPKIRLTVNKVAVFDLLTS
IAILILLVLHFTELFQSGLSTPADGFIAIKIAVLVTFIREISDNNFSLNRAFLNPGQFFILSFLSVILVGSLLLMMPNAT
NQPISFIDALFTATSAVCVTGLIVVDTATHFTTFGQVIILGLIQIGGLGILTFVTYFSYFFKGGISYETQLSISEMTYSP
RMGDMVTTLKSILYVTFGIEALAAILIYISVYDLAGMSIFERLFFSVFHAVSAFCNAGFSTFSAGLYDESLRFNYPLQLI
ISITFLFGGMGFLIVVNLLRYLRHRMQRALCRDGQRYAYQPWLLSINSRITLITSGALLLVGLIGVMMFEYHGVLAEHSS
WYGKLVAGLFTAATPRTAGFNNIDMNALAFPTIMLTIFLMWIGASPNSTGGGIKTSTFAIAFLNTLSLARGQTKVEVFKR
EIADNSIRRAFSVMWLSLLVIGLGVTLISYDQPELDLIKVIFECFSAYSTVGLSLNLTTELSTFSKLVVSFIMFVGRVSM
LTIFIALLKNRHERNYRYPTEEITIN

Sequences:

>Translated_586_residues
MYVGIPYRLLNKFIVVISLIGVGVALIDSGFTLSAWLQQVFHLFYLSIILLSFVTTLRRYIRPKIRLTVNKVAVFDLLTS
IAILILLVLHFTELFQSGLSTPADGFIAIKIAVLVTFIREISDNNFSLNRAFLNPGQFFILSFLSVILVGSLLLMMPNAT
NQPISFIDALFTATSAVCVTGLIVVDTATHFTTFGQVIILGLIQIGGLGILTFVTYFSYFFKGGISYETQLSISEMTYSP
RMGDMVTTLKSILYVTFGIEALAAILIYISVYDLAGMSIFERLFFSVFHAVSAFCNAGFSTFSAGLYDESLRFNYPLQLI
ISITFLFGGMGFLIVVNLLRYLRHRMQRALCRDGQRYAYQPWLLSINSRITLITSGALLLVGLIGVMMFEYHGVLAEHSS
WYGKLVAGLFTAATPRTAGFNNIDMNALAFPTIMLTIFLMWIGASPNSTGGGIKTSTFAIAFLNTLSLARGQTKVEVFKR
EIADNSIRRAFSVMWLSLLVIGLGVTLISYDQPELDLIKVIFECFSAYSTVGLSLNLTTELSTFSKLVVSFIMFVGRVSM
LTIFIALLKNRHERNYRYPTEEITIN
>Mature_586_residues
MYVGIPYRLLNKFIVVISLIGVGVALIDSGFTLSAWLQQVFHLFYLSIILLSFVTTLRRYIRPKIRLTVNKVAVFDLLTS
IAILILLVLHFTELFQSGLSTPADGFIAIKIAVLVTFIREISDNNFSLNRAFLNPGQFFILSFLSVILVGSLLLMMPNAT
NQPISFIDALFTATSAVCVTGLIVVDTATHFTTFGQVIILGLIQIGGLGILTFVTYFSYFFKGGISYETQLSISEMTYSP
RMGDMVTTLKSILYVTFGIEALAAILIYISVYDLAGMSIFERLFFSVFHAVSAFCNAGFSTFSAGLYDESLRFNYPLQLI
ISITFLFGGMGFLIVVNLLRYLRHRMQRALCRDGQRYAYQPWLLSINSRITLITSGALLLVGLIGVMMFEYHGVLAEHSS
WYGKLVAGLFTAATPRTAGFNNIDMNALAFPTIMLTIFLMWIGASPNSTGGGIKTSTFAIAFLNTLSLARGQTKVEVFKR
EIADNSIRRAFSVMWLSLLVIGLGVTLISYDQPELDLIKVIFECFSAYSTVGLSLNLTTELSTFSKLVVSFIMFVGRVSM
LTIFIALLKNRHERNYRYPTEEITIN

Specific function: Integral membrane subunit of the KtrAB potassium uptake transporter. The 2 major potassium transporter complexes KtrAB and KtrCD confer resistance to both suddenly imposed and prolonged osmotic stress [H]

COG id: COG0168

COG function: function code P; Trk-type K+ transport systems, membrane components

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the trkH potassium transport family. Ktr (TC 2.A.38.4) subfamily [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003445
- InterPro:   IPR004772 [H]

Pfam domain/function: PF02386 TrkH [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 65208; Mature: 65208

Theoretical pI: Translated: 9.34; Mature: 9.34

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
2.9 %Met     (Translated Protein)
3.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
2.9 %Met     (Mature Protein)
3.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MYVGIPYRLLNKFIVVISLIGVGVALIDSGFTLSAWLQQVFHLFYLSIILLSFVTTLRRY
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IRPKIRLTVNKVAVFDLLTSIAILILLVLHFTELFQSGLSTPADGFIAIKIAVLVTFIRE
HCCHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
ISDNNFSLNRAFLNPGQFFILSFLSVILVGSLLLMMPNATNQPISFIDALFTATSAVCVT
HCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLIVVDTATHFTTFGQVIILGLIQIGGLGILTFVTYFSYFFKGGISYETQLSISEMTYSP
HHHHEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHCCCC
RMGDMVTTLKSILYVTFGIEALAAILIYISVYDLAGMSIFERLFFSVFHAVSAFCNAGFS
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
TFSAGLYDESLRFNYPLQLIISITFLFGGMGFLIVVNLLRYLRHRMQRALCRDGQRYAYQ
HHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECC
PWLLSINSRITLITSGALLLVGLIGVMMFEYHGVLAEHSSWYGKLVAGLFTAATPRTAGF
CEEEEECCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
NNIDMNALAFPTIMLTIFLMWIGASPNSTGGGIKTSTFAIAFLNTLSLARGQTKVEVFKR
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
EIADNSIRRAFSVMWLSLLVIGLGVTLISYDQPELDLIKVIFECFSAYSTVGLSLNLTTE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEHHH
LSTFSKLVVSFIMFVGRVSMLTIFIALLKNRHERNYRYPTEEITIN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEECC
>Mature Secondary Structure
MYVGIPYRLLNKFIVVISLIGVGVALIDSGFTLSAWLQQVFHLFYLSIILLSFVTTLRRY
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IRPKIRLTVNKVAVFDLLTSIAILILLVLHFTELFQSGLSTPADGFIAIKIAVLVTFIRE
HCCHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
ISDNNFSLNRAFLNPGQFFILSFLSVILVGSLLLMMPNATNQPISFIDALFTATSAVCVT
HCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLIVVDTATHFTTFGQVIILGLIQIGGLGILTFVTYFSYFFKGGISYETQLSISEMTYSP
HHHHEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHCCCC
RMGDMVTTLKSILYVTFGIEALAAILIYISVYDLAGMSIFERLFFSVFHAVSAFCNAGFS
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
TFSAGLYDESLRFNYPLQLIISITFLFGGMGFLIVVNLLRYLRHRMQRALCRDGQRYAYQ
HHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECC
PWLLSINSRITLITSGALLLVGLIGVMMFEYHGVLAEHSSWYGKLVAGLFTAATPRTAGF
CEEEEECCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
NNIDMNALAFPTIMLTIFLMWIGASPNSTGGGIKTSTFAIAFLNTLSLARGQTKVEVFKR
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
EIADNSIRRAFSVMWLSLLVIGLGVTLISYDQPELDLIKVIFECFSAYSTVGLSLNLTTE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEHHH
LSTFSKLVVSFIMFVGRVSMLTIFIALLKNRHERNYRYPTEEITIN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: Proton [Periplasm]; K (I) [Periplasm] [C]

Specific reaction: Proton [Periplasm] + K (I) [Periplasm] = Proton [Cytoplasm] + K (I) [Cytoplasm] [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]