| Definition | Psychrobacter cryohalolentis K5 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007969 |
| Length | 3,059,876 |
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The map label for this gene is 93005781
Identifier: 93005781
GI number: 93005781
Start: 1137832
End: 1139898
Strand: Direct
Name: 93005781
Synonym: Pcryo_0953
Alternate gene names: NA
Gene position: 1137832-1139898 (Clockwise)
Preceding gene: 93005774
Following gene: 93005782
Centisome position: 37.19
GC content: 39.48
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases CCTAGATATTTATTACTAAATTGTGCTGACTTTAATTTGGTTATGTTTAGTTTAAATAGTATAACTTTCAATCTTTTATT TGATGGGATAGGTGATATTG
Downstream 100 bases:
>100_bases TTTTGGAGTGTATCGCTAATGATTGGTAATAGGTACGCTAAAAAAACTCGTTCGAAGGATGAGGGTGAGAAGCCTTTTTG GATCTCATTTGCTGACTTAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 688; Mature: 688
Protein sequence:
>688_residues MDWLKVAQFSQGYYVFPAIIFIFIAYISLRFFLNYLSPAKELNNKISQLADELDKLNDNSNLDKDPLDVKFDGNPSLKQA WTSYKKTFHDTYETVDGEAKVAYSRATVPSEVFFTESIVVDIPLKVDFYKHLPGIITGVGIIVTFLGLLIGLLAFDPAGN PDKVQDSLALLLTGVAEAFMASGLAIAAAMVITWREKSWLRQCYAQLQRLNTAIDNAFTADESGEEYLAKLLKSSQANEV NARQLKDSLVNDLKTMMTNLVEENKRNQAAFASQLSDSYAQTSQSMATQIGDSIKDSLQDPLDKIASSVQQVSGDQGSAV QDLMTDVLTAFMSKLETTFGGQMTGMSEMMTQSVTAMREMQLGFSQLITDMQTNSEVSTKTLETQMAKMMEDIHLKQNEM SIQMNEMVENLSAGSAKIGDQGLYAVEQLNSKVSELVSGLGNSMSGLLSNVAEQRIEQDRQISDNQQKLHEQSSVLIDSL GSEIKELITHSKEAVQTHKENIQKLSQVTTDSITGMNSGAERMGLAAEQFTTAGSSLSTVTGKTSELIAQVNTTSTNMTS ASSNLIELIRDYKNSKNSVNLAIETLETLIQQSKSEAGMTSQMLDDMQNMTTALSQVKKEMQEYLAEVSDVLVKSFDSFG TSVESSLNQSLVSFDNTLDQAVKRLATGVEGLGNVVEDLEDLTQRTRR
Sequences:
>Translated_688_residues MDWLKVAQFSQGYYVFPAIIFIFIAYISLRFFLNYLSPAKELNNKISQLADELDKLNDNSNLDKDPLDVKFDGNPSLKQA WTSYKKTFHDTYETVDGEAKVAYSRATVPSEVFFTESIVVDIPLKVDFYKHLPGIITGVGIIVTFLGLLIGLLAFDPAGN PDKVQDSLALLLTGVAEAFMASGLAIAAAMVITWREKSWLRQCYAQLQRLNTAIDNAFTADESGEEYLAKLLKSSQANEV NARQLKDSLVNDLKTMMTNLVEENKRNQAAFASQLSDSYAQTSQSMATQIGDSIKDSLQDPLDKIASSVQQVSGDQGSAV QDLMTDVLTAFMSKLETTFGGQMTGMSEMMTQSVTAMREMQLGFSQLITDMQTNSEVSTKTLETQMAKMMEDIHLKQNEM SIQMNEMVENLSAGSAKIGDQGLYAVEQLNSKVSELVSGLGNSMSGLLSNVAEQRIEQDRQISDNQQKLHEQSSVLIDSL GSEIKELITHSKEAVQTHKENIQKLSQVTTDSITGMNSGAERMGLAAEQFTTAGSSLSTVTGKTSELIAQVNTTSTNMTS ASSNLIELIRDYKNSKNSVNLAIETLETLIQQSKSEAGMTSQMLDDMQNMTTALSQVKKEMQEYLAEVSDVLVKSFDSFG TSVESSLNQSLVSFDNTLDQAVKRLATGVEGLGNVVEDLEDLTQRTRR >Mature_688_residues MDWLKVAQFSQGYYVFPAIIFIFIAYISLRFFLNYLSPAKELNNKISQLADELDKLNDNSNLDKDPLDVKFDGNPSLKQA WTSYKKTFHDTYETVDGEAKVAYSRATVPSEVFFTESIVVDIPLKVDFYKHLPGIITGVGIIVTFLGLLIGLLAFDPAGN PDKVQDSLALLLTGVAEAFMASGLAIAAAMVITWREKSWLRQCYAQLQRLNTAIDNAFTADESGEEYLAKLLKSSQANEV NARQLKDSLVNDLKTMMTNLVEENKRNQAAFASQLSDSYAQTSQSMATQIGDSIKDSLQDPLDKIASSVQQVSGDQGSAV QDLMTDVLTAFMSKLETTFGGQMTGMSEMMTQSVTAMREMQLGFSQLITDMQTNSEVSTKTLETQMAKMMEDIHLKQNEM SIQMNEMVENLSAGSAKIGDQGLYAVEQLNSKVSELVSGLGNSMSGLLSNVAEQRIEQDRQISDNQQKLHEQSSVLIDSL GSEIKELITHSKEAVQTHKENIQKLSQVTTDSITGMNSGAERMGLAAEQFTTAGSSLSTVTGKTSELIAQVNTTSTNMTS ASSNLIELIRDYKNSKNSVNLAIETLETLIQQSKSEAGMTSQMLDDMQNMTTALSQVKKEMQEYLAEVSDVLVKSFDSFG TSVESSLNQSLVSFDNTLDQAVKRLATGVEGLGNVVEDLEDLTQRTRR
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 75612; Mature: 75612
Theoretical pI: Translated: 4.37; Mature: 4.37
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 4.4 %Met (Translated Protein) 4.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 4.4 %Met (Mature Protein) 4.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MDWLKVAQFSQGYYVFPAIIFIFIAYISLRFFLNYLSPAKELNNKISQLADELDKLNDNS CCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC NLDKDPLDVKFDGNPSLKQAWTSYKKTFHDTYETVDGEAKVAYSRATVPSEVFFTESIVV CCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHEEE DIPLKVDFYKHLPGIITGVGIIVTFLGLLIGLLAFDPAGNPDKVQDSLALLLTGVAEAFM ECCCCHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ASGLAIAAAMVITWREKSWLRQCYAQLQRLNTAIDNAFTADESGEEYLAKLLKSSQANEV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCH NARQLKDSLVNDLKTMMTNLVEENKRNQAAFASQLSDSYAQTSQSMATQIGDSIKDSLQD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PLDKIASSVQQVSGDQGSAVQDLMTDVLTAFMSKLETTFGGQMTGMSEMMTQSVTAMREM HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH QLGFSQLITDMQTNSEVSTKTLETQMAKMMEDIHLKQNEMSIQMNEMVENLSAGSAKIGD HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC QGLYAVEQLNSKVSELVSGLGNSMSGLLSNVAEQRIEQDRQISDNQQKLHEQSSVLIDSL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH GSEIKELITHSKEAVQTHKENIQKLSQVTTDSITGMNSGAERMGLAAEQFTTAGSSLSTV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH TGKTSELIAQVNTTSTNMTSASSNLIELIRDYKNSKNSVNLAIETLETLIQQSKSEAGMT CCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH SQMLDDMQNMTTALSQVKKEMQEYLAEVSDVLVKSFDSFGTSVESSLNQSLVSFDNTLDQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AVKRLATGVEGLGNVVEDLEDLTQRTRR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MDWLKVAQFSQGYYVFPAIIFIFIAYISLRFFLNYLSPAKELNNKISQLADELDKLNDNS CCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC NLDKDPLDVKFDGNPSLKQAWTSYKKTFHDTYETVDGEAKVAYSRATVPSEVFFTESIVV CCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHEEE DIPLKVDFYKHLPGIITGVGIIVTFLGLLIGLLAFDPAGNPDKVQDSLALLLTGVAEAFM ECCCCHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ASGLAIAAAMVITWREKSWLRQCYAQLQRLNTAIDNAFTADESGEEYLAKLLKSSQANEV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCH NARQLKDSLVNDLKTMMTNLVEENKRNQAAFASQLSDSYAQTSQSMATQIGDSIKDSLQD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PLDKIASSVQQVSGDQGSAVQDLMTDVLTAFMSKLETTFGGQMTGMSEMMTQSVTAMREM HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH QLGFSQLITDMQTNSEVSTKTLETQMAKMMEDIHLKQNEMSIQMNEMVENLSAGSAKIGD HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC QGLYAVEQLNSKVSELVSGLGNSMSGLLSNVAEQRIEQDRQISDNQQKLHEQSSVLIDSL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH GSEIKELITHSKEAVQTHKENIQKLSQVTTDSITGMNSGAERMGLAAEQFTTAGSSLSTV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH TGKTSELIAQVNTTSTNMTSASSNLIELIRDYKNSKNSVNLAIETLETLIQQSKSEAGMT CCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH SQMLDDMQNMTTALSQVKKEMQEYLAEVSDVLVKSFDSFGTSVESSLNQSLVSFDNTLDQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AVKRLATGVEGLGNVVEDLEDLTQRTRR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA