Definition Polaromonas sp. JS666 chromosome, complete genome.
Accession NC_007948
Length 5,200,264

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The map label for this gene is 91786414

Identifier: 91786414

GI number: 91786414

Start: 513255

End: 515426

Strand: Direct

Name: 91786414

Synonym: Bpro_0504

Alternate gene names: NA

Gene position: 513255-515426 (Clockwise)

Preceding gene: 91786413

Following gene: 91786415

Centisome position: 9.87

GC content: 65.61

Gene sequence:

>2172_bases
ATGAACAGGATTTTTTTTGCAGTCGCCTTCGCCATCGGTCTGATGACCGTGACCTGGGTGGGGTTGGGGTTTGTCGGTTC
GAGCTGGATGGCCCTGGTCATGACGGCGGTGATTGCCGGGGTTTATTTGCTGGGCGCGTTCGAACTCAGACAGTTTCGCG
CTGCCACAGCCTCGCTGGCGGCGGCGCTTGCCGACATTCCTCAGCCGCTGCCGGACATCGGCGTCTGGCTAGTCGGCGTA
CCCCCTTCCCTGCAAAATTCCGTGCGTTTGCGGATCGAGGGCGAACGGGTCGCCTTGCCGGGCCCTGCGTTGACACCGTA
CCTGGTGGGGCTGCTGGTGATGCTGGGGATGCTCGGTACCTTCCTGGGCATGGTCGTGACCTTCAAGGGGGCCGTGTTCG
CTCTGGAGGGCTCGACGGATCTTCACGCCATCCGGTCGGCGCTAGCCGCACCGATCAAGGGCCTGGGGCTTGCATTTGGC
ACCTCGGTGGCCGGGGTGGCCGCGTCGGCCATGCTGGGCCTGCTGTCGGCCATCAGCCGCCGCGAGAGGGTAGACGTCGC
GCGGCAGCTGGACTCCCGTATTGCGACCGTCTTTCGGCCGTTTTCGCTCGCCCATCAGCGTCAGGAAACCTTCAAGGCGC
TGCAGGTGCAGGCGCACGCCTTGCCCGACGTGGTCGACAAGCTGCAGACCATGATGGAGGGAATGGAACGCCGGAGCCAG
CAGTTGAACGAGCAGCTGCTGGGCAGTCAGGCGCAGTTCCACCGTGAGGTGAGCGTCGCCTACACCGGTCTGGCCGACAC
CGTCGGGCAGTCCCTGAAAGACAGCCTGACGGCCAGCGCAAGGGTGGCGGGCGAGAGCATCAAGCCCGTGGTCGAGGCGG
CGATGACGGAAATTGCGCAGGAATCGAAGCGCCTGCACGAGCGCGTGAGCGACGCAGCGCAGACGCAGTTGACGGGCCTC
TCGGCCCAGTTCAGCGCCACCGCCCGAGCCGTGTCCGAAACCTGGACGACGGCTCTCCAGAACCATGCGCGGACCAGCGA
AAGCCAGGTCAATGGCCTGGACCGGGCACTGGCGGCCTTCACGGACACCTTCGAGCAGCGCTCAGGCGTGTTGCTGGCCA
CGGTCAACGAGGCCGTGTCCAGGTCGCAATCGGACCAGGCCTCGTCGGATCGGCAGAGGCTGCAGGCCTGGACGCAGGCG
CTGGAGTCCATGGCGGCCACGCTGCACGGCGAATGGCAGCGTGTCGGGGCGCAGTCGCTCGCCCAGCAGCAAGCAGTCTG
CCTGACGCTGGAGAAAACCGCCGGTGAGATTACCGAACGCGCCAGCCATCAGGCGAGCCGGACCCTGGACGACATTGCAC
GACTGTCGACCCACTCGGAGGAGCTGATTCGTTCGCGCATCGACTCCGAGGCCGACTGGATGCAGCAGCACGGCGACCGC
ATGGACCAGCTGGCCAGTGTGTGGCGCACGGAACTCGATGCGCTCAGGGAAGAAGAGGCAACGCGCGGCAACGCCGCCGT
CGAGCGGCTGGGCGAACTGCAGGCGGCACTGGCCAGTCATCTGGCCACGCTGGGCGCCGCGCTGGAAACACCCATGACCC
GGCTTATGCAAACGGCCTCTGAAGTGCCCCAGGCCGCTGCGGAAGTGATTGCGCAATTGCGGCAGGAAATGACCCGGCTC
ACCGAGCGAGACAACCTCGCGCTCGAAGAGCGCACCGGCCTGGTGGAACAAATCAGGGCGCTGCTCCAGACCATCCACCA
GGCCTCGGGTGAACAGCGTGCGGCGATCGAGTCGCTGGTGGGTTCGGCGGCAGCTGTGCTGGACAAGGCCGGCAGCCAGT
TTGCTGAAACGCTGGGGGCACAGGCCGGCAAGGCGGAGGACATGGCGGCGCACCTCACCGGCAGCGCGGTCGAGCTGGCT
AGCCTGGGCGAATCCTTCAATCATGGCGTCCAGCTTTTCAACGCGACCAACGAGAAGCTGATTGAAAGCCTGCAGCGCAT
GGAGGGCACCATGAACCAGTCCATGGCGCGGAGTGACGAACAACTTGCCTACTACGTGGCGCAGGCGCGCGAGGTCATCG
ACCTCAGCATCACGTCGCAGCAGGGCATTGTCGAAGACCTGCGCCAGCTCCACAGCAAGCAAGCCTCGCAGTCCGAGGGA
GTCGCGGGATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GCAAGGAGGTGCAGGAGGTCTTGCTGGCGGAACTGGAGGTCCGGCTGCAGCCGGTCGTGGGATTGATTGAAGCATTCAGC
AACGAGGTTAAGACGTACCA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCGACCTTGACGAAAGGGGCGACGGCATGGAGCAGACCGCGCCGGTCTGGGCCGTTTTCGGGGACCTGATGTCGGGCTTG
CTGGGCGCTTTCGTGCTGAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 723; Mature: 723

Protein sequence:

>723_residues
MNRIFFAVAFAIGLMTVTWVGLGFVGSSWMALVMTAVIAGVYLLGAFELRQFRAATASLAAALADIPQPLPDIGVWLVGV
PPSLQNSVRLRIEGERVALPGPALTPYLVGLLVMLGMLGTFLGMVVTFKGAVFALEGSTDLHAIRSALAAPIKGLGLAFG
TSVAGVAASAMLGLLSAISRRERVDVARQLDSRIATVFRPFSLAHQRQETFKALQVQAHALPDVVDKLQTMMEGMERRSQ
QLNEQLLGSQAQFHREVSVAYTGLADTVGQSLKDSLTASARVAGESIKPVVEAAMTEIAQESKRLHERVSDAAQTQLTGL
SAQFSATARAVSETWTTALQNHARTSESQVNGLDRALAAFTDTFEQRSGVLLATVNEAVSRSQSDQASSDRQRLQAWTQA
LESMAATLHGEWQRVGAQSLAQQQAVCLTLEKTAGEITERASHQASRTLDDIARLSTHSEELIRSRIDSEADWMQQHGDR
MDQLASVWRTELDALREEEATRGNAAVERLGELQAALASHLATLGAALETPMTRLMQTASEVPQAAAEVIAQLRQEMTRL
TERDNLALEERTGLVEQIRALLQTIHQASGEQRAAIESLVGSAAAVLDKAGSQFAETLGAQAGKAEDMAAHLTGSAVELA
SLGESFNHGVQLFNATNEKLIESLQRMEGTMNQSMARSDEQLAYYVAQAREVIDLSITSQQGIVEDLRQLHSKQASQSEG
VAG

Sequences:

>Translated_723_residues
MNRIFFAVAFAIGLMTVTWVGLGFVGSSWMALVMTAVIAGVYLLGAFELRQFRAATASLAAALADIPQPLPDIGVWLVGV
PPSLQNSVRLRIEGERVALPGPALTPYLVGLLVMLGMLGTFLGMVVTFKGAVFALEGSTDLHAIRSALAAPIKGLGLAFG
TSVAGVAASAMLGLLSAISRRERVDVARQLDSRIATVFRPFSLAHQRQETFKALQVQAHALPDVVDKLQTMMEGMERRSQ
QLNEQLLGSQAQFHREVSVAYTGLADTVGQSLKDSLTASARVAGESIKPVVEAAMTEIAQESKRLHERVSDAAQTQLTGL
SAQFSATARAVSETWTTALQNHARTSESQVNGLDRALAAFTDTFEQRSGVLLATVNEAVSRSQSDQASSDRQRLQAWTQA
LESMAATLHGEWQRVGAQSLAQQQAVCLTLEKTAGEITERASHQASRTLDDIARLSTHSEELIRSRIDSEADWMQQHGDR
MDQLASVWRTELDALREEEATRGNAAVERLGELQAALASHLATLGAALETPMTRLMQTASEVPQAAAEVIAQLRQEMTRL
TERDNLALEERTGLVEQIRALLQTIHQASGEQRAAIESLVGSAAAVLDKAGSQFAETLGAQAGKAEDMAAHLTGSAVELA
SLGESFNHGVQLFNATNEKLIESLQRMEGTMNQSMARSDEQLAYYVAQAREVIDLSITSQQGIVEDLRQLHSKQASQSEG
VAG
>Mature_723_residues
MNRIFFAVAFAIGLMTVTWVGLGFVGSSWMALVMTAVIAGVYLLGAFELRQFRAATASLAAALADIPQPLPDIGVWLVGV
PPSLQNSVRLRIEGERVALPGPALTPYLVGLLVMLGMLGTFLGMVVTFKGAVFALEGSTDLHAIRSALAAPIKGLGLAFG
TSVAGVAASAMLGLLSAISRRERVDVARQLDSRIATVFRPFSLAHQRQETFKALQVQAHALPDVVDKLQTMMEGMERRSQ
QLNEQLLGSQAQFHREVSVAYTGLADTVGQSLKDSLTASARVAGESIKPVVEAAMTEIAQESKRLHERVSDAAQTQLTGL
SAQFSATARAVSETWTTALQNHARTSESQVNGLDRALAAFTDTFEQRSGVLLATVNEAVSRSQSDQASSDRQRLQAWTQA
LESMAATLHGEWQRVGAQSLAQQQAVCLTLEKTAGEITERASHQASRTLDDIARLSTHSEELIRSRIDSEADWMQQHGDR
MDQLASVWRTELDALREEEATRGNAAVERLGELQAALASHLATLGAALETPMTRLMQTASEVPQAAAEVIAQLRQEMTRL
TERDNLALEERTGLVEQIRALLQTIHQASGEQRAAIESLVGSAAAVLDKAGSQFAETLGAQAGKAEDMAAHLTGSAVELA
SLGESFNHGVQLFNATNEKLIESLQRMEGTMNQSMARSDEQLAYYVAQAREVIDLSITSQQGIVEDLRQLHSKQASQSEG
VAG

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 77754; Mature: 77754

Theoretical pI: Translated: 5.17; Mature: 5.17

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
3.0 %Met     (Translated Protein)
3.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
3.0 %Met     (Mature Protein)
3.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNRIFFAVAFAIGLMTVTWVGLGFVGSSWMALVMTAVIAGVYLLGAFELRQFRAATASLA
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AALADIPQPLPDIGVWLVGVPPSLQNSVRLRIEGERVALPGPALTPYLVGLLVMLGMLGT
HHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCEEEEECCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
FLGMVVTFKGAVFALEGSTDLHAIRSALAAPIKGLGLAFGTSVAGVAASAMLGLLSAISR
HHHHHHHHCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RERVDVARQLDSRIATVFRPFSLAHQRQETFKALQVQAHALPDVVDKLQTMMEGMERRSQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QLNEQLLGSQAQFHREVSVAYTGLADTVGQSLKDSLTASARVAGESIKPVVEAAMTEIAQ
HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
ESKRLHERVSDAAQTQLTGLSAQFSATARAVSETWTTALQNHARTSESQVNGLDRALAAF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH
TDTFEQRSGVLLATVNEAVSRSQSDQASSDRQRLQAWTQALESMAATLHGEWQRVGAQSL
HHHHHHHCCEEEEEHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AQQQAVCLTLEKTAGEITERASHQASRTLDDIARLSTHSEELIRSRIDSEADWMQQHGDR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCHH
MDQLASVWRTELDALREEEATRGNAAVERLGELQAALASHLATLGAALETPMTRLMQTAS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EVPQAAAEVIAQLRQEMTRLTERDNLALEERTGLVEQIRALLQTIHQASGEQRAAIESLV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
GSAAAVLDKAGSQFAETLGAQAGKAEDMAAHLTGSAVELASLGESFNHGVQLFNATNEKL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
IESLQRMEGTMNQSMARSDEQLAYYVAQAREVIDLSITSQQGIVEDLRQLHSKQASQSEG
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCC
VAG
CCC
>Mature Secondary Structure
MNRIFFAVAFAIGLMTVTWVGLGFVGSSWMALVMTAVIAGVYLLGAFELRQFRAATASLA
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AALADIPQPLPDIGVWLVGVPPSLQNSVRLRIEGERVALPGPALTPYLVGLLVMLGMLGT
HHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCEEEEECCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
FLGMVVTFKGAVFALEGSTDLHAIRSALAAPIKGLGLAFGTSVAGVAASAMLGLLSAISR
HHHHHHHHCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RERVDVARQLDSRIATVFRPFSLAHQRQETFKALQVQAHALPDVVDKLQTMMEGMERRSQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QLNEQLLGSQAQFHREVSVAYTGLADTVGQSLKDSLTASARVAGESIKPVVEAAMTEIAQ
HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
ESKRLHERVSDAAQTQLTGLSAQFSATARAVSETWTTALQNHARTSESQVNGLDRALAAF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH
TDTFEQRSGVLLATVNEAVSRSQSDQASSDRQRLQAWTQALESMAATLHGEWQRVGAQSL
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AQQQAVCLTLEKTAGEITERASHQASRTLDDIARLSTHSEELIRSRIDSEADWMQQHGDR
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MDQLASVWRTELDALREEEATRGNAAVERLGELQAALASHLATLGAALETPMTRLMQTAS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EVPQAAAEVIAQLRQEMTRLTERDNLALEERTGLVEQIRALLQTIHQASGEQRAAIESLV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
GSAAAVLDKAGSQFAETLGAQAGKAEDMAAHLTGSAVELASLGESFNHGVQLFNATNEKL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
IESLQRMEGTMNQSMARSDEQLAYYVAQAREVIDLSITSQQGIVEDLRQLHSKQASQSEG
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCC
VAG
CCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA