| Definition | Polaromonas sp. JS666 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007948 |
| Length | 5,200,264 |
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The map label for this gene is 91786414
Identifier: 91786414
GI number: 91786414
Start: 513255
End: 515426
Strand: Direct
Name: 91786414
Synonym: Bpro_0504
Alternate gene names: NA
Gene position: 513255-515426 (Clockwise)
Preceding gene: 91786413
Following gene: 91786415
Centisome position: 9.87
GC content: 65.61
Gene sequence:
>2172_bases ATGAACAGGATTTTTTTTGCAGTCGCCTTCGCCATCGGTCTGATGACCGTGACCTGGGTGGGGTTGGGGTTTGTCGGTTC GAGCTGGATGGCCCTGGTCATGACGGCGGTGATTGCCGGGGTTTATTTGCTGGGCGCGTTCGAACTCAGACAGTTTCGCG CTGCCACAGCCTCGCTGGCGGCGGCGCTTGCCGACATTCCTCAGCCGCTGCCGGACATCGGCGTCTGGCTAGTCGGCGTA CCCCCTTCCCTGCAAAATTCCGTGCGTTTGCGGATCGAGGGCGAACGGGTCGCCTTGCCGGGCCCTGCGTTGACACCGTA CCTGGTGGGGCTGCTGGTGATGCTGGGGATGCTCGGTACCTTCCTGGGCATGGTCGTGACCTTCAAGGGGGCCGTGTTCG CTCTGGAGGGCTCGACGGATCTTCACGCCATCCGGTCGGCGCTAGCCGCACCGATCAAGGGCCTGGGGCTTGCATTTGGC ACCTCGGTGGCCGGGGTGGCCGCGTCGGCCATGCTGGGCCTGCTGTCGGCCATCAGCCGCCGCGAGAGGGTAGACGTCGC GCGGCAGCTGGACTCCCGTATTGCGACCGTCTTTCGGCCGTTTTCGCTCGCCCATCAGCGTCAGGAAACCTTCAAGGCGC TGCAGGTGCAGGCGCACGCCTTGCCCGACGTGGTCGACAAGCTGCAGACCATGATGGAGGGAATGGAACGCCGGAGCCAG CAGTTGAACGAGCAGCTGCTGGGCAGTCAGGCGCAGTTCCACCGTGAGGTGAGCGTCGCCTACACCGGTCTGGCCGACAC CGTCGGGCAGTCCCTGAAAGACAGCCTGACGGCCAGCGCAAGGGTGGCGGGCGAGAGCATCAAGCCCGTGGTCGAGGCGG CGATGACGGAAATTGCGCAGGAATCGAAGCGCCTGCACGAGCGCGTGAGCGACGCAGCGCAGACGCAGTTGACGGGCCTC TCGGCCCAGTTCAGCGCCACCGCCCGAGCCGTGTCCGAAACCTGGACGACGGCTCTCCAGAACCATGCGCGGACCAGCGA AAGCCAGGTCAATGGCCTGGACCGGGCACTGGCGGCCTTCACGGACACCTTCGAGCAGCGCTCAGGCGTGTTGCTGGCCA CGGTCAACGAGGCCGTGTCCAGGTCGCAATCGGACCAGGCCTCGTCGGATCGGCAGAGGCTGCAGGCCTGGACGCAGGCG CTGGAGTCCATGGCGGCCACGCTGCACGGCGAATGGCAGCGTGTCGGGGCGCAGTCGCTCGCCCAGCAGCAAGCAGTCTG CCTGACGCTGGAGAAAACCGCCGGTGAGATTACCGAACGCGCCAGCCATCAGGCGAGCCGGACCCTGGACGACATTGCAC GACTGTCGACCCACTCGGAGGAGCTGATTCGTTCGCGCATCGACTCCGAGGCCGACTGGATGCAGCAGCACGGCGACCGC ATGGACCAGCTGGCCAGTGTGTGGCGCACGGAACTCGATGCGCTCAGGGAAGAAGAGGCAACGCGCGGCAACGCCGCCGT CGAGCGGCTGGGCGAACTGCAGGCGGCACTGGCCAGTCATCTGGCCACGCTGGGCGCCGCGCTGGAAACACCCATGACCC GGCTTATGCAAACGGCCTCTGAAGTGCCCCAGGCCGCTGCGGAAGTGATTGCGCAATTGCGGCAGGAAATGACCCGGCTC ACCGAGCGAGACAACCTCGCGCTCGAAGAGCGCACCGGCCTGGTGGAACAAATCAGGGCGCTGCTCCAGACCATCCACCA GGCCTCGGGTGAACAGCGTGCGGCGATCGAGTCGCTGGTGGGTTCGGCGGCAGCTGTGCTGGACAAGGCCGGCAGCCAGT TTGCTGAAACGCTGGGGGCACAGGCCGGCAAGGCGGAGGACATGGCGGCGCACCTCACCGGCAGCGCGGTCGAGCTGGCT AGCCTGGGCGAATCCTTCAATCATGGCGTCCAGCTTTTCAACGCGACCAACGAGAAGCTGATTGAAAGCCTGCAGCGCAT GGAGGGCACCATGAACCAGTCCATGGCGCGGAGTGACGAACAACTTGCCTACTACGTGGCGCAGGCGCGCGAGGTCATCG ACCTCAGCATCACGTCGCAGCAGGGCATTGTCGAAGACCTGCGCCAGCTCCACAGCAAGCAAGCCTCGCAGTCCGAGGGA GTCGCGGGATGA
Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases TCGACCTTGACGAAAGGGGCGACGGCATGGAGCAGACCGCGCCGGTCTGGGCCGTTTTCGGGGACCTGATGTCGGGCTTG CTGGGCGCTTTCGTGCTGAT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 723; Mature: 723
Protein sequence:
>723_residues MNRIFFAVAFAIGLMTVTWVGLGFVGSSWMALVMTAVIAGVYLLGAFELRQFRAATASLAAALADIPQPLPDIGVWLVGV PPSLQNSVRLRIEGERVALPGPALTPYLVGLLVMLGMLGTFLGMVVTFKGAVFALEGSTDLHAIRSALAAPIKGLGLAFG TSVAGVAASAMLGLLSAISRRERVDVARQLDSRIATVFRPFSLAHQRQETFKALQVQAHALPDVVDKLQTMMEGMERRSQ QLNEQLLGSQAQFHREVSVAYTGLADTVGQSLKDSLTASARVAGESIKPVVEAAMTEIAQESKRLHERVSDAAQTQLTGL SAQFSATARAVSETWTTALQNHARTSESQVNGLDRALAAFTDTFEQRSGVLLATVNEAVSRSQSDQASSDRQRLQAWTQA LESMAATLHGEWQRVGAQSLAQQQAVCLTLEKTAGEITERASHQASRTLDDIARLSTHSEELIRSRIDSEADWMQQHGDR MDQLASVWRTELDALREEEATRGNAAVERLGELQAALASHLATLGAALETPMTRLMQTASEVPQAAAEVIAQLRQEMTRL TERDNLALEERTGLVEQIRALLQTIHQASGEQRAAIESLVGSAAAVLDKAGSQFAETLGAQAGKAEDMAAHLTGSAVELA SLGESFNHGVQLFNATNEKLIESLQRMEGTMNQSMARSDEQLAYYVAQAREVIDLSITSQQGIVEDLRQLHSKQASQSEG VAG
Sequences:
>Translated_723_residues MNRIFFAVAFAIGLMTVTWVGLGFVGSSWMALVMTAVIAGVYLLGAFELRQFRAATASLAAALADIPQPLPDIGVWLVGV PPSLQNSVRLRIEGERVALPGPALTPYLVGLLVMLGMLGTFLGMVVTFKGAVFALEGSTDLHAIRSALAAPIKGLGLAFG TSVAGVAASAMLGLLSAISRRERVDVARQLDSRIATVFRPFSLAHQRQETFKALQVQAHALPDVVDKLQTMMEGMERRSQ QLNEQLLGSQAQFHREVSVAYTGLADTVGQSLKDSLTASARVAGESIKPVVEAAMTEIAQESKRLHERVSDAAQTQLTGL SAQFSATARAVSETWTTALQNHARTSESQVNGLDRALAAFTDTFEQRSGVLLATVNEAVSRSQSDQASSDRQRLQAWTQA LESMAATLHGEWQRVGAQSLAQQQAVCLTLEKTAGEITERASHQASRTLDDIARLSTHSEELIRSRIDSEADWMQQHGDR MDQLASVWRTELDALREEEATRGNAAVERLGELQAALASHLATLGAALETPMTRLMQTASEVPQAAAEVIAQLRQEMTRL TERDNLALEERTGLVEQIRALLQTIHQASGEQRAAIESLVGSAAAVLDKAGSQFAETLGAQAGKAEDMAAHLTGSAVELA SLGESFNHGVQLFNATNEKLIESLQRMEGTMNQSMARSDEQLAYYVAQAREVIDLSITSQQGIVEDLRQLHSKQASQSEG VAG >Mature_723_residues MNRIFFAVAFAIGLMTVTWVGLGFVGSSWMALVMTAVIAGVYLLGAFELRQFRAATASLAAALADIPQPLPDIGVWLVGV PPSLQNSVRLRIEGERVALPGPALTPYLVGLLVMLGMLGTFLGMVVTFKGAVFALEGSTDLHAIRSALAAPIKGLGLAFG TSVAGVAASAMLGLLSAISRRERVDVARQLDSRIATVFRPFSLAHQRQETFKALQVQAHALPDVVDKLQTMMEGMERRSQ QLNEQLLGSQAQFHREVSVAYTGLADTVGQSLKDSLTASARVAGESIKPVVEAAMTEIAQESKRLHERVSDAAQTQLTGL SAQFSATARAVSETWTTALQNHARTSESQVNGLDRALAAFTDTFEQRSGVLLATVNEAVSRSQSDQASSDRQRLQAWTQA LESMAATLHGEWQRVGAQSLAQQQAVCLTLEKTAGEITERASHQASRTLDDIARLSTHSEELIRSRIDSEADWMQQHGDR MDQLASVWRTELDALREEEATRGNAAVERLGELQAALASHLATLGAALETPMTRLMQTASEVPQAAAEVIAQLRQEMTRL TERDNLALEERTGLVEQIRALLQTIHQASGEQRAAIESLVGSAAAVLDKAGSQFAETLGAQAGKAEDMAAHLTGSAVELA SLGESFNHGVQLFNATNEKLIESLQRMEGTMNQSMARSDEQLAYYVAQAREVIDLSITSQQGIVEDLRQLHSKQASQSEG VAG
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 77754; Mature: 77754
Theoretical pI: Translated: 5.17; Mature: 5.17
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 3.0 %Met (Translated Protein) 3.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 3.0 %Met (Mature Protein) 3.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNRIFFAVAFAIGLMTVTWVGLGFVGSSWMALVMTAVIAGVYLLGAFELRQFRAATASLA CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AALADIPQPLPDIGVWLVGVPPSLQNSVRLRIEGERVALPGPALTPYLVGLLVMLGMLGT HHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCEEEEECCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH FLGMVVTFKGAVFALEGSTDLHAIRSALAAPIKGLGLAFGTSVAGVAASAMLGLLSAISR HHHHHHHHCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RERVDVARQLDSRIATVFRPFSLAHQRQETFKALQVQAHALPDVVDKLQTMMEGMERRSQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QLNEQLLGSQAQFHREVSVAYTGLADTVGQSLKDSLTASARVAGESIKPVVEAAMTEIAQ HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH ESKRLHERVSDAAQTQLTGLSAQFSATARAVSETWTTALQNHARTSESQVNGLDRALAAF HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH TDTFEQRSGVLLATVNEAVSRSQSDQASSDRQRLQAWTQALESMAATLHGEWQRVGAQSL HHHHHHHCCEEEEEHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AQQQAVCLTLEKTAGEITERASHQASRTLDDIARLSTHSEELIRSRIDSEADWMQQHGDR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCHH MDQLASVWRTELDALREEEATRGNAAVERLGELQAALASHLATLGAALETPMTRLMQTAS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EVPQAAAEVIAQLRQEMTRLTERDNLALEERTGLVEQIRALLQTIHQASGEQRAAIESLV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH GSAAAVLDKAGSQFAETLGAQAGKAEDMAAHLTGSAVELASLGESFNHGVQLFNATNEKL HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH IESLQRMEGTMNQSMARSDEQLAYYVAQAREVIDLSITSQQGIVEDLRQLHSKQASQSEG HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCC VAG CCC >Mature Secondary Structure MNRIFFAVAFAIGLMTVTWVGLGFVGSSWMALVMTAVIAGVYLLGAFELRQFRAATASLA CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AALADIPQPLPDIGVWLVGVPPSLQNSVRLRIEGERVALPGPALTPYLVGLLVMLGMLGT HHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCEEEEECCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH FLGMVVTFKGAVFALEGSTDLHAIRSALAAPIKGLGLAFGTSVAGVAASAMLGLLSAISR HHHHHHHHCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RERVDVARQLDSRIATVFRPFSLAHQRQETFKALQVQAHALPDVVDKLQTMMEGMERRSQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QLNEQLLGSQAQFHREVSVAYTGLADTVGQSLKDSLTASARVAGESIKPVVEAAMTEIAQ HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH ESKRLHERVSDAAQTQLTGLSAQFSATARAVSETWTTALQNHARTSESQVNGLDRALAAF HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH TDTFEQRSGVLLATVNEAVSRSQSDQASSDRQRLQAWTQALESMAATLHGEWQRVGAQSL HHHHHHHCCEEEEEHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AQQQAVCLTLEKTAGEITERASHQASRTLDDIARLSTHSEELIRSRIDSEADWMQQHGDR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCHH MDQLASVWRTELDALREEEATRGNAAVERLGELQAALASHLATLGAALETPMTRLMQTAS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EVPQAAAEVIAQLRQEMTRLTERDNLALEERTGLVEQIRALLQTIHQASGEQRAAIESLV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH GSAAAVLDKAGSQFAETLGAQAGKAEDMAAHLTGSAVELASLGESFNHGVQLFNATNEKL HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH IESLQRMEGTMNQSMARSDEQLAYYVAQAREVIDLSITSQQGIVEDLRQLHSKQASQSEG HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCC VAG CCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA