Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is virB6-4

Identifier: 91206077

GI number:

Start: 1355366

End: 1358026

Strand: Reverse

Name: virB6-4

Synonym: RBE_1262

Alternate gene names: NA

Gene position: NA

Preceding gene: 91206078

Following gene: 91206076

Centisome position: NA

GC content: NA

Gene sequence:

>2661_bases
ATGAAAATTATTAAAAGTTTAATTTTATTAGTTTTATTTATGGCGTCGCCTGCCAAAGGTGATGACTTTGCTTGGATGTC
AAGTGGGCTTAGCGGTCTTAAAAGCATTTTTGGTTGTTTAGAAGTACCTACATTTACAAGTTTCCAAGAGGGTAAAATAG
GTATTAGTTTATCGACTGCTGGAGATTGGCAATCAACAGGTAATGCAGTTGAAAAAGGTAAGCTGCTTAAGATTAAATGG
TCTACTGCAGGTCTTACCCCAGAGCCTCGAAAATATCTAGTATTATATAGAATTGACCCAAGGTTTAGTGTTCCGCAAGT
CTTTATAAAAACTTATAATTACAAAAACTCACAGTTTGAAGTTGCAGGATTCCCAGGTTTTAGTACAGCAAATGATGGTG
TTATACCTCCTGATAAAAACCTTGATGCATTATCATTTACTAAGATGAATAATTATGTTAACTACTTTAATTATGCTAAT
GGTAATCCAAAAATTCAGGTTAATGTTGGTGATATAGTAAATATTAGTCTAGCTGATAAAGATGATTTTTTTAATCCAAG
TACATCAAAAACTCCAAGCACCTTAAATAATATACTAGCTAAAGAACTCGATAGTTCTGTATTTGCTGCTTCTGCTCTTT
ATACTGAAAGCAATCTTGGTAATTTTGAAAATAGGATAGTTTACTCAAGTGCAGAGCAAGTTTGTAATATTATAGATGCT
CAAAGAGCAACTTTATGTACTGGTACAGGTTCGGCTACAAAATATACTAATGTTAGTAATGGTGCATTAGTTGGTAAGCC
AATGGCTGTAACTACATTACAAAATTTTATGAGCATGATTAACTCTTGCCCTGCTAATTCTAATTTAAATGCTAACCCTT
CTTGTTATTATGATCAAGGTAGAGGAATGGTTATTAAAATAGGTGGACAAGTCATTAAAAATCGTGATCAAAGCTTTGTT
AATAATGATAATACACAGAATGGTTTTATGTATTATCAAGCAACTAGCGGTGGTGCTATGGATTTTAGTAGCGATTGGCA
GCCTACCGGTATGTTTAATAATTCTTTTTCAATGAGTGATTGGAGTAGAAATTTTTCTAATTATACTGATTTTGCAACTT
ATATAACTAATGGTAATTGGGCAACTAATTTTTTATATTTTGGTCGTTATGCAATGATTGTTGAGATAGGTAATGGTACA
AACACCATTAGCCCAGGTGATCAAAAAAATATAACTTTAGAGTATTTAATAACAGCTGATGGTACATTACCTAGTTCATC
TACTCCCGGCACTACAGTCGGTTATGATTTTTCAGGTGATGCACCACAAGATGGATATTTATGGTTAAGAGTAAAAAATC
CTAACAGTAATATACAGGGAACAATTAGTGTAGATTATGCTAATTATACTGGTACAACTTGGTTTTCAAATATAGTTTAT
AATGGGGCAATTAAACCTATTACAGATCAATTTAGAACTTATAGTGAGGATTTTTATTTTAAGTTAGTTGCAAATTCTGC
AATACAAAATATAGCTAAAACTGCATTAACGCTTTACGTTACTATATTTGGTTTAATGTTTGTTTTGGGGGCTTTAAAAT
TAACTGCTGTAGAAGTAGTAACTCGTATATTTAAAATAACTATAGTAGCTATTTTACTTAGACCTGAAAGCTGGAGTTTC
TTTAATAACAATTTCTTTAGTGCATTTATTAATGGTATAGATTTCTTTGCAACGAATGTTGTAGGTGCTACAAGCTCTAA
ATCTAATATTTTTGGTTTTATTGATCCTATATTTGACAAATATACTAATGGTAGGATTTGGGGATTACTGTTTATTCAGC
TATTGCAAATACATAATGGTTTAGCATTTATTGTTATTATAACCATTTACTCACTTATTACTTATTTTAGAGCAGTACTT
GAAGTAATTATAGGTTATGTTATAGCCTTTATAGGCTTGACAGTTATGATTTCATTAGCACCATTTTTTATAATATTAAT
GTTGTTTGAAAAAACAAAAACTATGTTTAACAACTGGATATCAATTTTGTTTAGCTATGTAGTGCAGCCAACGATATTAT
TAATTTTCTTTTTATTAATAGATCAAATTTTATCAGAACAGCTGTTAAAGGTAATTGTCAGAGCTTGCTGGGATACACTC
ATACCGATTAAAATAGGGCTCGATTTGTCAAATCTTGGTATTCCGTTAAATTTCTCTTTTACTTTACCATTTTTACCAGG
AATACCTTTTTTTGTTCCACAAGTTCCAGATATTACTAGTTCTAACATTTTAACGAATGACACTAATACATTTTTAGTAT
TGTTCACTACAGCTTTATTATTTTATTCATATTGTCTAATGTCGTATGGTTTAGTAAGTTTTGTAACTATAGTTGTTGGT
ATGTTAACGCAGGTTACTCCTGCACGAATAGAAGGTAATTATCAAGCTCCTTCTAATCCTACAGAATCTATTATGAAAGA
TATAGGTTCAGTAGCAGCCCCGATTAAAAAAGCTGCCCTTGCTCCAGCACGGATTTTTAAAGATAAAGTAATTGATCAGA
ATTATGAAGCTAGAAAGCCGCAAGGTGGTGGGGAGCATACAGGTAAGTTTTTTCAAAATCGTAATGATGTGAAACCTGAG
CAGACGGAAAGGAACGATTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTAAAGCAACGTAATGAAACTTTAAAGCAAGCTGAGAAAACTAGAAAAAATGCACCAAAAGAAGAGCCGCCTAAAGCGG
AAATACCAAAATAAAAAATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGTCATTGCGAGGAGCCGTAGGCGACGTGGCAATCTTATGAAACATTTAAGAATCCTAAGATTGCTTCGTCAAAACTTGT
AGTTTCTCCTCGCAATGATA

Product: VirB6

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: NA

Protein sequence:

>886_residues
MKIIKSLILLVLFMASPAKGDDFAWMSSGLSGLKSIFGCLEVPTFTSFQEGKIGISLSTAGDWQSTGNAVEKGKLLKIKW
STAGLTPEPRKYLVLYRIDPRFSVPQVFIKTYNYKNSQFEVAGFPGFSTANDGVIPPDKNLDALSFTKMNNYVNYFNYAN
GNPKIQVNVGDIVNISLADKDDFFNPSTSKTPSTLNNILAKELDSSVFAASALYTESNLGNFENRIVYSSAEQVCNIIDA
QRATLCTGTGSATKYTNVSNGALVGKPMAVTTLQNFMSMINSCPANSNLNANPSCYYDQGRGMVIKIGGQVIKNRDQSFV
NNDNTQNGFMYYQATSGGAMDFSSDWQPTGMFNNSFSMSDWSRNFSNYTDFATYITNGNWATNFLYFGRYAMIVEIGNGT
NTISPGDQKNITLEYLITADGTLPSSSTPGTTVGYDFSGDAPQDGYLWLRVKNPNSNIQGTISVDYANYTGTTWFSNIVY
NGAIKPITDQFRTYSEDFYFKLVANSAIQNIAKTALTLYVTIFGLMFVLGALKLTAVEVVTRIFKITIVAILLRPESWSF
FNNNFFSAFINGIDFFATNVVGATSSKSNIFGFIDPIFDKYTNGRIWGLLFIQLLQIHNGLAFIVIITIYSLITYFRAVL
EVIIGYVIAFIGLTVMISLAPFFIILMLFEKTKTMFNNWISILFSYVVQPTILLIFFLLIDQILSEQLLKVIVRACWDTL
IPIKIGLDLSNLGIPLNFSFTLPFLPGIPFFVPQVPDITSSNILTNDTNTFLVLFTTALLFYSYCLMSYGLVSFVTIVVG
MLTQVTPARIEGNYQAPSNPTESIMKDIGSVAAPIKKAALAPARIFKDKVIDQNYEARKPQGGGEHTGKFFQNRNDVKPE
QTERND

Sequences:
NA

Specific function: NA

COG id: COG3704

COG function: function code U; Type IV secretory pathway, VirB6 components

Gene ontology:

Cell location: NA

Metaboloic importance: NA

Operon status: NA

Operon components: NA

Similarity: NA

Homologues:

NA

Paralogues:

NA

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: NA

Theoretical pI: NA

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

NA

Transmembrane regions:

NA

Cys/Met content:

NA

Secondary structure: NA

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: NA

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: NA

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA