Definition Chlamydophila felis Fe/C-56, complete genome.
Accession NC_007899
Length 1,166,239

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The map label for this gene is 89898325

Identifier: 89898325

GI number: 89898325

Start: 608403

End: 611180

Strand: Direct

Name: 89898325

Synonym: CF0518

Alternate gene names: NA

Gene position: 608403-611180 (Clockwise)

Preceding gene: 89898324

Following gene: 89898326

Centisome position: 52.17

GC content: 36.39

Gene sequence:

>2778_bases
ATGCGAAAAGCCCTTCGTTTGCTACTAAATTTACATCACGGGGAAGAGAGAAGAGCGTTTTTATTCCTGATTTTGGGATT
AATCTGGGGTATTGGTTGCTACGGATCTCTTGCGTTAAGCGAAGGGCTTTTTCTAGAAAATGTAGGCACGGAAGGGCTCC
CATCTTTTTATCTGGGATCATCGTCCATTCTGTGCCTCTTTTCCTCGCTAATTCTTTACAATTTGTTCAAAAAAAGAGTT
TCACCAAAAACGCTATTTTTAATACCAATAACTAGCATGATTGCGTGTAACCTTTACCTCCTTTGTTACGCAGCAACGTG
CGCAGAAATTCCACCTACACCACTACTTATTTATCGCATGTTATCTTGGAACTTAATCATACTAGCGTATACGAATTTCT
GGGGATTCGTAGATCAGTTCTTTAACCTTCAGGATGCTAAAAGACATTTTAGCGTATTTAATGCTATCATATTTTTAGGA
GATGCTATTGGTTCAGGAATCGTTAATAGAATTCAATACATAGGAATCGAAAGAATTCTGATACTCCTTATAGTAATTCT
ACTATGCTGTTTCCCACTAGTGCACTATGTATCTAAAACTCTAAAGGAACTTTCGGAAGATCATGACCACTTCTTAGATA
CGGGCCATCCCCCATCCATATCCAAAGCTTTTAAGCTTTGTCTAAAGGATAGTTACACCTTTTACCTGCTATGTTTTTAC
TTTTTAATGCAACTGCTCGCTATAGCAACAGAGTTCAACTATTTAAAAATTTTCGAGGAGCACTTCGCTGATAAGAATAC
ATACGAACTGACAGCTCATATAACCAAGTGGTCGTCGTGGATTTCTTTAACAAATATGTGTTTTGCTCTATTTGCCTATA
GCAGAATTGTTAAAAATATCGGCGTAAATAACATTATTCTCTTTGCTCCACTATGCTTCACCAGTCTTTTTCTCTGTTGG
TCTTGCAAAACTTCAGTAGGAATTGCCACTATAGGTATGGTAGCAAGGGAGGGTCTTACCTACGCCCTAGATGATAATAA
CTTGCAGCTGCTAATCTACGGTGTTCCCAATAGAATCCGAAACCAAATTAGAATAGGGATCGAGTGTTTTATTGAACCCA
TAGGCATGTTCACATGGGCTCTCGTGTGTTTCACTACTTCCGCCCAATATAAAGTTTGTCTTATCATATCCATTATTACG
GTAGTTCTAGCCTATTTGTTGCGCTCATATTACGCCAAAGCTATTCTAAGAAATCTGTCTTCTCAAGCCATCTATCTGAA
AAAGACCATGGTAGAATGGATAAAAGCTATGACTTTAAAGGAGAAAAGACAGACCGAGCTTCTACTACTTTCTCATCTAA
AACATCAGCACGAAAGACATCAAATCTTGGCTTTCCAACACTTACTTAATCTTGGCAGCCGTAGTGTTCTTCCTAGTTTA
TTATCCCATATGAATAAACTTAGCCTGCCCAGCAAGCTAAAAACTATGGAAATGTTAAAAAATAGTCTTTGGGCTAAGGA
TTTTCTTACTCTAGAGCTTTTGAAGCGATGGTCATCAACCACCCCTCATCCCTCAATAGCTACAGGAATACATCTCTATT
TTGCAAAACATGACTTATTAGAAATTTCTGATATCTCTGAAGATCTTTATGACGATCCCGGTGATAGACTTCTAGCAGCA
ATTCTTACTGTTCGTCGCCAGGAAATTACAGGACAATATCGTGATATTGCAGATTCACGACTCAAAGAATTGCTCTCTTC
TCCAGATCTTCAAGTAGTATCCATAGGACTTTCTATTCTAACTCTAGAAAAAAATCCAGATAATTTCCCCTTCTTAATGG
AGTTTTTGGATAACGCAAGTCATGAGATTTTTATTCAAACATGTAAAGCTCTACAGGCATCAGTAAAAGCCTCTCATAAA
CCCTATTGCAAAAGACTGATACAAATTCTAAAACATCACGTTCATAACGAGGAAGCTTGCTATTATCTATTAAAAACCAT
CGCAGTTATCTTAGACGTTTCATTAGTTAAAGAGTTCCTGATTACCACATCATTATTAAAAAGTTCCTCTAGGAAATACG
CAGAGTCTATCATCTTAGATCTTCCTAAAGAAACAGCTTCCTCACTTCTTCAGATTCTTTCTGATAATAACGTACACAAT
CGTTGTCGTATTCTTGCAGCAAAAGCTCTATGTAAAATCGATAATAAACTATTTAAGAAGCACGCTTATAGAATTGTAAA
AGCCAAAGCTTTGAAGGCTATTTTTTACGACTATCATAAAAATTATATTCAAAAATCCTATCCAAAGTACAATCTCAGCC
TATTAGTTAATACTTTAGAATCCAATTATCAATCAGAAGTGAACTTCATGTTTGAATTCTTAGGAATTTTAGGCTCCATA
GAACACTCAGATATTCTTATAAGAGCTCTGACTGGGAAAAATAAAAAGGCAAAAGCTCAAGCTCTAGAATCTTTAGAAAA
GAGCTGCGAAGACTACTTATTTTCTCTGCTAGATCCTTTCATTAACGATACCGGCAATCGCAGTGAAAAATATTACTTAA
AATGCGGGGTTATTCCTTTAACTTTAAAAGAGTTATTGAATATGATGGAAAACTCTCCATCATATTTAAGTAAACTTACA
TCCAGACAGCTAAAAGAAGAACTAGCAAGCTGTGATGCAGATTTTCAACCCACGCCACCGTATTCGACTTTAGATGAAGA
AAATGAAAATCATAATCAAAACGACTCTACAAGTCTAGTTCACTTCTTTACTATTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAAAGTATATAAAAAATTTATTATTCTTTAATCCCTCACACCCACATTGAAATTAATTAATTTTATCAGTTAATATATTA
TTTTCTTAGGTGGGTTTGTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
CCAGGAGTCTCTTGATGAATCTAATAGACCGCGCTTTCCTTATAAAGAAAAATCCTATTTTCAACTCTTTAGATATGGAT
GTTCTCCTGGCTATTTCAGA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 925; Mature: 925

Protein sequence:

>925_residues
MRKALRLLLNLHHGEERRAFLFLILGLIWGIGCYGSLALSEGLFLENVGTEGLPSFYLGSSSILCLFSSLILYNLFKKRV
SPKTLFLIPITSMIACNLYLLCYAATCAEIPPTPLLIYRMLSWNLIILAYTNFWGFVDQFFNLQDAKRHFSVFNAIIFLG
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EHSDILIRALTGKNKKAKAQALESLEKSCEDYLFSLLDPFINDTGNRSEKYYLKCGVIPLTLKELLNMMENSPSYLSKLT
SRQLKEELASCDADFQPTPPYSTLDEENENHNQNDSTSLVHFFTI

Sequences:

>Translated_925_residues
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SPKTLFLIPITSMIACNLYLLCYAATCAEIPPTPLLIYRMLSWNLIILAYTNFWGFVDQFFNLQDAKRHFSVFNAIIFLG
DAIGSGIVNRIQYIGIERILILLIVILLCCFPLVHYVSKTLKELSEDHDHFLDTGHPPSISKAFKLCLKDSYTFYLLCFY
FLMQLLAIATEFNYLKIFEEHFADKNTYELTAHITKWSSWISLTNMCFALFAYSRIVKNIGVNNIILFAPLCFTSLFLCW
SCKTSVGIATIGMVAREGLTYALDDNNLQLLIYGVPNRIRNQIRIGIECFIEPIGMFTWALVCFTTSAQYKVCLIISIIT
VVLAYLLRSYYAKAILRNLSSQAIYLKKTMVEWIKAMTLKEKRQTELLLLSHLKHQHERHQILAFQHLLNLGSRSVLPSL
LSHMNKLSLPSKLKTMEMLKNSLWAKDFLTLELLKRWSSTTPHPSIATGIHLYFAKHDLLEISDISEDLYDDPGDRLLAA
ILTVRRQEITGQYRDIADSRLKELLSSPDLQVVSIGLSILTLEKNPDNFPFLMEFLDNASHEIFIQTCKALQASVKASHK
PYCKRLIQILKHHVHNEEACYYLLKTIAVILDVSLVKEFLITTSLLKSSSRKYAESIILDLPKETASSLLQILSDNNVHN
RCRILAAKALCKIDNKLFKKHAYRIVKAKALKAIFYDYHKNYIQKSYPKYNLSLLVNTLESNYQSEVNFMFEFLGILGSI
EHSDILIRALTGKNKKAKAQALESLEKSCEDYLFSLLDPFINDTGNRSEKYYLKCGVIPLTLKELLNMMENSPSYLSKLT
SRQLKEELASCDADFQPTPPYSTLDEENENHNQNDSTSLVHFFTI
>Mature_925_residues
MRKALRLLLNLHHGEERRAFLFLILGLIWGIGCYGSLALSEGLFLENVGTEGLPSFYLGSSSILCLFSSLILYNLFKKRV
SPKTLFLIPITSMIACNLYLLCYAATCAEIPPTPLLIYRMLSWNLIILAYTNFWGFVDQFFNLQDAKRHFSVFNAIIFLG
DAIGSGIVNRIQYIGIERILILLIVILLCCFPLVHYVSKTLKELSEDHDHFLDTGHPPSISKAFKLCLKDSYTFYLLCFY
FLMQLLAIATEFNYLKIFEEHFADKNTYELTAHITKWSSWISLTNMCFALFAYSRIVKNIGVNNIILFAPLCFTSLFLCW
SCKTSVGIATIGMVAREGLTYALDDNNLQLLIYGVPNRIRNQIRIGIECFIEPIGMFTWALVCFTTSAQYKVCLIISIIT
VVLAYLLRSYYAKAILRNLSSQAIYLKKTMVEWIKAMTLKEKRQTELLLLSHLKHQHERHQILAFQHLLNLGSRSVLPSL
LSHMNKLSLPSKLKTMEMLKNSLWAKDFLTLELLKRWSSTTPHPSIATGIHLYFAKHDLLEISDISEDLYDDPGDRLLAA
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PYCKRLIQILKHHVHNEEACYYLLKTIAVILDVSLVKEFLITTSLLKSSSRKYAESIILDLPKETASSLLQILSDNNVHN
RCRILAAKALCKIDNKLFKKHAYRIVKAKALKAIFYDYHKNYIQKSYPKYNLSLLVNTLESNYQSEVNFMFEFLGILGSI
EHSDILIRALTGKNKKAKAQALESLEKSCEDYLFSLLDPFINDTGNRSEKYYLKCGVIPLTLKELLNMMENSPSYLSKLT
SRQLKEELASCDADFQPTPPYSTLDEENENHNQNDSTSLVHFFTI

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 105792; Mature: 105792

Theoretical pI: Translated: 8.42; Mature: 8.42

Prosite motif: PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.6 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
4.3 %Cys+Met (Translated Protein)
2.6 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
4.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRKALRLLLNLHHGEERRAFLFLILGLIWGIGCYGSLALSEGLFLENVGTEGLPSFYLGS
CHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCCCCCHHCCC
SSILCLFSSLILYNLFKKRVSPKTLFLIPITSMIACNLYLLCYAATCAEIPPTPLLIYRM
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH
LSWNLIILAYTNFWGFVDQFFNLQDAKRHFSVFNAIIFLGDAIGSGIVNRIQYIGIERIL
HHCCEEEEEHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILLIVILLCCFPLVHYVSKTLKELSEDHDHFLDTGHPPSISKAFKLCLKDSYTFYLLCFY
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FLMQLLAIATEFNYLKIFEEHFADKNTYELTAHITKWSSWISLTNMCFALFAYSRIVKNI
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
GVNNIILFAPLCFTSLFLCWSCKTSVGIATIGMVAREGLTYALDDNNLQLLIYGVPNRIR
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEECCCEEEEEEECCHHHH
NQIRIGIECFIEPIGMFTWALVCFTTSAQYKVCLIISIITVVLAYLLRSYYAKAILRNLS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
SQAIYLKKTMVEWIKAMTLKEKRQTELLLLSHLKHQHERHQILAFQHLLNLGSRSVLPSL
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LSHMNKLSLPSKLKTMEMLKNSLWAKDFLTLELLKRWSSTTPHPSIATGIHLYFAKHDLL
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHEEHHCCCH
EISDISEDLYDDPGDRLLAAILTVRRQEITGQYRDIADSRLKELLSSPDLQVVSIGLSIL
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TLEKNPDNFPFLMEFLDNASHEIFIQTCKALQASVKASHKPYCKRLIQILKHHVHNEEAC
EEECCCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH
YYLLKTIAVILDVSLVKEFLITTSLLKSSSRKYAESIILDLPKETASSLLQILSDNNVHN
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RCRILAAKALCKIDNKLFKKHAYRIVKAKALKAIFYDYHKNYIQKSYPKYNLSLLVNTLE
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SNYQSEVNFMFEFLGILGSIEHSDILIRALTGKNKKAKAQALESLEKSCEDYLFSLLDPF
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
YSTLDEENENHNQNDSTSLVHFFTI
CCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEC
>Mature Secondary Structure
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SSILCLFSSLILYNLFKKRVSPKTLFLIPITSMIACNLYLLCYAATCAEIPPTPLLIYRM
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NQIRIGIECFIEPIGMFTWALVCFTTSAQYKVCLIISIITVVLAYLLRSYYAKAILRNLS
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EISDISEDLYDDPGDRLLAAILTVRRQEITGQYRDIADSRLKELLSSPDLQVVSIGLSIL
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YYLLKTIAVILDVSLVKEFLITTSLLKSSSRKYAESIILDLPKETASSLLQILSDNNVHN
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HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
INDTGNRSEKYYLKCGVIPLTLKELLNMMENSPSYLSKLTSRQLKEELASCDADFQPTPP
HCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
YSTLDEENENHNQNDSTSLVHFFTI
CCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA