| Definition | Chlamydophila felis Fe/C-56, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007899 |
| Length | 1,166,239 |
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The map label for this gene is 89898325
Identifier: 89898325
GI number: 89898325
Start: 608403
End: 611180
Strand: Direct
Name: 89898325
Synonym: CF0518
Alternate gene names: NA
Gene position: 608403-611180 (Clockwise)
Preceding gene: 89898324
Following gene: 89898326
Centisome position: 52.17
GC content: 36.39
Gene sequence:
>2778_bases ATGCGAAAAGCCCTTCGTTTGCTACTAAATTTACATCACGGGGAAGAGAGAAGAGCGTTTTTATTCCTGATTTTGGGATT AATCTGGGGTATTGGTTGCTACGGATCTCTTGCGTTAAGCGAAGGGCTTTTTCTAGAAAATGTAGGCACGGAAGGGCTCC CATCTTTTTATCTGGGATCATCGTCCATTCTGTGCCTCTTTTCCTCGCTAATTCTTTACAATTTGTTCAAAAAAAGAGTT TCACCAAAAACGCTATTTTTAATACCAATAACTAGCATGATTGCGTGTAACCTTTACCTCCTTTGTTACGCAGCAACGTG CGCAGAAATTCCACCTACACCACTACTTATTTATCGCATGTTATCTTGGAACTTAATCATACTAGCGTATACGAATTTCT GGGGATTCGTAGATCAGTTCTTTAACCTTCAGGATGCTAAAAGACATTTTAGCGTATTTAATGCTATCATATTTTTAGGA GATGCTATTGGTTCAGGAATCGTTAATAGAATTCAATACATAGGAATCGAAAGAATTCTGATACTCCTTATAGTAATTCT ACTATGCTGTTTCCCACTAGTGCACTATGTATCTAAAACTCTAAAGGAACTTTCGGAAGATCATGACCACTTCTTAGATA CGGGCCATCCCCCATCCATATCCAAAGCTTTTAAGCTTTGTCTAAAGGATAGTTACACCTTTTACCTGCTATGTTTTTAC TTTTTAATGCAACTGCTCGCTATAGCAACAGAGTTCAACTATTTAAAAATTTTCGAGGAGCACTTCGCTGATAAGAATAC ATACGAACTGACAGCTCATATAACCAAGTGGTCGTCGTGGATTTCTTTAACAAATATGTGTTTTGCTCTATTTGCCTATA GCAGAATTGTTAAAAATATCGGCGTAAATAACATTATTCTCTTTGCTCCACTATGCTTCACCAGTCTTTTTCTCTGTTGG TCTTGCAAAACTTCAGTAGGAATTGCCACTATAGGTATGGTAGCAAGGGAGGGTCTTACCTACGCCCTAGATGATAATAA CTTGCAGCTGCTAATCTACGGTGTTCCCAATAGAATCCGAAACCAAATTAGAATAGGGATCGAGTGTTTTATTGAACCCA TAGGCATGTTCACATGGGCTCTCGTGTGTTTCACTACTTCCGCCCAATATAAAGTTTGTCTTATCATATCCATTATTACG GTAGTTCTAGCCTATTTGTTGCGCTCATATTACGCCAAAGCTATTCTAAGAAATCTGTCTTCTCAAGCCATCTATCTGAA AAAGACCATGGTAGAATGGATAAAAGCTATGACTTTAAAGGAGAAAAGACAGACCGAGCTTCTACTACTTTCTCATCTAA AACATCAGCACGAAAGACATCAAATCTTGGCTTTCCAACACTTACTTAATCTTGGCAGCCGTAGTGTTCTTCCTAGTTTA TTATCCCATATGAATAAACTTAGCCTGCCCAGCAAGCTAAAAACTATGGAAATGTTAAAAAATAGTCTTTGGGCTAAGGA TTTTCTTACTCTAGAGCTTTTGAAGCGATGGTCATCAACCACCCCTCATCCCTCAATAGCTACAGGAATACATCTCTATT TTGCAAAACATGACTTATTAGAAATTTCTGATATCTCTGAAGATCTTTATGACGATCCCGGTGATAGACTTCTAGCAGCA ATTCTTACTGTTCGTCGCCAGGAAATTACAGGACAATATCGTGATATTGCAGATTCACGACTCAAAGAATTGCTCTCTTC TCCAGATCTTCAAGTAGTATCCATAGGACTTTCTATTCTAACTCTAGAAAAAAATCCAGATAATTTCCCCTTCTTAATGG AGTTTTTGGATAACGCAAGTCATGAGATTTTTATTCAAACATGTAAAGCTCTACAGGCATCAGTAAAAGCCTCTCATAAA CCCTATTGCAAAAGACTGATACAAATTCTAAAACATCACGTTCATAACGAGGAAGCTTGCTATTATCTATTAAAAACCAT CGCAGTTATCTTAGACGTTTCATTAGTTAAAGAGTTCCTGATTACCACATCATTATTAAAAAGTTCCTCTAGGAAATACG CAGAGTCTATCATCTTAGATCTTCCTAAAGAAACAGCTTCCTCACTTCTTCAGATTCTTTCTGATAATAACGTACACAAT CGTTGTCGTATTCTTGCAGCAAAAGCTCTATGTAAAATCGATAATAAACTATTTAAGAAGCACGCTTATAGAATTGTAAA AGCCAAAGCTTTGAAGGCTATTTTTTACGACTATCATAAAAATTATATTCAAAAATCCTATCCAAAGTACAATCTCAGCC TATTAGTTAATACTTTAGAATCCAATTATCAATCAGAAGTGAACTTCATGTTTGAATTCTTAGGAATTTTAGGCTCCATA GAACACTCAGATATTCTTATAAGAGCTCTGACTGGGAAAAATAAAAAGGCAAAAGCTCAAGCTCTAGAATCTTTAGAAAA GAGCTGCGAAGACTACTTATTTTCTCTGCTAGATCCTTTCATTAACGATACCGGCAATCGCAGTGAAAAATATTACTTAA AATGCGGGGTTATTCCTTTAACTTTAAAAGAGTTATTGAATATGATGGAAAACTCTCCATCATATTTAAGTAAACTTACA TCCAGACAGCTAAAAGAAGAACTAGCAAGCTGTGATGCAGATTTTCAACCCACGCCACCGTATTCGACTTTAGATGAAGA AAATGAAAATCATAATCAAAACGACTCTACAAGTCTAGTTCACTTCTTTACTATTTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases AAAAGTATATAAAAAATTTATTATTCTTTAATCCCTCACACCCACATTGAAATTAATTAATTTTATCAGTTAATATATTA TTTTCTTAGGTGGGTTTGTC
Downstream 100 bases:
>100_bases CCAGGAGTCTCTTGATGAATCTAATAGACCGCGCTTTCCTTATAAAGAAAAATCCTATTTTCAACTCTTTAGATATGGAT GTTCTCCTGGCTATTTCAGA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 925; Mature: 925
Protein sequence:
>925_residues MRKALRLLLNLHHGEERRAFLFLILGLIWGIGCYGSLALSEGLFLENVGTEGLPSFYLGSSSILCLFSSLILYNLFKKRV SPKTLFLIPITSMIACNLYLLCYAATCAEIPPTPLLIYRMLSWNLIILAYTNFWGFVDQFFNLQDAKRHFSVFNAIIFLG DAIGSGIVNRIQYIGIERILILLIVILLCCFPLVHYVSKTLKELSEDHDHFLDTGHPPSISKAFKLCLKDSYTFYLLCFY FLMQLLAIATEFNYLKIFEEHFADKNTYELTAHITKWSSWISLTNMCFALFAYSRIVKNIGVNNIILFAPLCFTSLFLCW SCKTSVGIATIGMVAREGLTYALDDNNLQLLIYGVPNRIRNQIRIGIECFIEPIGMFTWALVCFTTSAQYKVCLIISIIT VVLAYLLRSYYAKAILRNLSSQAIYLKKTMVEWIKAMTLKEKRQTELLLLSHLKHQHERHQILAFQHLLNLGSRSVLPSL LSHMNKLSLPSKLKTMEMLKNSLWAKDFLTLELLKRWSSTTPHPSIATGIHLYFAKHDLLEISDISEDLYDDPGDRLLAA ILTVRRQEITGQYRDIADSRLKELLSSPDLQVVSIGLSILTLEKNPDNFPFLMEFLDNASHEIFIQTCKALQASVKASHK PYCKRLIQILKHHVHNEEACYYLLKTIAVILDVSLVKEFLITTSLLKSSSRKYAESIILDLPKETASSLLQILSDNNVHN RCRILAAKALCKIDNKLFKKHAYRIVKAKALKAIFYDYHKNYIQKSYPKYNLSLLVNTLESNYQSEVNFMFEFLGILGSI EHSDILIRALTGKNKKAKAQALESLEKSCEDYLFSLLDPFINDTGNRSEKYYLKCGVIPLTLKELLNMMENSPSYLSKLT SRQLKEELASCDADFQPTPPYSTLDEENENHNQNDSTSLVHFFTI
Sequences:
>Translated_925_residues MRKALRLLLNLHHGEERRAFLFLILGLIWGIGCYGSLALSEGLFLENVGTEGLPSFYLGSSSILCLFSSLILYNLFKKRV SPKTLFLIPITSMIACNLYLLCYAATCAEIPPTPLLIYRMLSWNLIILAYTNFWGFVDQFFNLQDAKRHFSVFNAIIFLG DAIGSGIVNRIQYIGIERILILLIVILLCCFPLVHYVSKTLKELSEDHDHFLDTGHPPSISKAFKLCLKDSYTFYLLCFY FLMQLLAIATEFNYLKIFEEHFADKNTYELTAHITKWSSWISLTNMCFALFAYSRIVKNIGVNNIILFAPLCFTSLFLCW SCKTSVGIATIGMVAREGLTYALDDNNLQLLIYGVPNRIRNQIRIGIECFIEPIGMFTWALVCFTTSAQYKVCLIISIIT VVLAYLLRSYYAKAILRNLSSQAIYLKKTMVEWIKAMTLKEKRQTELLLLSHLKHQHERHQILAFQHLLNLGSRSVLPSL LSHMNKLSLPSKLKTMEMLKNSLWAKDFLTLELLKRWSSTTPHPSIATGIHLYFAKHDLLEISDISEDLYDDPGDRLLAA ILTVRRQEITGQYRDIADSRLKELLSSPDLQVVSIGLSILTLEKNPDNFPFLMEFLDNASHEIFIQTCKALQASVKASHK PYCKRLIQILKHHVHNEEACYYLLKTIAVILDVSLVKEFLITTSLLKSSSRKYAESIILDLPKETASSLLQILSDNNVHN RCRILAAKALCKIDNKLFKKHAYRIVKAKALKAIFYDYHKNYIQKSYPKYNLSLLVNTLESNYQSEVNFMFEFLGILGSI EHSDILIRALTGKNKKAKAQALESLEKSCEDYLFSLLDPFINDTGNRSEKYYLKCGVIPLTLKELLNMMENSPSYLSKLT SRQLKEELASCDADFQPTPPYSTLDEENENHNQNDSTSLVHFFTI >Mature_925_residues MRKALRLLLNLHHGEERRAFLFLILGLIWGIGCYGSLALSEGLFLENVGTEGLPSFYLGSSSILCLFSSLILYNLFKKRV SPKTLFLIPITSMIACNLYLLCYAATCAEIPPTPLLIYRMLSWNLIILAYTNFWGFVDQFFNLQDAKRHFSVFNAIIFLG DAIGSGIVNRIQYIGIERILILLIVILLCCFPLVHYVSKTLKELSEDHDHFLDTGHPPSISKAFKLCLKDSYTFYLLCFY FLMQLLAIATEFNYLKIFEEHFADKNTYELTAHITKWSSWISLTNMCFALFAYSRIVKNIGVNNIILFAPLCFTSLFLCW SCKTSVGIATIGMVAREGLTYALDDNNLQLLIYGVPNRIRNQIRIGIECFIEPIGMFTWALVCFTTSAQYKVCLIISIIT VVLAYLLRSYYAKAILRNLSSQAIYLKKTMVEWIKAMTLKEKRQTELLLLSHLKHQHERHQILAFQHLLNLGSRSVLPSL LSHMNKLSLPSKLKTMEMLKNSLWAKDFLTLELLKRWSSTTPHPSIATGIHLYFAKHDLLEISDISEDLYDDPGDRLLAA ILTVRRQEITGQYRDIADSRLKELLSSPDLQVVSIGLSILTLEKNPDNFPFLMEFLDNASHEIFIQTCKALQASVKASHK PYCKRLIQILKHHVHNEEACYYLLKTIAVILDVSLVKEFLITTSLLKSSSRKYAESIILDLPKETASSLLQILSDNNVHN RCRILAAKALCKIDNKLFKKHAYRIVKAKALKAIFYDYHKNYIQKSYPKYNLSLLVNTLESNYQSEVNFMFEFLGILGSI EHSDILIRALTGKNKKAKAQALESLEKSCEDYLFSLLDPFINDTGNRSEKYYLKCGVIPLTLKELLNMMENSPSYLSKLT SRQLKEELASCDADFQPTPPYSTLDEENENHNQNDSTSLVHFFTI
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 105792; Mature: 105792
Theoretical pI: Translated: 8.42; Mature: 8.42
Prosite motif: PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
2.6 %Cys (Translated Protein) 1.7 %Met (Translated Protein) 4.3 %Cys+Met (Translated Protein) 2.6 %Cys (Mature Protein) 1.7 %Met (Mature Protein) 4.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MRKALRLLLNLHHGEERRAFLFLILGLIWGIGCYGSLALSEGLFLENVGTEGLPSFYLGS CHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCCCCCHHCCC SSILCLFSSLILYNLFKKRVSPKTLFLIPITSMIACNLYLLCYAATCAEIPPTPLLIYRM CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH LSWNLIILAYTNFWGFVDQFFNLQDAKRHFSVFNAIIFLGDAIGSGIVNRIQYIGIERIL HHCCEEEEEHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILLIVILLCCFPLVHYVSKTLKELSEDHDHFLDTGHPPSISKAFKLCLKDSYTFYLLCFY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH FLMQLLAIATEFNYLKIFEEHFADKNTYELTAHITKWSSWISLTNMCFALFAYSRIVKNI HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GVNNIILFAPLCFTSLFLCWSCKTSVGIATIGMVAREGLTYALDDNNLQLLIYGVPNRIR CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEECCCEEEEEEECCHHHH NQIRIGIECFIEPIGMFTWALVCFTTSAQYKVCLIISIITVVLAYLLRSYYAKAILRNLS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC SQAIYLKKTMVEWIKAMTLKEKRQTELLLLSHLKHQHERHQILAFQHLLNLGSRSVLPSL CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH LSHMNKLSLPSKLKTMEMLKNSLWAKDFLTLELLKRWSSTTPHPSIATGIHLYFAKHDLL HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHEEHHCCCH EISDISEDLYDDPGDRLLAAILTVRRQEITGQYRDIADSRLKELLSSPDLQVVSIGLSIL HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECEEEE TLEKNPDNFPFLMEFLDNASHEIFIQTCKALQASVKASHKPYCKRLIQILKHHVHNEEAC EEECCCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH YYLLKTIAVILDVSLVKEFLITTSLLKSSSRKYAESIILDLPKETASSLLQILSDNNVHN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHH RCRILAAKALCKIDNKLFKKHAYRIVKAKALKAIFYDYHKNYIQKSYPKYNLSLLVNTLE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH SNYQSEVNFMFEFLGILGSIEHSDILIRALTGKNKKAKAQALESLEKSCEDYLFSLLDPF HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH INDTGNRSEKYYLKCGVIPLTLKELLNMMENSPSYLSKLTSRQLKEELASCDADFQPTPP HCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC YSTLDEENENHNQNDSTSLVHFFTI CCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEC >Mature Secondary Structure MRKALRLLLNLHHGEERRAFLFLILGLIWGIGCYGSLALSEGLFLENVGTEGLPSFYLGS CHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCCCCCHHCCC SSILCLFSSLILYNLFKKRVSPKTLFLIPITSMIACNLYLLCYAATCAEIPPTPLLIYRM CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH LSWNLIILAYTNFWGFVDQFFNLQDAKRHFSVFNAIIFLGDAIGSGIVNRIQYIGIERIL HHCCEEEEEHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILLIVILLCCFPLVHYVSKTLKELSEDHDHFLDTGHPPSISKAFKLCLKDSYTFYLLCFY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH FLMQLLAIATEFNYLKIFEEHFADKNTYELTAHITKWSSWISLTNMCFALFAYSRIVKNI HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GVNNIILFAPLCFTSLFLCWSCKTSVGIATIGMVAREGLTYALDDNNLQLLIYGVPNRIR CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEECCCEEEEEEECCHHHH NQIRIGIECFIEPIGMFTWALVCFTTSAQYKVCLIISIITVVLAYLLRSYYAKAILRNLS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC SQAIYLKKTMVEWIKAMTLKEKRQTELLLLSHLKHQHERHQILAFQHLLNLGSRSVLPSL CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH LSHMNKLSLPSKLKTMEMLKNSLWAKDFLTLELLKRWSSTTPHPSIATGIHLYFAKHDLL HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHEEHHCCCH EISDISEDLYDDPGDRLLAAILTVRRQEITGQYRDIADSRLKELLSSPDLQVVSIGLSIL HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECEEEE TLEKNPDNFPFLMEFLDNASHEIFIQTCKALQASVKASHKPYCKRLIQILKHHVHNEEAC EEECCCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH YYLLKTIAVILDVSLVKEFLITTSLLKSSSRKYAESIILDLPKETASSLLQILSDNNVHN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHH RCRILAAKALCKIDNKLFKKHAYRIVKAKALKAIFYDYHKNYIQKSYPKYNLSLLVNTLE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH SNYQSEVNFMFEFLGILGSIEHSDILIRALTGKNKKAKAQALESLEKSCEDYLFSLLDPF HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH INDTGNRSEKYYLKCGVIPLTLKELLNMMENSPSYLSKLTSRQLKEELASCDADFQPTPP HCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC YSTLDEENENHNQNDSTSLVHFFTI CCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA