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The map label for this gene is ycaI [H]

Identifier: 89257164

GI number: 89257164

Start: 1848973

End: 1850988

Strand: Reverse

Name: ycaI [H]

Synonym: FTL_1916

Alternate gene names: 89257164

Gene position: 1850988-1848973 (Counterclockwise)

Preceding gene: 89257168

Following gene: 89257163

Centisome position: 97.63

GC content: 29.61

Gene sequence:

>2016_bases
ATGTTAATTAGACAAAGATGTTTATTAATTATACTTTTATTTATAAGTGTTTGTTCAAGCTACTCTTATGATAAGCTTGA
GGAGTTTAAATATAATCAAAATATTTTACTTACTGGTATTGTCAGTGGCATTCCAAAACTACAAGATGATCAGTATGAGT
TTATTTTTCATAGCTATAAGTATGGTGATATATTACTCAAGGCAGCTAAGTCGTATCGTCACTATCTAATACCAGCTAAT
AAGCTAGAATTAGAAGCGAAAATCTATAAGCCGCATGAGTATGACAATCTATCTGCTTTTAATTATGCTGAGTATCTTGA
GCATAATGATATTATTGCTCTTGGCAAGGTTATTGACAACTCAGCTATTGCATACAAGGGCACAGCAAGCTTATATTTAC
CTCAGCGAATAAGGTATTATCTATATAATCATCTACAAAGACAGCTAAGCAATTTTAAACAAAAAGATTTTGCCATAGCA
CTACTTATTGGAGATAAGAATTTTGACCAGTCGCAGCAGAATCTTTTGATTAGTTCTGGGACCTCACATCTAATGGTAAT
TTCTGGGCTACATGTTGGGCTTTTAGCATTTATTGCATTTATTGTGTTTAGAGGATTATGGTCATTATCACCACGCTTAT
GTCGTAATTTGCCAGCACAATATATTGGGGTTATAGCTTCTGTTATTATAGCTTTTATTTATAGCTTATTAGCCGGCTTT
AGCTTACCAACAGAACGAGCGTTAATAATGCTTTTAGTAGTAGCTATGTTATGGCTTTTTGGAAAGCGTATTTCAATAGT
TAAGTCGCTACTAGTTGCTTTTGTCATAATACTTTTAATTGATTTTGAATCAATTTATAGCATTAGCCTTTGGTTGAGTT
TCTCAGCTGTGATCTTATTGGTTATTATTTCTATAGTGCTACAACAGTATAAATCAAAATTGATAAAGATATTACTTGCC
CAAACATATTTGGCAATTTTTTTAGTTCCTATATCAGTTTATTATTTTGGTGGTTTTTCTGTTGTTTCAATTTTAGCAAA
TATAGTTGCGATTCCTTTAGTGAGCTTTGTGATCGTACCGTTATTACTTTTATGTTTGTTGTTATCTTTTATCGGTATCA
ATCTGTGGTTGTTGCCAATGATGTTTTTAAAACTTCTGGTAGCTTATTTAAGTTTTTTGACTAATTATGCAGGCTTTATA
AGCTATTGGAGTTATTTTTCATTTTTTAGCCTAGTAATTATAATTCTAGGGATTATTTTAGTGATTTTCCCTTTTAGTAA
ACCTCTTAGTATACTTGGGCTAGCTATGTGCTTAGTATTTTTTCAGTCTTCACAAAATATTGCTGAAAAATATCAACGCT
TTCAAATAGACATTTTTGATACTCAAAATCAAATGGTATTAGTTCAAGATCAAGGTAAAAATCTTTTATATACAGCCGCA
AAAAATTTAGCTAATGAGTATCTTTTAGCAAATGTGCTAGAAAGCTATTTAAGATTTGCAGGTATTAAACAAATAGATTA
TATTATAATTGTTGATGGTAATAAAAATCTAAACCTTAAGCTTATTAGGCAAATTATTTCGATCAAAACAGTTATTACAA
ATATATCTACTAATGAAGATGTACAAAAATGTAGTTATGCTAATAATTTTAAATTAAATAGTCATACATCAGTTAAGCTA
CTATCAAATGCTCAAAGTTGTTTTACTTCATTAAATTATCAAGGTAAAGAGTTTTTATTAGCAGATAACTCAAATCAGAA
GGCACAGCAGCAGCTCTATACTTTGTATAACAGAGTTATTCAGCCACAGATAATAATTACACCAGCAATTATAGATTCTA
AGTTTTTAAATCAAGATGTTGATTATCTGGTATATATTTCTGATAAACCTTTAAAGGGGCAAAACTCTAAGAATACTAAA
TTAAAAATTTTTGATACTTATGCAAATGGTTTGATAACTATTAAGATTGATAATCATCATAGTATCACTATTAGTTCACA
GTTGAAGCAATACTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTATTATCTTAATAACTTGTATTTAGAAAAAAGTTAAGTTGTTAGTTGTAGCTTAATTAGGGTAATATGATAATTAAGT
AATAATATTTTGATGTCTAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GAAAAGTTAATATTCGTTAATTTTATCTCTATAGCCTTTTAAAAAGTCTTATATAAATGATACTATTTAGGTAGCAAATA
ACAATTTATAACAATATTAA

Product: competence-related protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 671; Mature: 671

Protein sequence:

>671_residues
MLIRQRCLLIILLFISVCSSYSYDKLEEFKYNQNILLTGIVSGIPKLQDDQYEFIFHSYKYGDILLKAAKSYRHYLIPAN
KLELEAKIYKPHEYDNLSAFNYAEYLEHNDIIALGKVIDNSAIAYKGTASLYLPQRIRYYLYNHLQRQLSNFKQKDFAIA
LLIGDKNFDQSQQNLLISSGTSHLMVISGLHVGLLAFIAFIVFRGLWSLSPRLCRNLPAQYIGVIASVIIAFIYSLLAGF
SLPTERALIMLLVVAMLWLFGKRISIVKSLLVAFVIILLIDFESIYSISLWLSFSAVILLVIISIVLQQYKSKLIKILLA
QTYLAIFLVPISVYYFGGFSVVSILANIVAIPLVSFVIVPLLLLCLLLSFIGINLWLLPMMFLKLLVAYLSFLTNYAGFI
SYWSYFSFFSLVIIILGIILVIFPFSKPLSILGLAMCLVFFQSSQNIAEKYQRFQIDIFDTQNQMVLVQDQGKNLLYTAA
KNLANEYLLANVLESYLRFAGIKQIDYIIIVDGNKNLNLKLIRQIISIKTVITNISTNEDVQKCSYANNFKLNSHTSVKL
LSNAQSCFTSLNYQGKEFLLADNSNQKAQQQLYTLYNRVIQPQIIITPAIIDSKFLNQDVDYLVYISDKPLKGQNSKNTK
LKIFDTYANGLITIKIDNHHSITISSQLKQY

Sequences:

>Translated_671_residues
MLIRQRCLLIILLFISVCSSYSYDKLEEFKYNQNILLTGIVSGIPKLQDDQYEFIFHSYKYGDILLKAAKSYRHYLIPAN
KLELEAKIYKPHEYDNLSAFNYAEYLEHNDIIALGKVIDNSAIAYKGTASLYLPQRIRYYLYNHLQRQLSNFKQKDFAIA
LLIGDKNFDQSQQNLLISSGTSHLMVISGLHVGLLAFIAFIVFRGLWSLSPRLCRNLPAQYIGVIASVIIAFIYSLLAGF
SLPTERALIMLLVVAMLWLFGKRISIVKSLLVAFVIILLIDFESIYSISLWLSFSAVILLVIISIVLQQYKSKLIKILLA
QTYLAIFLVPISVYYFGGFSVVSILANIVAIPLVSFVIVPLLLLCLLLSFIGINLWLLPMMFLKLLVAYLSFLTNYAGFI
SYWSYFSFFSLVIIILGIILVIFPFSKPLSILGLAMCLVFFQSSQNIAEKYQRFQIDIFDTQNQMVLVQDQGKNLLYTAA
KNLANEYLLANVLESYLRFAGIKQIDYIIIVDGNKNLNLKLIRQIISIKTVITNISTNEDVQKCSYANNFKLNSHTSVKL
LSNAQSCFTSLNYQGKEFLLADNSNQKAQQQLYTLYNRVIQPQIIITPAIIDSKFLNQDVDYLVYISDKPLKGQNSKNTK
LKIFDTYANGLITIKIDNHHSITISSQLKQY
>Mature_671_residues
MLIRQRCLLIILLFISVCSSYSYDKLEEFKYNQNILLTGIVSGIPKLQDDQYEFIFHSYKYGDILLKAAKSYRHYLIPAN
KLELEAKIYKPHEYDNLSAFNYAEYLEHNDIIALGKVIDNSAIAYKGTASLYLPQRIRYYLYNHLQRQLSNFKQKDFAIA
LLIGDKNFDQSQQNLLISSGTSHLMVISGLHVGLLAFIAFIVFRGLWSLSPRLCRNLPAQYIGVIASVIIAFIYSLLAGF
SLPTERALIMLLVVAMLWLFGKRISIVKSLLVAFVIILLIDFESIYSISLWLSFSAVILLVIISIVLQQYKSKLIKILLA
QTYLAIFLVPISVYYFGGFSVVSILANIVAIPLVSFVIVPLLLLCLLLSFIGINLWLLPMMFLKLLVAYLSFLTNYAGFI
SYWSYFSFFSLVIIILGIILVIFPFSKPLSILGLAMCLVFFQSSQNIAEKYQRFQIDIFDTQNQMVLVQDQGKNLLYTAA
KNLANEYLLANVLESYLRFAGIKQIDYIIIVDGNKNLNLKLIRQIISIKTVITNISTNEDVQKCSYANNFKLNSHTSVKL
LSNAQSCFTSLNYQGKEFLLADNSNQKAQQQLYTLYNRVIQPQIIITPAIIDSKFLNQDVDYLVYISDKPLKGQNSKNTK
LKIFDTYANGLITIKIDNHHSITISSQLKQY

Specific function: Unknown

COG id: COG0658

COG function: function code R; Predicted membrane metal-binding protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To B.subtilis ComEC, N.gonorrhoeae ComA, and H.influenzae Rec2 [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI87081801, Length=580, Percent_Identity=23.1034482758621, Blast_Score=110, Evalue=3e-25,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001279
- InterPro:   IPR004477
- InterPro:   IPR004797 [H]

Pfam domain/function: PF03772 Competence; PF00753 Lactamase_B [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 76480; Mature: 76480

Theoretical pI: Translated: 9.48; Mature: 9.48

Prosite motif: PS00626 RCC1_2

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
1.2 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
1.2 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLIRQRCLLIILLFISVCSSYSYDKLEEFKYNQNILLTGIVSGIPKLQDDQYEFIFHSYK
CCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHCCCCCCCCCCHHHHHHCC
YGDILLKAAKSYRHYLIPANKLELEAKIYKPHEYDNLSAFNYAEYLEHNDIIALGKVIDN
HHHHHHHHHHHCCEEECCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHCC
SAIAYKGTASLYLPQRIRYYLYNHLQRQLSNFKQKDFAIALLIGDKNFDQSQQNLLISSG
CCEEECCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCCCHHHCEEEECC
TSHLMVISGLHVGLLAFIAFIVFRGLWSLSPRLCRNLPAQYIGVIASVIIAFIYSLLAGF
CCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
SLPTERALIMLLVVAMLWLFGKRISIVKSLLVAFVIILLIDFESIYSISLWLSFSAVILL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VIISIVLQQYKSKLIKILLAQTYLAIFLVPISVYYFGGFSVVSILANIVAIPLVSFVIVP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLLLCLLLSFIGINLWLLPMMFLKLLVAYLSFLTNYAGFISYWSYFSFFSLVIIILGIIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VIFPFSKPLSILGLAMCLVFFQSSQNIAEKYQRFQIDIFDTQNQMVLVQDQGKNLLYTAA
HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCHHHHH
KNLANEYLLANVLESYLRFAGIKQIDYIIIVDGNKNLNLKLIRQIISIKTVITNISTNED
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH
VQKCSYANNFKLNSHTSVKLLSNAQSCFTSLNYQGKEFLLADNSNQKAQQQLYTLYNRVI
HHHHCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHC
QPQIIITPAIIDSKFLNQDVDYLVYISDKPLKGQNSKNTKLKIFDTYANGLITIKIDNHH
CCEEEEEHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCEEEEEECCCC
SITISSQLKQY
EEEEHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MLIRQRCLLIILLFISVCSSYSYDKLEEFKYNQNILLTGIVSGIPKLQDDQYEFIFHSYK
CCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHCCCCCCCCCCHHHHHHCC
YGDILLKAAKSYRHYLIPANKLELEAKIYKPHEYDNLSAFNYAEYLEHNDIIALGKVIDN
HHHHHHHHHHHCCEEECCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHCC
SAIAYKGTASLYLPQRIRYYLYNHLQRQLSNFKQKDFAIALLIGDKNFDQSQQNLLISSG
CCEEECCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCCCHHHCEEEECC
TSHLMVISGLHVGLLAFIAFIVFRGLWSLSPRLCRNLPAQYIGVIASVIIAFIYSLLAGF
CCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
SLPTERALIMLLVVAMLWLFGKRISIVKSLLVAFVIILLIDFESIYSISLWLSFSAVILL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VIISIVLQQYKSKLIKILLAQTYLAIFLVPISVYYFGGFSVVSILANIVAIPLVSFVIVP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLLLCLLLSFIGINLWLLPMMFLKLLVAYLSFLTNYAGFISYWSYFSFFSLVIIILGIIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VIFPFSKPLSILGLAMCLVFFQSSQNIAEKYQRFQIDIFDTQNQMVLVQDQGKNLLYTAA
HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCHHHHH
KNLANEYLLANVLESYLRFAGIKQIDYIIIVDGNKNLNLKLIRQIISIKTVITNISTNED
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH
VQKCSYANNFKLNSHTSVKLLSNAQSCFTSLNYQGKEFLLADNSNQKAQQQLYTLYNRVI
HHHHCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHC
QPQIIITPAIIDSKFLNQDVDYLVYISDKPLKGQNSKNTKLKIFDTYANGLITIKIDNHH
CCEEEEEHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCEEEEEECCCC
SITISSQLKQY
EEEEHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8905232; 9278503; 8094880 [H]