| Definition | Francisella tularensis subsp. holarctica LVS chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007880 |
| Length | 1,895,994 |
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The map label for this gene is feoB [H]
Identifier: 89255570
GI number: 89255570
Start: 137653
End: 139896
Strand: Reverse
Name: feoB [H]
Synonym: FTL_0133
Alternate gene names: 89255570
Gene position: 139896-137653 (Counterclockwise)
Preceding gene: 89255571
Following gene: 89255569
Centisome position: 7.38
GC content: 33.47
Gene sequence:
>2244_bases ATGAAATATGCTCTAGTTGGCAATCCAAACTGCGGTAAAACAACAATCTTTAATGCTTTAACAGGACTTAACCAAAAAGT TGGTAACTGGTCTGGAGTTACAGTTGATAAAAAAACTGGTTTTTTTAACTCAAAAGATAAAAAAATTGAAGTTGTTGATA TACCAGGAATTTATTCACTATCAGTATCAGATGCAAATTCTATTGATGAACAAATAGCCTATTCTTTTGTAGTTAAAGAG AAACCTAATGCTATTATTAATGTTGTAGATGCTTCTAATTTGAATAGAAGTCTTTATCTAACTATGCAACTTATTGAGCT TGGGCTACCAGTCATATTAGTGGTTAATATGATTGATGTTGCCAATAAAAAAGGACTCATTATTCACTATGACAGATTAG AGAAAACATTAGGTTGTAAAGTATTACCAGTCGTTGCAGCAAAAGGTATTGGTATTAAAGAGTTAAAAGAAACTCTAGTA GATCATCAAAAAATTTCTAGTTTTGACTTAAAAAGTTACTATCCAAGGATAGTCACTGAGTTAGCACAACAAATAACCAC ACAGAAAAATGATGATATTGGTAGTCTGTGGCTTGCTATTGAGCTAATTGATGGTAGAGAGCTACAACTCTCACAAGAAA TCACAGCTAGTCAACTAGATAGCTTAAAGTCTCTTTTACAATCAAACACTGACATTGATATTGCTAAAGTCAGATATAAT GCTGTCGCTGAAATTGTAGCTAGCATTACTGAAAATAAAAAAGTCTCTCGCTTTAACTTTACCAAAGCACTCGATGCACT TTGCATGAATAAATATTTAGGTGTGCCGATATTTTTATTGATGATGTACTTGATGTTTTTATTTTCAATTACACTAGGTG GCGCAATACAACCAATGTTTGATGATTTATCTCATGCTATTTTTGTTGATGGTTTGGCATATTACTCAAATATGCTTGGT CTACCGACAGCTGTCACAGGTATTCTCGCAAATGGTTTAGGTACAGGTATCAATACTGTACTAGGATTTATTCCTCAGAT TGGTTTTTTATTTATATTTTTATCAATACTCGAAGACTCTGGCTATATGTCTCGAGCTGCTTTTGTTATGGATAGATTTA TGCAATCTATTGGTTTATCCGGCAAAGCTTTTGTACCGTTAATTGTTGGCTTTGGTTGCAATGTCGCTTCAATTATGGCT GCTAGAACTTTAGAAACACGCAAAGATCGTCTGATGACTTTGATGATGTCACCATTTATGTCTTGTGGTGCAAGACTTGC GATATTTTCAGTATTTGCTAGTGCATTTTTTCCTCATAATGGTGCTACTGTAATATTCTTGCTATATTTAGCTGGTATAT TTGGAGCTATAATTACGGGTTATATCATTAAGTTCACTTTTTTAAAGGGTGATACTGCTCCATTTATTTTAGATATTCCA AACTATCATACGCCATCATTTAAAACAGTTATGATCTATAGCTGGAATAGACTCAAGTCTTTCTTAATTAGAGCTGGTAA AGTTATTGTTCCTGTAGCTATAATTGTTGGTAGTCTAAATAGTATATATATTGGTAATAAAACCACAGCACTTGAATATG CCGGTAAAAAAATTACACCAATACTAAATCCTATGGGCATAAATGATGATAACTGGCCAGCAACTGTCGGTCTAATAACC GGTACACTTGCTAAAGAGGTTGTAGTCGGAACATTAAATACAATTTATACTCAAGGTGAAGATAATGTCATTCCTGATAA GTTTAGTCTAATAGATAGTGTCAAAGAATCTTGGAATACAACTATTGATAATATCAAAGGTATAGATCTAGCAACTCTTA TGAATCCAATAGAAGCCAGCAAAGCTGATGCTAATATGGATAATGGGGCTATGGGTAATATGGTAACAAAATTCGGTTCA CTATCAGCAGCTTTTGCTTATCTACTCTTTGTTTTATTATATATACCTTGTATTTCTGTGGTTGGAGCAATGGTAAGAGA ATCAACACGAGGCTGGGCAATTTTGTCAGTTCTTTGGAGTGTTTCTATCGCTTATGTAGCTGCTGTTGTTATTTACCAAT TACTCAATATTGCTGAGCACCCTAGTAGTTCTATCATTTGTATTGCTCTAGCTATGGCATACATCATCGGGATAGTTTTT TTGATGAAATATTTATCAACAAAAATAAATTTCGTGGCAAATCTTACTGGCTGCTCTAGTTGTAGTAGTAAAAAATGCTC TTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TAATAATTATCATTATTACATCTACCAATTAATAATCATTTTGATATAATATCCCTACTTTCTTTAGAGAATCTATACTA TAAACTCCTGAAAACTGATT
Downstream 100 bases:
>100_bases AATTCTAATTTGAATATACAGCTTTAAATATGCCTTCTTAAAACTTACAAAAATTAAGATTATGTTGGCTTTCAACTTTT ATTAGTTTTAAAGCTACTAA
Product: ferrous iron transport protein
Products: Fe (II) [Cytoplasm] [C]
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 747; Mature: 747
Protein sequence:
>747_residues MKYALVGNPNCGKTTIFNALTGLNQKVGNWSGVTVDKKTGFFNSKDKKIEVVDIPGIYSLSVSDANSIDEQIAYSFVVKE KPNAIINVVDASNLNRSLYLTMQLIELGLPVILVVNMIDVANKKGLIIHYDRLEKTLGCKVLPVVAAKGIGIKELKETLV DHQKISSFDLKSYYPRIVTELAQQITTQKNDDIGSLWLAIELIDGRELQLSQEITASQLDSLKSLLQSNTDIDIAKVRYN AVAEIVASITENKKVSRFNFTKALDALCMNKYLGVPIFLLMMYLMFLFSITLGGAIQPMFDDLSHAIFVDGLAYYSNMLG LPTAVTGILANGLGTGINTVLGFIPQIGFLFIFLSILEDSGYMSRAAFVMDRFMQSIGLSGKAFVPLIVGFGCNVASIMA ARTLETRKDRLMTLMMSPFMSCGARLAIFSVFASAFFPHNGATVIFLLYLAGIFGAIITGYIIKFTFLKGDTAPFILDIP NYHTPSFKTVMIYSWNRLKSFLIRAGKVIVPVAIIVGSLNSIYIGNKTTALEYAGKKITPILNPMGINDDNWPATVGLIT GTLAKEVVVGTLNTIYTQGEDNVIPDKFSLIDSVKESWNTTIDNIKGIDLATLMNPIEASKADANMDNGAMGNMVTKFGS LSAAFAYLLFVLLYIPCISVVGAMVRESTRGWAILSVLWSVSIAYVAAVVIYQLLNIAEHPSSSIICIALAMAYIIGIVF LMKYLSTKINFVANLTGCSSCSSKKCS
Sequences:
>Translated_747_residues MKYALVGNPNCGKTTIFNALTGLNQKVGNWSGVTVDKKTGFFNSKDKKIEVVDIPGIYSLSVSDANSIDEQIAYSFVVKE KPNAIINVVDASNLNRSLYLTMQLIELGLPVILVVNMIDVANKKGLIIHYDRLEKTLGCKVLPVVAAKGIGIKELKETLV DHQKISSFDLKSYYPRIVTELAQQITTQKNDDIGSLWLAIELIDGRELQLSQEITASQLDSLKSLLQSNTDIDIAKVRYN AVAEIVASITENKKVSRFNFTKALDALCMNKYLGVPIFLLMMYLMFLFSITLGGAIQPMFDDLSHAIFVDGLAYYSNMLG LPTAVTGILANGLGTGINTVLGFIPQIGFLFIFLSILEDSGYMSRAAFVMDRFMQSIGLSGKAFVPLIVGFGCNVASIMA ARTLETRKDRLMTLMMSPFMSCGARLAIFSVFASAFFPHNGATVIFLLYLAGIFGAIITGYIIKFTFLKGDTAPFILDIP NYHTPSFKTVMIYSWNRLKSFLIRAGKVIVPVAIIVGSLNSIYIGNKTTALEYAGKKITPILNPMGINDDNWPATVGLIT GTLAKEVVVGTLNTIYTQGEDNVIPDKFSLIDSVKESWNTTIDNIKGIDLATLMNPIEASKADANMDNGAMGNMVTKFGS LSAAFAYLLFVLLYIPCISVVGAMVRESTRGWAILSVLWSVSIAYVAAVVIYQLLNIAEHPSSSIICIALAMAYIIGIVF LMKYLSTKINFVANLTGCSSCSSKKCS >Mature_747_residues MKYALVGNPNCGKTTIFNALTGLNQKVGNWSGVTVDKKTGFFNSKDKKIEVVDIPGIYSLSVSDANSIDEQIAYSFVVKE KPNAIINVVDASNLNRSLYLTMQLIELGLPVILVVNMIDVANKKGLIIHYDRLEKTLGCKVLPVVAAKGIGIKELKETLV DHQKISSFDLKSYYPRIVTELAQQITTQKNDDIGSLWLAIELIDGRELQLSQEITASQLDSLKSLLQSNTDIDIAKVRYN AVAEIVASITENKKVSRFNFTKALDALCMNKYLGVPIFLLMMYLMFLFSITLGGAIQPMFDDLSHAIFVDGLAYYSNMLG LPTAVTGILANGLGTGINTVLGFIPQIGFLFIFLSILEDSGYMSRAAFVMDRFMQSIGLSGKAFVPLIVGFGCNVASIMA ARTLETRKDRLMTLMMSPFMSCGARLAIFSVFASAFFPHNGATVIFLLYLAGIFGAIITGYIIKFTFLKGDTAPFILDIP NYHTPSFKTVMIYSWNRLKSFLIRAGKVIVPVAIIVGSLNSIYIGNKTTALEYAGKKITPILNPMGINDDNWPATVGLIT GTLAKEVVVGTLNTIYTQGEDNVIPDKFSLIDSVKESWNTTIDNIKGIDLATLMNPIEASKADANMDNGAMGNMVTKFGS LSAAFAYLLFVLLYIPCISVVGAMVRESTRGWAILSVLWSVSIAYVAAVVIYQLLNIAEHPSSSIICIALAMAYIIGIVF LMKYLSTKINFVANLTGCSSCSSKKCS
Specific function: GTP-driven Fe(2+) uptake system [H]
COG id: COG0370
COG function: function code P; Fe2+ transport system protein B
Gene ontology:
Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the feoB (TC 9.A.8) family [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1789813, Length=765, Percent_Identity=46.4052287581699, Blast_Score=669, Evalue=0.0,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003373 - InterPro: IPR011640 - InterPro: IPR011619 - InterPro: IPR011642 - InterPro: IPR005225 [H]
Pfam domain/function: PF07664 FeoB_C; PF02421 FeoB_N; PF07670 Gate [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 81461; Mature: 81461
Theoretical pI: Translated: 8.47; Mature: 8.47
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.3 %Cys (Translated Protein) 3.5 %Met (Translated Protein) 4.8 %Cys+Met (Translated Protein) 1.3 %Cys (Mature Protein) 3.5 %Met (Mature Protein) 4.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKYALVGNPNCGKTTIFNALTGLNQKVGNWSGVTVDKKTGFFNSKDKKIEVVDIPGIYSL CCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHCHHHCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCEEEEEECCCEEEE SVSDANSIDEQIAYSFVVKEKPNAIINVVDASNLNRSLYLTMQLIELGLPVILVVNMIDV ECCCCHHHHHHHHHHHEEECCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH ANKKGLIIHYDRLEKTLGCKVLPVVAAKGIGIKELKETLVDHQKISSFDLKSYYPRIVTE CCCCCEEEEHHHHHHHHCCEEEHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH LAQQITTQKNDDIGSLWLAIELIDGRELQLSQEITASQLDSLKSLLQSNTDIDIAKVRYN HHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHH AVAEIVASITENKKVSRFNFTKALDALCMNKYLGVPIFLLMMYLMFLFSITLGGAIQPMF HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH DDLSHAIFVDGLAYYSNMLGLPTAVTGILANGLGTGINTVLGFIPQIGFLFIFLSILEDS HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC GYMSRAAFVMDRFMQSIGLSGKAFVPLIVGFGCNVASIMAARTLETRKDRLMTLMMSPFM CHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SCGARLAIFSVFASAFFPHNGATVIFLLYLAGIFGAIITGYIIKFTFLKGDTAPFILDIP HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCEEEECC NYHTPSFKTVMIYSWNRLKSFLIRAGKVIVPVAIIVGSLNSIYIGNKTTALEYAGKKITP CCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCEEHHHCCCCCCC ILNPMGINDDNWPATVGLITGTLAKEVVVGTLNTIYTQGEDNVIPDKFSLIDSVKESWNT CCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCC TIDNIKGIDLATLMNPIEASKADANMDNGAMGNMVTKFGSLSAAFAYLLFVLLYIPCISV HHHCCCCCHHHHHHCHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VGAMVRESTRGWAILSVLWSVSIAYVAAVVIYQLLNIAEHPSSSIICIALAMAYIIGIVF HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH LMKYLSTKINFVANLTGCSSCSSKKCS HHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MKYALVGNPNCGKTTIFNALTGLNQKVGNWSGVTVDKKTGFFNSKDKKIEVVDIPGIYSL CCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHCHHHCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCEEEEEECCCEEEE SVSDANSIDEQIAYSFVVKEKPNAIINVVDASNLNRSLYLTMQLIELGLPVILVVNMIDV ECCCCHHHHHHHHHHHEEECCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH ANKKGLIIHYDRLEKTLGCKVLPVVAAKGIGIKELKETLVDHQKISSFDLKSYYPRIVTE CCCCCEEEEHHHHHHHHCCEEEHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH LAQQITTQKNDDIGSLWLAIELIDGRELQLSQEITASQLDSLKSLLQSNTDIDIAKVRYN HHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHH AVAEIVASITENKKVSRFNFTKALDALCMNKYLGVPIFLLMMYLMFLFSITLGGAIQPMF HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH DDLSHAIFVDGLAYYSNMLGLPTAVTGILANGLGTGINTVLGFIPQIGFLFIFLSILEDS HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC GYMSRAAFVMDRFMQSIGLSGKAFVPLIVGFGCNVASIMAARTLETRKDRLMTLMMSPFM CHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SCGARLAIFSVFASAFFPHNGATVIFLLYLAGIFGAIITGYIIKFTFLKGDTAPFILDIP HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCEEEECC NYHTPSFKTVMIYSWNRLKSFLIRAGKVIVPVAIIVGSLNSIYIGNKTTALEYAGKKITP CCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCEEHHHCCCCCCC ILNPMGINDDNWPATVGLITGTLAKEVVVGTLNTIYTQGEDNVIPDKFSLIDSVKESWNT CCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCC TIDNIKGIDLATLMNPIEASKADANMDNGAMGNMVTKFGSLSAAFAYLLFVLLYIPCISV HHHCCCCCHHHHHHCHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VGAMVRESTRGWAILSVLWSVSIAYVAAVVIYQLLNIAEHPSSSIICIALAMAYIIGIVF HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH LMKYLSTKINFVANLTGCSSCSSKKCS HHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: Fe (II) [Periplasm] [C]
Specific reaction: Fe (II) [Periplasm] = Fe (II) [Cytoplasm] [C]
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 11206551; 11258796 [H]