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The map label for this gene is 88658162

Identifier: 88658162

GI number: 88658162

Start: 493681

End: 501957

Strand: Direct

Name: 88658162

Synonym: ECH_0499

Alternate gene names: NA

Gene position: 493681-501957 (Clockwise)

Preceding gene: 88657563

Following gene: 88657837

Centisome position: 41.97

GC content: 34.96

Gene sequence:

>8277_bases
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AAGATTTTATTGCTGATAATAAGTCATTGGGAAATATTGTAAAAAATGATCAAGTAGTACGGTGGAAATATACTGGATAT
GTGACAGATGGTCGTCCAATTGTATTAAAAGCTGAGGGGATGTGGACTGCATGGGTCAATGATGTTAGTGCTGAAAAAAG
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TAGAAAAGACTTTTGTTCCTGATGGTCATAGTGAATGTAAGGTATCATGTGAACTAATCACTGGAGTTAAAGATGACTTG
GAAAGAGGGGCATATGGACCTCCTTGTTGGTTCAAAAATGGATATGGTGCATATTTATTATTTAAGAGACCAGATGACCC
TGAACCAAATGAAACGTTGGATCATATGAGATATCCGGTGTCTCCTGTAATGCATATAGGATACAAGCCATTAGAATTGG
CTGGTAGTGATGTTTTTTCTACTAAAAATAAACCAATTATGAATTCCCTTTGTCAAAAGGTGCAATTGGAGCCAGGGTGG
AAGATATATGTAAAAATATTAGATAAGTATTATTATGATAATGTTGGGGGATATGCAATCACATTCCTTGAAGGTGTAAA
AACAGAAAAACAATTTTCTGTTTTTGAATGGGTTCGTAAACAGGTAAGAGGTGAACTAGATAAAGCAGGTGAACAAGTTT
TTAGACATCTAGTTGGAAACCCGATATTTAAAAATTTTATTTTTAGTGTGTTAACTTTGTTTTTAGTATTTGGGGCTTTA
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GATTTCTCCAAGTAGTTGGGAGTTCTTTTATAACCATTTACTTGCTTTATTTATTCATGGTATAGATCAGATTATTGCGC
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TATTGCCGTATTCATCTACATTGCTTTATGTATGTATGGATGTGTTATATATCTAACAGCATTTGTTGGTATTACATTTT
TGATTGGGTTATTCCCATTATTTTTGTTAGGTATTCTTTTTTCTCAATTTAAGAGCTTATTTGATGGTTGGTTAACACAA
TGTGTAAGTTTTGCTATGCAGGCAATATTAATGTTCACTCTGATTTCCCTGTTTGGTGCACTTATTATGAATTATTATTA
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GATATATCTGATAGTGAAACAGATGAAAATAGTTCAGGAAATAGTGATAGTGTATCCGATGTTGAAGGGTTAGCTAGTTT
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>100_bases
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>100_bases
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CTTCTATAAGGCAGTGTAAA

Product: VirB6 family type IV secretion system protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 2758; Mature: 2758

Protein sequence:

>2758_residues
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Sequences:

>Translated_2758_residues
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ASDQVEDERVHDEVPYDAQDSTSGDKGDIAEHGDKDDIVEHDDKGGVVEHEDTVDQSIDDTHEEEGKFTEGIVSESVTEP
EGVSETDTQVDSEESQGDSSASDQVEDERVHDEVPYDSQDDTQDSASEDEGDVVEHGDKGDIVEHEDKDSVVEHEGTVDQ
SIDDTYEEEGKFTEGIVSESVTEPEEVSEADTQVNNEESQGDSSASDQVEDERVHDEVPYDAQDSTSGDKGDIAEHGDKD
DIVEHDDKDGVVEHDDKDGVVEHEDTVDQSIDDTHEEEGKFTEGIVSESVTEPEEVSEADTQVDETLQDLEHEDLKEGAD
DISDSETDENSSGNSDSVSDVEGLASLASIGEESTITQNVKTQSVQSSAILSMKDRDGVLDNKGIPSDQLDVKDTEKKKK
ESSKSKVENSDKKAKSTKATVTPKSLKKTFKVILSQCTQELSNKLSEAFDKLFIDPQSGKQKRRLSKQDIALMIEQLKAM
IESLKDRKAQVTDPDEMKAIEESIKQAESTIQNLLNQE

Specific function: Unknown

COG id: COG3704

COG function: function code U; Type IV secretory pathway, VirB6 components

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential). Cell membrane; Lipid-anchor (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the trbL/virB6 family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR007688 [H]

Pfam domain/function: PF04610 TrbL [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 302949; Mature: 302949

Theoretical pI: Translated: 3.87; Mature: 3.87

Prosite motif: PS00589 PTS_HPR_SER

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
1.2 %Met     (Translated Protein)
2.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
1.2 %Met     (Mature Protein)
2.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MCNFIKKGFIKLLLLLVITACESNQHPVPRCVPADVFTETRTASVSAYFDSRSEDFIADN
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KSLGNIVKNDQVVRWKYTGYVTDGRPIVLKAEGMWTAWVNDVSAEKSVSFGDEDSEHYNQ
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HHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEECHHHHHCCHHHC
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CCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEECCCEEEECCCCCCCCCCCEECCCCCC
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CCCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE
LNSKNKVLQIIQQRRTKDNSEKKSELEKYKDEDFKSQIIDSIIADVIGSAAQERTPQEEL
ECCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
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CCCCCEEEEEEECCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
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HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
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CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHCCCCCHHHCCCCC
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CCCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCCC
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CCCCCEECCCCCCCCHHHHHHHCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH
DCDRLDNALHEYLGDKFDDVTQGYASSRDPMGHPQDLITEDLSKISASSDFRDLNAIDLG
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCC
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CCEEECCHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHEECC
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CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCCEEECCCCCCEEEECCC
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CHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHCCCCCCCCHHHCC
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CCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCC
SVSVSDMAVADMEQGTEDSKYTDVDGLSDSVLDLGYLEGNVDNPDIEPEHDMSQQYSTET
CCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCHH
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HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCC
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CCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHH
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CCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCHHHHH
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CCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCEEEECCCHHHHHCCCCCCCCC
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CHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCC
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CCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
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HHCCCCHHCCCCCCCCCCCCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCHHHHHCCCCCC
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CCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCCHHCCCCCCCCCCCCCHHCCCCC
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CCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCEECCCCCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCH
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CCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC
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>Mature Secondary Structure
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IPDVEVTSSSDDVTQVYDSTEDRDSCLDIVSSADDTSSEISQQDLEGNDGYEIDKDMGSS
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EELSDMLSDDVIEPEGVSETDTQVDSEESQDDSGTAGQVEDERVHDEVPYDTQDSTSGDK
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CCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHH
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CHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCC
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PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

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Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA