Definition Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas, complete genome.
Accession NC_007799
Length 1,176,248

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The map label for this gene is 88657946

Identifier: 88657946

GI number: 88657946

Start: 270800

End: 272338

Strand: Direct

Name: 88657946

Synonym: ECH_0289

Alternate gene names: NA

Gene position: 270800-272338 (Clockwise)

Preceding gene: 88658562

Following gene: 88658069

Centisome position: 23.02

GC content: 30.34

Gene sequence:

>1539_bases
ATGATTACGAATAGGAGTGGAAGTGATAGGTTAAAACCTGGTGCATTTTTAGGAATTTCATCTTGTGTTGATCATAGATT
GGTAAGGCCTGGATATATAAAGAAAATGGTGGATTCATTAACTCTAGAGAGACGAAAACTAGAAGAGGCTAGAACATCAT
TAATAATGTATGAGTATAGTTTACAGTTTTACAGTTTGCTCATCCTATTTTTTAAAGTGTTAAGAAATAACTATGGGTCA
AGACAAACTTTACAGAAACATATTGAAATGAGGGGTATTACTACCTTGCTAAAGAATAAAAAAGTGTTGCTTAATGATGC
TTTTGCTAGGAAGTTTATTAATTGTATGGTGAATAAAGTTGTAGGATTTATTATAGATAAAAAGCAAGCTCAAAAGTTGT
GGGTTGAGAAAGAAGAGTATGCGAGGGAAATTTGTTATAAAGTTATTAATGATATAAATAAGAAAAGAAAAAGTTTAGAT
ATACAAAATCTTACAGAAGAGGAAATAGTTTCTCAAGATGATAAAATGGATGAAGCATTATTTGGTGCTTATACAGAACA
GGTTAGAATTTTTTCTGAAGTGAAGGATCAGCAGCAAGGTTTTAATTTCTTGAAATGTATTCCTTCTTTATCAGAAATAT
TTGATGCTAGTGATGTTTTGAGAAGTAGTGAGATTTGTAGTAGCATAAGGAGTGCTGTTGAAATTTCGCGTGTTGATGCA
ATAGAATTGGAAATGCTACTTAAGTATATTATTTTGGGAAATAGTGTTGATGTGATAAAGGTGAATTTCCTTTTCAGTGC
CTTAAAAAATTGTTTGAAGAATATCTATTGTAAAATTGCTGAAAATTTTGTTGATGTGCGAGAATCTAGGTCGTCTAGTA
GTGATATACATCAAGTGCAATTACATGAGCAAATTGGTGTAATATGTAAGAATCTTGTTAAGGTTTCTATGCCAGCAGAA
GATATATGTAATATGTATACGGAGATTTATTACACATTATCATTGCGTTTTAATATGATAAGTAAAGAAATAGAGGACTT
ATTAATAGCAGTATTTATAGGTAATGAAAAAGGTGAGGTTGAAGAATTTAAGAAAAAGGATATTATTAGATCTCTTTATG
ATTGCCAATTGAAATCAATTTATTCAATAATAGAAGCAGATTGTTGTTGTGCTGATTTGTTATTTGTAAATAGAAGGGTG
AAATCTGTAATAATGAGCCTTTGTGTGCAAAGAGATGATATTATAGATCACATGTCTAATGTTGAAAAGTTACTTATTTC
TGCTGCTAAGTACCAAGATATTGTAGCTGATTTTGTCTCTCATGATGTTCCTGTAAGTAATGAAGATCTTTTATTAAAAT
GTGATAATATTACACAATTAAAGAAAAGTTTAAAGTCAGGAGAGAGAGTAAATAGTAGTGTAGCCACAATTCTGACAGAG
GATTTAGGTGTTATAGATAGTCAAATACAAAAATTAGAAGAAAGCTTGAACATGTTAATATCCCGGAGATGTGTTAGAGC
TGGTTCTTGTATTGTATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GACCTTTTTATAAGTTTTATCAAAGATTAATCCTGAGTTAGTGTGTATTGGGGAGATGATGGATTTATTATAGAAAATTT
TAACATGTGGGTAGAAAGTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGTAGATTATCTTTTGATGTTTAAAGTTTATAATTCTGTGATATGAGTTAGTGCAACTTTAGTGTTATAGGATATGTGTT
TTAAGGTATAATGACTTTGA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 512; Mature: 512

Protein sequence:

>512_residues
MITNRSGSDRLKPGAFLGISSCVDHRLVRPGYIKKMVDSLTLERRKLEEARTSLIMYEYSLQFYSLLILFFKVLRNNYGS
RQTLQKHIEMRGITTLLKNKKVLLNDAFARKFINCMVNKVVGFIIDKKQAQKLWVEKEEYAREICYKVINDINKKRKSLD
IQNLTEEEIVSQDDKMDEALFGAYTEQVRIFSEVKDQQQGFNFLKCIPSLSEIFDASDVLRSSEICSSIRSAVEISRVDA
IELEMLLKYIILGNSVDVIKVNFLFSALKNCLKNIYCKIAENFVDVRESRSSSSDIHQVQLHEQIGVICKNLVKVSMPAE
DICNMYTEIYYTLSLRFNMISKEIEDLLIAVFIGNEKGEVEEFKKKDIIRSLYDCQLKSIYSIIEADCCCADLLFVNRRV
KSVIMSLCVQRDDIIDHMSNVEKLLISAAKYQDIVADFVSHDVPVSNEDLLLKCDNITQLKKSLKSGERVNSSVATILTE
DLGVIDSQIQKLEESLNMLISRRCVRAGSCIV

Sequences:

>Translated_512_residues
MITNRSGSDRLKPGAFLGISSCVDHRLVRPGYIKKMVDSLTLERRKLEEARTSLIMYEYSLQFYSLLILFFKVLRNNYGS
RQTLQKHIEMRGITTLLKNKKVLLNDAFARKFINCMVNKVVGFIIDKKQAQKLWVEKEEYAREICYKVINDINKKRKSLD
IQNLTEEEIVSQDDKMDEALFGAYTEQVRIFSEVKDQQQGFNFLKCIPSLSEIFDASDVLRSSEICSSIRSAVEISRVDA
IELEMLLKYIILGNSVDVIKVNFLFSALKNCLKNIYCKIAENFVDVRESRSSSSDIHQVQLHEQIGVICKNLVKVSMPAE
DICNMYTEIYYTLSLRFNMISKEIEDLLIAVFIGNEKGEVEEFKKKDIIRSLYDCQLKSIYSIIEADCCCADLLFVNRRV
KSVIMSLCVQRDDIIDHMSNVEKLLISAAKYQDIVADFVSHDVPVSNEDLLLKCDNITQLKKSLKSGERVNSSVATILTE
DLGVIDSQIQKLEESLNMLISRRCVRAGSCIV
>Mature_512_residues
MITNRSGSDRLKPGAFLGISSCVDHRLVRPGYIKKMVDSLTLERRKLEEARTSLIMYEYSLQFYSLLILFFKVLRNNYGS
RQTLQKHIEMRGITTLLKNKKVLLNDAFARKFINCMVNKVVGFIIDKKQAQKLWVEKEEYAREICYKVINDINKKRKSLD
IQNLTEEEIVSQDDKMDEALFGAYTEQVRIFSEVKDQQQGFNFLKCIPSLSEIFDASDVLRSSEICSSIRSAVEISRVDA
IELEMLLKYIILGNSVDVIKVNFLFSALKNCLKNIYCKIAENFVDVRESRSSSSDIHQVQLHEQIGVICKNLVKVSMPAE
DICNMYTEIYYTLSLRFNMISKEIEDLLIAVFIGNEKGEVEEFKKKDIIRSLYDCQLKSIYSIIEADCCCADLLFVNRRV
KSVIMSLCVQRDDIIDHMSNVEKLLISAAKYQDIVADFVSHDVPVSNEDLLLKCDNITQLKKSLKSGERVNSSVATILTE
DLGVIDSQIQKLEESLNMLISRRCVRAGSCIV

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 58675; Mature: 58675

Theoretical pI: Translated: 7.24; Mature: 7.24

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

3.3 %Cys     (Translated Protein)
2.5 %Met     (Translated Protein)
5.9 %Cys+Met (Translated Protein)
3.3 %Cys     (Mature Protein)
2.5 %Met     (Mature Protein)
5.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MITNRSGSDRLKPGAFLGISSCVDHRLVRPGYIKKMVDSLTLERRKLEEARTSLIMYEYS
CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LQFYSLLILFFKVLRNNYGSRQTLQKHIEMRGITTLLKNKKVLLNDAFARKFINCMVNKV
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VGFIIDKKQAQKLWVEKEEYAREICYKVINDINKKRKSLDIQNLTEEEIVSQDDKMDEAL
HHHHHCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCHHHHHCCCCHHHHHH
FGAYTEQVRIFSEVKDQQQGFNFLKCIPSLSEIFDASDVLRSSEICSSIRSAVEISRVDA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IELEMLLKYIILGNSVDVIKVNFLFSALKNCLKNIYCKIAENFVDVRESRSSSSDIHQVQ
HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHH
LHEQIGVICKNLVKVSMPAEDICNMYTEIYYTLSLRFNMISKEIEDLLIAVFIGNEKGEV
HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHEEECCCCCHH
EEFKKKDIIRSLYDCQLKSIYSIIEADCCCADLLFVNRRVKSVIMSLCVQRDDIIDHMSN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VEKLLISAAKYQDIVADFVSHDVPVSNEDLLLKCDNITQLKKSLKSGERVNSSVATILTE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH
DLGVIDSQIQKLEESLNMLISRRCVRAGSCIV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MITNRSGSDRLKPGAFLGISSCVDHRLVRPGYIKKMVDSLTLERRKLEEARTSLIMYEYS
CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LQFYSLLILFFKVLRNNYGSRQTLQKHIEMRGITTLLKNKKVLLNDAFARKFINCMVNKV
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VGFIIDKKQAQKLWVEKEEYAREICYKVINDINKKRKSLDIQNLTEEEIVSQDDKMDEAL
HHHHHCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCHHHHHCCCCHHHHHH
FGAYTEQVRIFSEVKDQQQGFNFLKCIPSLSEIFDASDVLRSSEICSSIRSAVEISRVDA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IELEMLLKYIILGNSVDVIKVNFLFSALKNCLKNIYCKIAENFVDVRESRSSSSDIHQVQ
HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHH
LHEQIGVICKNLVKVSMPAEDICNMYTEIYYTLSLRFNMISKEIEDLLIAVFIGNEKGEV
HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHEEECCCCCHH
EEFKKKDIIRSLYDCQLKSIYSIIEADCCCADLLFVNRRVKSVIMSLCVQRDDIIDHMSN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VEKLLISAAKYQDIVADFVSHDVPVSNEDLLLKCDNITQLKKSLKSGERVNSSVATILTE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH
DLGVIDSQIQKLEESLNMLISRRCVRAGSCIV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA