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The map label for this gene is nuoM [H]

Identifier: 88657881

GI number: 88657881

Start: 451794

End: 453383

Strand: Direct

Name: nuoM [H]

Synonym: ECH_0474

Alternate gene names: 88657881

Gene position: 451794-453383 (Clockwise)

Preceding gene: 88658036

Following gene: 88658536

Centisome position: 38.41

GC content: 27.36

Gene sequence:

>1590_bases
ATGACTGAGTATCTTGCTAACCGCTTCTCTATTATATCTTTTATACCTAAATTAGCTTTTTTAGTATTTGTTGTATTAGA
GCTCCTGTTATACGATACAAGGACTGAAACATATAATTATAGTCTAATATTATTTTTTGTATTTTCTTTTATTATTGTTC
TAATTTTTTTATATATTTGGAATATAAAGAAGCATGAGACGATTTTATATCTTTTATATTATTTAAGTAGTATAGCAGCT
ATTTCTTCAGGAAATTTATTGTCTTTAGTTATATCATTTGAATTTATGGCATTGAGTGCTCTAATGATAGTTGCTGTAAA
CTCTTTTGGAGCTAATAAAAATTCAGTGATACATTATTCATGTATTCATTTTTTGTCTGGTGTACTGTTACTTATTGGGG
CATCTGGTGGGTTTTTAGGGATAATTAATGGTGAGTATTATTATAAATTATTTTTTTTAATAGGTTTATTGATCAATTGT
GCTTGCTTTCCTTTATCTTCTTGGGTGACAGATGCTTATTCTGCAGCATTGAATAATGGTATTTTGATCTTATCTGTGTT
TACTACTAAAGTTTCAGCATATGTATTATTGTTCTTTTTTCAAGGAGAAAAAATATTACTGTTTTTAGGTATAGCGACGT
CTGTTTATGGCATAATTTTTTCAATGTTGGAAAATAATATTAAACGTTTACTTTGCTATAATTTAGTTGGACAAATGGGG
TTGGTTATCACTGCGATAGGGTTTTCTTATAATGATGGTGTTGATATTTATGGTATAATCGTTTTACAGATAGTCCTGTC
TATAATTTATCAAACTTTATTATTTATGGTTGCTATTTCTGTGATAAATAGTACTCAAAAATTTAATCTTAGTGAAATTG
GTGGGTTATTCAATAAAATGCCAGTAGAGGCAGTATGTTCTGCAATTGCTATATTTACTATGGGAGCTTTACCTGGTACT
GGTGGTTTTGTTTCTAAGTTTCTAATTACACATAATATAAACAATGTAGATCTTGCAAGTGTGTTGATGGGTAAATTGTT
CTTGATATGTAGTATATTGTTATTTGTGAGTGTTGGAATAAAATTTTTTTGGTATGCATTTATATCTAAAGCTATAGAAA
GTCCTATTGTTAGAAAGGTTTGTGCAGCATCTAAGTTATCGATGTTGATATTAACATTAGTTTGTACGTTTTTTGGAGTA
TTTGGAAGTTACTATTTGTTTCATGATCTAGATAGTGAAAAGCTAAGTAGTATTGTGTTGCAGTGTGGATTAATATTTGG
AAGTATATTATTCTTTATCTGTTTTCATCCAGTTTTTAAAGGGAGAGTTAATTTTACTATGGACATTGATTGGGTCTATA
GGGTATTGTTTATGAGTGTAATACTGTTTATCAATAATTTTTTGTTATGCATTTATAATATTCTTATTACAATGTTAAAC
AATGTATTAAGTACAAGAATATTATTGTATTTTAAAGATGGTAGGAAAATTTTAGGTATATCAAGTATTGATCCTTTAGG
ATTTACTATAATATTTGGTATGTTATTTATTATTATTATGGTCGTTGTATATTTATGTTTGAGTCTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATGATGTACATTTTAATTTCTAATATTTAGTAGCTATTTTTAATGCGATTTAGTATTAGTTATATATGCTTGAAAAAATA
ATAATATAACTTGAGTTATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTAGTAGTTTAACTAATGTAATCCAAAAGATGCAGAGTAAGCATGTTATTTCTTCTGAGGATTTTGATGCTGCGATGGAA
GAAGTAAAAGTTGCTTTGCT

Product: putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D

Products: NA

Alternate protein names: NADH dehydrogenase I subunit M; NDH-1 subunit M [H]

Number of amino acids: Translated: 529; Mature: 528

Protein sequence:

>529_residues
MTEYLANRFSIISFIPKLAFLVFVVLELLLYDTRTETYNYSLILFFVFSFIIVLIFLYIWNIKKHETILYLLYYLSSIAA
ISSGNLLSLVISFEFMALSALMIVAVNSFGANKNSVIHYSCIHFLSGVLLLIGASGGFLGIINGEYYYKLFFLIGLLINC
ACFPLSSWVTDAYSAALNNGILILSVFTTKVSAYVLLFFFQGEKILLFLGIATSVYGIIFSMLENNIKRLLCYNLVGQMG
LVITAIGFSYNDGVDIYGIIVLQIVLSIIYQTLLFMVAISVINSTQKFNLSEIGGLFNKMPVEAVCSAIAIFTMGALPGT
GGFVSKFLITHNINNVDLASVLMGKLFLICSILLFVSVGIKFFWYAFISKAIESPIVRKVCAASKLSMLILTLVCTFFGV
FGSYYLFHDLDSEKLSSIVLQCGLIFGSILFFICFHPVFKGRVNFTMDIDWVYRVLFMSVILFINNFLLCIYNILITMLN
NVLSTRILLYFKDGRKILGISSIDPLGFTIIFGMLFIIIMVVVYLCLSL

Sequences:

>Translated_529_residues
MTEYLANRFSIISFIPKLAFLVFVVLELLLYDTRTETYNYSLILFFVFSFIIVLIFLYIWNIKKHETILYLLYYLSSIAA
ISSGNLLSLVISFEFMALSALMIVAVNSFGANKNSVIHYSCIHFLSGVLLLIGASGGFLGIINGEYYYKLFFLIGLLINC
ACFPLSSWVTDAYSAALNNGILILSVFTTKVSAYVLLFFFQGEKILLFLGIATSVYGIIFSMLENNIKRLLCYNLVGQMG
LVITAIGFSYNDGVDIYGIIVLQIVLSIIYQTLLFMVAISVINSTQKFNLSEIGGLFNKMPVEAVCSAIAIFTMGALPGT
GGFVSKFLITHNINNVDLASVLMGKLFLICSILLFVSVGIKFFWYAFISKAIESPIVRKVCAASKLSMLILTLVCTFFGV
FGSYYLFHDLDSEKLSSIVLQCGLIFGSILFFICFHPVFKGRVNFTMDIDWVYRVLFMSVILFINNFLLCIYNILITMLN
NVLSTRILLYFKDGRKILGISSIDPLGFTIIFGMLFIIIMVVVYLCLSL
>Mature_528_residues
TEYLANRFSIISFIPKLAFLVFVVLELLLYDTRTETYNYSLILFFVFSFIIVLIFLYIWNIKKHETILYLLYYLSSIAAI
SSGNLLSLVISFEFMALSALMIVAVNSFGANKNSVIHYSCIHFLSGVLLLIGASGGFLGIINGEYYYKLFFLIGLLINCA
CFPLSSWVTDAYSAALNNGILILSVFTTKVSAYVLLFFFQGEKILLFLGIATSVYGIIFSMLENNIKRLLCYNLVGQMGL
VITAIGFSYNDGVDIYGIIVLQIVLSIIYQTLLFMVAISVINSTQKFNLSEIGGLFNKMPVEAVCSAIAIFTMGALPGTG
GFVSKFLITHNINNVDLASVLMGKLFLICSILLFVSVGIKFFWYAFISKAIESPIVRKVCAASKLSMLILTLVCTFFGVF
GSYYLFHDLDSEKLSSIVLQCGLIFGSILFFICFHPVFKGRVNFTMDIDWVYRVLFMSVILFINNFLLCIYNILITMLNN
VLSTRILLYFKDGRKILGISSIDPLGFTIIFGMLFIIIMVVVYLCLSL

Specific function: NDH-1 shuttles electrons from NADH, via FMN and iron- sulfur (Fe-S) centers, to quinones in the respiratory chain. The immediate electron acceptor for the enzyme in this species is believed to be ubiquinone. Couples the redox reaction to proton translocat

COG id: COG0651

COG function: function code CP; Formate hydrogenlyase subunit 3/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the complex I subunit 4 family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788613, Length=195, Percent_Identity=30.2564102564103, Blast_Score=77, Evalue=3e-15,
Organism=Escherichia coli, GI1788827, Length=183, Percent_Identity=22.4043715846995, Blast_Score=65, Evalue=1e-11,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR010227
- InterPro:   IPR001750
- InterPro:   IPR003918 [H]

Pfam domain/function: PF00361 Oxidored_q1 [H]

EC number: =1.6.99.5 [H]

Molecular weight: Translated: 59256; Mature: 59125

Theoretical pI: Translated: 8.26; Mature: 8.26

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.3 %Cys     (Translated Protein)
2.8 %Met     (Translated Protein)
5.1 %Cys+Met (Translated Protein)
2.3 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
4.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTEYLANRFSIISFIPKLAFLVFVVLELLLYDTRTETYNYSLILFFVFSFIIVLIFLYIW
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NIKKHETILYLLYYLSSIAAISSGNLLSLVISFEFMALSALMIVAVNSFGANKNSVIHYS
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHH
CIHFLSGVLLLIGASGGFLGIINGEYYYKLFFLIGLLINCACFPLSSWVTDAYSAALNNG
HHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
ILILSVFTTKVSAYVLLFFFQGEKILLFLGIATSVYGIIFSMLENNIKRLLCYNLVGQMG
EEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LVITAIGFSYNDGVDIYGIIVLQIVLSIIYQTLLFMVAISVINSTQKFNLSEIGGLFNKM
HHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCC
PVEAVCSAIAIFTMGALPGTGGFVSKFLITHNINNVDLASVLMGKLFLICSILLFVSVGI
CHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KFFWYAFISKAIESPIVRKVCAASKLSMLILTLVCTFFGVFGSYYLFHDLDSEKLSSIVL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
QCGLIFGSILFFICFHPVFKGRVNFTMDIDWVYRVLFMSVILFINNFLLCIYNILITMLN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NVLSTRILLYFKDGRKILGISSIDPLGFTIIFGMLFIIIMVVVYLCLSL
HHHHHHEEEEEECCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
TEYLANRFSIISFIPKLAFLVFVVLELLLYDTRTETYNYSLILFFVFSFIIVLIFLYIW
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NIKKHETILYLLYYLSSIAAISSGNLLSLVISFEFMALSALMIVAVNSFGANKNSVIHYS
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHH
CIHFLSGVLLLIGASGGFLGIINGEYYYKLFFLIGLLINCACFPLSSWVTDAYSAALNNG
HHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
ILILSVFTTKVSAYVLLFFFQGEKILLFLGIATSVYGIIFSMLENNIKRLLCYNLVGQMG
EEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LVITAIGFSYNDGVDIYGIIVLQIVLSIIYQTLLFMVAISVINSTQKFNLSEIGGLFNKM
HHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCC
PVEAVCSAIAIFTMGALPGTGGFVSKFLITHNINNVDLASVLMGKLFLICSILLFVSVGI
CHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KFFWYAFISKAIESPIVRKVCAASKLSMLILTLVCTFFGVFGSYYLFHDLDSEKLSSIVL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
QCGLIFGSILFFICFHPVFKGRVNFTMDIDWVYRVLFMSVILFINNFLLCIYNILITMLN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NVLSTRILLYFKDGRKILGISSIDPLGFTIIFGMLFIIIMVVVYLCLSL
HHHHHHEEEEEECCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 10984043 [H]