| Definition | Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007799 |
| Length | 1,176,248 |
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The map label for this gene is 88657598
Identifier: 88657598
GI number: 88657598
Start: 274943
End: 278257
Strand: Direct
Name: 88657598
Synonym: ECH_0292
Alternate gene names: NA
Gene position: 274943-278257 (Clockwise)
Preceding gene: 88658069
Following gene: 88658524
Centisome position: 23.37
GC content: 35.11
Gene sequence:
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Downstream 100 bases:
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Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1104; Mature: 1104
Protein sequence:
>1104_residues MLTNKFKQSAVMAHNMSYLAYFCRSMGLSSEDTLGLLTILESFHQNAASFLIYDLDRCNVESNDHIDFVVKDCDHRNYRC YDHVSQQLETQGHLELASMTRLWNVQMYLLLRLHSLAAQYVLSTRHYTDDEIVEGLLSDLSRTCMSIMTRGKTSSVTPEN AEALKVYGDKFVQRLFGIQTMDMDSMHSILHSMICSVRGSYLQVIEGLDKVQDKETLMKLVTLVVYKSAISCFMNINPDF FSQTLRKKAYSVLHGFICDGTDKLPISCRSRLGMGMAPSLVLFYKNLFSVFHQGSISDCYGDEIRYNISVFNDVCLATRG SLAIVANEPVPYNPFSSRMTHFAYYDATLAVNGIFHHPKLDNVLKLESMTQMYKMSLEGNPSDLHCLFVSGLGRMNFSFE DKGEPNSGLEMLCELLSMCYYAVFVARQPLSVVRGMFNICYGKLGDLGDKVNVGSVAGSKLAIESYRDAFNAAQAALHCT GINPSDVIFKKETLLILVQHLLLGEVAQEKIEDSKLAFDIFELCKPVNEVKAQQAAMMMCQAFRGSNGVVDGYEVGNLGA IVLKLLFGNFVERNLILKLLDITCVACDRYKMQGAVQDMYNELLKDFMSCADVCLSLFRYAGSSLPMCYSSQVVAGLDGD SCAVYSQMYNMLSSYASRLNVSQDDLIRARNSRFSVSFAELFSNAVLPHGEQSGPELQVNPCDGISKPESMALVQMLASY VYLYNSSEIKEELLSAKLSSPQFLFSIILVSPRFAANFINMCYESSTKKDYSPQKAVSAFLNRISNIGGSRTSSAEAIDI MTGQGNNVIMENFIRSCVNEDGSINVEDSILRAACLWIIKSNNLVHKDVIQDVDDADCAGKVSPVVIDSVSLSEVLLPVL SNPLALDDPEGPVSFSHLVYSTGLLDKSGIESASATVGKLQIQIQVDAKCETDVKEVGPSDDKVSEIVEMKDDVQEVEVE CKTSDTQTVAIEDQTQRYEDSYVARDPGDVQSSTSDIFKEKRSSICNYASAISAAILAVSLTLMGMAFAVNDEGARIACI ALSMTCFVISISMFLMTCINIRSLNGRNEGHDDDTQRILNNEVVNETQDATIFPVDINTRPKTH
Sequences:
>Translated_1104_residues MLTNKFKQSAVMAHNMSYLAYFCRSMGLSSEDTLGLLTILESFHQNAASFLIYDLDRCNVESNDHIDFVVKDCDHRNYRC YDHVSQQLETQGHLELASMTRLWNVQMYLLLRLHSLAAQYVLSTRHYTDDEIVEGLLSDLSRTCMSIMTRGKTSSVTPEN AEALKVYGDKFVQRLFGIQTMDMDSMHSILHSMICSVRGSYLQVIEGLDKVQDKETLMKLVTLVVYKSAISCFMNINPDF FSQTLRKKAYSVLHGFICDGTDKLPISCRSRLGMGMAPSLVLFYKNLFSVFHQGSISDCYGDEIRYNISVFNDVCLATRG SLAIVANEPVPYNPFSSRMTHFAYYDATLAVNGIFHHPKLDNVLKLESMTQMYKMSLEGNPSDLHCLFVSGLGRMNFSFE DKGEPNSGLEMLCELLSMCYYAVFVARQPLSVVRGMFNICYGKLGDLGDKVNVGSVAGSKLAIESYRDAFNAAQAALHCT GINPSDVIFKKETLLILVQHLLLGEVAQEKIEDSKLAFDIFELCKPVNEVKAQQAAMMMCQAFRGSNGVVDGYEVGNLGA IVLKLLFGNFVERNLILKLLDITCVACDRYKMQGAVQDMYNELLKDFMSCADVCLSLFRYAGSSLPMCYSSQVVAGLDGD SCAVYSQMYNMLSSYASRLNVSQDDLIRARNSRFSVSFAELFSNAVLPHGEQSGPELQVNPCDGISKPESMALVQMLASY VYLYNSSEIKEELLSAKLSSPQFLFSIILVSPRFAANFINMCYESSTKKDYSPQKAVSAFLNRISNIGGSRTSSAEAIDI MTGQGNNVIMENFIRSCVNEDGSINVEDSILRAACLWIIKSNNLVHKDVIQDVDDADCAGKVSPVVIDSVSLSEVLLPVL SNPLALDDPEGPVSFSHLVYSTGLLDKSGIESASATVGKLQIQIQVDAKCETDVKEVGPSDDKVSEIVEMKDDVQEVEVE CKTSDTQTVAIEDQTQRYEDSYVARDPGDVQSSTSDIFKEKRSSICNYASAISAAILAVSLTLMGMAFAVNDEGARIACI ALSMTCFVISISMFLMTCINIRSLNGRNEGHDDDTQRILNNEVVNETQDATIFPVDINTRPKTH >Mature_1104_residues MLTNKFKQSAVMAHNMSYLAYFCRSMGLSSEDTLGLLTILESFHQNAASFLIYDLDRCNVESNDHIDFVVKDCDHRNYRC YDHVSQQLETQGHLELASMTRLWNVQMYLLLRLHSLAAQYVLSTRHYTDDEIVEGLLSDLSRTCMSIMTRGKTSSVTPEN AEALKVYGDKFVQRLFGIQTMDMDSMHSILHSMICSVRGSYLQVIEGLDKVQDKETLMKLVTLVVYKSAISCFMNINPDF FSQTLRKKAYSVLHGFICDGTDKLPISCRSRLGMGMAPSLVLFYKNLFSVFHQGSISDCYGDEIRYNISVFNDVCLATRG SLAIVANEPVPYNPFSSRMTHFAYYDATLAVNGIFHHPKLDNVLKLESMTQMYKMSLEGNPSDLHCLFVSGLGRMNFSFE DKGEPNSGLEMLCELLSMCYYAVFVARQPLSVVRGMFNICYGKLGDLGDKVNVGSVAGSKLAIESYRDAFNAAQAALHCT GINPSDVIFKKETLLILVQHLLLGEVAQEKIEDSKLAFDIFELCKPVNEVKAQQAAMMMCQAFRGSNGVVDGYEVGNLGA IVLKLLFGNFVERNLILKLLDITCVACDRYKMQGAVQDMYNELLKDFMSCADVCLSLFRYAGSSLPMCYSSQVVAGLDGD SCAVYSQMYNMLSSYASRLNVSQDDLIRARNSRFSVSFAELFSNAVLPHGEQSGPELQVNPCDGISKPESMALVQMLASY VYLYNSSEIKEELLSAKLSSPQFLFSIILVSPRFAANFINMCYESSTKKDYSPQKAVSAFLNRISNIGGSRTSSAEAIDI MTGQGNNVIMENFIRSCVNEDGSINVEDSILRAACLWIIKSNNLVHKDVIQDVDDADCAGKVSPVVIDSVSLSEVLLPVL SNPLALDDPEGPVSFSHLVYSTGLLDKSGIESASATVGKLQIQIQVDAKCETDVKEVGPSDDKVSEIVEMKDDVQEVEVE CKTSDTQTVAIEDQTQRYEDSYVARDPGDVQSSTSDIFKEKRSSICNYASAISAAILAVSLTLMGMAFAVNDEGARIACI ALSMTCFVISISMFLMTCINIRSLNGRNEGHDDDTQRILNNEVVNETQDATIFPVDINTRPKTH
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 122269; Mature: 122269
Theoretical pI: Translated: 4.81; Mature: 4.81
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
3.2 %Cys (Translated Protein) 4.0 %Met (Translated Protein) 7.2 %Cys+Met (Translated Protein) 3.2 %Cys (Mature Protein) 4.0 %Met (Mature Protein) 7.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLTNKFKQSAVMAHNMSYLAYFCRSMGLSSEDTLGLLTILESFHQNAASFLIYDLDRCNV CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHEEEEECHHCCC ESNDHIDFVVKDCDHRNYRCYDHVSQQLETQGHLELASMTRLWNVQMYLLLRLHSLAAQY CCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VLSTRHYTDDEIVEGLLSDLSRTCMSIMTRGKTSSVTPENAEALKVYGDKFVQRLFGIQT HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCC MDMDSMHSILHSMICSVRGSYLQVIEGLDKVQDKETLMKLVTLVVYKSAISCFMNINPDF CCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH FSQTLRKKAYSVLHGFICDGTDKLPISCRSRLGMGMAPSLVLFYKNLFSVFHQGSISDCY HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC GDEIRYNISVFNDVCLATRGSLAIVANEPVPYNPFSSRMTHFAYYDATLAVNGIFHHPKL CCCEEEEEEHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHEEEHHEEEECEECCCCC DNVLKLESMTQMYKMSLEGNPSDLHCLFVSGLGRMNFSFEDKGEPNSGLEMLCELLSMCY CHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH YAVFVARQPLSVVRGMFNICYGKLGDLGDKVNVGSVAGSKLAIESYRDAFNAAQAALHCT HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEC GINPSDVIFKKETLLILVQHLLLGEVAQEKIEDSKLAFDIFELCKPVNEVKAQQAAMMMC CCCHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH QAFRGSNGVVDGYEVGNLGAIVLKLLFGNFVERNLILKLLDITCVACDRYKMQGAVQDMY HHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NELLKDFMSCADVCLSLFRYAGSSLPMCYSSQVVAGLDGDSCAVYSQMYNMLSSYASRLN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC VSQDDLIRARNSRFSVSFAELFSNAVLPHGEQSGPELQVNPCDGISKPESMALVQMLASY CCHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH VYLYNSSEIKEELLSAKLSSPQFLFSIILVSPRFAANFINMCYESSTKKDYSPQKAVSAF HHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHH LNRISNIGGSRTSSAEAIDIMTGQGNNVIMENFIRSCVNEDGSINVEDSILRAACLWIIK HHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCC SNNLVHKDVIQDVDDADCAGKVSPVVIDSVSLSEVLLPVLSNPLALDDPEGPVSFSHLVY CCCEEHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHH STGLLDKSGIESASATVGKLQIQIQVDAKCETDVKEVGPSDDKVSEIVEMKDDVQEVEVE HHCCCCCCCCCHHHCCEEEEEEEEEECCCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE CKTSDTQTVAIEDQTQRYEDSYVARDPGDVQSSTSDIFKEKRSSICNYASAISAAILAVS EECCCCEEEEECCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LTLMGMAFAVNDEGARIACIALSMTCFVISISMFLMTCINIRSLNGRNEGHDDDTQRILN HHHHHHHEEECCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHH NEVVNETQDATIFPVDINTRPKTH HHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCC >Mature Secondary Structure MLTNKFKQSAVMAHNMSYLAYFCRSMGLSSEDTLGLLTILESFHQNAASFLIYDLDRCNV CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHEEEEECHHCCC ESNDHIDFVVKDCDHRNYRCYDHVSQQLETQGHLELASMTRLWNVQMYLLLRLHSLAAQY CCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VLSTRHYTDDEIVEGLLSDLSRTCMSIMTRGKTSSVTPENAEALKVYGDKFVQRLFGIQT HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCC MDMDSMHSILHSMICSVRGSYLQVIEGLDKVQDKETLMKLVTLVVYKSAISCFMNINPDF CCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH FSQTLRKKAYSVLHGFICDGTDKLPISCRSRLGMGMAPSLVLFYKNLFSVFHQGSISDCY HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC GDEIRYNISVFNDVCLATRGSLAIVANEPVPYNPFSSRMTHFAYYDATLAVNGIFHHPKL CCCEEEEEEHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHEEEHHEEEECEECCCCC DNVLKLESMTQMYKMSLEGNPSDLHCLFVSGLGRMNFSFEDKGEPNSGLEMLCELLSMCY CHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH YAVFVARQPLSVVRGMFNICYGKLGDLGDKVNVGSVAGSKLAIESYRDAFNAAQAALHCT HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEC GINPSDVIFKKETLLILVQHLLLGEVAQEKIEDSKLAFDIFELCKPVNEVKAQQAAMMMC CCCHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH QAFRGSNGVVDGYEVGNLGAIVLKLLFGNFVERNLILKLLDITCVACDRYKMQGAVQDMY HHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NELLKDFMSCADVCLSLFRYAGSSLPMCYSSQVVAGLDGDSCAVYSQMYNMLSSYASRLN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC VSQDDLIRARNSRFSVSFAELFSNAVLPHGEQSGPELQVNPCDGISKPESMALVQMLASY CCHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH VYLYNSSEIKEELLSAKLSSPQFLFSIILVSPRFAANFINMCYESSTKKDYSPQKAVSAF HHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHH LNRISNIGGSRTSSAEAIDIMTGQGNNVIMENFIRSCVNEDGSINVEDSILRAACLWIIK HHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCC SNNLVHKDVIQDVDDADCAGKVSPVVIDSVSLSEVLLPVLSNPLALDDPEGPVSFSHLVY CCCEEHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHH STGLLDKSGIESASATVGKLQIQIQVDAKCETDVKEVGPSDDKVSEIVEMKDDVQEVEVE HHCCCCCCCCCHHHCCEEEEEEEEEECCCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE CKTSDTQTVAIEDQTQRYEDSYVARDPGDVQSSTSDIFKEKRSSICNYASAISAAILAVS EECCCCEEEEECCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LTLMGMAFAVNDEGARIACIALSMTCFVISISMFLMTCINIRSLNGRNEGHDDDTQRILN HHHHHHHEEECCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHH NEVVNETQDATIFPVDINTRPKTH HHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA