Definition Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas, complete genome.
Accession NC_007799
Length 1,176,248

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The map label for this gene is 88657598

Identifier: 88657598

GI number: 88657598

Start: 274943

End: 278257

Strand: Direct

Name: 88657598

Synonym: ECH_0292

Alternate gene names: NA

Gene position: 274943-278257 (Clockwise)

Preceding gene: 88658069

Following gene: 88658524

Centisome position: 23.37

GC content: 35.11

Gene sequence:

>3315_bases
ATGTTAACTAATAAGTTTAAACAAAGTGCTGTGATGGCTCATAACATGAGTTATTTAGCATATTTTTGTAGAAGTATGGG
ATTGTCTAGTGAAGACACATTAGGATTATTGACAATACTAGAATCCTTCCATCAAAACGCAGCTTCTTTCCTGATATATG
ATTTGGACAGATGTAATGTTGAAAGCAATGATCATATAGATTTTGTAGTGAAAGATTGTGATCATAGGAACTATAGATGT
TATGACCATGTATCACAACAATTAGAGACTCAAGGTCACCTTGAGTTAGCATCTATGACACGTTTGTGGAATGTTCAAAT
GTATTTACTGTTGCGTCTTCACTCTCTTGCTGCTCAATATGTACTGTCCACACGGCATTATACTGATGACGAAATAGTGG
AAGGATTGTTATCTGATCTAAGTCGAACTTGTATGTCTATTATGACTCGGGGAAAAACAAGTTCAGTCACTCCTGAAAAT
GCAGAAGCACTAAAGGTGTATGGTGACAAGTTTGTCCAGAGACTTTTTGGAATACAGACTATGGATATGGATAGTATGCA
CAGTATATTGCATAGTATGATCTGTAGTGTTAGAGGTAGTTACTTACAAGTTATAGAAGGCTTAGATAAAGTACAAGACA
AAGAAACGCTTATGAAACTAGTTACTCTTGTTGTGTATAAGAGTGCTATAAGTTGTTTTATGAACATAAATCCTGATTTT
TTCAGCCAAACATTGAGGAAAAAAGCTTACTCTGTTCTCCATGGATTTATTTGTGATGGTACAGACAAATTACCTATATC
ATGTAGAAGTCGTCTTGGTATGGGCATGGCACCTTCACTTGTTCTTTTTTATAAGAATTTATTTTCTGTATTTCATCAAG
GAAGTATATCTGATTGTTATGGTGATGAAATTAGGTACAACATATCTGTATTTAATGATGTATGTCTGGCAACAAGAGGA
TCGTTAGCTATTGTTGCTAATGAGCCTGTACCATACAATCCGTTTTCTTCTCGTATGACTCATTTTGCTTATTATGACGC
TACTTTGGCAGTTAATGGGATATTTCATCACCCAAAACTTGATAATGTATTGAAATTGGAATCTATGACACAAATGTACA
AGATGTCATTAGAAGGGAACCCATCAGACTTACACTGTTTGTTTGTATCGGGATTAGGTAGGATGAATTTTTCCTTTGAA
GATAAAGGAGAGCCTAATTCTGGACTTGAGATGTTATGTGAGTTGCTGTCTATGTGTTACTATGCTGTTTTTGTTGCAAG
ACAGCCATTGAGTGTAGTTAGAGGAATGTTTAATATATGTTATGGGAAATTAGGTGATCTTGGTGATAAGGTAAATGTAG
GAAGTGTTGCAGGAAGTAAGTTAGCCATTGAAAGTTATAGGGATGCTTTTAATGCTGCACAAGCAGCATTACATTGTACT
GGAATTAATCCTTCAGACGTTATTTTTAAGAAAGAAACACTTTTGATATTAGTGCAACATTTATTATTAGGTGAAGTTGC
GCAAGAAAAGATTGAGGACTCAAAATTAGCATTTGATATATTTGAGTTATGTAAACCAGTGAATGAAGTAAAAGCTCAGC
AAGCAGCAATGATGATGTGTCAGGCATTCAGGGGATCTAATGGTGTTGTAGATGGTTATGAAGTAGGAAACTTGGGTGCA
ATAGTTCTAAAATTGCTTTTTGGTAATTTTGTAGAAAGAAACCTGATTTTAAAGTTGTTAGATATTACTTGTGTAGCTTG
TGATCGTTATAAAATGCAGGGTGCTGTACAGGATATGTACAATGAGTTATTGAAAGATTTCATGTCTTGTGCTGATGTTT
GTTTGAGTTTATTCAGATATGCAGGTAGTTCTTTACCTATGTGTTATAGTTCGCAAGTGGTGGCAGGACTAGACGGTGAT
AGTTGTGCAGTATACAGTCAAATGTACAATATGTTATCATCCTATGCAAGTAGGTTAAATGTATCTCAAGATGATCTTAT
TAGGGCAAGAAATTCAAGATTTAGTGTTAGCTTTGCTGAGCTGTTTAGTAATGCGGTATTACCACATGGTGAGCAATCTG
GTCCAGAATTGCAAGTTAATCCTTGTGATGGCATAAGTAAACCAGAGTCCATGGCCTTGGTACAGATGCTTGCATCTTAT
GTGTATTTATATAATTCAAGTGAGATAAAAGAGGAGTTATTGTCTGCGAAGTTATCTTCACCACAGTTCTTATTCTCTAT
TATTTTGGTCTCTCCTAGATTTGCTGCTAATTTTATAAATATGTGTTATGAATCTTCGACAAAGAAAGATTATTCACCTC
AGAAAGCTGTAAGTGCGTTTCTTAATCGTATTAGTAATATAGGGGGATCTAGGACATCTAGTGCTGAAGCTATCGATATA
ATGACTGGTCAAGGTAATAATGTTATTATGGAAAATTTTATTAGATCATGTGTTAACGAAGATGGCAGTATTAATGTTGA
AGATTCAATACTTAGGGCAGCATGTTTATGGATTATAAAATCGAACAATTTAGTACATAAAGATGTTATACAAGATGTTG
ATGATGCTGATTGTGCAGGTAAAGTTAGTCCAGTTGTTATCGATTCTGTGTCATTATCTGAAGTTTTGCTACCGGTATTA
TCAAATCCATTAGCTCTAGATGATCCGGAAGGACCTGTGTCATTTTCTCATCTCGTTTATAGTACTGGTTTATTAGATAA
ATCAGGTATTGAGAGTGCTTCTGCGACTGTAGGTAAATTGCAGATACAAATTCAGGTGGATGCGAAATGTGAGACAGATG
TAAAAGAAGTAGGTCCTAGTGATGATAAAGTCAGCGAGATAGTAGAAATGAAAGATGACGTCCAAGAAGTAGAGGTGGAA
TGTAAAACTTCGGACACTCAAACAGTAGCAATAGAAGATCAAACTCAGAGATATGAAGATTCTTATGTCGCACGTGATCC
TGGTGATGTGCAATCAAGTACTAGTGACATTTTTAAAGAGAAGAGGTCTTCAATTTGTAATTATGCATCTGCAATATCAG
CAGCTATACTTGCTGTTTCTCTTACATTAATGGGAATGGCTTTTGCGGTAAATGATGAAGGAGCACGAATAGCATGTATC
GCTTTATCTATGACTTGTTTTGTTATATCAATATCAATGTTTCTTATGACATGTATAAACATCCGTAGCTTAAATGGACG
TAATGAAGGTCATGATGATGATACGCAACGCATACTAAATAATGAAGTTGTAAATGAAACACAAGATGCAACAATTTTTC
CAGTAGACATTAATACACGTCCTAAGACACATTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAAAAGAAGAGAGTGTCTTTTTGGTTGGGAATTTATGTATTGTATAGACACAATGTAATCATTTTCTATTTTTCAATAAT
TCTAAAGTGGGAGGTATAGC

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAGTCACATTCTGCTTTAAAAAAGCCTTTATCCTTGCTCATCTATTTTACTTCTTAAAGTAGATATATCAGCTGCTCCA
CCAATAAATGTATCTCCTAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 1104; Mature: 1104

Protein sequence:

>1104_residues
MLTNKFKQSAVMAHNMSYLAYFCRSMGLSSEDTLGLLTILESFHQNAASFLIYDLDRCNVESNDHIDFVVKDCDHRNYRC
YDHVSQQLETQGHLELASMTRLWNVQMYLLLRLHSLAAQYVLSTRHYTDDEIVEGLLSDLSRTCMSIMTRGKTSSVTPEN
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GINPSDVIFKKETLLILVQHLLLGEVAQEKIEDSKLAFDIFELCKPVNEVKAQQAAMMMCQAFRGSNGVVDGYEVGNLGA
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ALSMTCFVISISMFLMTCINIRSLNGRNEGHDDDTQRILNNEVVNETQDATIFPVDINTRPKTH

Sequences:

>Translated_1104_residues
MLTNKFKQSAVMAHNMSYLAYFCRSMGLSSEDTLGLLTILESFHQNAASFLIYDLDRCNVESNDHIDFVVKDCDHRNYRC
YDHVSQQLETQGHLELASMTRLWNVQMYLLLRLHSLAAQYVLSTRHYTDDEIVEGLLSDLSRTCMSIMTRGKTSSVTPEN
AEALKVYGDKFVQRLFGIQTMDMDSMHSILHSMICSVRGSYLQVIEGLDKVQDKETLMKLVTLVVYKSAISCFMNINPDF
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>Mature_1104_residues
MLTNKFKQSAVMAHNMSYLAYFCRSMGLSSEDTLGLLTILESFHQNAASFLIYDLDRCNVESNDHIDFVVKDCDHRNYRC
YDHVSQQLETQGHLELASMTRLWNVQMYLLLRLHSLAAQYVLSTRHYTDDEIVEGLLSDLSRTCMSIMTRGKTSSVTPEN
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ALSMTCFVISISMFLMTCINIRSLNGRNEGHDDDTQRILNNEVVNETQDATIFPVDINTRPKTH

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 122269; Mature: 122269

Theoretical pI: Translated: 4.81; Mature: 4.81

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

3.2 %Cys     (Translated Protein)
4.0 %Met     (Translated Protein)
7.2 %Cys+Met (Translated Protein)
3.2 %Cys     (Mature Protein)
4.0 %Met     (Mature Protein)
7.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLTNKFKQSAVMAHNMSYLAYFCRSMGLSSEDTLGLLTILESFHQNAASFLIYDLDRCNV
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHEEEEECHHCCC
ESNDHIDFVVKDCDHRNYRCYDHVSQQLETQGHLELASMTRLWNVQMYLLLRLHSLAAQY
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MDMDSMHSILHSMICSVRGSYLQVIEGLDKVQDKETLMKLVTLVVYKSAISCFMNINPDF
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HHHHHHHEEECCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHH
NEVVNETQDATIFPVDINTRPKTH
HHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MLTNKFKQSAVMAHNMSYLAYFCRSMGLSSEDTLGLLTILESFHQNAASFLIYDLDRCNV
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHEEEEECHHCCC
ESNDHIDFVVKDCDHRNYRCYDHVSQQLETQGHLELASMTRLWNVQMYLLLRLHSLAAQY
CCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
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HHHHHHHEEECCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHH
NEVVNETQDATIFPVDINTRPKTH
HHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA