Definition Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas, complete genome.
Accession NC_007799
Length 1,176,248

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The map label for this gene is 88657582

Identifier: 88657582

GI number: 88657582

Start: 470792

End: 474883

Strand: Direct

Name: 88657582

Synonym: ECH_0488

Alternate gene names: NA

Gene position: 470792-474883 (Clockwise)

Preceding gene: 88658256

Following gene: 88657885

Centisome position: 40.02

GC content: 28.01

Gene sequence:

>4092_bases
ATGATTCAAATAGATAATGTGAGATTGGAGAACCACTTTTTATACATTGATATAATATATAACAGTGATGATGACAGAAA
AAAAATTTTAAATGTTTTACCTCGTGGTGTTATTCAGGAAGATCTAGTAGATTGTAGATTAACGGTAAAAAAATCAGATT
TAATTTTTTTTAAAACGCAACTTCATAATCCTTTTCGTGCGACAGCTGGTAATAATGAATATAACATCAGATTAATGATG
TATTTGATATTTGAAGCAACAGATCTTTGGGAATTACACTGTTGTGATATTTATAGTTCTATAAAAGGTCATTATCAGCA
TGATCAGCGTGAATGTAAAGGAATATTCCAGCAATTGATGAGTTATTTCTTTAAAAGTAAAGAATGTGTTGGAAGAATGG
GTGAAGATTGTGTAAGGGATTTGAATCCTTTATGTTTTCCAAACCCGGAGTTGTTAAGGAGTAAGTTATGTATACATTCT
GATGGTAAATATTATGTTTTTTTATCTACTATAAAAGAATATGAAGATAGTGTTTTATTTAAAGTAATTACAAAAAAATT
GCAAATGCTGGAATTAGAAAGCGCTAAATCATCTGATGATAGTGTATTATTAAAAATATTGGATCAGAAAAAATGTTTGC
AGTATTTTATTGCTTGTCTGTCAGACGTAAATTGCTTTAATTCATTAGCGGTACCATTTCATGTATTTCTAGAGGCGTTA
AATATTTTAATAAGTGATCAGGTAATAGTAAAAGAAATTGAAGGTTTATTAAGAGAACGTCAGCTACATGATATGATAAA
TCATGTTGCTTATAAGTTTTTTCAAGATAAAAAACAATATGGTATTGATGTATATGGACAAGGGTTAGAGAAAGCACATG
ATATATATTATGAATTATATGGAAATAATTTACCGGAAGATAATTTAGCAGTGAAAAAAGCTATATTGAGTTTACAAAAT
GTGAAGTTCAATATTACAGCAAATCTTGATTTTTTTATTAAAATGAATAGTGATAAAGGGATTTTACGTGCTCAACAGTA
TTTTAGGGGATTGACTGCACTTGTAGAAGCAGAGATTAATTTTTTGCAGAAGTTCCAAGATGTTTTAGTAATAAAAGATT
TAGATTTGTTTTTAAAGGTTACTTGTAAAAATGTTCATGATGATATTAATCGATTGCTTGCTGCATATGATTTCTTTATG
CAGAAAAAGATTGTTGACAGGAATGCAATATTAAAATTTACGAAAAAAGAACTCTTGGAATTGACACAATATACCAATAG
TAGGGTACTTTTGTTGAAAGAAATTGTCAGGTATATGAACGATAGTATAAGGGCAAAGAATATAAACAAGAGTTTTCTTA
GCGAAAGAGTTATTGGTTTTATAGTAGATAATCATCCAATATTAAGTACACAGTTGTTAAAAGATAATCGATTAATATCA
TCTATAGATTTTCCTGGATTAATTGATTCAATAGTGTGTGTTAATGGAAAGTGGATAATAAGAAACAAAGAGAAAAATAA
GTGGCTTTTACGTCAATTAAAATTGCATTCTTTGATAGATTACTTAGATATAAACATAGACTGTTTGGATATTCTTGATG
AATTATGGGATAAGAAAATAAGTGATAGCAAATTTCTCGGTATCTTACGAGTTATTATAAACAATAGTCATACAGATAAA
AAATTTATTTATGATGTTAAAGTTAGTAAATCTTTGAGAGTGTTACAAGTTTTATATAGAATTTCACATTTTATACCATT
TTCTTCTATATGGCGTTATTATATTAATCCTAGTCGTTATCGTACTACGCCAGGTTATGTAGGTGATAATGTTAAGGAAA
AATTATATACACAAAATAAAAAAATTCCTGTTACATCATTTTCAAGTAAAATTATAGAAAATATCAAATTATGCAATTCT
GAAGAAAGATATGTTCAAAGTTATTATGAAGCTAAGTTTTTAAAGAAAAGAATTCGTAAGGACAATAATATAGCAGGAAG
ATTTGAAAAGCTGAAAATAAGACTATTATCTAATAGGTTTGTAGCTTATGTACTTTTTGGTCTTATGTTTGTTATCATAC
TGATAAGTGCAATTGTTGGTAGGATACTTATGCATTTTAATATTATACCAGGTGTTTTTATTGGTAAGTTTATTTATGGA
ATGCAGGGGATATTTGATTCGTTGTGTGTAGTAGTAGGGTTGGATACTATAGTAGATAAAGGGTTAAGTTTGATTTTAGA
TACTGCAGGTATTATTGTTAGGGTACTTGATTTTATTTTGTTATGTGGTTTGCTCTCAGAGTGTATAAGGTTTTTTATAA
AGTTGGTATATTTAATATGTAAGCATGTTTATAAGGTATGTGAAAACATTTATGAATTTTTGAAAATTTATGGGTTTAAG
TATTCATGTATTATTTTATTGAGTAAGATTTGGTTTATTAAGCATAGGGAGTTTGAGACCTGTCAGCAACAAAGAGAATC
TAGTGAACAGGGGTATGATATTAATGGTGGTTTGATAGAAGCATTGGAACAGATTTATGGTAAGGTGAAGGTCAGTGATG
GTCTATCATCACGCATTATTAGTATGACACGAGAGCTATCTTCGCAGATTGATCAGATTCTATGTTGTAATAAGCCCAAA
CCTGAGTTTTTGTTAAAAGAGTTTGAAAGTCATACCTCTAAATTGCCTCAGGATGTGGTAGGTAATGTAAATTATATTAA
ATTAAAATATGAGTTTTCTTATTTATTAAATAATTATACAGAAAAGATTAACTATTGTAGTGATACAGACAGGTTGAATA
TTCTAAATAGTTTTCAAAAGAGATCAGCACTTTATGACAAGATTACTGCTGTTAATTTACAGACCAGATATTTTCATAAG
GATTCATGCGTTAAAATATGCAATACACGAGATGTAGAGCGTATATTTGCTGAAGCAAATACTATGGGTGATATTGTAAC
AGTAGAATTATTAGATGCAAAAATTGCATCATTAAAATGGGCAATACATATGTTAGATGTTCATGATGTTTATAATATCA
AAAATAGATCAGAGCCGGTATTCTTAAATACTAAAGTGGACCATAGTATGACTGTAGTGCTTTATGATTGTATATTAAGA
TTACAGAATTACCGCAAACAACTGCAATTTGGTAAATTAATTTCTAAAAAGTTTATAGATACTGATATTGATAGTAATTT
TTCTCCATATATAAGGGATGTATATCATGTTTTACAGTCACTGGATGATAATAGTATGCTTAACAGCCAGACATCAAGTA
TAAGAATATTTGTTGAGAACTTTTTTGATTCTAATAGTTTATTATTAAAAAAACCTTCAGATAAAGCTAAAGATTTAGCT
AATTATATTAAAATTGATAAAGGAACAGTATCTTGTATGTCCCGTATTAAAAAGTCTATTTATGAATTTATAGAATATTT
TCAAGATCCAAAGAGCATTTCTATATCTTTTATATTGTATTATTTACTCCGTTTAACAAATTCAATAACTTTACTTAGTA
TTGCTGATTATGTTACACAAATAACGGATCATGCGTTAGATATAGTAATGTTAGATGGGTTATATGAATATTTTACTTGT
ACTGATTTTGGTAAATTATTGTTAGTTGAATTTTATCAAAAAGGTATTTTGTTTAAAGATATAATGTTTATGTGTTCTGA
ATTTGATTTAGGATTGCTGTATAATAATATACAAACAGTTCAAGGTAGTTTGCATTGTCAAGATATTAATTACTCTATAT
ATTCATCTTCTTTTCATAGGGGAAATCCTGCACAGGAGAAGATATCACAAATGATTAATGGATTTATAGAAGTTTTATGT
GAAGGGTTGTTTATAAAGGGAGTACAACAACTTGTTAATTATTTTAAAAAGAAGGTAGTATATAATATTCAATACTTTAT
GTTACATGAGAATATGGCGTCAAATTCAGTATTGTTTAATACTAAATGTGTGTCTGATTGTTATTATTCTGCTGATGTAA
AAGTAGTGCAGGAAGTAGGTTGTCGTAGGCAAAGAGGAGAGTTATTTCTTAGTGATGTTGATCATACCTTGGAGTTAAGT
ATTGATCGTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTCATATAAAGTAAAATTGTGATTATCTAAGTATTGAGGTAATGTATGTTATTAAGTAGTACATATAAAAGTCAATCGC
TAGTTGATTTCCTCAGTTCC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGTTATATTTCAAGAGTCCGTTTTTAAAGTGTGGATGGTATGTTTTTATGGTAGATGATAAAAGTTACAAAACAAAGTCA
AGTAGCTTAAATGGGCTCAG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 1363; Mature: 1363

Protein sequence:

>1363_residues
MIQIDNVRLENHFLYIDIIYNSDDDRKKILNVLPRGVIQEDLVDCRLTVKKSDLIFFKTQLHNPFRATAGNNEYNIRLMM
YLIFEATDLWELHCCDIYSSIKGHYQHDQRECKGIFQQLMSYFFKSKECVGRMGEDCVRDLNPLCFPNPELLRSKLCIHS
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VKFNITANLDFFIKMNSDKGILRAQQYFRGLTALVEAEINFLQKFQDVLVIKDLDLFLKVTCKNVHDDINRLLAAYDFFM
QKKIVDRNAILKFTKKELLELTQYTNSRVLLLKEIVRYMNDSIRAKNINKSFLSERVIGFIVDNHPILSTQLLKDNRLIS
SIDFPGLIDSIVCVNGKWIIRNKEKNKWLLRQLKLHSLIDYLDINIDCLDILDELWDKKISDSKFLGILRVIINNSHTDK
KFIYDVKVSKSLRVLQVLYRISHFIPFSSIWRYYINPSRYRTTPGYVGDNVKEKLYTQNKKIPVTSFSSKIIENIKLCNS
EERYVQSYYEAKFLKKRIRKDNNIAGRFEKLKIRLLSNRFVAYVLFGLMFVIILISAIVGRILMHFNIIPGVFIGKFIYG
MQGIFDSLCVVVGLDTIVDKGLSLILDTAGIIVRVLDFILLCGLLSECIRFFIKLVYLICKHVYKVCENIYEFLKIYGFK
YSCIILLSKIWFIKHREFETCQQQRESSEQGYDINGGLIEALEQIYGKVKVSDGLSSRIISMTRELSSQIDQILCCNKPK
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NYIKIDKGTVSCMSRIKKSIYEFIEYFQDPKSISISFILYYLLRLTNSITLLSIADYVTQITDHALDIVMLDGLYEYFTC
TDFGKLLLVEFYQKGILFKDIMFMCSEFDLGLLYNNIQTVQGSLHCQDINYSIYSSSFHRGNPAQEKISQMINGFIEVLC
EGLFIKGVQQLVNYFKKKVVYNIQYFMLHENMASNSVLFNTKCVSDCYYSADVKVVQEVGCRRQRGELFLSDVDHTLELS
IDR

Sequences:

>Translated_1363_residues
MIQIDNVRLENHFLYIDIIYNSDDDRKKILNVLPRGVIQEDLVDCRLTVKKSDLIFFKTQLHNPFRATAGNNEYNIRLMM
YLIFEATDLWELHCCDIYSSIKGHYQHDQRECKGIFQQLMSYFFKSKECVGRMGEDCVRDLNPLCFPNPELLRSKLCIHS
DGKYYVFLSTIKEYEDSVLFKVITKKLQMLELESAKSSDDSVLLKILDQKKCLQYFIACLSDVNCFNSLAVPFHVFLEAL
NILISDQVIVKEIEGLLRERQLHDMINHVAYKFFQDKKQYGIDVYGQGLEKAHDIYYELYGNNLPEDNLAVKKAILSLQN
VKFNITANLDFFIKMNSDKGILRAQQYFRGLTALVEAEINFLQKFQDVLVIKDLDLFLKVTCKNVHDDINRLLAAYDFFM
QKKIVDRNAILKFTKKELLELTQYTNSRVLLLKEIVRYMNDSIRAKNINKSFLSERVIGFIVDNHPILSTQLLKDNRLIS
SIDFPGLIDSIVCVNGKWIIRNKEKNKWLLRQLKLHSLIDYLDINIDCLDILDELWDKKISDSKFLGILRVIINNSHTDK
KFIYDVKVSKSLRVLQVLYRISHFIPFSSIWRYYINPSRYRTTPGYVGDNVKEKLYTQNKKIPVTSFSSKIIENIKLCNS
EERYVQSYYEAKFLKKRIRKDNNIAGRFEKLKIRLLSNRFVAYVLFGLMFVIILISAIVGRILMHFNIIPGVFIGKFIYG
MQGIFDSLCVVVGLDTIVDKGLSLILDTAGIIVRVLDFILLCGLLSECIRFFIKLVYLICKHVYKVCENIYEFLKIYGFK
YSCIILLSKIWFIKHREFETCQQQRESSEQGYDINGGLIEALEQIYGKVKVSDGLSSRIISMTRELSSQIDQILCCNKPK
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LQNYRKQLQFGKLISKKFIDTDIDSNFSPYIRDVYHVLQSLDDNSMLNSQTSSIRIFVENFFDSNSLLLKKPSDKAKDLA
NYIKIDKGTVSCMSRIKKSIYEFIEYFQDPKSISISFILYYLLRLTNSITLLSIADYVTQITDHALDIVMLDGLYEYFTC
TDFGKLLLVEFYQKGILFKDIMFMCSEFDLGLLYNNIQTVQGSLHCQDINYSIYSSSFHRGNPAQEKISQMINGFIEVLC
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IDR
>Mature_1363_residues
MIQIDNVRLENHFLYIDIIYNSDDDRKKILNVLPRGVIQEDLVDCRLTVKKSDLIFFKTQLHNPFRATAGNNEYNIRLMM
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YSCIILLSKIWFIKHREFETCQQQRESSEQGYDINGGLIEALEQIYGKVKVSDGLSSRIISMTRELSSQIDQILCCNKPK
PEFLLKEFESHTSKLPQDVVGNVNYIKLKYEFSYLLNNYTEKINYCSDTDRLNILNSFQKRSALYDKITAVNLQTRYFHK
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LQNYRKQLQFGKLISKKFIDTDIDSNFSPYIRDVYHVLQSLDDNSMLNSQTSSIRIFVENFFDSNSLLLKKPSDKAKDLA
NYIKIDKGTVSCMSRIKKSIYEFIEYFQDPKSISISFILYYLLRLTNSITLLSIADYVTQITDHALDIVMLDGLYEYFTC
TDFGKLLLVEFYQKGILFKDIMFMCSEFDLGLLYNNIQTVQGSLHCQDINYSIYSSSFHRGNPAQEKISQMINGFIEVLC
EGLFIKGVQQLVNYFKKKVVYNIQYFMLHENMASNSVLFNTKCVSDCYYSADVKVVQEVGCRRQRGELFLSDVDHTLELS
IDR

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 158889; Mature: 158889

Theoretical pI: Translated: 8.25; Mature: 8.25

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.6 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
4.5 %Cys+Met (Translated Protein)
2.6 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
4.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIQIDNVRLENHFLYIDIIYNSDDDRKKILNVLPRGVIQEDLVDCRLTVKKSDLIFFKTQ
CEEECCEEEECEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHEEEEECCCEEEEEEC
LHNPFRATAGNNEYNIRLMMYLIFEATDLWELHCCDIYSSIKGHYQHDQRECKGIFQQLM
CCCCCEECCCCCCEEEEEEEEEHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHH
SYFFKSKECVGRMGEDCVRDLNPLCFPNPELLRSKLCIHSDGKYYVFLSTIKEYEDSVLF
HHHHCCHHHHHHCCHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCEECCCCEEEEHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
NILISDQVIVKEIEGLLRERQLHDMINHVAYKFFQDKKQYGIDVYGQGLEKAHDIYYELY
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GNNLPEDNLAVKKAILSLQNVKFNITANLDFFIKMNSDKGILRAQQYFRGLTALVEAEIN
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHCEEEEEEECEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KHVYKVCENIYEFLKIYGFKYSCIILLSKIWFIKHREFETCQQQRESSEQGYDINGGLIE
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHH
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GNVNYIKLKYEFSYLLNNYTEKINYCSDTDRLNILNSFQKRSALYDKITAVNLQTRYFHK
CCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEHHEECC
DSCVKICNTRDVERIFAEANTMGDIVTVELLDAKIASLKWAIHMLDVHDVYNIKNRSEPV
CCHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHEEEEHHHHHCCCCCCCCE
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CCCCCCCCCCCCCEEEEEEHHCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH
YEFIEYFQDPKSISISFILYYLLRLTNSITLLSIADYVTQITDHALDIVMLDGLYEYFTC
HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TDFGKLLLVEFYQKGILFKDIMFMCSEFDLGLLYNNIQTVQGSLHCQDINYSIYSSSFHR
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TKCVSDCYYSADVKVVQEVGCRRQRGELFLSDVDHTLELSIDR
CHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCHHCCCEEEECCCCEEEEEECC
>Mature Secondary Structure
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CEEECCEEEECEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHEEEEECCCEEEEEEC
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NILISDQVIVKEIEGLLRERQLHDMINHVAYKFFQDKKQYGIDVYGQGLEKAHDIYYELY
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHC
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CCCCCCCHHHHHHHHHHHHCEEEEEEECEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHH
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CCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEHHEECC
DSCVKICNTRDVERIFAEANTMGDIVTVELLDAKIASLKWAIHMLDVHDVYNIKNRSEPV
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CCCCCCCCCCCCCEEEEEEHHCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH
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TDFGKLLLVEFYQKGILFKDIMFMCSEFDLGLLYNNIQTVQGSLHCQDINYSIYSSSFHR
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCEEEECCCCCC
GNPAQEKISQMINGFIEVLCEGLFIKGVQQLVNYFKKKVVYNIQYFMLHENMASNSVLFN
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCCCCEEEE
TKCVSDCYYSADVKVVQEVGCRRQRGELFLSDVDHTLELSIDR
CHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCHHCCCEEEECCCCEEEEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA