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The map label for this gene is comEC [H]

Identifier: 88657575

GI number: 88657575

Start: 414009

End: 416033

Strand: Direct

Name: comEC [H]

Synonym: ECH_0435

Alternate gene names: 88657575

Gene position: 414009-416033 (Clockwise)

Preceding gene: 88658312

Following gene: 88657573

Centisome position: 35.2

GC content: 28.59

Gene sequence:

>2025_bases
ATGCTATTGGTTAGTATAATTATCCGCAAAATAACATTATTGTTATGCAAGAATCTTAACGATAATAGAGATGTTCTTAT
AATTTGGGTACCAATATTACAGGGAATTGGCATAATAATATACTTTTCTTTGACTAATGAACCGCAGGATGATGTATTAG
TATACATTGCTTTCTTATTATTGGTCGGTTTGGTTTTTATTTGTTTAAGGAAGTATAGTATTTTATTTATATCAGTTTTT
TTTATCTTATTAGGATTTGTTAGTGTGCAAATAAAAGCACATTATTTTGTAGGTAGTGTATTACGACATCAGGTGTATGT
AAGAGATGTTATTGCTACAGTTAAAGAAATAAGTATTCAACAGTCAAACAAAAGATTAGTTGTGTGTGACATCAAAGGTA
GCAAATATGGAATAAAGTGTATTAGGTTAGGAGTTCGTACCAAATTAGACGATAATATTACAATAGGTGACATGGTACAA
TTTTCTGCAATTATTTATCCTCCATCAGTTGCTGTATCTCCATTTTCTTATGACTTTTCTCGTATAGCGTATTTTAAAAA
TATCAGTGCAGTAGGTTTTGCAGTTAGTAATATATGCTTATTCAAAAAAAGCAGAAGTAGACGAGTTACAGAATATATAG
AACTTATAAGATTGAATATATATAAGGTGCTTCTGCGTAGCCTAACGGAAGATAGTGCTAATATATTAAGTGCACTACTA
ATAGGGAAAAAAGAAGGTATTAAAAGTGATATCATGGATACTATTAGAAATACAGGAATAGCTCATCTTTTTGCTATTTC
TGGATTGCATTTATCTTTTATTGCTGGGTTATTTTTTTCTTTATCAAGAAGTTTATTAGTATTGTTTACAAAATTTGCTG
AAAGCTATGACATAAAGAAAATCTCTTCTGTTATAGCTATTGTGGTGAGCCTAATTTATTTGTTAATTGCTGGGATGCCT
GTTTCAGGTCAACGTGCTTTTATTATGGTAAGTTGTGTTTTTATTGGTATATTGATTGATCGAAATCATAATAATTTTTG
TTCTATAGCGGTTGCATCATTTATTATATTATTGTTTAATCCTGAATCATTGCTAAGCCCAAGTTTTCAGATGTCCTTTG
CTGCTGTACTTGCTCTTGTTGCTAGTCATAATATTTTTTTAAGATTAGTAGTTATGAATAATATAGTACAGTATTTTTCA
TCAATTGTTTTGAGTTCGCTGATTGCAAGTTTGGCTACACTTCCTTATGTAGTATATCATTTTAACTATTTTTCTATAGC
AGGAGTTTTTGCTAATTTGCTTGCAATTCCAATTACAACATTTTTTATAATGCCATTGGGATTGTTATATATTGTATTGG
GTATTGTCAATTTGGAATTTTGTGTTTCGTGGATGCTAGAAAGCACAGTAAATTTACTTATATATATAGTTAAGTATATT
GCTAAAATAGATGGATTAGTAGTATTGTTTCATGCTTTTTCTTCAGTATCTATATTAATTATTACTTTAGGATTTTTATT
TTTGTGTTTATGGAAAGGAAATATGAGATTTTGTGGATTAATATTAGTTATACTGGGATTTTTTGTTGGTATTAGTTATG
TAACTCCTGATATTATGTTTAATCAACACAATATTGTAGTTAAAGAGTTAAATGGTAAATTATATGCAATTAATCAAAAG
GCTCATTTGACAAGTTTTATAAATTTAACATGGGCAAGACAAAATGGTCAGAAGAAAATGTTAAAACATTATTCTGGAAA
TAATCAATACTTATCCTGTGAGAGAGCAGGGTGTATATATAACAAATTGGGAAGGAATGTTTTGATTGCTTATAATGCTG
ATTATGTAATGCAAAATTGTCAGGATGTAGACTTAATTATACAGGCTAAGAAGTTTATGTATCCGAGTGAATGTTTAACA
CAGCATATTAATTATAATAATACTAGTAAGTCATATGTTATTTGGATAACAAATAATGAGATAAAGATTGATGGGATGTT
TGGTAACAGAATATGGAATACATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTGGGTTATAGTCTTTTAAGGGAATATGTAGTCAAGATTAGGTTGTTTATAAAATAATATGTATTAACATATGTTAATAT
TTTAATTATTATTAAATTAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGAGTAATGAATTAGGAGTAGTAAATTTTAGTGATAGAATAGTTGCCGTTTACTTGTAATGTATGGAATATACTTATTCA
TGATTTATGCATTGTTGGTA

Product: ComEC/Rec2-related protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 674; Mature: 674

Protein sequence:

>674_residues
MLLVSIIIRKITLLLCKNLNDNRDVLIIWVPILQGIGIIIYFSLTNEPQDDVLVYIAFLLLVGLVFICLRKYSILFISVF
FILLGFVSVQIKAHYFVGSVLRHQVYVRDVIATVKEISIQQSNKRLVVCDIKGSKYGIKCIRLGVRTKLDDNITIGDMVQ
FSAIIYPPSVAVSPFSYDFSRIAYFKNISAVGFAVSNICLFKKSRSRRVTEYIELIRLNIYKVLLRSLTEDSANILSALL
IGKKEGIKSDIMDTIRNTGIAHLFAISGLHLSFIAGLFFSLSRSLLVLFTKFAESYDIKKISSVIAIVVSLIYLLIAGMP
VSGQRAFIMVSCVFIGILIDRNHNNFCSIAVASFIILLFNPESLLSPSFQMSFAAVLALVASHNIFLRLVVMNNIVQYFS
SIVLSSLIASLATLPYVVYHFNYFSIAGVFANLLAIPITTFFIMPLGLLYIVLGIVNLEFCVSWMLESTVNLLIYIVKYI
AKIDGLVVLFHAFSSVSILIITLGFLFLCLWKGNMRFCGLILVILGFFVGISYVTPDIMFNQHNIVVKELNGKLYAINQK
AHLTSFINLTWARQNGQKKMLKHYSGNNQYLSCERAGCIYNKLGRNVLIAYNADYVMQNCQDVDLIIQAKKFMYPSECLT
QHINYNNTSKSYVIWITNNEIKIDGMFGNRIWNT

Sequences:

>Translated_674_residues
MLLVSIIIRKITLLLCKNLNDNRDVLIIWVPILQGIGIIIYFSLTNEPQDDVLVYIAFLLLVGLVFICLRKYSILFISVF
FILLGFVSVQIKAHYFVGSVLRHQVYVRDVIATVKEISIQQSNKRLVVCDIKGSKYGIKCIRLGVRTKLDDNITIGDMVQ
FSAIIYPPSVAVSPFSYDFSRIAYFKNISAVGFAVSNICLFKKSRSRRVTEYIELIRLNIYKVLLRSLTEDSANILSALL
IGKKEGIKSDIMDTIRNTGIAHLFAISGLHLSFIAGLFFSLSRSLLVLFTKFAESYDIKKISSVIAIVVSLIYLLIAGMP
VSGQRAFIMVSCVFIGILIDRNHNNFCSIAVASFIILLFNPESLLSPSFQMSFAAVLALVASHNIFLRLVVMNNIVQYFS
SIVLSSLIASLATLPYVVYHFNYFSIAGVFANLLAIPITTFFIMPLGLLYIVLGIVNLEFCVSWMLESTVNLLIYIVKYI
AKIDGLVVLFHAFSSVSILIITLGFLFLCLWKGNMRFCGLILVILGFFVGISYVTPDIMFNQHNIVVKELNGKLYAINQK
AHLTSFINLTWARQNGQKKMLKHYSGNNQYLSCERAGCIYNKLGRNVLIAYNADYVMQNCQDVDLIIQAKKFMYPSECLT
QHINYNNTSKSYVIWITNNEIKIDGMFGNRIWNT
>Mature_674_residues
MLLVSIIIRKITLLLCKNLNDNRDVLIIWVPILQGIGIIIYFSLTNEPQDDVLVYIAFLLLVGLVFICLRKYSILFISVF
FILLGFVSVQIKAHYFVGSVLRHQVYVRDVIATVKEISIQQSNKRLVVCDIKGSKYGIKCIRLGVRTKLDDNITIGDMVQ
FSAIIYPPSVAVSPFSYDFSRIAYFKNISAVGFAVSNICLFKKSRSRRVTEYIELIRLNIYKVLLRSLTEDSANILSALL
IGKKEGIKSDIMDTIRNTGIAHLFAISGLHLSFIAGLFFSLSRSLLVLFTKFAESYDIKKISSVIAIVVSLIYLLIAGMP
VSGQRAFIMVSCVFIGILIDRNHNNFCSIAVASFIILLFNPESLLSPSFQMSFAAVLALVASHNIFLRLVVMNNIVQYFS
SIVLSSLIASLATLPYVVYHFNYFSIAGVFANLLAIPITTFFIMPLGLLYIVLGIVNLEFCVSWMLESTVNLLIYIVKYI
AKIDGLVVLFHAFSSVSILIITLGFLFLCLWKGNMRFCGLILVILGFFVGISYVTPDIMFNQHNIVVKELNGKLYAINQK
AHLTSFINLTWARQNGQKKMLKHYSGNNQYLSCERAGCIYNKLGRNVLIAYNADYVMQNCQDVDLIIQAKKFMYPSECLT
QHINYNNTSKSYVIWITNNEIKIDGMFGNRIWNT

Specific function: The comE operon is required for the binding and uptake of transforming DNA. ComEC is required for internalization but is dispensable for DNA binding [H]

COG id: COG0658

COG function: function code R; Predicted membrane metal-binding protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To H.influenzae REC2, N.gonorrhoeae ComA and E.coli YcaI [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI87081801, Length=253, Percent_Identity=28.0632411067194, Blast_Score=71, Evalue=2e-13,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001279
- InterPro:   IPR004477
- InterPro:   IPR004797 [H]

Pfam domain/function: PF03772 Competence; PF00753 Lactamase_B [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 76049; Mature: 76049

Theoretical pI: Translated: 9.59; Mature: 9.59

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.1 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
4.3 %Cys+Met (Translated Protein)
2.1 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
4.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLLVSIIIRKITLLLCKNLNDNRDVLIIWVPILQGIGIIIYFSLTNEPQDDVLVYIAFLL
CHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEHHHHCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHH
LVGLVFICLRKYSILFISVFFILLGFVSVQIKAHYFVGSVLRHQVYVRDVIATVKEISIQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
QSNKRLVVCDIKGSKYGIKCIRLGVRTKLDDNITIGDMVQFSAIIYPPSVAVSPFSYDFS
CCCCEEEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCEEHHHHHHHEEEECCCCEECCCCCCHH
RIAYFKNISAVGFAVSNICLFKKSRSRRVTEYIELIRLNIYKVLLRSLTEDSANILSALL
HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
IGKKEGIKSDIMDTIRNTGIAHLFAISGLHLSFIAGLFFSLSRSLLVLFTKFAESYDIKK
HCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
ISSVIAIVVSLIYLLIAGMPVSGQRAFIMVSCVFIGILIDRNHNNFCSIAVASFIILLFN
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHEEC
PESLLSPSFQMSFAAVLALVASHNIFLRLVVMNNIVQYFSSIVLSSLIASLATLPYVVYH
CHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FNYFSIAGVFANLLAIPITTFFIMPLGLLYIVLGIVNLEFCVSWMLESTVNLLIYIVKYI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AKIDGLVVLFHAFSSVSILIITLGFLFLCLWKGNMRFCGLILVILGFFVGISYVTPDIMF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEE
NQHNIVVKELNGKLYAINQKAHLTSFINLTWARQNGQKKMLKHYSGNNQYLSCERAGCIY
CCCCEEEEECCCEEEEECCHHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHCCCCCCEEEEHHCCHHH
NKLGRNVLIAYNADYVMQNCQDVDLIIQAKKFMYPSECLTQHINYNNTSKSYVIWITNNE
HHCCCEEEEEECCHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCE
IKIDGMFGNRIWNT
EEEEEEECCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MLLVSIIIRKITLLLCKNLNDNRDVLIIWVPILQGIGIIIYFSLTNEPQDDVLVYIAFLL
CHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEHHHHCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHH
LVGLVFICLRKYSILFISVFFILLGFVSVQIKAHYFVGSVLRHQVYVRDVIATVKEISIQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
QSNKRLVVCDIKGSKYGIKCIRLGVRTKLDDNITIGDMVQFSAIIYPPSVAVSPFSYDFS
CCCCEEEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCEEHHHHHHHEEEECCCCEECCCCCCHH
RIAYFKNISAVGFAVSNICLFKKSRSRRVTEYIELIRLNIYKVLLRSLTEDSANILSALL
HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
IGKKEGIKSDIMDTIRNTGIAHLFAISGLHLSFIAGLFFSLSRSLLVLFTKFAESYDIKK
HCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
ISSVIAIVVSLIYLLIAGMPVSGQRAFIMVSCVFIGILIDRNHNNFCSIAVASFIILLFN
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHEEC
PESLLSPSFQMSFAAVLALVASHNIFLRLVVMNNIVQYFSSIVLSSLIASLATLPYVVYH
CHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FNYFSIAGVFANLLAIPITTFFIMPLGLLYIVLGIVNLEFCVSWMLESTVNLLIYIVKYI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AKIDGLVVLFHAFSSVSILIITLGFLFLCLWKGNMRFCGLILVILGFFVGISYVTPDIMF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEE
NQHNIVVKELNGKLYAINQKAHLTSFINLTWARQNGQKKMLKHYSGNNQYLSCERAGCIY
CCCCEEEEECCCEEEEECCHHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHCCCCCCEEEEHHCCHHH
NKLGRNVLIAYNADYVMQNCQDVDLIIQAKKFMYPSECLTQHINYNNTSKSYVIWITNNE
HHCCCEEEEEECCHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCE
IKIDGMFGNRIWNT
EEEEEEECCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7968523; 8969508; 9384377 [H]