Definition Anaplasma phagocytophilum HZ, complete genome.
Accession NC_007797
Length 1,471,282

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The map label for this gene is 88607644

Identifier: 88607644

GI number: 88607644

Start: 924684

End: 927827

Strand: Reverse

Name: 88607644

Synonym: APH_0874

Alternate gene names: NA

Gene position: 927827-924684 (Counterclockwise)

Preceding gene: 88607936

Following gene: 88607163

Centisome position: 63.06

GC content: 48.63

Gene sequence:

>3144_bases
ATGGCGAAAAGATTCTTAAACGACACAGAAAAGAAATTACTATCTCTGCTCAAGTCGGTAATGCAGCATTATAAGCCTCG
TACCGGTTTTGTCAGGGCTTTGCTAAGTGCCCTGCGTTCTATAAGTGTAGGGAATCCGAGACAAACAGCACATGATCTAT
CTGTGTTGGTTACACAGGATTTCCTTGTCGAGGTTATTGGCTCTTTCAGTACGCAAGCTATCGCTCCTTCCTTCCTCAAC
ATCATGGCCCTGGTAGATGAGGAGGCATTAAATCACTACGACCGCCCTGGGCGTGCTCCAATGTTTGCAGACATGTTGAG
GTATGCGCAAGAGCAAATTCGTAGAGGTAATCTGCTTCAGCATAGATGGAATGAGGAGACATTTGCATCTTTTGCGGATA
GTTACCTCAGGAGAAGGCACGAGCGTGTCAGTGCGGAGCATCTTCGCCAGGCGATGCAGATCTTGCATGCACCGGCTAGT
TATCGCGTCCTGTCTACAAATTGGTTTTTGCTGCGTTTGATTGCTGCAGGGTACGTGAGGAATGCAGTTGATGTGGTCGA
TGCGGAAAGTGCAGGGCTTACTTCTCCTCGGAGCTCCAGTGAGCGTACTGCTATTGAATCGCTCCTGAAGGATTATGATG
AAGAGGGTCTCAGCGAGATGCTCGAGACCGAAAAAGGTGTCATGACGAGCCTCTTCGGTACTGTGTTACTCAGCACTTAC
GTTAACGAATTACGGGCAGAAGTAGCGCAGGAATTCGCTGAGCATCATCGATTTTTATCTAGGGTACTTTCTACCTGTTC
TGCGCTACTTAGCCCGCTGGGTACAGTTGCTGTTGTTGCGTACTGTGCATCGATGTTCTCCTCGATTATTCAGCAGGCGA
CTAATCCTTCTAGTGATAAGGAGAAGTATTGTGCACTGATAGACTATATAAATGAGACCATTGCAAGTTTTGGTTCCGGG
AATGGCAATGCCACTATTACCGAAGCTCTTATACGTGGAAGTAATCTAACCGCTCTTTTCGGTAATCACAGTTGCTCTGA
AAGCAATGAAGCTCTTCATGATATTTTGAGTAATCGCAGGAATGAGAGCCTTTCAATAACGAACATGAGTGCGATGCCGG
CATCTATCTCCGTGCTAACGACTATGTATCTTGCTCTGCCGATAATAGCGTTTGGTGGATATGCTGCCCAGTGGGTCAGT
AGGAGGATGTCTAGCAGAGGGAGGGGGGGTTTTTCTTCACCTGAAATGTTCTCTATGCTCTCGGCTGTGGTCTGTGCTAA
GCTCGGGTTGAACACTTTCTTAACGCTTACCGCGCACGTCTCTCATAAGGCGTTTAGCACTGCTTTGAATTGGTCAGTTA
CCAGGCTCTTCTTGCCTTTGTCGCTGATAGAGCAGCCCAAAAAGATAGGTCTCTTCGTCAACTCTGCAATGTCTGCTGCA
TGGAGCAGTAGAAGGTTGCGCTTTGAGCCTAGTAGCCGGGCATGTGCTATCGCTGCAGCATTGTCTATACCGTTTGAATA
TGCTGGGCATGTTGTGGCGAAGCTACATGTAATAAACACTGGATGGACTCAAGTTCCGCCGTCTTGTAGGCAGATCTTAA
ATTTCACAGTTAAGCACGCCAGAGTTGCTGCCTTTTTCGGTACCATAATTGCTGCTCGTAGGCATATTAGAAACATGCCA
TACTCCAGGCGGCTCGAAAGGATTATATGGGCAGATGGTGTAAAAGCTACTACAGCTCCAGCTGCGCTGCTACTCTTAGA
CGTTGCAGCCGGTAATGTGTTCCTATCTACGGTCGTGTTGACAGTAGATTCACTGGTAAGCCTCATTCCAGATATGATAT
GTAGTGCTAACGTAGATATGCTCAATAATGCTGGGAATCAACTGGCTGCGCTTGAGCAATGGCTTGTGGAGAATCTAGAC
GAAGAGGCGCTGCTAAAGATAGCAATGCTCACTTCATTGCAGAGGCTCCCTGGTAGTACGCATGGTGAGTTGGAGAAGAT
CCTAGAAGAGTTCTACAATAAGGATCAGATAACTGATCACGGGGTAGATTTGACAGTAGATGATGACTTTACGGAAGGTA
TTACCGAAAGGCAGTTATTAGAATGGCAATCCGATGACGCGTCTCGAAGACGGACACGAGGCGGTGATTGTGCTGATGCA
TCTAGTGAAGGTGAGCTTATAGGTGCTACTTCTCGTGACTACTATGATCCTCCAGAGAGGAGGAGAGGTCCTACTTTATA
CGAGGAGCTTGTACGTGGTATACTAGAAAGGCATGGTACGCGTTTCTCAGACGCTCTTGCTGGTGAGGAAGAAGATGCGG
ACGAAGCATTGCTTTTCAGTGACCTAAGGCTGCAGCTTGATGATGCTGCGGTACCTCATGAGGAGCAAAGTGAAAGAGGA
AGGTCGTCGCGTCGCGGACGTTTCTGTGGCGATGAAGATTTTGATGTTAAGTGCCAAGGGCAAGGCGATGGTCGGCGTTC
AAGGAGGAGTGATAGGAGAGGGTATAGTGAGGAACCTGCTCTTGGTGATATGAGGCATTCTTCTCGGGGCGCGGCTTCAG
AATCGGATGCGAGACGTAGTAGAAGATCTGATAGGGAAGAACCTGCTACTTCACCAAGGAGACATCCTGCTGGAGAAGTG
CCTCAACGGCAGGATGAGGCGTCGCCAAGTGGTCTAAGGAATCACCCTAGTGGTGCGATACCTAAGGTCAGAAGTGCTTC
TGCTGCAATGCATACTAAAAAAGATAAAAGCAAAAAGAGTGCAAGGTCTTCTGAGTCAACGCGTAGAGGGGTGGATTTAG
GGTTTCTTGGTTCTCCGAAAGATCTTGAGCGTTGCGTATTAGAGGGGGAGAGGGCTCGTGCGAGGAGCCCGCGGTGTGGT
GTAGGTACTCCTCCTTGTCATCTCGATAGGGTGGTGTATGAGACTGAGGGTGCTCAGGATGTTGATAATGACGTCTTTGA
TGTTTCGCGCTATGTTACCCCGCGCAACCAGGCGGGAGAGAGAGTGCGTGTGGGTACTTCTTCTTCCTCTCGTGCTCCTC
AAGGTGCTACTGGTCTTGCTCCGGGAACTAGTCTAACGTCTCTTGATGATGATGCGCTGGATATTTTGGATGCTATCCAG
GGGCAGCGAGGGCGAAGAAGGTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTGTGGGATTTGTGTGGGCTGTTGTATAAATACCACGTTCGAAGCTGTCCTAGTGTAATTCAGCATATGTTGAGGAAGTT
GTTGCTATGAGGTTGATGGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGAGCGCAGTGCTTATTTGTCATATATCTGTGCTGAATATACTCTCGAAGAGAAAGGGTTTGACGGGAGTAGAGTTTGTT
AGTGTTGAGCCAGTTCATGC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 1047; Mature: 1046

Protein sequence:

>1047_residues
MAKRFLNDTEKKLLSLLKSVMQHYKPRTGFVRALLSALRSISVGNPRQTAHDLSVLVTQDFLVEVIGSFSTQAIAPSFLN
IMALVDEEALNHYDRPGRAPMFADMLRYAQEQIRRGNLLQHRWNEETFASFADSYLRRRHERVSAEHLRQAMQILHAPAS
YRVLSTNWFLLRLIAAGYVRNAVDVVDAESAGLTSPRSSSERTAIESLLKDYDEEGLSEMLETEKGVMTSLFGTVLLSTY
VNELRAEVAQEFAEHHRFLSRVLSTCSALLSPLGTVAVVAYCASMFSSIIQQATNPSSDKEKYCALIDYINETIASFGSG
NGNATITEALIRGSNLTALFGNHSCSESNEALHDILSNRRNESLSITNMSAMPASISVLTTMYLALPIIAFGGYAAQWVS
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WSSRRLRFEPSSRACAIAAALSIPFEYAGHVVAKLHVINTGWTQVPPSCRQILNFTVKHARVAAFFGTIIAARRHIRNMP
YSRRLERIIWADGVKATTAPAALLLLDVAAGNVFLSTVVLTVDSLVSLIPDMICSANVDMLNNAGNQLAALEQWLVENLD
EEALLKIAMLTSLQRLPGSTHGELEKILEEFYNKDQITDHGVDLTVDDDFTEGITERQLLEWQSDDASRRRTRGGDCADA
SSEGELIGATSRDYYDPPERRRGPTLYEELVRGILERHGTRFSDALAGEEEDADEALLFSDLRLQLDDAAVPHEEQSERG
RSSRRGRFCGDEDFDVKCQGQGDGRRSRRSDRRGYSEEPALGDMRHSSRGAASESDARRSRRSDREEPATSPRRHPAGEV
PQRQDEASPSGLRNHPSGAIPKVRSASAAMHTKKDKSKKSARSSESTRRGVDLGFLGSPKDLERCVLEGERARARSPRCG
VGTPPCHLDRVVYETEGAQDVDNDVFDVSRYVTPRNQAGERVRVGTSSSSRAPQGATGLAPGTSLTSLDDDALDILDAIQ
GQRGRRR

Sequences:

>Translated_1047_residues
MAKRFLNDTEKKLLSLLKSVMQHYKPRTGFVRALLSALRSISVGNPRQTAHDLSVLVTQDFLVEVIGSFSTQAIAPSFLN
IMALVDEEALNHYDRPGRAPMFADMLRYAQEQIRRGNLLQHRWNEETFASFADSYLRRRHERVSAEHLRQAMQILHAPAS
YRVLSTNWFLLRLIAAGYVRNAVDVVDAESAGLTSPRSSSERTAIESLLKDYDEEGLSEMLETEKGVMTSLFGTVLLSTY
VNELRAEVAQEFAEHHRFLSRVLSTCSALLSPLGTVAVVAYCASMFSSIIQQATNPSSDKEKYCALIDYINETIASFGSG
NGNATITEALIRGSNLTALFGNHSCSESNEALHDILSNRRNESLSITNMSAMPASISVLTTMYLALPIIAFGGYAAQWVS
RRMSSRGRGGFSSPEMFSMLSAVVCAKLGLNTFLTLTAHVSHKAFSTALNWSVTRLFLPLSLIEQPKKIGLFVNSAMSAA
WSSRRLRFEPSSRACAIAAALSIPFEYAGHVVAKLHVINTGWTQVPPSCRQILNFTVKHARVAAFFGTIIAARRHIRNMP
YSRRLERIIWADGVKATTAPAALLLLDVAAGNVFLSTVVLTVDSLVSLIPDMICSANVDMLNNAGNQLAALEQWLVENLD
EEALLKIAMLTSLQRLPGSTHGELEKILEEFYNKDQITDHGVDLTVDDDFTEGITERQLLEWQSDDASRRRTRGGDCADA
SSEGELIGATSRDYYDPPERRRGPTLYEELVRGILERHGTRFSDALAGEEEDADEALLFSDLRLQLDDAAVPHEEQSERG
RSSRRGRFCGDEDFDVKCQGQGDGRRSRRSDRRGYSEEPALGDMRHSSRGAASESDARRSRRSDREEPATSPRRHPAGEV
PQRQDEASPSGLRNHPSGAIPKVRSASAAMHTKKDKSKKSARSSESTRRGVDLGFLGSPKDLERCVLEGERARARSPRCG
VGTPPCHLDRVVYETEGAQDVDNDVFDVSRYVTPRNQAGERVRVGTSSSSRAPQGATGLAPGTSLTSLDDDALDILDAIQ
GQRGRRR
>Mature_1046_residues
AKRFLNDTEKKLLSLLKSVMQHYKPRTGFVRALLSALRSISVGNPRQTAHDLSVLVTQDFLVEVIGSFSTQAIAPSFLNI
MALVDEEALNHYDRPGRAPMFADMLRYAQEQIRRGNLLQHRWNEETFASFADSYLRRRHERVSAEHLRQAMQILHAPASY
RVLSTNWFLLRLIAAGYVRNAVDVVDAESAGLTSPRSSSERTAIESLLKDYDEEGLSEMLETEKGVMTSLFGTVLLSTYV
NELRAEVAQEFAEHHRFLSRVLSTCSALLSPLGTVAVVAYCASMFSSIIQQATNPSSDKEKYCALIDYINETIASFGSGN
GNATITEALIRGSNLTALFGNHSCSESNEALHDILSNRRNESLSITNMSAMPASISVLTTMYLALPIIAFGGYAAQWVSR
RMSSRGRGGFSSPEMFSMLSAVVCAKLGLNTFLTLTAHVSHKAFSTALNWSVTRLFLPLSLIEQPKKIGLFVNSAMSAAW
SSRRLRFEPSSRACAIAAALSIPFEYAGHVVAKLHVINTGWTQVPPSCRQILNFTVKHARVAAFFGTIIAARRHIRNMPY
SRRLERIIWADGVKATTAPAALLLLDVAAGNVFLSTVVLTVDSLVSLIPDMICSANVDMLNNAGNQLAALEQWLVENLDE
EALLKIAMLTSLQRLPGSTHGELEKILEEFYNKDQITDHGVDLTVDDDFTEGITERQLLEWQSDDASRRRTRGGDCADAS
SEGELIGATSRDYYDPPERRRGPTLYEELVRGILERHGTRFSDALAGEEEDADEALLFSDLRLQLDDAAVPHEEQSERGR
SSRRGRFCGDEDFDVKCQGQGDGRRSRRSDRRGYSEEPALGDMRHSSRGAASESDARRSRRSDREEPATSPRRHPAGEVP
QRQDEASPSGLRNHPSGAIPKVRSASAAMHTKKDKSKKSARSSESTRRGVDLGFLGSPKDLERCVLEGERARARSPRCGV
GTPPCHLDRVVYETEGAQDVDNDVFDVSRYVTPRNQAGERVRVGTSSSSRAPQGATGLAPGTSLTSLDDDALDILDAIQG
QRGRRR

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 115493; Mature: 115362

Theoretical pI: Translated: 7.08; Mature: 7.08

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
3.4 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
2.0 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MAKRFLNDTEKKLLSLLKSVMQHYKPRTGFVRALLSALRSISVGNPRQTAHDLSVLVTQD
CCCHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
FLVEVIGSFSTQAIAPSFLNIMALVDEEALNHYDRPGRAPMFADMLRYAQEQIRRGNLLQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
HRWNEETFASFADSYLRRRHERVSAEHLRQAMQILHAPASYRVLSTNWFLLRLIAAGYVR
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHH
NAVDVVDAESAGLTSPRSSSERTAIESLLKDYDEEGLSEMLETEKGVMTSLFGTVLLSTY
HHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VNELRAEVAQEFAEHHRFLSRVLSTCSALLSPLGTVAVVAYCASMFSSIIQQATNPSSDK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH
EKYCALIDYINETIASFGSGNGNATITEALIRGSNLTALFGNHSCSESNEALHDILSNRR
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCC
NESLSITNMSAMPASISVLTTMYLALPIIAFGGYAAQWVSRRMSSRGRGGFSSPEMFSML
CCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHH
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HHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHH
WSSRRLRFEPSSRACAIAAALSIPFEYAGHVVAKLHVINTGWTQVPPSCRQILNFTVKHA
HHCCCEEECCCCCHHHHHHHHHCCHHHHCHHHHEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
RVAAFFGTIIAARRHIRNMPYSRRLERIIWADGVKATTAPAALLLLDVAAGNVFLSTVVL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH
TVDSLVSLIPDMICSANVDMLNNAGNQLAALEQWLVENLDEEALLKIAMLTSLQRLPGST
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
HGELEKILEEFYNKDQITDHGVDLTVDDDFTEGITERQLLEWQSDDASRRRTRGGDCADA
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEECCCHHHCHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCCCCC
SSEGELIGATSRDYYDPPERRRGPTLYEELVRGILERHGTRFSDALAGEEEDADEALLFS
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PKVRSASAAMHTKKDKSKKSARSSESTRRGVDLGFLGSPKDLERCVLEGERARARSPRCG
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCC
VGTPPCHLDRVVYETEGAQDVDNDVFDVSRYVTPRNQAGERVRVGTSSSSRAPQGATGLA
CCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCC
PGTSLTSLDDDALDILDAIQGQRGRRR
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
AKRFLNDTEKKLLSLLKSVMQHYKPRTGFVRALLSALRSISVGNPRQTAHDLSVLVTQD
CCHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
FLVEVIGSFSTQAIAPSFLNIMALVDEEALNHYDRPGRAPMFADMLRYAQEQIRRGNLLQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
HRWNEETFASFADSYLRRRHERVSAEHLRQAMQILHAPASYRVLSTNWFLLRLIAAGYVR
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHH
NAVDVVDAESAGLTSPRSSSERTAIESLLKDYDEEGLSEMLETEKGVMTSLFGTVLLSTY
HHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VNELRAEVAQEFAEHHRFLSRVLSTCSALLSPLGTVAVVAYCASMFSSIIQQATNPSSDK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH
EKYCALIDYINETIASFGSGNGNATITEALIRGSNLTALFGNHSCSESNEALHDILSNRR
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CCCCCEEECCCCCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCCCHHHHHHH
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HHHHHCCCCCCCCHHHHHHCHHHCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCC
LGDMRHSSRGAASESDARRSRRSDREEPATSPRRHPAGEVPQRQDEASPSGLRNHPSGAI
CCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
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CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCC
VGTPPCHLDRVVYETEGAQDVDNDVFDVSRYVTPRNQAGERVRVGTSSSSRAPQGATGLA
CCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCC
PGTSLTSLDDDALDILDAIQGQRGRRR
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA