| Definition | Anaplasma phagocytophilum HZ, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007797 |
| Length | 1,471,282 |
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The map label for this gene is 88607644
Identifier: 88607644
GI number: 88607644
Start: 924684
End: 927827
Strand: Reverse
Name: 88607644
Synonym: APH_0874
Alternate gene names: NA
Gene position: 927827-924684 (Counterclockwise)
Preceding gene: 88607936
Following gene: 88607163
Centisome position: 63.06
GC content: 48.63
Gene sequence:
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Downstream 100 bases:
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Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1047; Mature: 1046
Protein sequence:
>1047_residues MAKRFLNDTEKKLLSLLKSVMQHYKPRTGFVRALLSALRSISVGNPRQTAHDLSVLVTQDFLVEVIGSFSTQAIAPSFLN IMALVDEEALNHYDRPGRAPMFADMLRYAQEQIRRGNLLQHRWNEETFASFADSYLRRRHERVSAEHLRQAMQILHAPAS YRVLSTNWFLLRLIAAGYVRNAVDVVDAESAGLTSPRSSSERTAIESLLKDYDEEGLSEMLETEKGVMTSLFGTVLLSTY VNELRAEVAQEFAEHHRFLSRVLSTCSALLSPLGTVAVVAYCASMFSSIIQQATNPSSDKEKYCALIDYINETIASFGSG NGNATITEALIRGSNLTALFGNHSCSESNEALHDILSNRRNESLSITNMSAMPASISVLTTMYLALPIIAFGGYAAQWVS RRMSSRGRGGFSSPEMFSMLSAVVCAKLGLNTFLTLTAHVSHKAFSTALNWSVTRLFLPLSLIEQPKKIGLFVNSAMSAA WSSRRLRFEPSSRACAIAAALSIPFEYAGHVVAKLHVINTGWTQVPPSCRQILNFTVKHARVAAFFGTIIAARRHIRNMP YSRRLERIIWADGVKATTAPAALLLLDVAAGNVFLSTVVLTVDSLVSLIPDMICSANVDMLNNAGNQLAALEQWLVENLD EEALLKIAMLTSLQRLPGSTHGELEKILEEFYNKDQITDHGVDLTVDDDFTEGITERQLLEWQSDDASRRRTRGGDCADA SSEGELIGATSRDYYDPPERRRGPTLYEELVRGILERHGTRFSDALAGEEEDADEALLFSDLRLQLDDAAVPHEEQSERG RSSRRGRFCGDEDFDVKCQGQGDGRRSRRSDRRGYSEEPALGDMRHSSRGAASESDARRSRRSDREEPATSPRRHPAGEV PQRQDEASPSGLRNHPSGAIPKVRSASAAMHTKKDKSKKSARSSESTRRGVDLGFLGSPKDLERCVLEGERARARSPRCG VGTPPCHLDRVVYETEGAQDVDNDVFDVSRYVTPRNQAGERVRVGTSSSSRAPQGATGLAPGTSLTSLDDDALDILDAIQ GQRGRRR
Sequences:
>Translated_1047_residues MAKRFLNDTEKKLLSLLKSVMQHYKPRTGFVRALLSALRSISVGNPRQTAHDLSVLVTQDFLVEVIGSFSTQAIAPSFLN IMALVDEEALNHYDRPGRAPMFADMLRYAQEQIRRGNLLQHRWNEETFASFADSYLRRRHERVSAEHLRQAMQILHAPAS YRVLSTNWFLLRLIAAGYVRNAVDVVDAESAGLTSPRSSSERTAIESLLKDYDEEGLSEMLETEKGVMTSLFGTVLLSTY VNELRAEVAQEFAEHHRFLSRVLSTCSALLSPLGTVAVVAYCASMFSSIIQQATNPSSDKEKYCALIDYINETIASFGSG NGNATITEALIRGSNLTALFGNHSCSESNEALHDILSNRRNESLSITNMSAMPASISVLTTMYLALPIIAFGGYAAQWVS RRMSSRGRGGFSSPEMFSMLSAVVCAKLGLNTFLTLTAHVSHKAFSTALNWSVTRLFLPLSLIEQPKKIGLFVNSAMSAA WSSRRLRFEPSSRACAIAAALSIPFEYAGHVVAKLHVINTGWTQVPPSCRQILNFTVKHARVAAFFGTIIAARRHIRNMP YSRRLERIIWADGVKATTAPAALLLLDVAAGNVFLSTVVLTVDSLVSLIPDMICSANVDMLNNAGNQLAALEQWLVENLD EEALLKIAMLTSLQRLPGSTHGELEKILEEFYNKDQITDHGVDLTVDDDFTEGITERQLLEWQSDDASRRRTRGGDCADA SSEGELIGATSRDYYDPPERRRGPTLYEELVRGILERHGTRFSDALAGEEEDADEALLFSDLRLQLDDAAVPHEEQSERG RSSRRGRFCGDEDFDVKCQGQGDGRRSRRSDRRGYSEEPALGDMRHSSRGAASESDARRSRRSDREEPATSPRRHPAGEV PQRQDEASPSGLRNHPSGAIPKVRSASAAMHTKKDKSKKSARSSESTRRGVDLGFLGSPKDLERCVLEGERARARSPRCG VGTPPCHLDRVVYETEGAQDVDNDVFDVSRYVTPRNQAGERVRVGTSSSSRAPQGATGLAPGTSLTSLDDDALDILDAIQ GQRGRRR >Mature_1046_residues AKRFLNDTEKKLLSLLKSVMQHYKPRTGFVRALLSALRSISVGNPRQTAHDLSVLVTQDFLVEVIGSFSTQAIAPSFLNI MALVDEEALNHYDRPGRAPMFADMLRYAQEQIRRGNLLQHRWNEETFASFADSYLRRRHERVSAEHLRQAMQILHAPASY RVLSTNWFLLRLIAAGYVRNAVDVVDAESAGLTSPRSSSERTAIESLLKDYDEEGLSEMLETEKGVMTSLFGTVLLSTYV NELRAEVAQEFAEHHRFLSRVLSTCSALLSPLGTVAVVAYCASMFSSIIQQATNPSSDKEKYCALIDYINETIASFGSGN GNATITEALIRGSNLTALFGNHSCSESNEALHDILSNRRNESLSITNMSAMPASISVLTTMYLALPIIAFGGYAAQWVSR RMSSRGRGGFSSPEMFSMLSAVVCAKLGLNTFLTLTAHVSHKAFSTALNWSVTRLFLPLSLIEQPKKIGLFVNSAMSAAW SSRRLRFEPSSRACAIAAALSIPFEYAGHVVAKLHVINTGWTQVPPSCRQILNFTVKHARVAAFFGTIIAARRHIRNMPY SRRLERIIWADGVKATTAPAALLLLDVAAGNVFLSTVVLTVDSLVSLIPDMICSANVDMLNNAGNQLAALEQWLVENLDE EALLKIAMLTSLQRLPGSTHGELEKILEEFYNKDQITDHGVDLTVDDDFTEGITERQLLEWQSDDASRRRTRGGDCADAS SEGELIGATSRDYYDPPERRRGPTLYEELVRGILERHGTRFSDALAGEEEDADEALLFSDLRLQLDDAAVPHEEQSERGR SSRRGRFCGDEDFDVKCQGQGDGRRSRRSDRRGYSEEPALGDMRHSSRGAASESDARRSRRSDREEPATSPRRHPAGEVP QRQDEASPSGLRNHPSGAIPKVRSASAAMHTKKDKSKKSARSSESTRRGVDLGFLGSPKDLERCVLEGERARARSPRCGV GTPPCHLDRVVYETEGAQDVDNDVFDVSRYVTPRNQAGERVRVGTSSSSRAPQGATGLAPGTSLTSLDDDALDILDAIQG QRGRRR
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 115493; Mature: 115362
Theoretical pI: Translated: 7.08; Mature: 7.08
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.3 %Cys (Translated Protein) 2.1 %Met (Translated Protein) 3.4 %Cys+Met (Translated Protein) 1.3 %Cys (Mature Protein) 2.0 %Met (Mature Protein) 3.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MAKRFLNDTEKKLLSLLKSVMQHYKPRTGFVRALLSALRSISVGNPRQTAHDLSVLVTQD CCCHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH FLVEVIGSFSTQAIAPSFLNIMALVDEEALNHYDRPGRAPMFADMLRYAQEQIRRGNLLQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH HRWNEETFASFADSYLRRRHERVSAEHLRQAMQILHAPASYRVLSTNWFLLRLIAAGYVR HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHH NAVDVVDAESAGLTSPRSSSERTAIESLLKDYDEEGLSEMLETEKGVMTSLFGTVLLSTY HHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VNELRAEVAQEFAEHHRFLSRVLSTCSALLSPLGTVAVVAYCASMFSSIIQQATNPSSDK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH EKYCALIDYINETIASFGSGNGNATITEALIRGSNLTALFGNHSCSESNEALHDILSNRR HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCC NESLSITNMSAMPASISVLTTMYLALPIIAFGGYAAQWVSRRMSSRGRGGFSSPEMFSML CCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHH SAVVCAKLGLNTFLTLTAHVSHKAFSTALNWSVTRLFLPLSLIEQPKKIGLFVNSAMSAA HHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHH WSSRRLRFEPSSRACAIAAALSIPFEYAGHVVAKLHVINTGWTQVPPSCRQILNFTVKHA HHCCCEEECCCCCHHHHHHHHHCCHHHHCHHHHEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH RVAAFFGTIIAARRHIRNMPYSRRLERIIWADGVKATTAPAALLLLDVAAGNVFLSTVVL HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH TVDSLVSLIPDMICSANVDMLNNAGNQLAALEQWLVENLDEEALLKIAMLTSLQRLPGST HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC HGELEKILEEFYNKDQITDHGVDLTVDDDFTEGITERQLLEWQSDDASRRRTRGGDCADA HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEECCCHHHCHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCCCCC SSEGELIGATSRDYYDPPERRRGPTLYEELVRGILERHGTRFSDALAGEEEDADEALLFS CCCCCEEECCCCCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCCCHHHHHHH DLRLQLDDAAVPHEEQSERGRSSRRGRFCGDEDFDVKCQGQGDGRRSRRSDRRGYSEEPA HHHHHCCCCCCCCHHHHHHCHHHCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCC LGDMRHSSRGAASESDARRSRRSDREEPATSPRRHPAGEVPQRQDEASPSGLRNHPSGAI CCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC PKVRSASAAMHTKKDKSKKSARSSESTRRGVDLGFLGSPKDLERCVLEGERARARSPRCG CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCC VGTPPCHLDRVVYETEGAQDVDNDVFDVSRYVTPRNQAGERVRVGTSSSSRAPQGATGLA CCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCC PGTSLTSLDDDALDILDAIQGQRGRRR CCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCC >Mature Secondary Structure AKRFLNDTEKKLLSLLKSVMQHYKPRTGFVRALLSALRSISVGNPRQTAHDLSVLVTQD CCHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH FLVEVIGSFSTQAIAPSFLNIMALVDEEALNHYDRPGRAPMFADMLRYAQEQIRRGNLLQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH HRWNEETFASFADSYLRRRHERVSAEHLRQAMQILHAPASYRVLSTNWFLLRLIAAGYVR HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHH NAVDVVDAESAGLTSPRSSSERTAIESLLKDYDEEGLSEMLETEKGVMTSLFGTVLLSTY HHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VNELRAEVAQEFAEHHRFLSRVLSTCSALLSPLGTVAVVAYCASMFSSIIQQATNPSSDK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH EKYCALIDYINETIASFGSGNGNATITEALIRGSNLTALFGNHSCSESNEALHDILSNRR HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCC NESLSITNMSAMPASISVLTTMYLALPIIAFGGYAAQWVSRRMSSRGRGGFSSPEMFSML CCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHH SAVVCAKLGLNTFLTLTAHVSHKAFSTALNWSVTRLFLPLSLIEQPKKIGLFVNSAMSAA HHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHH WSSRRLRFEPSSRACAIAAALSIPFEYAGHVVAKLHVINTGWTQVPPSCRQILNFTVKHA HHCCCEEECCCCCHHHHHHHHHCCHHHHCHHHHEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH RVAAFFGTIIAARRHIRNMPYSRRLERIIWADGVKATTAPAALLLLDVAAGNVFLSTVVL HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH TVDSLVSLIPDMICSANVDMLNNAGNQLAALEQWLVENLDEEALLKIAMLTSLQRLPGST HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC HGELEKILEEFYNKDQITDHGVDLTVDDDFTEGITERQLLEWQSDDASRRRTRGGDCADA HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEECCCHHHCHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCCCCC SSEGELIGATSRDYYDPPERRRGPTLYEELVRGILERHGTRFSDALAGEEEDADEALLFS CCCCCEEECCCCCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCCCHHHHHHH DLRLQLDDAAVPHEEQSERGRSSRRGRFCGDEDFDVKCQGQGDGRRSRRSDRRGYSEEPA HHHHHCCCCCCCCHHHHHHCHHHCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCC LGDMRHSSRGAASESDARRSRRSDREEPATSPRRHPAGEVPQRQDEASPSGLRNHPSGAI CCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC PKVRSASAAMHTKKDKSKKSARSSESTRRGVDLGFLGSPKDLERCVLEGERARARSPRCG CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCC VGTPPCHLDRVVYETEGAQDVDNDVFDVSRYVTPRNQAGERVRVGTSSSSRAPQGATGLA CCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCC PGTSLTSLDDDALDILDAIQGQRGRRR CCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
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Specific activity: NA
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Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA