Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 84489742

Identifier: 84489742

GI number: 84489742

Start: 1085878

End: 1088631

Strand: Direct

Name: 84489742

Synonym: Msp_0943

Alternate gene names: NA

Gene position: 1085878-1088631 (Clockwise)

Preceding gene: 84489741

Following gene: 84489743

Centisome position: 61.44

GC content: 20.48

Gene sequence:

>2754_bases
ATGGATTCAAATGATATGATTTATTCAACTAGATATGATTTTAACAAATCATGTATCATATTAAATAATAATGAATTTGA
AATATATGCTCATCCTAATGAATTACTTCATGAACATTCATATAAAACATGGATTATTTTCAAAGAATTATTAGATGAAT
CTGTTTTAACATCCTTTTATTCTTTTTTTAATAAAAAGAATTATTTAGATATGAATAAAGATGAATTTCTAGATATCCTT
AAAGTATTTGTATATTATCATGATATTGGTAAAGTATCATTTTCATTTCAAATAAAAAAATTAACTAAAAAAGATACAGA
AGATAGAACTAGACGATATTCTCAGTTAAAATCAATTTATGGTGATTTAACAAATAATTTATTAAATATGGATTCAAAAC
ATTCATTTTATGGTTATTATCTTTTTATGAATTATGTTTTACATCATTATAATATAGAAAATAATCCCATACTCTTATTA
TTATCTTATTGTATTTTAGGTCATCATACAAAAATAAAAGAGATAAATTTAGAAAACTTGGAGAAAAAAGTACCAACTAT
GGTTTGTCTAAATAACTTCATTTTTAATCAAGAACACTATTTAAAAAATAATGAAATTAAAGAAAATATAAGTAATATAG
ACAATCATATTAATCAACTAAATAAACTTTTAAATGAAAATAAAACTAATAATAGTATGTTTTCCTGTTTTTATCAATAT
ATTTATTCATTGTTGATATCTGCAGATGCACTTGCTACGTCCCAATATGATAAGAATGAAATAGATACTAGTTCTATTAA
TAATAGAATTGATTCAAAATTAAGAAAACGTATGTTAGATAAATATTACTCTTGTGAGATTAATGAAAATATAAATGAAG
GTATCTATAATAAAATAGATAATAAAATCAATCGTTTAAGACATAATATGTTAATTGAAGCATCCACAAATCTTATTAAA
TGTATTGAAAATAATCCATCACAACATACTTTTTATTTAAATATGCCTACAGGTGGTGGTAAAACTAATACTTCTATGAA
GTTAGCATTAGATATTTTAGAGCACACAACTGCCGATAGGATTATTTATGCTATGCCTTATATTAATATTATTGATCAGA
ATTATGAAATTATAAAAGATAATTGGGATCTTGTAAATAATGAGGAAATCCGAAATATATGTTCTACTAATTCATTTATT
TTTGATAATAAAAATGAAGATGATATGGGTGACATTTTAATAAATGATGATTTTTTTAATTATCCTGTGATGTGTACTAC
ATTTGTTAGATTATTTGATGTATTATTAAATACTAAAAAAAAGAGTAAATATGCTCTTTCATCACTTGCTAATTCAATTA
TTATATTAGATGAAGTTCAATCATTACCTATAAAGAATTGGACTAGTTTAACATATATTTTAGATAGCATCACAAAAAAT
TATAATATATATTTTATTCTCATGAGTGCTACATTACCTAAATTTGATAAATTATTGCTAGAAAATAATGATTCAAATAA
TTACAAAATAAATTGTGAATATCTAATAAAAAATCCTTCTATTTATTTTAATCATGATATTTTCTTAAAGAGAAATGAAA
TTAAAGATAAAATAAGAGAATTTTCTTTAACAGATACTGAAAATAAAAAAGAATTAGTGAAATATCTCTCAAAAGTAATA
GAAGAAAATTTTAATCAAGAATATACACATGGTTTAATTGTTTTAAATACTGTTAAATCCTCAAAAATTATATATGAAAT
TATTGAAAATTTAAGAGAATATTTCAAACTCGAAGTTGATATTTTAAATTCAACTACTTTAAAATATAAAAAAAGAGAAT
TAATTGAAAAAATAGATAATCTAAAACCTAAAGAAAGATATATTCTTGTTAGTACTCAAAGTATTGAAGCAGGAATTGAT
GTTAGTTTTGATTTTGTTATTCGTGATTTTGCAACAATTGATTCAATAGAACAAGTACGTGGAAGATGTAATAGGGGAAA
TACAGATAAAAAAGGTAATATATATTTAATTAAATTAAAAATGAATAATAAAACAACATATGAAATTATATATAATGAAG
ATGAATTAAAAACAAGAATAATAACATCTGAAGAATTATTTAAAGATAAAACTAATTTAAATTATGATTTTAATGATTTA
AAAAAATATTATGATAATATATCTTGTAAAATAAATGAAAAAGAGATTAGTAAAGATAATACTGATGAAAAAAGTGATTT
TAAAAATATAGAACGCTGGAATACTATTAAATATTCTGAATTTAAAGAAAAAAGTGGAATTAAAATAATTGATGATAGAA
ATGAAATAGCATTTTACATTGAAGAAAATATTTCTGAAGAAAACCTTGAAAAATACTTTGATAAAAATGAAATAAAATTC
TTGAAAGAAAAAAATCTAATAAAAAATAATGCAATAAATTCCATTGATATTCTAGAATGTTATTTAGATGAAATTAAGGA
AATTGAAAAAAATCAATACATAAAATATAAAATTATAACCAAACAATATGGTTCTATTATGAGTAATTTTATCATTAACA
CATATCGTAATGAAGCATTACTTGAAGAATATAAAAACTCAGAGTCATATCATACATATAAAGATAAATTTTACTTTTAT
ATTATTTTGAATGAATTAATAGGTGATGATGAATCTAAAATGTATTCATTAAACTCAGGACTTAATAAGAGTTTTAAATA
TAGAGAAGATATTTTAACAAATCGTTTCATGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTGAAGATTTATCATCATACTTTTGTAATATTGAATTAAAAAACAATGAAACTATTACATTAACTAAAATATATTTAGAC
AATAAGGTAGGAGAAGAAAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGGTGTTGATTATGAGAATAGAAATATATTTAGAATCAAAAGATAAAAAAAATACATTAATTAAATATAATTATAATTAT
ATGCTTTCTTCGGCAATATA

Product: helicase

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 917; Mature: 917

Protein sequence:

>917_residues
MDSNDMIYSTRYDFNKSCIILNNNEFEIYAHPNELLHEHSYKTWIIFKELLDESVLTSFYSFFNKKNYLDMNKDEFLDIL
KVFVYYHDIGKVSFSFQIKKLTKKDTEDRTRRYSQLKSIYGDLTNNLLNMDSKHSFYGYYLFMNYVLHHYNIENNPILLL
LSYCILGHHTKIKEINLENLEKKVPTMVCLNNFIFNQEHYLKNNEIKENISNIDNHINQLNKLLNENKTNNSMFSCFYQY
IYSLLISADALATSQYDKNEIDTSSINNRIDSKLRKRMLDKYYSCEINENINEGIYNKIDNKINRLRHNMLIEASTNLIK
CIENNPSQHTFYLNMPTGGGKTNTSMKLALDILEHTTADRIIYAMPYINIIDQNYEIIKDNWDLVNNEEIRNICSTNSFI
FDNKNEDDMGDILINDDFFNYPVMCTTFVRLFDVLLNTKKKSKYALSSLANSIIILDEVQSLPIKNWTSLTYILDSITKN
YNIYFILMSATLPKFDKLLLENNDSNNYKINCEYLIKNPSIYFNHDIFLKRNEIKDKIREFSLTDTENKKELVKYLSKVI
EENFNQEYTHGLIVLNTVKSSKIIYEIIENLREYFKLEVDILNSTTLKYKKRELIEKIDNLKPKERYILVSTQSIEAGID
VSFDFVIRDFATIDSIEQVRGRCNRGNTDKKGNIYLIKLKMNNKTTYEIIYNEDELKTRIITSEELFKDKTNLNYDFNDL
KKYYDNISCKINEKEISKDNTDEKSDFKNIERWNTIKYSEFKEKSGIKIIDDRNEIAFYIEENISEENLEKYFDKNEIKF
LKEKNLIKNNAINSIDILECYLDEIKEIEKNQYIKYKIITKQYGSIMSNFIINTYRNEALLEEYKNSESYHTYKDKFYFY
IILNELIGDDESKMYSLNSGLNKSFKYREDILTNRFM

Sequences:

>Translated_917_residues
MDSNDMIYSTRYDFNKSCIILNNNEFEIYAHPNELLHEHSYKTWIIFKELLDESVLTSFYSFFNKKNYLDMNKDEFLDIL
KVFVYYHDIGKVSFSFQIKKLTKKDTEDRTRRYSQLKSIYGDLTNNLLNMDSKHSFYGYYLFMNYVLHHYNIENNPILLL
LSYCILGHHTKIKEINLENLEKKVPTMVCLNNFIFNQEHYLKNNEIKENISNIDNHINQLNKLLNENKTNNSMFSCFYQY
IYSLLISADALATSQYDKNEIDTSSINNRIDSKLRKRMLDKYYSCEINENINEGIYNKIDNKINRLRHNMLIEASTNLIK
CIENNPSQHTFYLNMPTGGGKTNTSMKLALDILEHTTADRIIYAMPYINIIDQNYEIIKDNWDLVNNEEIRNICSTNSFI
FDNKNEDDMGDILINDDFFNYPVMCTTFVRLFDVLLNTKKKSKYALSSLANSIIILDEVQSLPIKNWTSLTYILDSITKN
YNIYFILMSATLPKFDKLLLENNDSNNYKINCEYLIKNPSIYFNHDIFLKRNEIKDKIREFSLTDTENKKELVKYLSKVI
EENFNQEYTHGLIVLNTVKSSKIIYEIIENLREYFKLEVDILNSTTLKYKKRELIEKIDNLKPKERYILVSTQSIEAGID
VSFDFVIRDFATIDSIEQVRGRCNRGNTDKKGNIYLIKLKMNNKTTYEIIYNEDELKTRIITSEELFKDKTNLNYDFNDL
KKYYDNISCKINEKEISKDNTDEKSDFKNIERWNTIKYSEFKEKSGIKIIDDRNEIAFYIEENISEENLEKYFDKNEIKF
LKEKNLIKNNAINSIDILECYLDEIKEIEKNQYIKYKIITKQYGSIMSNFIINTYRNEALLEEYKNSESYHTYKDKFYFY
IILNELIGDDESKMYSLNSGLNKSFKYREDILTNRFM
>Mature_917_residues
MDSNDMIYSTRYDFNKSCIILNNNEFEIYAHPNELLHEHSYKTWIIFKELLDESVLTSFYSFFNKKNYLDMNKDEFLDIL
KVFVYYHDIGKVSFSFQIKKLTKKDTEDRTRRYSQLKSIYGDLTNNLLNMDSKHSFYGYYLFMNYVLHHYNIENNPILLL
LSYCILGHHTKIKEINLENLEKKVPTMVCLNNFIFNQEHYLKNNEIKENISNIDNHINQLNKLLNENKTNNSMFSCFYQY
IYSLLISADALATSQYDKNEIDTSSINNRIDSKLRKRMLDKYYSCEINENINEGIYNKIDNKINRLRHNMLIEASTNLIK
CIENNPSQHTFYLNMPTGGGKTNTSMKLALDILEHTTADRIIYAMPYINIIDQNYEIIKDNWDLVNNEEIRNICSTNSFI
FDNKNEDDMGDILINDDFFNYPVMCTTFVRLFDVLLNTKKKSKYALSSLANSIIILDEVQSLPIKNWTSLTYILDSITKN
YNIYFILMSATLPKFDKLLLENNDSNNYKINCEYLIKNPSIYFNHDIFLKRNEIKDKIREFSLTDTENKKELVKYLSKVI
EENFNQEYTHGLIVLNTVKSSKIIYEIIENLREYFKLEVDILNSTTLKYKKRELIEKIDNLKPKERYILVSTQSIEAGID
VSFDFVIRDFATIDSIEQVRGRCNRGNTDKKGNIYLIKLKMNNKTTYEIIYNEDELKTRIITSEELFKDKTNLNYDFNDL
KKYYDNISCKINEKEISKDNTDEKSDFKNIERWNTIKYSEFKEKSGIKIIDDRNEIAFYIEENISEENLEKYFDKNEIKF
LKEKNLIKNNAINSIDILECYLDEIKEIEKNQYIKYKIITKQYGSIMSNFIINTYRNEALLEEYKNSESYHTYKDKFYFY
IILNELIGDDESKMYSLNSGLNKSFKYREDILTNRFM

Specific function: Unknown

COG id: COG1203

COG function: function code R; Predicted helicases

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 helicase C-terminal domain [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR014001
- InterPro:   IPR011545
- InterPro:   IPR001650
- InterPro:   IPR006474
- InterPro:   IPR014021 [H]

Pfam domain/function: PF00270 DEAD [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 109233; Mature: 109233

Theoretical pI: Translated: 5.84; Mature: 5.84

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
3.4 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
2.1 %Met     (Mature Protein)
3.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDSNDMIYSTRYDFNKSCIILNNNEFEIYAHPNELLHEHSYKTWIIFKELLDESVLTSFY
CCCCCEEEEEECCCCCEEEEEECCEEEEEECCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SFFNKKNYLDMNKDEFLDILKVFVYYHDIGKVSFSFQIKKLTKKDTEDRTRRYSQLKSIY
HHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
GDLTNNLLNMDSKHSFYGYYLFMNYVLHHYNIENNPILLLLSYCILGHHTKIKEINLENL
HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEECCHHHH
EKKVPTMVCLNNFIFNQEHYLKNNEIKENISNIDNHINQLNKLLNENKTNNSMFSCFYQY
HHHCCHHHHHHHHHCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH
IYSLLISADALATSQYDKNEIDTSSINNRIDSKLRKRMLDKYYSCEINENINEGIYNKID
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEECCCCCCHHHHHHHH
NKINRLRHNMLIEASTNLIKCIENNPSQHTFYLNMPTGGGKTNTSMKLALDILEHTTADR
HHHHHHHHHEEEECCCHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCC
IIYAMPYINIIDQNYEIIKDNWDLVNNEEIRNICSTNSFIFDNKNEDDMGDILINDDFFN
EEEEECCEEEECCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCCCCEEECCCCCC
YPVMCTTFVRLFDVLLNTKKKSKYALSSLANSIIILDEVQSLPIKNWTSLTYILDSITKN
CCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEECHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCC
YNIYFILMSATLPKFDKLLLENNDSNNYKINCEYLIKNPSIYFNHDIFLKRNEIKDKIRE
CEEEEEEEECCCCHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEEECCEEEECCEEEEEHHHHHHHHHH
FSLTDTENKKELVKYLSKVIEENFNQEYTHGLIVLNTVKSSKIIYEIIENLREYFKLEVD
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHEEEEE
ILNSTTLKYKKRELIEKIDNLKPKERYILVSTQSIEAGIDVSFDFVIRDFATIDSIEQVR
EECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GRCNRGNTDKKGNIYLIKLKMNNKTTYEIIYNEDELKTRIITSEELFKDKTNLNYDFNDL
HCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCEEEEEEECCCHHHEEEECHHHHHCCCCCCCCCHHHH
KKYYDNISCKINEKEISKDNTDEKSDFKNIERWNTIKYSEFKEKSGIKIIDDRNEIAFYI
HHHHCCCEEEEEHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCEEEECCCCEEEEE
EENISEENLEKYFDKNEIKFLKEKNLIKNNAINSIDILECYLDEIKEIEKNQYIKYKIIT
ECCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEH
KQYGSIMSNFIINTYRNEALLEEYKNSESYHTYKDKFYFYIILNELIGDDESKMYSLNSG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHCEEEEEEEEHHHCCCCHHEEECCCC
LNKSFKYREDILTNRFM
CCCCHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MDSNDMIYSTRYDFNKSCIILNNNEFEIYAHPNELLHEHSYKTWIIFKELLDESVLTSFY
CCCCCEEEEEECCCCCEEEEEECCEEEEEECCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SFFNKKNYLDMNKDEFLDILKVFVYYHDIGKVSFSFQIKKLTKKDTEDRTRRYSQLKSIY
HHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
GDLTNNLLNMDSKHSFYGYYLFMNYVLHHYNIENNPILLLLSYCILGHHTKIKEINLENL
HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEECCHHHH
EKKVPTMVCLNNFIFNQEHYLKNNEIKENISNIDNHINQLNKLLNENKTNNSMFSCFYQY
HHHCCHHHHHHHHHCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH
IYSLLISADALATSQYDKNEIDTSSINNRIDSKLRKRMLDKYYSCEINENINEGIYNKID
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEECCCCCCHHHHHHHH
NKINRLRHNMLIEASTNLIKCIENNPSQHTFYLNMPTGGGKTNTSMKLALDILEHTTADR
HHHHHHHHHEEEECCCHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCC
IIYAMPYINIIDQNYEIIKDNWDLVNNEEIRNICSTNSFIFDNKNEDDMGDILINDDFFN
EEEEECCEEEECCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCCCCEEECCCCCC
YPVMCTTFVRLFDVLLNTKKKSKYALSSLANSIIILDEVQSLPIKNWTSLTYILDSITKN
CCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEECHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCC
YNIYFILMSATLPKFDKLLLENNDSNNYKINCEYLIKNPSIYFNHDIFLKRNEIKDKIRE
CEEEEEEEECCCCHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEEECCEEEECCEEEEEHHHHHHHHHH
FSLTDTENKKELVKYLSKVIEENFNQEYTHGLIVLNTVKSSKIIYEIIENLREYFKLEVD
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHEEEEE
ILNSTTLKYKKRELIEKIDNLKPKERYILVSTQSIEAGIDVSFDFVIRDFATIDSIEQVR
EECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GRCNRGNTDKKGNIYLIKLKMNNKTTYEIIYNEDELKTRIITSEELFKDKTNLNYDFNDL
HCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCEEEEEEECCCHHHEEEECHHHHHCCCCCCCCCHHHH
KKYYDNISCKINEKEISKDNTDEKSDFKNIERWNTIKYSEFKEKSGIKIIDDRNEIAFYI
HHHHCCCEEEEEHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCEEEECCCCEEEEE
EENISEENLEKYFDKNEIKFLKEKNLIKNNAINSIDILECYLDEIKEIEKNQYIKYKIIT
ECCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEH
KQYGSIMSNFIINTYRNEALLEEYKNSESYHTYKDKFYFYIILNELIGDDESKMYSLNSG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHCEEEEEEEEHHHCCCCHHEEECCCC
LNKSFKYREDILTNRFM
CCCCHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8688087 [H]