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The map label for this gene is ydfJ [H]

Identifier: 82752134

GI number: 82752134

Start: 2563452

End: 2565941

Strand: Reverse

Name: ydfJ [H]

Synonym: SAB2426c

Alternate gene names: 82752134

Gene position: 2565941-2563452 (Counterclockwise)

Preceding gene: 82752136

Following gene: 82752133

Centisome position: 93.56

GC content: 34.1

Gene sequence:

>2490_bases
TTGGCGAAATTTTTATACAAGATGGGTACATTTATCGCAAAGCATAAGTGGTCCACATTAATCGCATGGGTAATTATTGT
AGCTGCAATATTTATACCAATTGCTACAAATACACCGAAATTTGATAATGATATTAAAATGACTGGTTTAAAGTCATTAG
ACACGAATGAAAAGATTGAAAAGTATTTTAATCAAGATAGTGAGAAGGCACAAATACGTGTGGTCTTTAAGACGACTAAA
GATGATGGAATTGTACAACCGAGTATCACTAAAGATATTAAGAAAACGTTAGACGATATTAAAAAAGATGACAAACACAT
CGATAAAATATCAGATCCATATGAAAATAAGCAAATTAGTAAAGACAAAACAACGGCATTTGCAGATATCACATATAACG
TGAGTCAAACATCTTTGAAAGATGATTCTAGAGATAATATTAAAAGTCATTTAAAAGATTTGCGTGACAATCATAATGTA
CAGACTGAATTAACAGGAACAGGTATGACCTCTACAGAAGTAGGCGGTAATTCTGAACTAGTTGGTATCATTGTTGCATT
TGTAGTGTTATTGGTTATATTTGGTTCAGTCATTGCTGCAGGATTACCAATTATAAGTGCATTGATTGGTTTAGCATCTG
GAGTTGGCATTATTAGCCTATTGACCTATGTCTTTGATATACCTAATGTTACATTAACTTTAGCGGTAATGATTGGGCTC
GCTGTTGGTATCGATTATGCATTATTTATTTTGTTTAGATATCGACAAGTAATGAAAACTGAAACAGACTATGTTAAAGG
TATCGGACTTGCAGTGGGAACAGCAGGTAGCACAGTCATCTTCGCTGGTGTGACAGTTGTGATTGCCGTATGTGGTTTAT
CGCTAGTTGGCATAGATTTCTTAGCAGTGATGGGGTTTGCTTCGGCAATTAGTGTTATATTTGCTGTATTCAGTGCACTG
ACTTTATTACCTGCGTTAATTAGCATTTTCCATAAACGCATTAAAGTGAACAAATTGCAGTCTAATTTTAAAAAAGATAT
TGATACGCCGTGGTCTAAATTTATTACTGGTAATGCACTTGCAGCAGTATTATTAGGTTTAATTATATTAGTTGCAGCGG
CTATTCCAGTTAGTCATATGCGTCTAGGCATTCCGGATGATGGCGTAAAGCCAGCAGATTCTACTCAGAAAAAGGCTTAC
GATATTATTTCAGATAAGTTCGGTGAAGGATTTAATGGCCAAATACCGATGCTGATTAACGTTAAAGATAAAAAAGATGA
TCCACAAGGATTACAACAAGATTTACAATCTGTGTATAAAGGTATTAAAGATAAGAAAAATGTAGATATTGTTACTCCGC
CACAAATGAGTAAAGATAATGATTACGCTTTGATGGTCGTGATACCTAAGCAAGGGCCTAATGCAGAGAGTACAAACGAT
TTAGTGCATGATTTACGAGATTATCATAAAGATGCACAAGATAAATATGGGTTCAAAACGGAGATTTCAGGACAAAGTGT
CATTAATATTGATATGTCTAAAAAGTTAAATGAGGCGATACCTTTATTTGCAACAGTAATTGTTGTATTGGCATTTTTCT
TATTAATGATTGTCTTTCGTTCAATTCTAATACCGTTAAAAGCAGTTTTAGGATTTGTCTTGTCATTAATGGCAACACTA
GGTTTTACAACCTTTGCAATGCAAGATGGCTTTATGAAAGGATTATTCGGCATAGAAACGACAGGACCAATGCTAGCCTT
CTTGCCGGTTATTACAATTGGTATTCTATTCGGCTTAGCAATGGATTACGAAGTCTTCCTTATGTCGCGAATTCATGAAG
AATATAGTAAAACAGGGGATAATGATTATTCTATCAAAGTAGGATTGAAAGAAAGTGGTCCTGTTATTGTAGCAGCTGCA
TTAATCATGTTTAGTGTCTTCTTTGCGTTTGTATTCCAAGAAGATGTCATGATTAAATCAATGGGTATGGCATTAGCGTT
TGGTGTACTCTTTGATGCCTTCGTAGTCAGAATGATGTTAATTCCTGCATTAACTAAATTGTTTGGAAAAGGTTCGTGGT
ATTTACCAGCATGGTTGAATCGCATTATTCCACGAGTTGATATTGAAGGACATGCACTTGAAAAATATAAAACGGTTGAA
TCACAGGAATCTGAAGCTAAAGATAGTAAGGAAACATACGACACAACCTTTAAAGTATATCCACAAGGTGCAACAAATGT
ATCGAAACATCAAGATGTACATGGGCAAGATGATGCACGTTCAATAGTACTAGATGATAAAACGATGGCATTATACCAAG
AAGTGAAACAGCAATCAGCAAGTTCATTGTTTTTATATGATGCTTTAATGGATTATCAAAACAAGCATCAACTAAATTCA
AAACCACAAATGACAAATATAGAACAGTTGAATAAAAATATTGAAAAGCTCAATCAATTGTTAGAAAAAAACTTAAGAAA
TAAATCATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATTAGTTCTTTAAGATGCATGGTATAGATACTATAATCGAACAATAATCTACACTGTATAGTTAAACTATAACGTTGAT
TTTAAAGGGAGGCAATATAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATAACATGTACATGCCTCCGCTTTAAATGTCTATCAATGACATTTGAAGTGGAGGTTTTTTTGCATGGAAGCGATTATA
CAAAACATTTTTGCAATGTC

Product: membrane transporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 829; Mature: 828

Protein sequence:

>829_residues
MAKFLYKMGTFIAKHKWSTLIAWVIIVAAIFIPIATNTPKFDNDIKMTGLKSLDTNEKIEKYFNQDSEKAQIRVVFKTTK
DDGIVQPSITKDIKKTLDDIKKDDKHIDKISDPYENKQISKDKTTAFADITYNVSQTSLKDDSRDNIKSHLKDLRDNHNV
QTELTGTGMTSTEVGGNSELVGIIVAFVVLLVIFGSVIAAGLPIISALIGLASGVGIISLLTYVFDIPNVTLTLAVMIGL
AVGIDYALFILFRYRQVMKTETDYVKGIGLAVGTAGSTVIFAGVTVVIAVCGLSLVGIDFLAVMGFASAISVIFAVFSAL
TLLPALISIFHKRIKVNKLQSNFKKDIDTPWSKFITGNALAAVLLGLIILVAAAIPVSHMRLGIPDDGVKPADSTQKKAY
DIISDKFGEGFNGQIPMLINVKDKKDDPQGLQQDLQSVYKGIKDKKNVDIVTPPQMSKDNDYALMVVIPKQGPNAESTND
LVHDLRDYHKDAQDKYGFKTEISGQSVINIDMSKKLNEAIPLFATVIVVLAFFLLMIVFRSILIPLKAVLGFVLSLMATL
GFTTFAMQDGFMKGLFGIETTGPMLAFLPVITIGILFGLAMDYEVFLMSRIHEEYSKTGDNDYSIKVGLKESGPVIVAAA
LIMFSVFFAFVFQEDVMIKSMGMALAFGVLFDAFVVRMMLIPALTKLFGKGSWYLPAWLNRIIPRVDIEGHALEKYKTVE
SQESEAKDSKETYDTTFKVYPQGATNVSKHQDVHGQDDARSIVLDDKTMALYQEVKQQSASSLFLYDALMDYQNKHQLNS
KPQMTNIEQLNKNIEKLNQLLEKNLRNKS

Sequences:

>Translated_829_residues
MAKFLYKMGTFIAKHKWSTLIAWVIIVAAIFIPIATNTPKFDNDIKMTGLKSLDTNEKIEKYFNQDSEKAQIRVVFKTTK
DDGIVQPSITKDIKKTLDDIKKDDKHIDKISDPYENKQISKDKTTAFADITYNVSQTSLKDDSRDNIKSHLKDLRDNHNV
QTELTGTGMTSTEVGGNSELVGIIVAFVVLLVIFGSVIAAGLPIISALIGLASGVGIISLLTYVFDIPNVTLTLAVMIGL
AVGIDYALFILFRYRQVMKTETDYVKGIGLAVGTAGSTVIFAGVTVVIAVCGLSLVGIDFLAVMGFASAISVIFAVFSAL
TLLPALISIFHKRIKVNKLQSNFKKDIDTPWSKFITGNALAAVLLGLIILVAAAIPVSHMRLGIPDDGVKPADSTQKKAY
DIISDKFGEGFNGQIPMLINVKDKKDDPQGLQQDLQSVYKGIKDKKNVDIVTPPQMSKDNDYALMVVIPKQGPNAESTND
LVHDLRDYHKDAQDKYGFKTEISGQSVINIDMSKKLNEAIPLFATVIVVLAFFLLMIVFRSILIPLKAVLGFVLSLMATL
GFTTFAMQDGFMKGLFGIETTGPMLAFLPVITIGILFGLAMDYEVFLMSRIHEEYSKTGDNDYSIKVGLKESGPVIVAAA
LIMFSVFFAFVFQEDVMIKSMGMALAFGVLFDAFVVRMMLIPALTKLFGKGSWYLPAWLNRIIPRVDIEGHALEKYKTVE
SQESEAKDSKETYDTTFKVYPQGATNVSKHQDVHGQDDARSIVLDDKTMALYQEVKQQSASSLFLYDALMDYQNKHQLNS
KPQMTNIEQLNKNIEKLNQLLEKNLRNKS
>Mature_828_residues
AKFLYKMGTFIAKHKWSTLIAWVIIVAAIFIPIATNTPKFDNDIKMTGLKSLDTNEKIEKYFNQDSEKAQIRVVFKTTKD
DGIVQPSITKDIKKTLDDIKKDDKHIDKISDPYENKQISKDKTTAFADITYNVSQTSLKDDSRDNIKSHLKDLRDNHNVQ
TELTGTGMTSTEVGGNSELVGIIVAFVVLLVIFGSVIAAGLPIISALIGLASGVGIISLLTYVFDIPNVTLTLAVMIGLA
VGIDYALFILFRYRQVMKTETDYVKGIGLAVGTAGSTVIFAGVTVVIAVCGLSLVGIDFLAVMGFASAISVIFAVFSALT
LLPALISIFHKRIKVNKLQSNFKKDIDTPWSKFITGNALAAVLLGLIILVAAAIPVSHMRLGIPDDGVKPADSTQKKAYD
IISDKFGEGFNGQIPMLINVKDKKDDPQGLQQDLQSVYKGIKDKKNVDIVTPPQMSKDNDYALMVVIPKQGPNAESTNDL
VHDLRDYHKDAQDKYGFKTEISGQSVINIDMSKKLNEAIPLFATVIVVLAFFLLMIVFRSILIPLKAVLGFVLSLMATLG
FTTFAMQDGFMKGLFGIETTGPMLAFLPVITIGILFGLAMDYEVFLMSRIHEEYSKTGDNDYSIKVGLKESGPVIVAAAL
IMFSVFFAFVFQEDVMIKSMGMALAFGVLFDAFVVRMMLIPALTKLFGKGSWYLPAWLNRIIPRVDIEGHALEKYKTVES
QESEAKDSKETYDTTFKVYPQGATNVSKHQDVHGQDDARSIVLDDKTMALYQEVKQQSASSLFLYDALMDYQNKHQLNSK
PQMTNIEQLNKNIEKLNQLLEKNLRNKS

Specific function: Unknown

COG id: COG2409

COG function: function code R; Predicted drug exporters of the RND superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the mmpL family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004869
- InterPro:   IPR000731 [H]

Pfam domain/function: PF03176 MMPL [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 91603; Mature: 91472

Theoretical pI: Translated: 7.48; Mature: 7.48

Prosite motif: PS50156 SSD

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
3.4 %Met     (Translated Protein)
3.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
3.3 %Met     (Mature Protein)
3.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MAKFLYKMGTFIAKHKWSTLIAWVIIVAAIFIPIATNTPKFDNDIKMTGLKSLDTNEKIE
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCHHHHH
KYFNQDSEKAQIRVVFKTTKDDGIVQPSITKDIKKTLDDIKKDDKHIDKISDPYENKQIS
HHHCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
KDKTTAFADITYNVSQTSLKDDSRDNIKSHLKDLRDNHNVQTELTGTGMTSTEVGGNSEL
CCCCCEEEEEEECCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCHH
VGIIVAFVVLLVIFGSVIAAGLPIISALIGLASGVGIISLLTYVFDIPNVTLTLAVMIGL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
AVGIDYALFILFRYRQVMKTETDYVKGIGLAVGTAGSTVIFAGVTVVIAVCGLSLVGIDF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAVMGFASAISVIFAVFSALTLLPALISIFHKRIKVNKLQSNFKKDIDTPWSKFITGNAL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCHHHH
AAVLLGLIILVAAAIPVSHMRLGIPDDGVKPADSTQKKAYDIISDKFGEGFNGQIPMLIN
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEE
VKDKKDDPQGLQQDLQSVYKGIKDKKNVDIVTPPQMSKDNDYALMVVIPKQGPNAESTND
ECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCHHH
LVHDLRDYHKDAQDKYGFKTEISGQSVINIDMSKKLNEAIPLFATVIVVLAFFLLMIVFR
HHHHHHHHHHCHHHCCCCEEECCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SILIPLKAVLGFVLSLMATLGFTTFAMQDGFMKGLFGIETTGPMLAFLPVITIGILFGLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MDYEVFLMSRIHEEYSKTGDNDYSIKVGLKESGPVIVAAALIMFSVFFAFVFQEDVMIKS
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MGMALAFGVLFDAFVVRMMLIPALTKLFGKGSWYLPAWLNRIIPRVDIEGHALEKYKTVE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHH
SQESEAKDSKETYDTTFKVYPQGATNVSKHQDVHGQDDARSIVLDDKTMALYQEVKQQSA
HHHHHHHCCHHHHCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHH
SSLFLYDALMDYQNKHQLNSKPQMTNIEQLNKNIEKLNQLLEKNLRNKS
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure 
AKFLYKMGTFIAKHKWSTLIAWVIIVAAIFIPIATNTPKFDNDIKMTGLKSLDTNEKIE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCHHHHH
KYFNQDSEKAQIRVVFKTTKDDGIVQPSITKDIKKTLDDIKKDDKHIDKISDPYENKQIS
HHHCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
KDKTTAFADITYNVSQTSLKDDSRDNIKSHLKDLRDNHNVQTELTGTGMTSTEVGGNSEL
CCCCCEEEEEEECCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCHH
VGIIVAFVVLLVIFGSVIAAGLPIISALIGLASGVGIISLLTYVFDIPNVTLTLAVMIGL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
AVGIDYALFILFRYRQVMKTETDYVKGIGLAVGTAGSTVIFAGVTVVIAVCGLSLVGIDF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAVMGFASAISVIFAVFSALTLLPALISIFHKRIKVNKLQSNFKKDIDTPWSKFITGNAL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCHHHH
AAVLLGLIILVAAAIPVSHMRLGIPDDGVKPADSTQKKAYDIISDKFGEGFNGQIPMLIN
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEE
VKDKKDDPQGLQQDLQSVYKGIKDKKNVDIVTPPQMSKDNDYALMVVIPKQGPNAESTND
ECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCHHH
LVHDLRDYHKDAQDKYGFKTEISGQSVINIDMSKKLNEAIPLFATVIVVLAFFLLMIVFR
HHHHHHHHHHCHHHCCCCEEECCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SILIPLKAVLGFVLSLMATLGFTTFAMQDGFMKGLFGIETTGPMLAFLPVITIGILFGLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MDYEVFLMSRIHEEYSKTGDNDYSIKVGLKESGPVIVAAALIMFSVFFAFVFQEDVMIKS
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MGMALAFGVLFDAFVVRMMLIPALTKLFGKGSWYLPAWLNRIIPRVDIEGHALEKYKTVE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHH
SQESEAKDSKETYDTTFKVYPQGATNVSKHQDVHGQDDARSIVLDDKTMALYQEVKQQSA
HHHHHHHCCHHHHCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHH
SSLFLYDALMDYQNKHQLNSKPQMTNIEQLNKNIEKLNQLLEKNLRNKS
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]