| Definition | Staphylococcus aureus RF122, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007622 |
| Length | 2,742,531 |
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The map label for this gene is yhaN [H]
Identifier: 82751497
GI number: 82751497
Start: 1900314
End: 1903250
Strand: Reverse
Name: yhaN [H]
Synonym: SAB1776c
Alternate gene names: 82751497
Gene position: 1903250-1900314 (Counterclockwise)
Preceding gene: 82751498
Following gene: 82751496
Centisome position: 69.4
GC content: 30.71
Gene sequence:
>2937_bases ATGATAATTAAATCACTTGAAATTTATGGTTACGGTCAATTTGTTCAACGTAAAATTGAATTTAATAAAAACTTCACTGA AATTTTTGGTGAAAATGAAGCGGGTAAATCGACGATTCAAGCATTCATCCATTCTATATTATTTGGTTTTCCAACTAAAA AGTCTAAAGAGCCAAGACTAGAACCACGTCTAGGTAACCAATACGGTGGTAAATTAGTACTTATTCTTGATGATGGCTTA GAGATTGAAGTTGAACGAATTAAAGGCAGTGCTCAAGGTGATGTGAAAGTATATTTACCTAATGGTGCTGTGCGTGATGA TGCTTGGTTACAAAAGAAACTTAATTATATTTCTAAAAAGACATATCAAGGTATTTTTTCATTTGATGTACTAGGGCTTC AAGACATTCATAGAAACCTAAATGAAAAACAATTGCAAGATTATTTATTACAAGCAGGGGCTTTAGGATCAACTGAATTC ACGTCAATGCGCGAAGTGATTAATCGTAAAAAAGATGAATTATATAAAAAATCAGGTAAAAATCCAATCATTAATCAACA AATTGAGCAATTAAAACAACTAGAAAGTCAAATTCGTGAAGAAGAAGCTAAACTAGAAACATATCATCGCTTAGTAGATG ATCGAGATAAATCATCACGTCGATTAGAGAATTTAAAGCATAATTTAAATCAATTATCAAAAATGCATGAAGAAAAACAA AAAGAGGTTGCTTTACATGATCATTCACAAGAATGGAAGTCTCTAGAACAACAGTTAAATATTGAGCCAATCACATTCCC AGAAAAAGGTGTGGATCGTTACGAAAAAGCACGAGCGCATAAGCAATCGTTAGAAAGAGATATTGGTTTAAGAAATGAGC GTTTAGCTCAACTTAAAGAAGAAGCGACTCAATTAGAGCCAGTTAAACAATCTGATATTGACGCCTTCATTAGTTTGAAT CAACAAGAAAATGAAATTAAAAATAAAGAATTTGAACTTACTGCAATCGAAAAGGATATTGCGAATAAACAACGTGATAA AGATGAATTGCAAGCAAATATTGGTTGGTCTGAAACGCATCATGACGTAGATAGTTCTGAGGCAATGAAAAGTTATGTCA GTGAGCAAATCAAGAATAAACAAGAACAAGCGGCATACATTAAGCAATTAGAACGTAGTTTAGAAGAAAATAAAATCGAA GATAATGCGGTTCATAGCGAACTAGATTCTGTTGAAGAAAAAATAGTTCCTGAAGAGACTTTTGAAAAGAAAAAAGAATA CTCACAACAAGTCATTGAATTAAACGAAAAAGAGAACTTGTATAGCAAATTGAAAGAACGTTTCGAAATTGAGCAACAAG AAAAACAAAAACGTCAAAAATTGTTACGAACAACGTTTATTCTTTTAACATTAGTAGGTATTGGTTTAACTGCCTTCTCA TTTATTTCAAATAACATGTTGTTTGGTATTATTTTCGCAGTATTAACTTTAGTATTTGTTATCGGTATCATCATGTCTAA ATCAAAAGAAGTAGATTATAGCGAGGCCATCACAGATGAAATCGAAGAAATTAAAGCACAACTAGCCATTTTAGATGAAA ACTATGACTTAGATTTTGATCTTAATGAGCAATATCGCATTCGAGATCACTGGCAACAAGCTTTGAAAAATAAAGATATT TTAGAAGAGAAACGTCAGTATATTGAAGGTCGTTTAAATGATGCGAAAGGGCGTCATGATGAATTGCAATCGACAGTTGA AAACGTTAAGGATGAATTATACTTATCATCTAAAATTTCAAATGATTTAATTGTTGATAGTATTTCTACAATGGCGAATA TTAAAGCATTAGATCAACACATCAGTGATTTAAATCAACAACGCCAGCAATTGGTTCAAGAATTAGATACATTCTACAAT CATGCTGAAGCTGTTACAAAATCACAATTTGTTTATTTCAACAAATTATCTTTATTCCACGATGTGCAACAATGGTTGAA ATCAGCTGAAGACACGAATGAAAAATGGCGTATTAATGCTGAAAATACCAAACTTGTTACAAATGAATTAAATCATTTAA ATGCTCAATTAGAAGAAAATAATAAAGAAATTACAGCACTATTCGATTTTATCAATGTTGGTACTGAAGAAGATTTTTAC CAACATCATGAAGATTACCAAACTTATACTAGTAATTTGAGTCGTTTTAATGATTTAACTAAATATCTTGAGAACCAAAA CTATTCTTATGAATTAAGTTCTAGTTTAAGTGAAAAAACAACAGCACAACTTGAAGAAGAAGATCATTTATTGGCTACTC AAGTTGACGAATATAATGAGCAATATCTTGAAATGCAAGCACAAATCAGTGATTTAAGTGCACAAATCAATCACATGGAA ACTGATACAACGCTTGCTAATTTAAGACATGAATATCACAGTCTTAAAAATCAACTTAATGATATCGCAAAAGATTGGGC AAGTTTAAGTTATTTACAAAGTTTAGTTGATGAACACATTAAACAAATTAAAGATAAACGTTTGCCTCAAGTTATTAATG AAGCGGTAGAAATATTGAAGCATTTAACAGATGGCAGATATACGATGATTAACTATAATGAAGATTCAATTACGGTTAAA CATGTTAATGGTCAATTATATGATCCTGTTGAACTAAGTCAATCTACAAAAGAATTACTTTATGTAGCTTTACGTATCAG TTTAATTAAGGTACTACGACCATATTATCCGTTCCCATTAATTGTTGATGATGCATTTGTTCATTTTGATAAAAAACGTA CTGAAAAAATGTTGAATTATTTACGATCATTATCAGAACACTATCAAGTACTATACTTTACATGTGTAAAAGATAATATT GTTCCATCAAAAGAAGTGATTACATTAAACAAAATAGAGGAAGGCGGGAAACGATGA
Upstream 100 bases:
>100_bases AGGGCATCTAAGTTCCTAGACGATTATGGAACATTCGACCATACAGCATTAGTTAATCGTGCTGAAGAAATATTAAAAGC TGAAATGAGAGGTGAACAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases GAAATATAGAGAATCTAAATCCCGGAGATTCAGTTGACCACTTTTTCTTAGTGCATAAAGCTACACAGGGTGTAACAGCA CAAGGTAAAGATTATATGAC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 978; Mature: 978
Protein sequence:
>978_residues MIIKSLEIYGYGQFVQRKIEFNKNFTEIFGENEAGKSTIQAFIHSILFGFPTKKSKEPRLEPRLGNQYGGKLVLILDDGL EIEVERIKGSAQGDVKVYLPNGAVRDDAWLQKKLNYISKKTYQGIFSFDVLGLQDIHRNLNEKQLQDYLLQAGALGSTEF TSMREVINRKKDELYKKSGKNPIINQQIEQLKQLESQIREEEAKLETYHRLVDDRDKSSRRLENLKHNLNQLSKMHEEKQ KEVALHDHSQEWKSLEQQLNIEPITFPEKGVDRYEKARAHKQSLERDIGLRNERLAQLKEEATQLEPVKQSDIDAFISLN QQENEIKNKEFELTAIEKDIANKQRDKDELQANIGWSETHHDVDSSEAMKSYVSEQIKNKQEQAAYIKQLERSLEENKIE DNAVHSELDSVEEKIVPEETFEKKKEYSQQVIELNEKENLYSKLKERFEIEQQEKQKRQKLLRTTFILLTLVGIGLTAFS FISNNMLFGIIFAVLTLVFVIGIIMSKSKEVDYSEAITDEIEEIKAQLAILDENYDLDFDLNEQYRIRDHWQQALKNKDI LEEKRQYIEGRLNDAKGRHDELQSTVENVKDELYLSSKISNDLIVDSISTMANIKALDQHISDLNQQRQQLVQELDTFYN HAEAVTKSQFVYFNKLSLFHDVQQWLKSAEDTNEKWRINAENTKLVTNELNHLNAQLEENNKEITALFDFINVGTEEDFY QHHEDYQTYTSNLSRFNDLTKYLENQNYSYELSSSLSEKTTAQLEEEDHLLATQVDEYNEQYLEMQAQISDLSAQINHME TDTTLANLRHEYHSLKNQLNDIAKDWASLSYLQSLVDEHIKQIKDKRLPQVINEAVEILKHLTDGRYTMINYNEDSITVK HVNGQLYDPVELSQSTKELLYVALRISLIKVLRPYYPFPLIVDDAFVHFDKKRTEKMLNYLRSLSEHYQVLYFTCVKDNI VPSKEVITLNKIEEGGKR
Sequences:
>Translated_978_residues MIIKSLEIYGYGQFVQRKIEFNKNFTEIFGENEAGKSTIQAFIHSILFGFPTKKSKEPRLEPRLGNQYGGKLVLILDDGL EIEVERIKGSAQGDVKVYLPNGAVRDDAWLQKKLNYISKKTYQGIFSFDVLGLQDIHRNLNEKQLQDYLLQAGALGSTEF TSMREVINRKKDELYKKSGKNPIINQQIEQLKQLESQIREEEAKLETYHRLVDDRDKSSRRLENLKHNLNQLSKMHEEKQ KEVALHDHSQEWKSLEQQLNIEPITFPEKGVDRYEKARAHKQSLERDIGLRNERLAQLKEEATQLEPVKQSDIDAFISLN QQENEIKNKEFELTAIEKDIANKQRDKDELQANIGWSETHHDVDSSEAMKSYVSEQIKNKQEQAAYIKQLERSLEENKIE DNAVHSELDSVEEKIVPEETFEKKKEYSQQVIELNEKENLYSKLKERFEIEQQEKQKRQKLLRTTFILLTLVGIGLTAFS FISNNMLFGIIFAVLTLVFVIGIIMSKSKEVDYSEAITDEIEEIKAQLAILDENYDLDFDLNEQYRIRDHWQQALKNKDI LEEKRQYIEGRLNDAKGRHDELQSTVENVKDELYLSSKISNDLIVDSISTMANIKALDQHISDLNQQRQQLVQELDTFYN HAEAVTKSQFVYFNKLSLFHDVQQWLKSAEDTNEKWRINAENTKLVTNELNHLNAQLEENNKEITALFDFINVGTEEDFY QHHEDYQTYTSNLSRFNDLTKYLENQNYSYELSSSLSEKTTAQLEEEDHLLATQVDEYNEQYLEMQAQISDLSAQINHME TDTTLANLRHEYHSLKNQLNDIAKDWASLSYLQSLVDEHIKQIKDKRLPQVINEAVEILKHLTDGRYTMINYNEDSITVK HVNGQLYDPVELSQSTKELLYVALRISLIKVLRPYYPFPLIVDDAFVHFDKKRTEKMLNYLRSLSEHYQVLYFTCVKDNI VPSKEVITLNKIEEGGKR >Mature_978_residues MIIKSLEIYGYGQFVQRKIEFNKNFTEIFGENEAGKSTIQAFIHSILFGFPTKKSKEPRLEPRLGNQYGGKLVLILDDGL EIEVERIKGSAQGDVKVYLPNGAVRDDAWLQKKLNYISKKTYQGIFSFDVLGLQDIHRNLNEKQLQDYLLQAGALGSTEF TSMREVINRKKDELYKKSGKNPIINQQIEQLKQLESQIREEEAKLETYHRLVDDRDKSSRRLENLKHNLNQLSKMHEEKQ KEVALHDHSQEWKSLEQQLNIEPITFPEKGVDRYEKARAHKQSLERDIGLRNERLAQLKEEATQLEPVKQSDIDAFISLN QQENEIKNKEFELTAIEKDIANKQRDKDELQANIGWSETHHDVDSSEAMKSYVSEQIKNKQEQAAYIKQLERSLEENKIE DNAVHSELDSVEEKIVPEETFEKKKEYSQQVIELNEKENLYSKLKERFEIEQQEKQKRQKLLRTTFILLTLVGIGLTAFS FISNNMLFGIIFAVLTLVFVIGIIMSKSKEVDYSEAITDEIEEIKAQLAILDENYDLDFDLNEQYRIRDHWQQALKNKDI LEEKRQYIEGRLNDAKGRHDELQSTVENVKDELYLSSKISNDLIVDSISTMANIKALDQHISDLNQQRQQLVQELDTFYN HAEAVTKSQFVYFNKLSLFHDVQQWLKSAEDTNEKWRINAENTKLVTNELNHLNAQLEENNKEITALFDFINVGTEEDFY QHHEDYQTYTSNLSRFNDLTKYLENQNYSYELSSSLSEKTTAQLEEEDHLLATQVDEYNEQYLEMQAQISDLSAQINHME TDTTLANLRHEYHSLKNQLNDIAKDWASLSYLQSLVDEHIKQIKDKRLPQVINEAVEILKHLTDGRYTMINYNEDSITVK HVNGQLYDPVELSQSTKELLYVALRISLIKVLRPYYPFPLIVDDAFVHFDKKRTEKMLNYLRSLSEHYQVLYFTCVKDNI VPSKEVITLNKIEEGGKR
Specific function: Unknown
COG id: COG4717
COG function: function code S; Uncharacterized conserved protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Single-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 114419; Mature: 114419
Theoretical pI: Translated: 5.00; Mature: 5.00
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 1.1 %Met (Translated Protein) 1.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 1.1 %Met (Mature Protein) 1.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIIKSLEIYGYGQFVQRKIEFNKNFTEIFGENEAGKSTIQAFIHSILFGFPTKKSKEPRL CCEECEECCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC EPRLGNQYGGKLVLILDDGLEIEVERIKGSAQGDVKVYLPNGAVRDDAWLQKKLNYISKK CCCCCCCCCCEEEEEECCCCEEEHHHHCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH TYQGIFSFDVLGLQDIHRNLNEKQLQDYLLQAGALGSTEFTSMREVINRKKDELYKKSGK HHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC NPIINQQIEQLKQLESQIREEEAKLETYHRLVDDRDKSSRRLENLKHNLNQLSKMHEEKQ CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KEVALHDHSQEWKSLEQQLNIEPITFPEKGVDRYEKARAHKQSLERDIGLRNERLAQLKE HHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH EATQLEPVKQSDIDAFISLNQQENEIKNKEFELTAIEKDIANKQRDKDELQANIGWSETH HHHHCCCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCHHC HDVDSSEAMKSYVSEQIKNKQEQAAYIKQLERSLEENKIEDNAVHSELDSVEEKIVPEET CCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH FEKKKEYSQQVIELNEKENLYSKLKERFEIEQQEKQKRQKLLRTTFILLTLVGIGLTAFS HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FISNNMLFGIIFAVLTLVFVIGIIMSKSKEVDYSEAITDEIEEIKAQLAILDENYDLDFD HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCC LNEQYRIRDHWQQALKNKDILEEKRQYIEGRLNDAKGRHDELQSTVENVKDELYLSSKIS CCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC NDLIVDSISTMANIKALDQHISDLNQQRQQLVQELDTFYNHAEAVTKSQFVYFNKLSLFH CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DVQQWLKSAEDTNEKWRINAENTKLVTNELNHLNAQLEENNKEITALFDFINVGTEEDFY HHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHH QHHEDYQTYTSNLSRFNDLTKYLENQNYSYELSSSLSEKTTAQLEEEDHLLATQVDEYNE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH QYLEMQAQISDLSAQINHMETDTTLANLRHEYHSLKNQLNDIAKDWASLSYLQSLVDEHI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KQIKDKRLPQVINEAVEILKHLTDGRYTMINYNEDSITVKHVNGQLYDPVELSQSTKELL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHH YVALRISLIKVLRPYYPFPLIVDDAFVHFDKKRTEKMLNYLRSLSEHYQVLYFTCVKDNI HHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCC VPSKEVITLNKIEEGGKR CCCCCEEEHHHHHCCCCC >Mature Secondary Structure MIIKSLEIYGYGQFVQRKIEFNKNFTEIFGENEAGKSTIQAFIHSILFGFPTKKSKEPRL CCEECEECCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC EPRLGNQYGGKLVLILDDGLEIEVERIKGSAQGDVKVYLPNGAVRDDAWLQKKLNYISKK CCCCCCCCCCEEEEEECCCCEEEHHHHCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH TYQGIFSFDVLGLQDIHRNLNEKQLQDYLLQAGALGSTEFTSMREVINRKKDELYKKSGK HHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC NPIINQQIEQLKQLESQIREEEAKLETYHRLVDDRDKSSRRLENLKHNLNQLSKMHEEKQ CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KEVALHDHSQEWKSLEQQLNIEPITFPEKGVDRYEKARAHKQSLERDIGLRNERLAQLKE HHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH EATQLEPVKQSDIDAFISLNQQENEIKNKEFELTAIEKDIANKQRDKDELQANIGWSETH HHHHCCCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCHHC HDVDSSEAMKSYVSEQIKNKQEQAAYIKQLERSLEENKIEDNAVHSELDSVEEKIVPEET CCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH FEKKKEYSQQVIELNEKENLYSKLKERFEIEQQEKQKRQKLLRTTFILLTLVGIGLTAFS HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FISNNMLFGIIFAVLTLVFVIGIIMSKSKEVDYSEAITDEIEEIKAQLAILDENYDLDFD HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCC LNEQYRIRDHWQQALKNKDILEEKRQYIEGRLNDAKGRHDELQSTVENVKDELYLSSKIS CCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC NDLIVDSISTMANIKALDQHISDLNQQRQQLVQELDTFYNHAEAVTKSQFVYFNKLSLFH CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DVQQWLKSAEDTNEKWRINAENTKLVTNELNHLNAQLEENNKEITALFDFINVGTEEDFY HHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHH QHHEDYQTYTSNLSRFNDLTKYLENQNYSYELSSSLSEKTTAQLEEEDHLLATQVDEYNE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH QYLEMQAQISDLSAQINHMETDTTLANLRHEYHSLKNQLNDIAKDWASLSYLQSLVDEHI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KQIKDKRLPQVINEAVEILKHLTDGRYTMINYNEDSITVKHVNGQLYDPVELSQSTKELL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHH YVALRISLIKVLRPYYPFPLIVDDAFVHFDKKRTEKMLNYLRSLSEHYQVLYFTCVKDNI HHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCC VPSKEVITLNKIEEGGKR CCCCCEEEHHHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9579061; 9384377 [H]