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The map label for this gene is yjbQ [H]

Identifier: 82750622

GI number: 82750622

Start: 948704

End: 950548

Strand: Direct

Name: yjbQ [H]

Synonym: SAB0876

Alternate gene names: 82750622

Gene position: 948704-950548 (Clockwise)

Preceding gene: 82750621

Following gene: 82750623

Centisome position: 34.59

GC content: 31.65

Gene sequence:

>1845_bases
ATGGAGTTTTTATCTTTAGTTATTGTTGTTTTAGCAGCGTTTTTAACTCCAATAATTGTCAATCGATTAAATATTAATTT
CTTGCCAGTTGTTGTTGCAGAAATTTTGATGGGGATTGTGATTGGAAATTCATTTCTAAATATAGTAGAAAGGGATTCAA
TTCTAAATATTTTATCAACGTTAGGCTTTATCTTTTTAATGTTTTTAAGTGGTTTAGAAATTGATTTTAAAGCTTTTAAA
AAAGATAAACGCGCACGTCAAGGACAAAATGATGATGAATCCTCAATTCCAGGGCATCTTAATCTAGCGTTAACTGTATT
TGCATTTATTATGATTATTTCGATTCTTTTAGCGTATGTATTTAAATGGCTTGGATTAGTGGATGATGTGTTATTAATGG
TCATTATCATTTCAACTATTTCCTTAGGTGTAGTTGTTCCAACTTTAAAAGAAATGAATATTATGAGAACAACTATAGGT
CAATTTATCCTATTAGTAGCAGTACTTGCGGACTTAGTAACTATGATTTTATTAACGGTCTATGGTGCAATCAATGGTCA
AGGCGACAGTACAATATGGTTAATAGGTATATTAGTTGTTTTCACAGCAATTTCATATATTTTAGGTGTTCAATTTAAAA
GAATGTCATTTTTACAAAAATTGATGGATGGTACGACGCAAATCGGTATTCGTGCGGTGTTTGCATTAATAATATTATTA
GTAGCCCTAGCAGAGGGAGTTGGCGCAGAAAATATATTAGGTGCATTCTTAGCAGGTGTCGTTGTTTCATTATTAAATCC
AGATGAAGAAATGGTTGAAAAGTTAGACTCATTTGGTTATGGGTTCTTTATTCCTATTTTCTTTATAATGGTTGGTGTAG
ATTTAAACATACCATCATTAATTAAAGAACCGAAATTACTAATTATCATACCGATTTTAATCGTTGCATTTATCATTTCA
AAATTAATTCCAGTCATGTTTATTCGACGTTGGTTTGATATGAAAACAACGATTGCATCAGCATTTTTATTAACATCAAC
ATTATCGCTCGTGATAGCTGCAGCCAAAATTTCAGAAAGATTAAATGCTATTTCAGCTGAAACGTCAGGTATATTAATTT
TAAGCGCAGTCATTACATGTGTATTCGTTCCGATTATTTTCAAAAAACTGTTTCCAGTTCCAGATGAGTTTAACCGTAAA
ATTGAAGTTAGTTTAATTGGCAAAAATCAATTAACGATTCCTATAGCGCAAAATTTAACATCTCAGTTATATGACGTGAC
ATTATATTATCGCAAAGACTTGAGTGATCGTCGTCAATTGTCGGATGATATCACTATGATAGAAATTGCTGATTATGAAC
AAGATGTTTTAGAACGACTAGGTCTGTTTGACCGAGACATAGTTGTTTGTGCCACGAATGACGATGATATTAACCGAAAA
GTTGCTAAATTAGCCAAAGCACATCAAGTTGAGCGTGTCATTTGCAGACTTGAAAGCACAACGGACGATACAGAGTTAGT
TGATTCAGGTATTGAAATTTTCAGTAGCTACTTAAGTAATAAAATCTTATTAAAAGGTTTAATTGAAACACCTAACATGT
TGAATTTATTAAGTAATGTTGAAACGTCACTATATGAAATCCAAATGTTAAATTATAAATATGAAAATATTCAATTACGT
AATTTCCCATTCGGAGGAGACATCATCTTCGTGCGTATTATCCGTAATAATGAGTCGATTGTTCCGCATGGAGATACACA
ATTGCGATATGGTGATCGCTTAATTGTTACCGGTGCTAAAGAATACGTTGATGAATTGAAGCAAGAGTTAGAATTTTATT
TTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAGCGGACCATTTATTACAACAATTAATGATATTATTAGTATGTTGATTTATTTTGGTTTAGCTACATCATTTATGGCTT
ACTTAATTTAAGGAGGAGTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CAATAATGATATTAAAATGCAGACGTATTTTAGTACGACGTAAAATTAATGATTTTAAAATGCTAGTATGTATATGATTT
TGATAAATACATGCTTTTTA

Product: Na+/H+ antiporter

Products: Proton [Cytoplasm]; K (I) [Periplasm] [C]

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 614; Mature: 614

Protein sequence:

>614_residues
MEFLSLVIVVLAAFLTPIIVNRLNINFLPVVVAEILMGIVIGNSFLNIVERDSILNILSTLGFIFLMFLSGLEIDFKAFK
KDKRARQGQNDDESSIPGHLNLALTVFAFIMIISILLAYVFKWLGLVDDVLLMVIIISTISLGVVVPTLKEMNIMRTTIG
QFILLVAVLADLVTMILLTVYGAINGQGDSTIWLIGILVVFTAISYILGVQFKRMSFLQKLMDGTTQIGIRAVFALIILL
VALAEGVGAENILGAFLAGVVVSLLNPDEEMVEKLDSFGYGFFIPIFFIMVGVDLNIPSLIKEPKLLIIIPILIVAFIIS
KLIPVMFIRRWFDMKTTIASAFLLTSTLSLVIAAAKISERLNAISAETSGILILSAVITCVFVPIIFKKLFPVPDEFNRK
IEVSLIGKNQLTIPIAQNLTSQLYDVTLYYRKDLSDRRQLSDDITMIEIADYEQDVLERLGLFDRDIVVCATNDDDINRK
VAKLAKAHQVERVICRLESTTDDTELVDSGIEIFSSYLSNKILLKGLIETPNMLNLLSNVETSLYEIQMLNYKYENIQLR
NFPFGGDIIFVRIIRNNESIVPHGDTQLRYGDRLIVTGAKEYVDELKQELEFYF

Sequences:

>Translated_614_residues
MEFLSLVIVVLAAFLTPIIVNRLNINFLPVVVAEILMGIVIGNSFLNIVERDSILNILSTLGFIFLMFLSGLEIDFKAFK
KDKRARQGQNDDESSIPGHLNLALTVFAFIMIISILLAYVFKWLGLVDDVLLMVIIISTISLGVVVPTLKEMNIMRTTIG
QFILLVAVLADLVTMILLTVYGAINGQGDSTIWLIGILVVFTAISYILGVQFKRMSFLQKLMDGTTQIGIRAVFALIILL
VALAEGVGAENILGAFLAGVVVSLLNPDEEMVEKLDSFGYGFFIPIFFIMVGVDLNIPSLIKEPKLLIIIPILIVAFIIS
KLIPVMFIRRWFDMKTTIASAFLLTSTLSLVIAAAKISERLNAISAETSGILILSAVITCVFVPIIFKKLFPVPDEFNRK
IEVSLIGKNQLTIPIAQNLTSQLYDVTLYYRKDLSDRRQLSDDITMIEIADYEQDVLERLGLFDRDIVVCATNDDDINRK
VAKLAKAHQVERVICRLESTTDDTELVDSGIEIFSSYLSNKILLKGLIETPNMLNLLSNVETSLYEIQMLNYKYENIQLR
NFPFGGDIIFVRIIRNNESIVPHGDTQLRYGDRLIVTGAKEYVDELKQELEFYF
>Mature_614_residues
MEFLSLVIVVLAAFLTPIIVNRLNINFLPVVVAEILMGIVIGNSFLNIVERDSILNILSTLGFIFLMFLSGLEIDFKAFK
KDKRARQGQNDDESSIPGHLNLALTVFAFIMIISILLAYVFKWLGLVDDVLLMVIIISTISLGVVVPTLKEMNIMRTTIG
QFILLVAVLADLVTMILLTVYGAINGQGDSTIWLIGILVVFTAISYILGVQFKRMSFLQKLMDGTTQIGIRAVFALIILL
VALAEGVGAENILGAFLAGVVVSLLNPDEEMVEKLDSFGYGFFIPIFFIMVGVDLNIPSLIKEPKLLIIIPILIVAFIIS
KLIPVMFIRRWFDMKTTIASAFLLTSTLSLVIAAAKISERLNAISAETSGILILSAVITCVFVPIIFKKLFPVPDEFNRK
IEVSLIGKNQLTIPIAQNLTSQLYDVTLYYRKDLSDRRQLSDDITMIEIADYEQDVLERLGLFDRDIVVCATNDDDINRK
VAKLAKAHQVERVICRLESTTDDTELVDSGIEIFSSYLSNKILLKGLIETPNMLNLLSNVETSLYEIQMLNYKYENIQLR
NFPFGGDIIFVRIIRNNESIVPHGDTQLRYGDRLIVTGAKEYVDELKQELEFYF

Specific function: Probable Na(+)/H(+) antiporter [H]

COG id: COG0475

COG function: function code P; Kef-type K+ transport systems, membrane components

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 RCK N-terminal domain [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786232, Length=549, Percent_Identity=24.5901639344262, Blast_Score=70, Evalue=4e-13,
Organism=Escherichia coli, GI1789749, Length=541, Percent_Identity=21.996303142329, Blast_Score=65, Evalue=1e-11,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR006153
- InterPro:   IPR016040
- InterPro:   IPR006037
- InterPro:   IPR003148 [H]

Pfam domain/function: PF00999 Na_H_Exchanger; PF02080 TrkA_C; PF02254 TrkA_N [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 68738; Mature: 68738

Theoretical pI: Translated: 4.66; Mature: 4.66

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
2.8 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
2.8 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MEFLSLVIVVLAAFLTPIIVNRLNINFLPVVVAEILMGIVIGNSFLNIVERDSILNILST
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGFIFLMFLSGLEIDFKAFKKDKRARQGQNDDESSIPGHLNLALTVFAFIMIISILLAYV
HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FKWLGLVDDVLLMVIIISTISLGVVVPTLKEMNIMRTTIGQFILLVAVLADLVTMILLTV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YGAINGQGDSTIWLIGILVVFTAISYILGVQFKRMSFLQKLMDGTTQIGIRAVFALIILL
HHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
VALAEGVGAENILGAFLAGVVVSLLNPDEEMVEKLDSFGYGFFIPIFFIMVGVDLNIPSL
HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
IKEPKLLIIIPILIVAFIISKLIPVMFIRRWFDMKTTIASAFLLTSTLSLVIAAAKISER
HCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LNAISAETSGILILSAVITCVFVPIIFKKLFPVPDEFNRKIEVSLIGKNQLTIPIAQNLT
HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCEEEEEEECCCCEEEHHHHHHH
SQLYDVTLYYRKDLSDRRQLSDDITMIEIADYEQDVLERLGLFDRDIVVCATNDDDINRK
HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCHHHHH
VAKLAKAHQVERVICRLESTTDDTELVDSGIEIFSSYLSNKILLKGLIETPNMLNLLSNV
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
ETSLYEIQMLNYKYENIQLRNFPFGGDIIFVRIIRNNESIVPHGDTQLRYGDRLIVTGAK
HHHHHHHHHHCEEECCEEEECCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCEEECCEEEEECHH
EYVDELKQELEFYF
HHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MEFLSLVIVVLAAFLTPIIVNRLNINFLPVVVAEILMGIVIGNSFLNIVERDSILNILST
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGFIFLMFLSGLEIDFKAFKKDKRARQGQNDDESSIPGHLNLALTVFAFIMIISILLAYV
HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FKWLGLVDDVLLMVIIISTISLGVVVPTLKEMNIMRTTIGQFILLVAVLADLVTMILLTV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YGAINGQGDSTIWLIGILVVFTAISYILGVQFKRMSFLQKLMDGTTQIGIRAVFALIILL
HHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
VALAEGVGAENILGAFLAGVVVSLLNPDEEMVEKLDSFGYGFFIPIFFIMVGVDLNIPSL
HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
IKEPKLLIIIPILIVAFIISKLIPVMFIRRWFDMKTTIASAFLLTSTLSLVIAAAKISER
HCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LNAISAETSGILILSAVITCVFVPIIFKKLFPVPDEFNRKIEVSLIGKNQLTIPIAQNLT
HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCEEEEEEECCCCEEEHHHHHHH
SQLYDVTLYYRKDLSDRRQLSDDITMIEIADYEQDVLERLGLFDRDIVVCATNDDDINRK
HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCHHHHH
VAKLAKAHQVERVICRLESTTDDTELVDSGIEIFSSYLSNKILLKGLIETPNMLNLLSNV
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
ETSLYEIQMLNYKYENIQLRNFPFGGDIIFVRIIRNNESIVPHGDTQLRYGDRLIVTGAK
HHHHHHHHHHCEEECCEEEECCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCEEECCEEEEECHH
EYVDELKQELEFYF
HHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: Proton [Periplasm]; K (I) [Cytoplasm] [C]

Specific reaction: Proton [Periplasm] + K (I) [Cytoplasm] = Proton [Cytoplasm] + K (I) [Periplasm] [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]