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The map label for this gene is pepB

Identifier: 82750613

GI number: 82750613

Start: 940267

End: 942075

Strand: Direct

Name: pepB

Synonym: SAB0867

Alternate gene names: 82750613

Gene position: 940267-942075 (Clockwise)

Preceding gene: 82750612

Following gene: 82750617

Centisome position: 34.28

GC content: 31.9

Gene sequence:

>1809_bases
ATGAGTCAACAATTATCGAGAGAAGAACAGGAACGTAAATATCCTGAATATACATGGGACTTAACAACAATTTTCAAAGA
TGATGAAGCTTTTGAGGCTGCATTTAAAGAAGTTGAAAATGAGTTAGGAAAAGAAGAACAATTTAAAGGACACATTGGTG
ATAGTGCTGAGACATTATACAATGCGTTAGAATTAGAAGATACATTAGGTACTAAATTAGAAAAAGTATATGTATACGCG
CATCTAAAACAAGACCAAGATACAACGAACGACAAATATACTGGTATGGAGTCAAGAGCACATCAATTAATTATTAAATT
TAGCTCGGCATGGAGTTTCTTAGTGCCAGCGATTTTACAAATTGATGAAGATAAAATTCAATCATTTGTAAATTCATATG
ATAAATTACAAAAATTCGCATTTGATTTGAAGTTGATTAACGAAAAACGTCCTCATATTTTAGATGCTGAAACTGAAAAG
TTATTAACAGAAGCGCAGGACGCGTTATCAACACCATCAAATGTATACGGTATGTTTAGCAACGCTGATTTAGTATTTGA
AGATGCGATTGATAAAGATGGAAATGCACACCCGTTAACACAAGGTACATTTATTAAGTATTTAGAATCAGATGATCGCA
AACTAAGAGAAAGTGCTTTTAAAAATGTATATAAAGCATATGGTGCTCATAATAATACGCTTGGCGCTACGCTAGCAGGT
GAAGTGAAGAAAAATGTATTTAATGCTCGTACGCACAATTACAAAACTGCAAGAGAAAAAGCATTGAGTAATAATCATAT
TCCAGAAAATGTATATGACAATCTAGTAAAAACTGTACATAAATATTTACCATTGCTACATAGATATACTGAATTGCGCA
AAGAATTGCTAGGTTTAGATGACTTGAAAATGTATGATTTATATACACCATTAATTAAAGATATTAAGTTTGAAATGCCT
TATGAAGAAGCTAAAGAGTGGATGTTAAAAGCTTTAGAACCAATGGGTGAAGAATATTTAAATGTAGTTAAAGAAGGCTT
AAACAATCGTTGGGTCGATGTCTATGAGAATAAAGGTAAACGTTCAGGTGGCTATTCATCAGGTGCACATTTAACTAATC
CATTTATTCTACTTAACTGGTCTAATACTATTTCAGACTTATACACATTAGTTCATGAATTTGGACATTCAGCACATAGT
TACTTCAGTAGAAAATTCCAACCGTCAAATTCTAGTGACTACACTATTTTTGTCGCTGAAGTAGCATCAACTTGTAACGA
AGCACTTTTAAGTGATTATATGGATAAACATCTTGATGATGAAAAACGCTTATTATTATTAAACCAAGAATTAGAACGTT
TCAGAGCTACATTATTCCGACAAACAATGTTCGCAGAATTTGAGCATAAAATTCATACCATTGAAGAAGCAGGTGAACCA
TTAACGCCAACTAGAATGAATGAAGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGA
TATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAATTATTATGTATATCAATACGCAACTGGTTATAGTGCAG
CTCAAAGCTTAAGTCATCAAATTTTAACAGAAGGTAAGCCAGCAGTAGATAGATATATTAATGAATTCTTGAAAAAAGGT
AGCTCAAATTATCCAATTGAGATATTAAAAAATGCTGGTGTAGATATGACAACACCTGAACCAATTGAACAAGCTTGTGA
AGTTTTTGAACAAAAATTGAACGCTTTTGAAAAATTAATGAAAGCTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTATTTAAATATTAGTTCAGATAGAGGTAATGACGTGCAAATTTTGTTCTAAAATGAGAAAATTATATCAATTATATTT
TATTAGGAGGTTTACTACAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGCTGTTGTATTCGCTTACATTATGAACAGATTGTGACAATTTAAATTAAGTACTATTAAAAGGTTGAAATGGAAGAGAT
AGCGTGTTATATTATGAACA

Product: thimet oligopeptidase

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 602; Mature: 601

Protein sequence:

>602_residues
MSQQLSREEQERKYPEYTWDLTTIFKDDEAFEAAFKEVENELGKEEQFKGHIGDSAETLYNALELEDTLGTKLEKVYVYA
HLKQDQDTTNDKYTGMESRAHQLIIKFSSAWSFLVPAILQIDEDKIQSFVNSYDKLQKFAFDLKLINEKRPHILDAETEK
LLTEAQDALSTPSNVYGMFSNADLVFEDAIDKDGNAHPLTQGTFIKYLESDDRKLRESAFKNVYKAYGAHNNTLGATLAG
EVKKNVFNARTHNYKTAREKALSNNHIPENVYDNLVKTVHKYLPLLHRYTELRKELLGLDDLKMYDLYTPLIKDIKFEMP
YEEAKEWMLKALEPMGEEYLNVVKEGLNNRWVDVYENKGKRSGGYSSGAHLTNPFILLNWSNTISDLYTLVHEFGHSAHS
YFSRKFQPSNSSDYTIFVAEVASTCNEALLSDYMDKHLDDEKRLLLLNQELERFRATLFRQTMFAEFEHKIHTIEEAGEP
LTPTRMNEEYAKLNKLYFGDSVETDEDISKEWSRIPHFYMNYYVYQYATGYSAAQSLSHQILTEGKPAVDRYINEFLKKG
SSNYPIEILKNAGVDMTTPEPIEQACEVFEQKLNAFEKLMKA

Sequences:

>Translated_602_residues
MSQQLSREEQERKYPEYTWDLTTIFKDDEAFEAAFKEVENELGKEEQFKGHIGDSAETLYNALELEDTLGTKLEKVYVYA
HLKQDQDTTNDKYTGMESRAHQLIIKFSSAWSFLVPAILQIDEDKIQSFVNSYDKLQKFAFDLKLINEKRPHILDAETEK
LLTEAQDALSTPSNVYGMFSNADLVFEDAIDKDGNAHPLTQGTFIKYLESDDRKLRESAFKNVYKAYGAHNNTLGATLAG
EVKKNVFNARTHNYKTAREKALSNNHIPENVYDNLVKTVHKYLPLLHRYTELRKELLGLDDLKMYDLYTPLIKDIKFEMP
YEEAKEWMLKALEPMGEEYLNVVKEGLNNRWVDVYENKGKRSGGYSSGAHLTNPFILLNWSNTISDLYTLVHEFGHSAHS
YFSRKFQPSNSSDYTIFVAEVASTCNEALLSDYMDKHLDDEKRLLLLNQELERFRATLFRQTMFAEFEHKIHTIEEAGEP
LTPTRMNEEYAKLNKLYFGDSVETDEDISKEWSRIPHFYMNYYVYQYATGYSAAQSLSHQILTEGKPAVDRYINEFLKKG
SSNYPIEILKNAGVDMTTPEPIEQACEVFEQKLNAFEKLMKA
>Mature_601_residues
SQQLSREEQERKYPEYTWDLTTIFKDDEAFEAAFKEVENELGKEEQFKGHIGDSAETLYNALELEDTLGTKLEKVYVYAH
LKQDQDTTNDKYTGMESRAHQLIIKFSSAWSFLVPAILQIDEDKIQSFVNSYDKLQKFAFDLKLINEKRPHILDAETEKL
LTEAQDALSTPSNVYGMFSNADLVFEDAIDKDGNAHPLTQGTFIKYLESDDRKLRESAFKNVYKAYGAHNNTLGATLAGE
VKKNVFNARTHNYKTAREKALSNNHIPENVYDNLVKTVHKYLPLLHRYTELRKELLGLDDLKMYDLYTPLIKDIKFEMPY
EEAKEWMLKALEPMGEEYLNVVKEGLNNRWVDVYENKGKRSGGYSSGAHLTNPFILLNWSNTISDLYTLVHEFGHSAHSY
FSRKFQPSNSSDYTIFVAEVASTCNEALLSDYMDKHLDDEKRLLLLNQELERFRATLFRQTMFAEFEHKIHTIEEAGEPL
TPTRMNEEYAKLNKLYFGDSVETDEDISKEWSRIPHFYMNYYVYQYATGYSAAQSLSHQILTEGKPAVDRYINEFLKKGS
SNYPIEILKNAGVDMTTPEPIEQACEVFEQKLNAFEKLMKA

Specific function: Unknown

COG id: COG1164

COG function: function code E; Oligoendopeptidase F

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the peptidase M3B family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001567
- InterPro:   IPR004438
- InterPro:   IPR013647 [H]

Pfam domain/function: PF01432 Peptidase_M3; PF08439 Peptidase_M3_N [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 69750; Mature: 69619

Theoretical pI: Translated: 4.96; Mature: 4.96

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
2.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
2.0 %Met     (Mature Protein)
2.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSQQLSREEQERKYPEYTWDLTTIFKDDEAFEAAFKEVENELGKEEQFKGHIGDSAETLY
CCCHHHHHHHHHCCCCCEEEHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCHHHHHH
NALELEDTLGTKLEKVYVYAHLKQDQDTTNDKYTGMESRAHQLIIKFSSAWSFLVPAILQ
HHHHHHHHHCCHHHHEEEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IDEDKIQSFVNSYDKLQKFAFDLKLINEKRPHILDAETEKLLTEAQDALSTPSNVYGMFS
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHEECC
NADLVFEDAIDKDGNAHPLTQGTFIKYLESDDRKLRESAFKNVYKAYGAHNNTLGATLAG
CCCEEEHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHH
EVKKNVFNARTHNYKTAREKALSNNHIPENVYDNLVKTVHKYLPLLHRYTELRKELLGLD
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
DLKMYDLYTPLIKDIKFEMPYEEAKEWMLKALEPMGEEYLNVVKEGLNNRWVDVYENKGK
CHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHCCCCC
RSGGYSSGAHLTNPFILLNWSNTISDLYTLVHEFGHSAHSYFSRKFQPSNSSDYTIFVAE
CCCCCCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEHHH
VASTCNEALLSDYMDKHLDDEKRLLLLNQELERFRATLFRQTMFAEFEHKIHTIEEAGEP
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
LTPTRMNEEYAKLNKLYFGDSVETDEDISKEWSRIPHFYMNYYVYQYATGYSAAQSLSHQ
CCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
ILTEGKPAVDRYINEFLKKGSSNYPIEILKNAGVDMTTPEPIEQACEVFEQKLNAFEKLM
HHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KA
CC
>Mature Secondary Structure 
SQQLSREEQERKYPEYTWDLTTIFKDDEAFEAAFKEVENELGKEEQFKGHIGDSAETLY
CCHHHHHHHHHCCCCCEEEHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCHHHHHH
NALELEDTLGTKLEKVYVYAHLKQDQDTTNDKYTGMESRAHQLIIKFSSAWSFLVPAILQ
HHHHHHHHHCCHHHHEEEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IDEDKIQSFVNSYDKLQKFAFDLKLINEKRPHILDAETEKLLTEAQDALSTPSNVYGMFS
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHEECC
NADLVFEDAIDKDGNAHPLTQGTFIKYLESDDRKLRESAFKNVYKAYGAHNNTLGATLAG
CCCEEEHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHH
EVKKNVFNARTHNYKTAREKALSNNHIPENVYDNLVKTVHKYLPLLHRYTELRKELLGLD
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
DLKMYDLYTPLIKDIKFEMPYEEAKEWMLKALEPMGEEYLNVVKEGLNNRWVDVYENKGK
CHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHCCCCC
RSGGYSSGAHLTNPFILLNWSNTISDLYTLVHEFGHSAHSYFSRKFQPSNSSDYTIFVAE
CCCCCCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEHHH
VASTCNEALLSDYMDKHLDDEKRLLLLNQELERFRATLFRQTMFAEFEHKIHTIEEAGEP
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
LTPTRMNEEYAKLNKLYFGDSVETDEDISKEWSRIPHFYMNYYVYQYATGYSAAQSLSHQ
CCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
ILTEGKPAVDRYINEFLKKGSSNYPIEILKNAGVDMTTPEPIEQACEVFEQKLNAFEKLM
HHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KA
CC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]