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The map label for this gene is cap8K

Identifier: 82749872

GI number: 82749872

Start: 122633

End: 123871

Strand: Direct

Name: cap8K

Synonym: SAB0100

Alternate gene names: NA

Gene position: 122633-123871 (Clockwise)

Preceding gene: 82749871

Following gene: 82749873

Centisome position: 4.47

GC content: 27.2

Gene sequence:

>1239_bases
ATGAGATTAAATAAATTTATTGGCGATTCGTTCTTAATGATTTTAAGCAGTGGCATCGCTCAAGTCATATTAATCATCAC
TACCCCAATTATTACAAGACTATATTCACCTACAGAATTTGGTGAGTTTACAATTTTTTCAAATATCGCAATGATTTTAA
TACCAATAATAAATGCAAGATACGATTTGTTGATTGTGAATACCAAAAATGACCGTAGTGCTAATATACTTTCACAAATC
AGTTTTTTGATATCATTGCTTATTTTATTAATACTGATACCAATATTTGCGATTAGCGCATGGTTATACCCAAACTTTAT
ATTAGATTTTATTTTCATTATTATTATGTTGTTTTTGGTAAGTTTAACAAACATTTTTACAAATTATCTAAATAAGGAAA
GAAAATATAAAGTGTTAAGTTTGATTAATGTGTTTAGAGCTGGATCAATGGCTTTACTTCAAATCATTTTCGGACTTTTA
GCATTAGGAAGTCTAGGATTAATTATTGGTTTTTCATTATCCTATATCGCAGGCATTACACTAGGATATAAAACGTTTAA
AAAGCACTTTAATATTGTGAGAGATAAAGAAGAAACTAAAGCATTATTTTTAGAAAATAAAAATCAGTTAGTTTATTCAA
CACCATCAATATTATTAAATAGTTTGTCTTTCTCGGTTGTTGTGTTCTTTATAGGTATTTTGTATACCAATACAGAAGTA
GGTATTTATGGTATGGCCATAAGAGTACTAGGCATACCAGTGACAATTATTTCTTTAGGGTTATCAAAAATATTTATGCA
ACAAGCTAATGACTATTATATTGAGCATGGTAACTTCCGAAATTTATTACTTAAATTTAGTTCCATACTGGTTATAGTTT
CTATAATTCTTTATGTGCCACTTTATTTGTTCAGTGAAGAATTAGTCAATATATTATTAGGACACAGCTGGGTTGACGCA
ATTACAGTTATAAAAATTGTTATCCCATTATTTGTTATAAGGCTGATTGTATCAACGGTATCACTTTCTGTGATTGTATT
ACAAAAACAACAGTTAGAATTAATACTACAAGCGTTATTTTTAATAGGTACTACTGTAACATTTGTTATATCAAAAATGC
TTAATTTAACGTTTTTAAACTTTGTATCTATTAATACAGTTGTTTTAATCGTATCGTACATGATATTTTTCATAGCACTC
TATTATTTTGCTAAAAATAAACAGTTCAAAAATTCTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTGTAGGGGCTGGGTCGGTTGTAACAAAAAGTTTTCCAGAAGGTAACGTTGTTATAGGTGGCAATCCAGCGAAAGTGATC
AAGAAAATCTGAGGTTAATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCTAAATTCATTAATAAAAAGGACGTCGATTAGATGAGTGAAAAAAAGATTTTGATTTTATGTCAGTATTTTTATCCGGA
ATATGTATCTTCAGCGACGT

Product: capsular polysaccharide synthesis enzyme CapK

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 412; Mature: 412

Protein sequence:

>412_residues
MRLNKFIGDSFLMILSSGIAQVILIITTPIITRLYSPTEFGEFTIFSNIAMILIPIINARYDLLIVNTKNDRSANILSQI
SFLISLLILLILIPIFAISAWLYPNFILDFIFIIIMLFLVSLTNIFTNYLNKERKYKVLSLINVFRAGSMALLQIIFGLL
ALGSLGLIIGFSLSYIAGITLGYKTFKKHFNIVRDKEETKALFLENKNQLVYSTPSILLNSLSFSVVVFFIGILYTNTEV
GIYGMAIRVLGIPVTIISLGLSKIFMQQANDYYIEHGNFRNLLLKFSSILVIVSIILYVPLYLFSEELVNILLGHSWVDA
ITVIKIVIPLFVIRLIVSTVSLSVIVLQKQQLELILQALFLIGTTVTFVISKMLNLTFLNFVSINTVVLIVSYMIFFIAL
YYFAKNKQFKNS

Sequences:

>Translated_412_residues
MRLNKFIGDSFLMILSSGIAQVILIITTPIITRLYSPTEFGEFTIFSNIAMILIPIINARYDLLIVNTKNDRSANILSQI
SFLISLLILLILIPIFAISAWLYPNFILDFIFIIIMLFLVSLTNIFTNYLNKERKYKVLSLINVFRAGSMALLQIIFGLL
ALGSLGLIIGFSLSYIAGITLGYKTFKKHFNIVRDKEETKALFLENKNQLVYSTPSILLNSLSFSVVVFFIGILYTNTEV
GIYGMAIRVLGIPVTIISLGLSKIFMQQANDYYIEHGNFRNLLLKFSSILVIVSIILYVPLYLFSEELVNILLGHSWVDA
ITVIKIVIPLFVIRLIVSTVSLSVIVLQKQQLELILQALFLIGTTVTFVISKMLNLTFLNFVSINTVVLIVSYMIFFIAL
YYFAKNKQFKNS
>Mature_412_residues
MRLNKFIGDSFLMILSSGIAQVILIITTPIITRLYSPTEFGEFTIFSNIAMILIPIINARYDLLIVNTKNDRSANILSQI
SFLISLLILLILIPIFAISAWLYPNFILDFIFIIIMLFLVSLTNIFTNYLNKERKYKVLSLINVFRAGSMALLQIIFGLL
ALGSLGLIIGFSLSYIAGITLGYKTFKKHFNIVRDKEETKALFLENKNQLVYSTPSILLNSLSFSVVVFFIGILYTNTEV
GIYGMAIRVLGIPVTIISLGLSKIFMQQANDYYIEHGNFRNLLLKFSSILVIVSIILYVPLYLFSEELVNILLGHSWVDA
ITVIKIVIPLFVIRLIVSTVSLSVIVLQKQQLELILQALFLIGTTVTFVISKMLNLTFLNFVSINTVVLIVSYMIFFIAL
YYFAKNKQFKNS

Specific function: Unknown

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 46638; Mature: 46638

Theoretical pI: Translated: 9.99; Mature: 9.99

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRLNKFIGDSFLMILSSGIAQVILIITTPIITRLYSPTEFGEFTIFSNIAMILIPIINAR
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCC
YDLLIVNTKNDRSANILSQISFLISLLILLILIPIFAISAWLYPNFILDFIFIIIMLFLV
EEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLTNIFTNYLNKERKYKVLSLINVFRAGSMALLQIIFGLLALGSLGLIIGFSLSYIAGIT
HHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGYKTFKKHFNIVRDKEETKALFLENKNQLVYSTPSILLNSLSFSVVVFFIGILYTNTEV
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHEECCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
GIYGMAIRVLGIPVTIISLGLSKIFMQQANDYYIEHGNFRNLLLKFSSILVIVSIILYVP
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LYLFSEELVNILLGHSWVDAITVIKIVIPLFVIRLIVSTVSLSVIVLQKQQLELILQALF
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIGTTVTFVISKMLNLTFLNFVSINTVVLIVSYMIFFIALYYFAKNKQFKNS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MRLNKFIGDSFLMILSSGIAQVILIITTPIITRLYSPTEFGEFTIFSNIAMILIPIINAR
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCC
YDLLIVNTKNDRSANILSQISFLISLLILLILIPIFAISAWLYPNFILDFIFIIIMLFLV
EEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLTNIFTNYLNKERKYKVLSLINVFRAGSMALLQIIFGLLALGSLGLIIGFSLSYIAGIT
HHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGYKTFKKHFNIVRDKEETKALFLENKNQLVYSTPSILLNSLSFSVVVFFIGILYTNTEV
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHEECCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
GIYGMAIRVLGIPVTIISLGLSKIFMQQANDYYIEHGNFRNLLLKFSSILVIVSIILYVP
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LYLFSEELVNILLGHSWVDAITVIKIVIPLFVIRLIVSTVSLSVIVLQKQQLELILQALF
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIGTTVTFVISKMLNLTFLNFVSINTVVLIVSYMIFFIALYYFAKNKQFKNS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA