Definition Staphylococcus aureus RF122, complete genome.
Accession NC_007622
Length 2,742,531

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The map label for this gene is cap8I

Identifier: 82749870

GI number: 82749870

Start: 120676

End: 122070

Strand: Direct

Name: cap8I

Synonym: SAB0098

Alternate gene names: NA

Gene position: 120676-122070 (Clockwise)

Preceding gene: 82749869

Following gene: 82749871

Centisome position: 4.4

GC content: 28.75

Gene sequence:

>1395_bases
ATGAATAAGGTATATAATGTCACTTCATATGTTATTGCCATTTTAATATTTCCTTGCCTTATGTTAGGTGATAAACCTTT
ATTATTTTTAGCACCTATAAGTTATGGAGTAGGAAAGCTCTTTATAAGCTTCTCGAATAATCCGAATTTTAAATTTTCGA
AAATTGTATACGATGTTTTAGGTTTTCTTAGATTAGTATTTATACCTTCTATGATAGTGTTTTTCCAGGATTCAACTATA
GATAATTTACCATTAGGACAAGCTTATTTTAATCAAGCGGTTATTTATATGAGTGTGGAGTTTATCATAGGATCGCTATT
TATATTGATACTATCTAAATTATTCAAACATGAAGTGGTATCAAGAAATAGCTTTACACTTTCTGGATCATCAATTTATT
ACATTGTGTTTGGTCTTGTTATTTGTGGGATTTTTGTAGCTTTTCCCGAAGTGCGCAAAAACATATCATTTTTAATTATT
AAAACAGATGCAATGGGAAGAGGAACCGAAGCAACAAGTGGTTTAAATGTCCTTTTTGTAATGCTATTTCAACTTGCCTT
AGCGTTATTATTCTTAATAATCGCATATGCTTCATATAAAAAGTATAAAGAGAATCCTAAAATTATTTATGTTGTATTGC
CGCTAGCTATAGGAATTTTAAATATTAGTTTAATTGTTGGTGAAAGAAGAAGTTATCAACTTTATACGATGGTTGCTGTT
TTAACAGTGGTGTCACTCTTGTTTTCTAAACACAAAAGACGTATCAATATCATTATTATATCTGTTGGTATTTTCGTATT
AGCATTGATGACACTATATAAAGAATTGTATGTGTTTAATTATAGTTCATATAGCGAGGCGTTAAATAGTACAAGTGTAA
GTAATCTTAAGATAGTTGACACGTTACAGTCATATTTTTATGGACCTAGCAATATTGCAGCTTCTATAGACTATTTGAAT
TACTATAATGGTTCGTTCAAACAATATTTATTTGATAATACTAGAGCTGTTTTTGGGTTTAATTTCTTTGTAGATAAAAA
GCAGTTGATTACTAGCCAACTTTTTAACCAATTGATATATGGTAGTAAACAATTGACTGGGCATCTAATTTCGAGTGCTG
GATATGGAATTATTTATTTTGGACCCTTATTCTTCTATTTGAATTTAATTGCAAATATCTTTTTTGCATTTCTGAGTGAG
TATATTATTCGGAAGAGTCATTCGTTAGAAGTGATATTTATTGGTACATATATTTATATGAGACTTATTACGAGTATTTT
TAGTCACCCGACACCATTAATCACATTGATTTCTATGATTTTAGTTGTATATGTTATAGCTATTATCCCAGGCATTATAA
TAAAAAAATTTACTAAAAAAGTAGGGATAGAATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATTTGGATGTAATGGACATTAATCATAAAAGAGAAGCTTATAGAAACGATGTAATTGAAAATAATAAACAGTTCTATCA
AGAGATAGGCAGGATATTTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTGTAAAAACATTTATGAAATCGAAAATATTTAGATTAATGAATACACCACTATTATTATTTTATAAGAAAGAATATTTA
ACTGGATATTATTTTGAAAA

Product: capsular polysaccharide synthesis enzyme CapI

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 464; Mature: 464

Protein sequence:

>464_residues
MNKVYNVTSYVIAILIFPCLMLGDKPLLFLAPISYGVGKLFISFSNNPNFKFSKIVYDVLGFLRLVFIPSMIVFFQDSTI
DNLPLGQAYFNQAVIYMSVEFIIGSLFILILSKLFKHEVVSRNSFTLSGSSIYYIVFGLVICGIFVAFPEVRKNISFLII
KTDAMGRGTEATSGLNVLFVMLFQLALALLFLIIAYASYKKYKENPKIIYVVLPLAIGILNISLIVGERRSYQLYTMVAV
LTVVSLLFSKHKRRINIIIISVGIFVLALMTLYKELYVFNYSSYSEALNSTSVSNLKIVDTLQSYFYGPSNIAASIDYLN
YYNGSFKQYLFDNTRAVFGFNFFVDKKQLITSQLFNQLIYGSKQLTGHLISSAGYGIIYFGPLFFYLNLIANIFFAFLSE
YIIRKSHSLEVIFIGTYIYMRLITSIFSHPTPLITLISMILVVYVIAIIPGIIIKKFTKKVGIE

Sequences:

>Translated_464_residues
MNKVYNVTSYVIAILIFPCLMLGDKPLLFLAPISYGVGKLFISFSNNPNFKFSKIVYDVLGFLRLVFIPSMIVFFQDSTI
DNLPLGQAYFNQAVIYMSVEFIIGSLFILILSKLFKHEVVSRNSFTLSGSSIYYIVFGLVICGIFVAFPEVRKNISFLII
KTDAMGRGTEATSGLNVLFVMLFQLALALLFLIIAYASYKKYKENPKIIYVVLPLAIGILNISLIVGERRSYQLYTMVAV
LTVVSLLFSKHKRRINIIIISVGIFVLALMTLYKELYVFNYSSYSEALNSTSVSNLKIVDTLQSYFYGPSNIAASIDYLN
YYNGSFKQYLFDNTRAVFGFNFFVDKKQLITSQLFNQLIYGSKQLTGHLISSAGYGIIYFGPLFFYLNLIANIFFAFLSE
YIIRKSHSLEVIFIGTYIYMRLITSIFSHPTPLITLISMILVVYVIAIIPGIIIKKFTKKVGIE
>Mature_464_residues
MNKVYNVTSYVIAILIFPCLMLGDKPLLFLAPISYGVGKLFISFSNNPNFKFSKIVYDVLGFLRLVFIPSMIVFFQDSTI
DNLPLGQAYFNQAVIYMSVEFIIGSLFILILSKLFKHEVVSRNSFTLSGSSIYYIVFGLVICGIFVAFPEVRKNISFLII
KTDAMGRGTEATSGLNVLFVMLFQLALALLFLIIAYASYKKYKENPKIIYVVLPLAIGILNISLIVGERRSYQLYTMVAV
LTVVSLLFSKHKRRINIIIISVGIFVLALMTLYKELYVFNYSSYSEALNSTSVSNLKIVDTLQSYFYGPSNIAASIDYLN
YYNGSFKQYLFDNTRAVFGFNFFVDKKQLITSQLFNQLIYGSKQLTGHLISSAGYGIIYFGPLFFYLNLIANIFFAFLSE
YIIRKSHSLEVIFIGTYIYMRLITSIFSHPTPLITLISMILVVYVIAIIPGIIIKKFTKKVGIE

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 52599; Mature: 52599

Theoretical pI: Translated: 9.85; Mature: 9.85

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
2.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
2.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNKVYNVTSYVIAILIFPCLMLGDKPLLFLAPISYGVGKLFISFSNNPNFKFSKIVYDVL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHH
GFLRLVFIPSMIVFFQDSTIDNLPLGQAYFNQAVIYMSVEFIIGSLFILILSKLFKHEVV
HHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SRNSFTLSGSSIYYIVFGLVICGIFVAFPEVRKNISFLIIKTDAMGRGTEATSGLNVLFV
CCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHH
MLFQLALALLFLIIAYASYKKYKENPKIIYVVLPLAIGILNISLIVGERRSYQLYTMVAV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHH
LTVVSLLFSKHKRRINIIIISVGIFVLALMTLYKELYVFNYSSYSEALNSTSVSNLKIVD
HHHHHHHHHHCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCHHHH
TLQSYFYGPSNIAASIDYLNYYNGSFKQYLFDNTRAVFGFNFFVDKKQLITSQLFNQLIY
HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCEEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHH
GSKQLTGHLISSAGYGIIYFGPLFFYLNLIANIFFAFLSEYIIRKSHSLEVIFIGTYIYM
CCHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHH
RLITSIFSHPTPLITLISMILVVYVIAIIPGIIIKKFTKKVGIE
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MNKVYNVTSYVIAILIFPCLMLGDKPLLFLAPISYGVGKLFISFSNNPNFKFSKIVYDVL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHH
GFLRLVFIPSMIVFFQDSTIDNLPLGQAYFNQAVIYMSVEFIIGSLFILILSKLFKHEVV
HHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SRNSFTLSGSSIYYIVFGLVICGIFVAFPEVRKNISFLIIKTDAMGRGTEATSGLNVLFV
CCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHH
MLFQLALALLFLIIAYASYKKYKENPKIIYVVLPLAIGILNISLIVGERRSYQLYTMVAV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHH
LTVVSLLFSKHKRRINIIIISVGIFVLALMTLYKELYVFNYSSYSEALNSTSVSNLKIVD
HHHHHHHHHHCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCHHHH
TLQSYFYGPSNIAASIDYLNYYNGSFKQYLFDNTRAVFGFNFFVDKKQLITSQLFNQLIY
HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCEEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHH
GSKQLTGHLISSAGYGIIYFGPLFFYLNLIANIFFAFLSEYIIRKSHSLEVIFIGTYIYM
CCHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHH
RLITSIFSHPTPLITLISMILVVYVIAIIPGIIIKKFTKKVGIE
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA