| Definition | Staphylococcus aureus RF122, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007622 |
| Length | 2,742,531 |
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The map label for this gene is cap8I
Identifier: 82749870
GI number: 82749870
Start: 120676
End: 122070
Strand: Direct
Name: cap8I
Synonym: SAB0098
Alternate gene names: NA
Gene position: 120676-122070 (Clockwise)
Preceding gene: 82749869
Following gene: 82749871
Centisome position: 4.4
GC content: 28.75
Gene sequence:
>1395_bases ATGAATAAGGTATATAATGTCACTTCATATGTTATTGCCATTTTAATATTTCCTTGCCTTATGTTAGGTGATAAACCTTT ATTATTTTTAGCACCTATAAGTTATGGAGTAGGAAAGCTCTTTATAAGCTTCTCGAATAATCCGAATTTTAAATTTTCGA AAATTGTATACGATGTTTTAGGTTTTCTTAGATTAGTATTTATACCTTCTATGATAGTGTTTTTCCAGGATTCAACTATA GATAATTTACCATTAGGACAAGCTTATTTTAATCAAGCGGTTATTTATATGAGTGTGGAGTTTATCATAGGATCGCTATT TATATTGATACTATCTAAATTATTCAAACATGAAGTGGTATCAAGAAATAGCTTTACACTTTCTGGATCATCAATTTATT ACATTGTGTTTGGTCTTGTTATTTGTGGGATTTTTGTAGCTTTTCCCGAAGTGCGCAAAAACATATCATTTTTAATTATT AAAACAGATGCAATGGGAAGAGGAACCGAAGCAACAAGTGGTTTAAATGTCCTTTTTGTAATGCTATTTCAACTTGCCTT AGCGTTATTATTCTTAATAATCGCATATGCTTCATATAAAAAGTATAAAGAGAATCCTAAAATTATTTATGTTGTATTGC CGCTAGCTATAGGAATTTTAAATATTAGTTTAATTGTTGGTGAAAGAAGAAGTTATCAACTTTATACGATGGTTGCTGTT TTAACAGTGGTGTCACTCTTGTTTTCTAAACACAAAAGACGTATCAATATCATTATTATATCTGTTGGTATTTTCGTATT AGCATTGATGACACTATATAAAGAATTGTATGTGTTTAATTATAGTTCATATAGCGAGGCGTTAAATAGTACAAGTGTAA GTAATCTTAAGATAGTTGACACGTTACAGTCATATTTTTATGGACCTAGCAATATTGCAGCTTCTATAGACTATTTGAAT TACTATAATGGTTCGTTCAAACAATATTTATTTGATAATACTAGAGCTGTTTTTGGGTTTAATTTCTTTGTAGATAAAAA GCAGTTGATTACTAGCCAACTTTTTAACCAATTGATATATGGTAGTAAACAATTGACTGGGCATCTAATTTCGAGTGCTG GATATGGAATTATTTATTTTGGACCCTTATTCTTCTATTTGAATTTAATTGCAAATATCTTTTTTGCATTTCTGAGTGAG TATATTATTCGGAAGAGTCATTCGTTAGAAGTGATATTTATTGGTACATATATTTATATGAGACTTATTACGAGTATTTT TAGTCACCCGACACCATTAATCACATTGATTTCTATGATTTTAGTTGTATATGTTATAGCTATTATCCCAGGCATTATAA TAAAAAAATTTACTAAAAAAGTAGGGATAGAATGA
Upstream 100 bases:
>100_bases AATTTGGATGTAATGGACATTAATCATAAAAGAGAAGCTTATAGAAACGATGTAATTGAAAATAATAAACAGTTCTATCA AGAGATAGGCAGGATATTTA
Downstream 100 bases:
>100_bases TTGTAAAAACATTTATGAAATCGAAAATATTTAGATTAATGAATACACCACTATTATTATTTTATAAGAAAGAATATTTA ACTGGATATTATTTTGAAAA
Product: capsular polysaccharide synthesis enzyme CapI
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 464; Mature: 464
Protein sequence:
>464_residues MNKVYNVTSYVIAILIFPCLMLGDKPLLFLAPISYGVGKLFISFSNNPNFKFSKIVYDVLGFLRLVFIPSMIVFFQDSTI DNLPLGQAYFNQAVIYMSVEFIIGSLFILILSKLFKHEVVSRNSFTLSGSSIYYIVFGLVICGIFVAFPEVRKNISFLII KTDAMGRGTEATSGLNVLFVMLFQLALALLFLIIAYASYKKYKENPKIIYVVLPLAIGILNISLIVGERRSYQLYTMVAV LTVVSLLFSKHKRRINIIIISVGIFVLALMTLYKELYVFNYSSYSEALNSTSVSNLKIVDTLQSYFYGPSNIAASIDYLN YYNGSFKQYLFDNTRAVFGFNFFVDKKQLITSQLFNQLIYGSKQLTGHLISSAGYGIIYFGPLFFYLNLIANIFFAFLSE YIIRKSHSLEVIFIGTYIYMRLITSIFSHPTPLITLISMILVVYVIAIIPGIIIKKFTKKVGIE
Sequences:
>Translated_464_residues MNKVYNVTSYVIAILIFPCLMLGDKPLLFLAPISYGVGKLFISFSNNPNFKFSKIVYDVLGFLRLVFIPSMIVFFQDSTI DNLPLGQAYFNQAVIYMSVEFIIGSLFILILSKLFKHEVVSRNSFTLSGSSIYYIVFGLVICGIFVAFPEVRKNISFLII KTDAMGRGTEATSGLNVLFVMLFQLALALLFLIIAYASYKKYKENPKIIYVVLPLAIGILNISLIVGERRSYQLYTMVAV LTVVSLLFSKHKRRINIIIISVGIFVLALMTLYKELYVFNYSSYSEALNSTSVSNLKIVDTLQSYFYGPSNIAASIDYLN YYNGSFKQYLFDNTRAVFGFNFFVDKKQLITSQLFNQLIYGSKQLTGHLISSAGYGIIYFGPLFFYLNLIANIFFAFLSE YIIRKSHSLEVIFIGTYIYMRLITSIFSHPTPLITLISMILVVYVIAIIPGIIIKKFTKKVGIE >Mature_464_residues MNKVYNVTSYVIAILIFPCLMLGDKPLLFLAPISYGVGKLFISFSNNPNFKFSKIVYDVLGFLRLVFIPSMIVFFQDSTI DNLPLGQAYFNQAVIYMSVEFIIGSLFILILSKLFKHEVVSRNSFTLSGSSIYYIVFGLVICGIFVAFPEVRKNISFLII KTDAMGRGTEATSGLNVLFVMLFQLALALLFLIIAYASYKKYKENPKIIYVVLPLAIGILNISLIVGERRSYQLYTMVAV LTVVSLLFSKHKRRINIIIISVGIFVLALMTLYKELYVFNYSSYSEALNSTSVSNLKIVDTLQSYFYGPSNIAASIDYLN YYNGSFKQYLFDNTRAVFGFNFFVDKKQLITSQLFNQLIYGSKQLTGHLISSAGYGIIYFGPLFFYLNLIANIFFAFLSE YIIRKSHSLEVIFIGTYIYMRLITSIFSHPTPLITLISMILVVYVIAIIPGIIIKKFTKKVGIE
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 52599; Mature: 52599
Theoretical pI: Translated: 9.85; Mature: 9.85
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 2.2 %Met (Translated Protein) 2.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 2.2 %Met (Mature Protein) 2.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNKVYNVTSYVIAILIFPCLMLGDKPLLFLAPISYGVGKLFISFSNNPNFKFSKIVYDVL CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHH GFLRLVFIPSMIVFFQDSTIDNLPLGQAYFNQAVIYMSVEFIIGSLFILILSKLFKHEVV HHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SRNSFTLSGSSIYYIVFGLVICGIFVAFPEVRKNISFLIIKTDAMGRGTEATSGLNVLFV CCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHH MLFQLALALLFLIIAYASYKKYKENPKIIYVVLPLAIGILNISLIVGERRSYQLYTMVAV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHH LTVVSLLFSKHKRRINIIIISVGIFVLALMTLYKELYVFNYSSYSEALNSTSVSNLKIVD HHHHHHHHHHCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCHHHH TLQSYFYGPSNIAASIDYLNYYNGSFKQYLFDNTRAVFGFNFFVDKKQLITSQLFNQLIY HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCEEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHH GSKQLTGHLISSAGYGIIYFGPLFFYLNLIANIFFAFLSEYIIRKSHSLEVIFIGTYIYM CCHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHH RLITSIFSHPTPLITLISMILVVYVIAIIPGIIIKKFTKKVGIE HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MNKVYNVTSYVIAILIFPCLMLGDKPLLFLAPISYGVGKLFISFSNNPNFKFSKIVYDVL CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHH GFLRLVFIPSMIVFFQDSTIDNLPLGQAYFNQAVIYMSVEFIIGSLFILILSKLFKHEVV HHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SRNSFTLSGSSIYYIVFGLVICGIFVAFPEVRKNISFLIIKTDAMGRGTEATSGLNVLFV CCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHH MLFQLALALLFLIIAYASYKKYKENPKIIYVVLPLAIGILNISLIVGERRSYQLYTMVAV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHH LTVVSLLFSKHKRRINIIIISVGIFVLALMTLYKELYVFNYSSYSEALNSTSVSNLKIVD HHHHHHHHHHCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCHHHH TLQSYFYGPSNIAASIDYLNYYNGSFKQYLFDNTRAVFGFNFFVDKKQLITSQLFNQLIY HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCEEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHH GSKQLTGHLISSAGYGIIYFGPLFFYLNLIANIFFAFLSEYIIRKSHSLEVIFIGTYIYM CCHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHH RLITSIFSHPTPLITLISMILVVYVIAIIPGIIIKKFTKKVGIE HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA