| Definition | Shigella boydii Sb227, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007613 |
| Length | 4,519,823 |
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The map label for this gene is wzy
Identifier: 82543411
GI number: 82543411
Start: 874635
End: 875927
Strand: Reverse
Name: wzy
Synonym: SBO_0860
Alternate gene names: NA
Gene position: 875927-874635 (Counterclockwise)
Preceding gene: 82543412
Following gene: 82543410
Centisome position: 19.38
GC content: 28.07
Gene sequence:
>1293_bases ATGCTAGCTTGGGCACCAAAGTTGTTATTGCTGTTTTTTTTATTGTCTGGATTAATTAAGGCTATATCATTGTATATAAA TATTAATCTTAATTATGTGTTTATTCCTCTATTAATATTAGCCTCTCTGTTTTATCTGTTAATTAACAGAACAATAAAAA TGAAAGCTCAAGGGGCATGTTTTATATTTTTCTTTTCCATATCTGCAATTTTGTTTCTTGTAAATAACATCGTTGTTAAT AATGTTTATACACAATTACAATTAATGCTTGCAGTAACGATACAATATATTTTTCCAATTATAATCATTTGTTTAGCCGG TTCGGGAAAGTTGAAATTGGATATTTTTGACTCTTTGATTAATATAATAACAAAGCTTACCTTTTTATCACTTTTAATAT TTGGGTTATGTGTGATGTATGACTCTAAAATGGTTGAAGAGTTTTATTCGCAATTATACAATCATGGTTTAATAATTAAT CCATTTCAAACAAGTGAAGAAGGTATTACTCTTCGTTTTAGTGGGATATTTTCATCTGGGTTTATCTTAGCTAGTTATTG TTGCTTTGCAATAATTTATTATTATTTTAATAAATCTGTCAATCGTATAAAGTTTGCTTTTCTATTTGTTGGTTTTGTCA TAATGGTTGTTTTGACATATAATAGAAACGGGATGTTGGCATTTGCAGTTACATCTTTATTTATAATGATTCATACTTAC CTTCGTCGATACTATCTAACTCTTGCGAATTTATATTATGTTTTTTTGATTGGAATATTGTTCATAGCACCAAGTTTTAT ATTATACTTTGGTGGTGACATTCAGAATTCATATTCTTCTATAGATTATTCAGCTTTTACAAAATTGAGTACATTATTCT CTCGTATAGATGCCTGGCTTCAGGTTTTGAATATTAATGACGTCTCTCGTTTATTATTTGGTTCCGGTTTAGTGCAGGGG TTAGGGGAAGATGATATGAATTTTTACGTCGATAATGGTTATTTATATCTTTTGCATCAGAGTGGTCTTATAGCTCTTGT TTTATATATCGCTACTTGGAGTTACATGTTTATTTCTCTCTCTAAAAACTTAAAGAAAAGACGAAACCATAATTTTGTTT CAGTAGATGAAATAAATATATGCTTACTTCTTATTCTTGTAAGTTTCACCTTGGCACTCCTTAATAATCTATTTTTTGAA CCCGTATTTCTAATTCTTGTATTAATGAAATGTGTAACTGTGAATAATAAATCAAGTAGTATTTATGAAAAAAATGAACA AACATATGAGTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AAGTAGTAAAAAAGTCAGAATACAACTAGATCTCGATATAAATTTCAAGAAAATTGATAGTTACTTTAAGGCTAGATATA ATAACAAGAGGAATTAATTT
Downstream 100 bases:
>100_bases TACCGCCATTATTGGTACTGTAGGTGTTCCTGCTTCGTATGGAGGGTTTGAAACACTTGTTGAAAATTTAATTGAAACTG AAAAGGTTAATTATATTGTT
Product: O-antigen polymerase
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 430; Mature: 430
Protein sequence:
>430_residues MLAWAPKLLLLFFLLSGLIKAISLYININLNYVFIPLLILASLFYLLINRTIKMKAQGACFIFFFSISAILFLVNNIVVN NVYTQLQLMLAVTIQYIFPIIIICLAGSGKLKLDIFDSLINIITKLTFLSLLIFGLCVMYDSKMVEEFYSQLYNHGLIIN PFQTSEEGITLRFSGIFSSGFILASYCCFAIIYYYFNKSVNRIKFAFLFVGFVIMVVLTYNRNGMLAFAVTSLFIMIHTY LRRYYLTLANLYYVFLIGILFIAPSFILYFGGDIQNSYSSIDYSAFTKLSTLFSRIDAWLQVLNINDVSRLLFGSGLVQG LGEDDMNFYVDNGYLYLLHQSGLIALVLYIATWSYMFISLSKNLKKRRNHNFVSVDEINICLLLILVSFTLALLNNLFFE PVFLILVLMKCVTVNNKSSSIYEKNEQTYE
Sequences:
>Translated_430_residues MLAWAPKLLLLFFLLSGLIKAISLYININLNYVFIPLLILASLFYLLINRTIKMKAQGACFIFFFSISAILFLVNNIVVN NVYTQLQLMLAVTIQYIFPIIIICLAGSGKLKLDIFDSLINIITKLTFLSLLIFGLCVMYDSKMVEEFYSQLYNHGLIIN PFQTSEEGITLRFSGIFSSGFILASYCCFAIIYYYFNKSVNRIKFAFLFVGFVIMVVLTYNRNGMLAFAVTSLFIMIHTY LRRYYLTLANLYYVFLIGILFIAPSFILYFGGDIQNSYSSIDYSAFTKLSTLFSRIDAWLQVLNINDVSRLLFGSGLVQG LGEDDMNFYVDNGYLYLLHQSGLIALVLYIATWSYMFISLSKNLKKRRNHNFVSVDEINICLLLILVSFTLALLNNLFFE PVFLILVLMKCVTVNNKSSSIYEKNEQTYE >Mature_430_residues MLAWAPKLLLLFFLLSGLIKAISLYININLNYVFIPLLILASLFYLLINRTIKMKAQGACFIFFFSISAILFLVNNIVVN NVYTQLQLMLAVTIQYIFPIIIICLAGSGKLKLDIFDSLINIITKLTFLSLLIFGLCVMYDSKMVEEFYSQLYNHGLIIN PFQTSEEGITLRFSGIFSSGFILASYCCFAIIYYYFNKSVNRIKFAFLFVGFVIMVVLTYNRNGMLAFAVTSLFIMIHTY LRRYYLTLANLYYVFLIGILFIAPSFILYFGGDIQNSYSSIDYSAFTKLSTLFSRIDAWLQVLNINDVSRLLFGSGLVQG LGEDDMNFYVDNGYLYLLHQSGLIALVLYIATWSYMFISLSKNLKKRRNHNFVSVDEINICLLLILVSFTLALLNNLFFE PVFLILVLMKCVTVNNKSSSIYEKNEQTYE
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 49343; Mature: 49343
Theoretical pI: Translated: 8.70; Mature: 8.70
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.6 %Cys (Translated Protein) 2.6 %Met (Translated Protein) 4.2 %Cys+Met (Translated Protein) 1.6 %Cys (Mature Protein) 2.6 %Met (Mature Protein) 4.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLAWAPKLLLLFFLLSGLIKAISLYININLNYVFIPLLILASLFYLLINRTIKMKAQGAC CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEECCCCH FIFFFSISAILFLVNNIVVNNVYTQLQLMLAVTIQYIFPIIIICLAGSGKLKLDIFDSLI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHH NIITKLTFLSLLIFGLCVMYDSKMVEEFYSQLYNHGLIINPFQTSEEGITLRFSGIFSSG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCCCCCCEEEEEECCHHCH FILASYCCFAIIYYYFNKSVNRIKFAFLFVGFVIMVVLTYNRNGMLAFAVTSLFIMIHTY HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH LRRYYLTLANLYYVFLIGILFIAPSFILYFGGDIQNSYSSIDYSAFTKLSTLFSRIDAWL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH QVLNINDVSRLLFGSGLVQGLGEDDMNFYVDNGYLYLLHQSGLIALVLYIATWSYMFISL HHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH SKNLKKRRNHNFVSVDEINICLLLILVSFTLALLNNLFFEPVFLILVLMKCVTVNNKSSS HHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH IYEKNEQTYE HHHCCCCCCC >Mature Secondary Structure MLAWAPKLLLLFFLLSGLIKAISLYININLNYVFIPLLILASLFYLLINRTIKMKAQGAC CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEECCCCH FIFFFSISAILFLVNNIVVNNVYTQLQLMLAVTIQYIFPIIIICLAGSGKLKLDIFDSLI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHH NIITKLTFLSLLIFGLCVMYDSKMVEEFYSQLYNHGLIINPFQTSEEGITLRFSGIFSSG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCCCCCCEEEEEECCHHCH FILASYCCFAIIYYYFNKSVNRIKFAFLFVGFVIMVVLTYNRNGMLAFAVTSLFIMIHTY HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH LRRYYLTLANLYYVFLIGILFIAPSFILYFGGDIQNSYSSIDYSAFTKLSTLFSRIDAWL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH QVLNINDVSRLLFGSGLVQGLGEDDMNFYVDNGYLYLLHQSGLIALVLYIATWSYMFISL HHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH SKNLKKRRNHNFVSVDEINICLLLILVSFTLALLNNLFFEPVFLILVLMKCVTVNNKSSS HHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH IYEKNEQTYE HHHCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA