Definition Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20 chromosome, complete genome.
Accession NC_007519
Length 3,730,232

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The map label for this gene is 78355776

Identifier: 78355776

GI number: 78355776

Start: 751577

End: 753592

Strand: Reverse

Name: 78355776

Synonym: Dde_0729

Alternate gene names: NA

Gene position: 753592-751577 (Counterclockwise)

Preceding gene: 78355777

Following gene: 78355775

Centisome position: 20.2

GC content: 62.85

Gene sequence:

>2016_bases
ATGATACGGCTGCGCGCGCTCTTCACCGGTCTGGCGGTCAGCCTGTGCCTTTGTGCGGCCGTTCCTCTGCAAAGCGGCCT
TGCCGGAGGCGCCCCGCTGGGCGGAGGCCCCATGCCGGTGCTGCCTTTTGTGCTGGCCATGCTGCTGTATGCGGCCAGTG
CCGCATGGGCCCGGCTGCGCCATACCGCCCCGCCGCTCAGCGGCAACGAAATACTGGTCATCTGGCTGCTGACGGCACTG
GTTTCCGGCGTTGCATGGAGCGGACTCACGGAACATTTTCTGCTGCTGGTTACCGCGCCGCTGCGCTTTGTGCAGGAGGG
CCTGCCATGGCCCGACGCCATACGCCCGCTGCTGCCCCGCAGCTGGCTGCAGCACGACGCCGCAGCCGTACGCGACCTGT
ACAACGGTCTGCGCGACGGCCGTGCCATGTCGTGGTCAGCCGTTGCCGCCGCAATACCATGGCATGTCTGGCTGCCGCTG
CTGACGGTGTGGGTGGCGTTTATCCTGCTGTGTTACGCCACAATGATCTGCCTGATAAGCCTGTTCGGCCGCCAGTGGGT
GGATAACGAGCGCATGAACTTTCCGCTGCTGCGCGTGCCCCAGATGATGGGGGATGCGCTGGACACGGGACGCATGGGGC
AGTTTCTGACAGACAGATATCTGTGGTGGGGGCTTGCCGTGCCTGTAACCCTGCACATGATGAACGGCCTGCACTATGTG
ACCCCCGGCGTCCCCCAGATAGACACACTGGTGCTGGCAGGTAAATTTTTTCCCAAATACGGGCTGCTTTCCGGATTCCA
TAAGCTCAGAATATTTTTCATACCCGCTGTTATCGGCTTTGCTTTTCTTACCGCACGGCAGGTGTCGTTCAGCCTGTGGT
TTTTTCATCTGACCGGTCTGCTGCTGCTCGGCGTGCTGTACATAACCGGTCTGCAGGCCCCCGAAGCGGCGCTGGGGGTA
ACGCTGGGACCGGATTTCAGCCGTCCGGAGGAAGCACAGGCACTGGGTGCTTCGGTGATTTTTTTCTGTTTTCTGCTATG
GCTTGCACGCACGCACCTGCGCCGCGCGCTGGGGGCTGCCATACGTCCGGCCGCACACGCCGGCGGCAACGCCATGCATA
CGGCCGCTGGCGGAGAATGGATGAGTCCCGTCACCGCGCTGCGCGGCGCGCTTGCCGGTCTGGTGCTCATGGGGCTGTGG
TGCAGCTGGGCCGGCATTTCCCCCGCGGGAAGCCTGCTGCTGCCGCTGCTGTTTTTTCTGATGCTGCTGGTTGTCTCGCG
GCTTATCGCTCAGGGCGGACTGGCAGGTTTTTCGCTGGCAGCCGCTCCCACAGACGGCCTGACGGCCACGTCAGGCTCCG
GAATACTGGGCGGCACGGGCATAGCCGCCGCAGCAGTCATGCAGAAGCTGCTTTTTGCCGACATGCGCGAATCTGTCATG
CCGGTGCTGGTACATGGTGCCAAGGTAACCGGCACAGCCACGGAACACGCGGCTGTCCGCCCCGCAACGGCACGGCGGCG
GATACTCGCCGGTATGGCCGCAGCGCTTGTCATGGCGGTATGCGTTTCATTTTTTACCATGCTTCTGATGGCCTACCGTT
ACGGACTGCGTGACCTGCGGCTGGATTTTGCCTCACGCGCGGTGACGGCGACCTATGAAAACGCATGGAAGCTGCTGGAA
CTTCCGGCGGCAACCAGCGGCTGGACAACGGGATTCATCCTGCTGGGCATGGCAGTCATGGCCGTGCTTGTGCTGTGTTT
CACCCGTTTCTACTGGTGGCCGCTGCATCCGCTGGGCTATCTGGCGGCATATTCTCCGGCCCTGCGCACGCTGTGGTTCA
GCATAATGCTGGGATGGCTGTGCAACCAGCTGGTACTGCGCTACGGCGGCACGCGGCTGTACCGCCGCATCCAGCTGCTG
TTTGCGGGGCTAGTGGCCGGAGATTTCATCATGGCGGGCGTGTGGGCGGCGGTGTCCGCCTTTACCGGCAATCCTTACCG
GGTATTCCCGTTTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGGAAGCGGTTCTTGCCGCGCAGGGACGCGGTCTTCCGCCCGAGGCGGCAACGCAGCGTGCTTTGTCCGGCACGGATAAC
GACAACCGGGGAGGAAAGGC

Downstream 100 bases:

>100_bases
GCGGACTTGATGTATCAGGACAAGGAACTGCGTGAATACCGCGATCTTCTCACGCCACCGTCGCACTTTGAAGAAGGCTT
CGGATGGAAGACCGTCATCG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 671; Mature: 671

Protein sequence:

>671_residues
MIRLRALFTGLAVSLCLCAAVPLQSGLAGGAPLGGGPMPVLPFVLAMLLYAASAAWARLRHTAPPLSGNEILVIWLLTAL
VSGVAWSGLTEHFLLLVTAPLRFVQEGLPWPDAIRPLLPRSWLQHDAAAVRDLYNGLRDGRAMSWSAVAAAIPWHVWLPL
LTVWVAFILLCYATMICLISLFGRQWVDNERMNFPLLRVPQMMGDALDTGRMGQFLTDRYLWWGLAVPVTLHMMNGLHYV
TPGVPQIDTLVLAGKFFPKYGLLSGFHKLRIFFIPAVIGFAFLTARQVSFSLWFFHLTGLLLLGVLYITGLQAPEAALGV
TLGPDFSRPEEAQALGASVIFFCFLLWLARTHLRRALGAAIRPAAHAGGNAMHTAAGGEWMSPVTALRGALAGLVLMGLW
CSWAGISPAGSLLLPLLFFLMLLVVSRLIAQGGLAGFSLAAAPTDGLTATSGSGILGGTGIAAAAVMQKLLFADMRESVM
PVLVHGAKVTGTATEHAAVRPATARRRILAGMAAALVMAVCVSFFTMLLMAYRYGLRDLRLDFASRAVTATYENAWKLLE
LPAATSGWTTGFILLGMAVMAVLVLCFTRFYWWPLHPLGYLAAYSPALRTLWFSIMLGWLCNQLVLRYGGTRLYRRIQLL
FAGLVAGDFIMAGVWAAVSAFTGNPYRVFPF

Sequences:

>Translated_671_residues
MIRLRALFTGLAVSLCLCAAVPLQSGLAGGAPLGGGPMPVLPFVLAMLLYAASAAWARLRHTAPPLSGNEILVIWLLTAL
VSGVAWSGLTEHFLLLVTAPLRFVQEGLPWPDAIRPLLPRSWLQHDAAAVRDLYNGLRDGRAMSWSAVAAAIPWHVWLPL
LTVWVAFILLCYATMICLISLFGRQWVDNERMNFPLLRVPQMMGDALDTGRMGQFLTDRYLWWGLAVPVTLHMMNGLHYV
TPGVPQIDTLVLAGKFFPKYGLLSGFHKLRIFFIPAVIGFAFLTARQVSFSLWFFHLTGLLLLGVLYITGLQAPEAALGV
TLGPDFSRPEEAQALGASVIFFCFLLWLARTHLRRALGAAIRPAAHAGGNAMHTAAGGEWMSPVTALRGALAGLVLMGLW
CSWAGISPAGSLLLPLLFFLMLLVVSRLIAQGGLAGFSLAAAPTDGLTATSGSGILGGTGIAAAAVMQKLLFADMRESVM
PVLVHGAKVTGTATEHAAVRPATARRRILAGMAAALVMAVCVSFFTMLLMAYRYGLRDLRLDFASRAVTATYENAWKLLE
LPAATSGWTTGFILLGMAVMAVLVLCFTRFYWWPLHPLGYLAAYSPALRTLWFSIMLGWLCNQLVLRYGGTRLYRRIQLL
FAGLVAGDFIMAGVWAAVSAFTGNPYRVFPF
>Mature_671_residues
MIRLRALFTGLAVSLCLCAAVPLQSGLAGGAPLGGGPMPVLPFVLAMLLYAASAAWARLRHTAPPLSGNEILVIWLLTAL
VSGVAWSGLTEHFLLLVTAPLRFVQEGLPWPDAIRPLLPRSWLQHDAAAVRDLYNGLRDGRAMSWSAVAAAIPWHVWLPL
LTVWVAFILLCYATMICLISLFGRQWVDNERMNFPLLRVPQMMGDALDTGRMGQFLTDRYLWWGLAVPVTLHMMNGLHYV
TPGVPQIDTLVLAGKFFPKYGLLSGFHKLRIFFIPAVIGFAFLTARQVSFSLWFFHLTGLLLLGVLYITGLQAPEAALGV
TLGPDFSRPEEAQALGASVIFFCFLLWLARTHLRRALGAAIRPAAHAGGNAMHTAAGGEWMSPVTALRGALAGLVLMGLW
CSWAGISPAGSLLLPLLFFLMLLVVSRLIAQGGLAGFSLAAAPTDGLTATSGSGILGGTGIAAAAVMQKLLFADMRESVM
PVLVHGAKVTGTATEHAAVRPATARRRILAGMAAALVMAVCVSFFTMLLMAYRYGLRDLRLDFASRAVTATYENAWKLLE
LPAATSGWTTGFILLGMAVMAVLVLCFTRFYWWPLHPLGYLAAYSPALRTLWFSIMLGWLCNQLVLRYGGTRLYRRIQLL
FAGLVAGDFIMAGVWAAVSAFTGNPYRVFPF

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 72718; Mature: 72718

Theoretical pI: Translated: 10.11; Mature: 10.11

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
3.9 %Met     (Translated Protein)
5.2 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
3.9 %Met     (Mature Protein)
5.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIRLRALFTGLAVSLCLCAAVPLQSGLAGGAPLGGGPMPVLPFVLAMLLYAASAAWARLR
CEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HTAPPLSGNEILVIWLLTALVSGVAWSGLTEHFLLLVTAPLRFVQEGLPWPDAIRPLLPR
HCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCH
SWLQHDAAAVRDLYNGLRDGRAMSWSAVAAAIPWHVWLPLLTVWVAFILLCYATMICLIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFGRQWVDNERMNFPLLRVPQMMGDALDTGRMGQFLTDRYLWWGLAVPVTLHMMNGLHYV
HHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEC
TPGVPQIDTLVLAGKFFPKYGLLSGFHKLRIFFIPAVIGFAFLTARQVSFSLWFFHLTGL
CCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLLGVLYITGLQAPEAALGVTLGPDFSRPEEAQALGASVIFFCFLLWLARTHLRRALGAA
HHHHHHHHHCCCCCHHHHCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IRPAAHAGGNAMHTAAGGEWMSPVTALRGALAGLVLMGLWCSWAGISPAGSLLLPLLFFL
HCCHHHCCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH
MLLVVSRLIAQGGLAGFSLAAAPTDGLTATSGSGILGGTGIAAAAVMQKLLFADMRESVM
HHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PVLVHGAKVTGTATEHAAVRPATARRRILAGMAAALVMAVCVSFFTMLLMAYRYGLRDLR
HHHHCCCEEECCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHH
LDFASRAVTATYENAWKLLELPAATSGWTTGFILLGMAVMAVLVLCFTRFYWWPLHPLGY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
LAAYSPALRTLWFSIMLGWLCNQLVLRYGGTRLYRRIQLLFAGLVAGDFIMAGVWAAVSA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FTGNPYRVFPF
HCCCCEEECCC
>Mature Secondary Structure
MIRLRALFTGLAVSLCLCAAVPLQSGLAGGAPLGGGPMPVLPFVLAMLLYAASAAWARLR
CEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HTAPPLSGNEILVIWLLTALVSGVAWSGLTEHFLLLVTAPLRFVQEGLPWPDAIRPLLPR
HCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCH
SWLQHDAAAVRDLYNGLRDGRAMSWSAVAAAIPWHVWLPLLTVWVAFILLCYATMICLIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFGRQWVDNERMNFPLLRVPQMMGDALDTGRMGQFLTDRYLWWGLAVPVTLHMMNGLHYV
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TPGVPQIDTLVLAGKFFPKYGLLSGFHKLRIFFIPAVIGFAFLTARQVSFSLWFFHLTGL
CCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLLGVLYITGLQAPEAALGVTLGPDFSRPEEAQALGASVIFFCFLLWLARTHLRRALGAA
HHHHHHHHHCCCCCHHHHCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IRPAAHAGGNAMHTAAGGEWMSPVTALRGALAGLVLMGLWCSWAGISPAGSLLLPLLFFL
HCCHHHCCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH
MLLVVSRLIAQGGLAGFSLAAAPTDGLTATSGSGILGGTGIAAAAVMQKLLFADMRESVM
HHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PVLVHGAKVTGTATEHAAVRPATARRRILAGMAAALVMAVCVSFFTMLLMAYRYGLRDLR
HHHHCCCEEECCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHH
LDFASRAVTATYENAWKLLELPAATSGWTTGFILLGMAVMAVLVLCFTRFYWWPLHPLGY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
LAAYSPALRTLWFSIMLGWLCNQLVLRYGGTRLYRRIQLLFAGLVAGDFIMAGVWAAVSA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FTGNPYRVFPF
HCCCCEEECCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA