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The map label for this gene is 78189817

Identifier: 78189817

GI number: 78189817

Start: 2370424

End: 2371914

Strand: Reverse

Name: 78189817

Synonym: Cag_1862

Alternate gene names: NA

Gene position: 2371914-2370424 (Counterclockwise)

Preceding gene: 78189818

Following gene: 78189814

Centisome position: 92.22

GC content: 49.3

Gene sequence:

>1491_bases
ATGAGCCGAAATTCGTTAGTTGCAGGGCAGGCAGGATTTGCCTTTGCGGGATTGCTCTTTGGGCAACTGATGCGCTTTGG
TTATAACCTTGTGGTTGCCCGCTTGCTTGGCGTAGAAGCGCTTGGCATTTATGCGCTTGCCATCGCTGTTATGCAAGTTG
CTGAAGTGGTTGCGCTTGCAGGGTGCGATGCATCACTGCTTCGTTTTGTCAACCTCTACCACAACGATGCCGCACGTCAA
CGCCAAGTGATTGGCTTTGCCGCTAAAAGTAGCTTACTCTTCTCGCTTGCTGTTATGGCGTTGCTGATGCTCTTTGCCAA
TCAACTCTCAGCGCTTTTCCACGGCAATGAACTGCTGACGTTGGCACTCTCCTGCTATGCAGCCGCCTTGCCATTCAATG
TGTTAACACAGGTTACAGCGCACGCCTTGCAAGCATTTCAGCACTTAAAGCCGAAAATTATTGCCACGCAACTGCTCAGT
CCATTGCTTTTGCTGCTCTTCACCTTGCTTTTTTATTATACCGTTGGCATACAAGCGGCATTGCTTATGCCCTTTCTCCT
TTCAGCATGTGGCGCATTGCTCTGGATTCTTCTACCATTTGCCACAACCACCGGCATTCGCTTTATTGACATTGTACGCG
CTCGGCACGATAACGCCATGCTAACCTATGCCTTGCCACTTATGGCAGTCTCGCTCTTTAGTATGCTAAGCCACTGGCTT
GATGTGATGATGCTTGGCATCTTTAGCGATGCAGTTACCGTTGGATTGTACCATCCAGCCGCAAGAACCGCAGGCTTGTT
ACGCTCCGTGCTTTTGGCATTTGCAGGCATTGCCGCACCGCTTTTTGCAGAGCTTCACGCACAAGGCAACAAAGCCGAAA
TGGCTCGTCTCTACAAATTAGTTACACGCTGGAGCGTTATCCTCCTTATTCCCCCTCTCTTGATTTTTATGGTGCTACCG
CAGCAAGTACTTTCGCTTTTTGGCGCCCACTTTGCCGATAGCGGAGCTGTAGCCTTGCAACTCTTAAGCGCCGCATATTT
TGTACAATGCGTTTTTGGCATTGCCTCCACCCTGCTTGCTATGAGCGGCTATGCTCAACTCAGCCTCATAAACGCCGTTG
TAGCACTTGCCTTACAAGCAGGCTTAAATTGGCTTTTTATTCCAACAATGGGATTACAAGGCGCAGCCGTTGCATCGTTA
GTGCTCTTTCTCTTGCTCTCAGCACTTCGATGGCTGGAAGTTCGCCTCTTATTGCAGATGAATCCATTAAGCACCATGTT
GTGGAAGCCGCTCGTTGCTGGAGCTGTTACCTTCTTGCTACTCATGCTCATGCACTCGTGGTTGCTCATGCTGCCATCGT
TGCTGGCGCTTGGGGTTGGAACCGTTATTGCCTTTAGCTGTTATGTGGCTCTGATGTTGATGCTGAAGTTGGAAGTGGAT
GAGAAGGAGATTATTTTCAAGTATCTGCCTTTTATGAGGAAGGATGGATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTCGTGAAGCACGGCAGGCATTTGCAAAGCAGCATAGCTGGGATGCACTTGCGGCTACGATGGTTCACGAGTTACAACAT
GCTTGGCAGGAGAGTGCGCC

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGGGAGGACTTATAACGCTTAAGAGCAGTCGCCGCCCGCCTTCACTGAGCCTAAAATACAGAAGAAGCTGCATGGCGGTC
GGTTGGACTGGAGCGCAATG

Product: polysaccharide efflux transporter

Products: NA

Alternate protein names: Polysaccharide Efflux Transporter; Heteropolysaccharide Repeat-Containing Protein; Polysaccharide Biosynthesis Related Protein; Capsular Polysaccharide Biosynthesis Protein; Polysaccharide Biosynthesis-Like Protein; Polysaccharide Biosynthesis Associated Protein; Polysaccharide Biosynthesis Transporter

Number of amino acids: Translated: 496; Mature: 495

Protein sequence:

>496_residues
MSRNSLVAGQAGFAFAGLLFGQLMRFGYNLVVARLLGVEALGIYALAIAVMQVAEVVALAGCDASLLRFVNLYHNDAARQ
RQVIGFAAKSSLLFSLAVMALLMLFANQLSALFHGNELLTLALSCYAAALPFNVLTQVTAHALQAFQHLKPKIIATQLLS
PLLLLLFTLLFYYTVGIQAALLMPFLLSACGALLWILLPFATTTGIRFIDIVRARHDNAMLTYALPLMAVSLFSMLSHWL
DVMMLGIFSDAVTVGLYHPAARTAGLLRSVLLAFAGIAAPLFAELHAQGNKAEMARLYKLVTRWSVILLIPPLLIFMVLP
QQVLSLFGAHFADSGAVALQLLSAAYFVQCVFGIASTLLAMSGYAQLSLINAVVALALQAGLNWLFIPTMGLQGAAVASL
VLFLLLSALRWLEVRLLLQMNPLSTMLWKPLVAGAVTFLLLMLMHSWLLMLPSLLALGVGTVIAFSCYVALMLMLKLEVD
EKEIIFKYLPFMRKDG

Sequences:

>Translated_496_residues
MSRNSLVAGQAGFAFAGLLFGQLMRFGYNLVVARLLGVEALGIYALAIAVMQVAEVVALAGCDASLLRFVNLYHNDAARQ
RQVIGFAAKSSLLFSLAVMALLMLFANQLSALFHGNELLTLALSCYAAALPFNVLTQVTAHALQAFQHLKPKIIATQLLS
PLLLLLFTLLFYYTVGIQAALLMPFLLSACGALLWILLPFATTTGIRFIDIVRARHDNAMLTYALPLMAVSLFSMLSHWL
DVMMLGIFSDAVTVGLYHPAARTAGLLRSVLLAFAGIAAPLFAELHAQGNKAEMARLYKLVTRWSVILLIPPLLIFMVLP
QQVLSLFGAHFADSGAVALQLLSAAYFVQCVFGIASTLLAMSGYAQLSLINAVVALALQAGLNWLFIPTMGLQGAAVASL
VLFLLLSALRWLEVRLLLQMNPLSTMLWKPLVAGAVTFLLLMLMHSWLLMLPSLLALGVGTVIAFSCYVALMLMLKLEVD
EKEIIFKYLPFMRKDG
>Mature_495_residues
SRNSLVAGQAGFAFAGLLFGQLMRFGYNLVVARLLGVEALGIYALAIAVMQVAEVVALAGCDASLLRFVNLYHNDAARQR
QVIGFAAKSSLLFSLAVMALLMLFANQLSALFHGNELLTLALSCYAAALPFNVLTQVTAHALQAFQHLKPKIIATQLLSP
LLLLLFTLLFYYTVGIQAALLMPFLLSACGALLWILLPFATTTGIRFIDIVRARHDNAMLTYALPLMAVSLFSMLSHWLD
VMMLGIFSDAVTVGLYHPAARTAGLLRSVLLAFAGIAAPLFAELHAQGNKAEMARLYKLVTRWSVILLIPPLLIFMVLPQ
QVLSLFGAHFADSGAVALQLLSAAYFVQCVFGIASTLLAMSGYAQLSLINAVVALALQAGLNWLFIPTMGLQGAAVASLV
LFLLLSALRWLEVRLLLQMNPLSTMLWKPLVAGAVTFLLLMLMHSWLLMLPSLLALGVGTVIAFSCYVALMLMLKLEVDE
KEIIFKYLPFMRKDG

Specific function: Unknown

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 53883; Mature: 53752

Theoretical pI: Translated: 9.42; Mature: 9.42

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
4.6 %Met     (Translated Protein)
5.6 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
4.4 %Met     (Mature Protein)
5.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
SRNSLVAGQAGFAFAGLLFGQLMRFGYNLVVARLLGVEALGIYALAIAVMQVAEVVALA
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH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HHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA