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The map label for this gene is 78189728

Identifier: 78189728

GI number: 78189728

Start: 2288369

End: 2290090

Strand: Reverse

Name: 78189728

Synonym: Cag_1772

Alternate gene names: NA

Gene position: 2290090-2288369 (Counterclockwise)

Preceding gene: 78189729

Following gene: 78189727

Centisome position: 89.04

GC content: 31.13

Gene sequence:

>1722_bases
ATGTTAACAAATATTACCATTGAAAATTTCAAAAAGCTTGAGCGCATTTCGTTTCCACTTTCACAATCGGTAGTAATTAT
TGGGCCTAATAATTCCGGAAAATCTACCATTTTTCAAGCACTCTGTTTATGGGAAATAGGTGTTAAAAATTATATAGCAG
CTTATCAAAAAAATGATTTAAATCGGCAAGGTACTATAACTATTAATAGACGAGACCTCTTAAATAGCCCTATTGCTGAT
GCTCGTTTTTTATGGAAAAGTAAGAAAGTAACACAACGAAATATTTCCGGTGCCGGACAAAAACATGTGCCACTTTCAAT
TGAATTAGAAGGTGATAACAATGGAGTACAATGGTCATGTCAAGCTGAATTTACCTTTTCAAATTCTGAATCCTTTTCAT
GTAAAATTTGCACAGGATTGCAACAAATGGTTGAGCTTTATGAAAATGAGCATGGACTCCATTTTGGATTTTTACAGCCA
ATGTCGGGTATTTCAACAACGGAAGACAAACTTACAAAAGGCTCAATTGATAGAAAATTAGGAGAAGGTAAAACTGCCGA
AGTATTAAGAAATATTTGTTTTGAAATATTAAATCCCGAAACAGCTTCTAAAAATAGAAATAATGCAGAAAATAATTGGC
TACAATTATGTAATGTAATAAAGGTAATGTTTGGGGTAATTTTACAAAAGCCGGAGTTTATAAAAGCTACAGGATTAATA
AGTTTAGAGTATATAGAAAACAATATAAAATATGATATTTCCTCCGGTGGTCGAGGTTTTCAACAAACCCTATTACTTTT
TTCATATATGTTCGCAAATCCAAATACTATATTATTGCTTGATGAACCGGATGCACATTTAGAAGTTATAAGGCAACGAG
AGGTGTTTCAAAAAATTAATGATATTGCAACTATAACAAATTCTCAGCTATTAGTTGCCTCACACTCTGAGGTGGTATTA
GATGAAGCGGCTGAAGCCTCAAAAGTTATAGCATTAATTGAAAATCAAACATTTGAAGTTAATACATCAACAAACAGCAA
ATCAATTCAATATATTAAAAAAGCATTAACGGAAATTGGTTGGGAAAAATATTATTTAGCTAAATCGAAAGGGCATATTC
TTTATCTTGAGGGATCAACCGATTTACAAATGTTACTTGCTTTTGCAACAGCATTAAACCATAACGTTGCAGCATTGCTG
CGCTTTGCAAATGTAAGCTATACCTCCGATAACGTCCCAAATACTGCTGTTGCTAATTTTGTTGCATTAAAAGAAATATT
CCCTGAACTTAAAGGATTAGCTATTTTTGATAAAATAGAAAAAAATCTTAATGATATTAAACCGCTTACAGTGGTTTGTT
GGCAAAAAAGAGAGCTTGAGAATTATTTTGCACGACCATATTTGCTTATAAAATATGCACAGTCGTTGCATGAAAAGTAT
GAACAATTCTCTTTAGAGCAGTTAGAAAAAGCTATGAAAAAAGCTATTGAAGATTTTACCTTACGAGCATATCTTAATGA
TTTAAACCATAATTGGTGGAATAGCGCTAAATTATCAAGTGAATGGTTGGATAATATTTTTCCTGAGTTTTATAAACAAT
TGAATGTACCTTTAAATTTTTATAAAAGAGATTATTATCAATTAATTGCATTAATGGAAAGGCAAGATATTGCTGATGAA
ATAGTTGACAAACTTGATTTAATCTATGAAATACTTAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTCCTCAGGTGATTGGTAAGGTAGCGGCTGTAGCGTCATGCTTTACCACCTATTCCCATAAAAAAATGGCAATTTTACTG
ATTTTTAAACAACAAAGCAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
GAAAGATTTGCATAACATTACTACCCATAACAAGAACAATGACTTTTGCAGACTTTTCTGAAAAAAAGTTTCCTATAAAA
ATACAGACAATGAAACATCC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: SMC Domain Protein; ATPase; SMC Domain-Containing Protein; Initiation Factor 2 Associated Domain-Containing Protein

Number of amino acids: Translated: 573; Mature: 573

Protein sequence:

>573_residues
MLTNITIENFKKLERISFPLSQSVVIIGPNNSGKSTIFQALCLWEIGVKNYIAAYQKNDLNRQGTITINRRDLLNSPIAD
ARFLWKSKKVTQRNISGAGQKHVPLSIELEGDNNGVQWSCQAEFTFSNSESFSCKICTGLQQMVELYENEHGLHFGFLQP
MSGISTTEDKLTKGSIDRKLGEGKTAEVLRNICFEILNPETASKNRNNAENNWLQLCNVIKVMFGVILQKPEFIKATGLI
SLEYIENNIKYDISSGGRGFQQTLLLFSYMFANPNTILLLDEPDAHLEVIRQREVFQKINDIATITNSQLLVASHSEVVL
DEAAEASKVIALIENQTFEVNTSTNSKSIQYIKKALTEIGWEKYYLAKSKGHILYLEGSTDLQMLLAFATALNHNVAALL
RFANVSYTSDNVPNTAVANFVALKEIFPELKGLAIFDKIEKNLNDIKPLTVVCWQKRELENYFARPYLLIKYAQSLHEKY
EQFSLEQLEKAMKKAIEDFTLRAYLNDLNHNWWNSAKLSSEWLDNIFPEFYKQLNVPLNFYKRDYYQLIALMERQDIADE
IVDKLDLIYEILK

Sequences:

>Translated_573_residues
MLTNITIENFKKLERISFPLSQSVVIIGPNNSGKSTIFQALCLWEIGVKNYIAAYQKNDLNRQGTITINRRDLLNSPIAD
ARFLWKSKKVTQRNISGAGQKHVPLSIELEGDNNGVQWSCQAEFTFSNSESFSCKICTGLQQMVELYENEHGLHFGFLQP
MSGISTTEDKLTKGSIDRKLGEGKTAEVLRNICFEILNPETASKNRNNAENNWLQLCNVIKVMFGVILQKPEFIKATGLI
SLEYIENNIKYDISSGGRGFQQTLLLFSYMFANPNTILLLDEPDAHLEVIRQREVFQKINDIATITNSQLLVASHSEVVL
DEAAEASKVIALIENQTFEVNTSTNSKSIQYIKKALTEIGWEKYYLAKSKGHILYLEGSTDLQMLLAFATALNHNVAALL
RFANVSYTSDNVPNTAVANFVALKEIFPELKGLAIFDKIEKNLNDIKPLTVVCWQKRELENYFARPYLLIKYAQSLHEKY
EQFSLEQLEKAMKKAIEDFTLRAYLNDLNHNWWNSAKLSSEWLDNIFPEFYKQLNVPLNFYKRDYYQLIALMERQDIADE
IVDKLDLIYEILK
>Mature_573_residues
MLTNITIENFKKLERISFPLSQSVVIIGPNNSGKSTIFQALCLWEIGVKNYIAAYQKNDLNRQGTITINRRDLLNSPIAD
ARFLWKSKKVTQRNISGAGQKHVPLSIELEGDNNGVQWSCQAEFTFSNSESFSCKICTGLQQMVELYENEHGLHFGFLQP
MSGISTTEDKLTKGSIDRKLGEGKTAEVLRNICFEILNPETASKNRNNAENNWLQLCNVIKVMFGVILQKPEFIKATGLI
SLEYIENNIKYDISSGGRGFQQTLLLFSYMFANPNTILLLDEPDAHLEVIRQREVFQKINDIATITNSQLLVASHSEVVL
DEAAEASKVIALIENQTFEVNTSTNSKSIQYIKKALTEIGWEKYYLAKSKGHILYLEGSTDLQMLLAFATALNHNVAALL
RFANVSYTSDNVPNTAVANFVALKEIFPELKGLAIFDKIEKNLNDIKPLTVVCWQKRELENYFARPYLLIKYAQSLHEKY
EQFSLEQLEKAMKKAIEDFTLRAYLNDLNHNWWNSAKLSSEWLDNIFPEFYKQLNVPLNFYKRDYYQLIALMERQDIADE
IVDKLDLIYEILK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 65520; Mature: 65520

Theoretical pI: Translated: 6.10; Mature: 6.10

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
1.4 %Met     (Translated Protein)
2.6 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
1.4 %Met     (Mature Protein)
2.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLTNITIENFKKLERISFPLSQSVVIIGPNNSGKSTIFQALCLWEIGVKNYIAAYQKNDL
CCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
NRQGTITINRRDLLNSPIADARFLWKSKKVTQRNISGAGQKHVPLSIELEGDNNGVQWSC
CCCCEEEEEHHHHCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEEE
QAEFTFSNSESFSCKICTGLQQMVELYENEHGLHFGFLQPMSGISTTEDKLTKGSIDRKL
EEEEEECCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCCCCCCHHHHHHCCHHHHC
GEGKTAEVLRNICFEILNPETASKNRNNAENNWLQLCNVIKVMFGVILQKPEFIKATGLI
CCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHCCCE
SLEYIENNIKYDISSGGRGFQQTLLLFSYMFANPNTILLLDEPDAHLEVIRQREVFQKIN
EEEEECCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
DIATITNSQLLVASHSEVVLDEAAEASKVIALIENQTFEVNTSTNSKSIQYIKKALTEIG
HHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHEEEEECCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCC
WEKYYLAKSKGHILYLEGSTDLQMLLAFATALNHNVAALLRFANVSYTSDNVPNTAVANF
CCEEEEEECCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHH
VALKEIFPELKGLAIFDKIEKNLNDIKPLTVVCWQKRELENYFARPYLLIKYAQSLHEKY
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHH
EQFSLEQLEKAMKKAIEDFTLRAYLNDLNHNWWNSAKLSSEWLDNIFPEFYKQLNVPLNF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
YKRDYYQLIALMERQDIADEIVDKLDLIYEILK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
>Mature Secondary Structure
MLTNITIENFKKLERISFPLSQSVVIIGPNNSGKSTIFQALCLWEIGVKNYIAAYQKNDL
CCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
NRQGTITINRRDLLNSPIADARFLWKSKKVTQRNISGAGQKHVPLSIELEGDNNGVQWSC
CCCCEEEEEHHHHCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEEE
QAEFTFSNSESFSCKICTGLQQMVELYENEHGLHFGFLQPMSGISTTEDKLTKGSIDRKL
EEEEEECCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCCCCCCHHHHHHCCHHHHC
GEGKTAEVLRNICFEILNPETASKNRNNAENNWLQLCNVIKVMFGVILQKPEFIKATGLI
CCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHCCCE
SLEYIENNIKYDISSGGRGFQQTLLLFSYMFANPNTILLLDEPDAHLEVIRQREVFQKIN
EEEEECCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
DIATITNSQLLVASHSEVVLDEAAEASKVIALIENQTFEVNTSTNSKSIQYIKKALTEIG
HHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHEEEEECCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCC
WEKYYLAKSKGHILYLEGSTDLQMLLAFATALNHNVAALLRFANVSYTSDNVPNTAVANF
CCEEEEEECCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHH
VALKEIFPELKGLAIFDKIEKNLNDIKPLTVVCWQKRELENYFARPYLLIKYAQSLHEKY
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHH
EQFSLEQLEKAMKKAIEDFTLRAYLNDLNHNWWNSAKLSSEWLDNIFPEFYKQLNVPLNF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
YKRDYYQLIALMERQDIADEIVDKLDLIYEILK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA