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The map label for this gene is eriC [C]

Identifier: 78189363

GI number: 78189363

Start: 1863568

End: 1865463

Strand: Reverse

Name: eriC [C]

Synonym: Cag_1400

Alternate gene names: 78189363

Gene position: 1865463-1863568 (Counterclockwise)

Preceding gene: 78189364

Following gene: 78189361

Centisome position: 72.53

GC content: 35.23

Gene sequence:

>1896_bases
ATGAATATTTTATCTCATAAAAAAGGACGTTTAGCGCGAAGAATTATTGCCTTCTTTTATATTCTTTTTAGAAGAAGTAG
ATACTTTAAAGGAAGTTCTCAAAATTTTATAAAATTAACATTAGAGTATATTTTGGTTCAATTGAATTTGAATCAAGATA
TACCATTTCTTTTTGTTGCCGTAATTGTTGGTCTTGTTACTGGTTATGTAGCTGTTTTATTTCACGAAGCCATTAAAGCA
ATCAGTAATTTTAGCTTTAATGATTTACGTTTGCTTGGCGATATATCTTTTATTGAACAATATTGGGTCTTTTTTTTACC
GTTTATTCCAGCAATTGGAGGGCTGTTTGTTGGCTTATATAATACGTTTATTATTAAAAAATCTTCCCGACATGCACTTG
CTTCAGTAATTAAATCTGTTGCTCACAATGATGGTATTATAGATAGAAAATTATGGTTTCATAAAACCATTACTTCCGTT
GTTTGCATTGGTACAGGCGGAGGCGGAGGGAGAGAAGCACCAATTGTACAAGTTGGCTCAGCTATAGGTTCTACTATAGC
TCAATGGCTACGATTTTCTCCCGAAAAAACACGAACGTTGCTTGGTTGTGGGGCAGCCGCAGGGCTTGCCGCAGTATTTA
ATGCACCAATTGGTGCTGTCATGTTTGCTATTGAGGTGCTGCTTGGCGATTTTAGTGTAAAAACGTTTAGTCCAATTGTT
ATAGCGGCTGTTATTGGCACAGTTCTTTCAAGAAGTTTTTTAGGCAATAGGCCAACATTTGATGTGCCTGATTATACATT
AGTTTCAAATATTGAGTTGCTTTTTTATTGTGTGCTTGGGGTGCTTGCAGGGTTATCAGCAGTTATGTTTATAAAAACAT
ATTTTGCTATTGAAGAATGGTTTGATAAACTTCAAATTCGTCGCAATCTTCCAGTTTGGATAATGCCTGCAATTGGAGGT
TTTTTAAGTGGTATTATTTGTATTTGGTTACCTGGATTATATGGATTTTCGTATAACGTTATTAGTAATGCTGTTTATGG
AAACGAAACATGGTATAACCTTATAGGTATTTATTTGCTTAAGCCGGTTGTTGCGGGATTAAGTATTGGTTCGGGTGGTG
CTGGTGGAATGTTTGCACCTGCAATGAAAATGGGGGCTATGTTAGGTGGTATGTTTGGAATTGTTGTTCACCAATTTTTT
CCGCTCATAACAGCTACATCAGGGGCATACGCTCTTGTAGGTATGGGAGCTTTAACCGCAGGTGTTATGAGGGCACCCTT
AACAGTTATTCTTATACTTTTTGAAATTACTGGGCAATATGAAATTGTATTGCCAATTATGTTTGCGGCTGTTACCTCTG
CCGTAGTTGCACGTCTTGCATATCGTCATTCTATGGAAACCTACGTGCTTGAAAAACAAGGCATAAAAGTTGGTTTTGGT
ATTGCGTTATCTGTAGCAGAACAAGTAGTTGTTTCGGATATTCTTGATAAAAAACGCACTCAATTTGTTAGCACCACACC
AATGAAAAAGATTTTGGAGGTTTTTTATAGCACTCCCGAAACTAACTTTCTTATTGTGGATAAGCAAGGTGTTTTTATTG
GTAACATTAGTTTAGATGATATCCGAATTTTGCTTAAAAATGGTTGTAATGATGATTTAATAGCCGATGATATTGTTAAT
AAAAATGTTCCTGTTCTTTATACCAATTCACGGCTTGATGAGGCATTAAAATTATTTGAGCTTTCTGATTACGATATATT
GCCTGTACTTGATACAAAAAATAATATTTTGCAAGGTGTGCTTCGTCAAGAAAAAGCATTTGCAAGTTATCGTAAACAGC
TTAATCTTTATGGATCAGATTATTCTGATAAATCAGTACATCAAGGGGTTAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ACAAAATTCAGAATGCGTCAAAATTGCTTGCCAACACTGTATGAAAAGATGACAATCATTGTGTGATTTTTTCTTTATGC
TTTAGTTGTGATTATAAATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATAGTGTACTACATTCTTATGGTACTTGTTTTTTTATTCGAAAATAACACGAAGTGAATCGTTTTGTGTGCGAGCTTGT
AACCACATTGTAATTTTTTC

Product: chloride channel

Products: Cl Ion [Cytoplasm] [C]

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 631; Mature: 631

Protein sequence:

>631_residues
MNILSHKKGRLARRIIAFFYILFRRSRYFKGSSQNFIKLTLEYILVQLNLNQDIPFLFVAVIVGLVTGYVAVLFHEAIKA
ISNFSFNDLRLLGDISFIEQYWVFFLPFIPAIGGLFVGLYNTFIIKKSSRHALASVIKSVAHNDGIIDRKLWFHKTITSV
VCIGTGGGGGREAPIVQVGSAIGSTIAQWLRFSPEKTRTLLGCGAAAGLAAVFNAPIGAVMFAIEVLLGDFSVKTFSPIV
IAAVIGTVLSRSFLGNRPTFDVPDYTLVSNIELLFYCVLGVLAGLSAVMFIKTYFAIEEWFDKLQIRRNLPVWIMPAIGG
FLSGIICIWLPGLYGFSYNVISNAVYGNETWYNLIGIYLLKPVVAGLSIGSGGAGGMFAPAMKMGAMLGGMFGIVVHQFF
PLITATSGAYALVGMGALTAGVMRAPLTVILILFEITGQYEIVLPIMFAAVTSAVVARLAYRHSMETYVLEKQGIKVGFG
IALSVAEQVVVSDILDKKRTQFVSTTPMKKILEVFYSTPETNFLIVDKQGVFIGNISLDDIRILLKNGCNDDLIADDIVN
KNVPVLYTNSRLDEALKLFELSDYDILPVLDTKNNILQGVLRQEKAFASYRKQLNLYGSDYSDKSVHQGVK

Sequences:

>Translated_631_residues
MNILSHKKGRLARRIIAFFYILFRRSRYFKGSSQNFIKLTLEYILVQLNLNQDIPFLFVAVIVGLVTGYVAVLFHEAIKA
ISNFSFNDLRLLGDISFIEQYWVFFLPFIPAIGGLFVGLYNTFIIKKSSRHALASVIKSVAHNDGIIDRKLWFHKTITSV
VCIGTGGGGGREAPIVQVGSAIGSTIAQWLRFSPEKTRTLLGCGAAAGLAAVFNAPIGAVMFAIEVLLGDFSVKTFSPIV
IAAVIGTVLSRSFLGNRPTFDVPDYTLVSNIELLFYCVLGVLAGLSAVMFIKTYFAIEEWFDKLQIRRNLPVWIMPAIGG
FLSGIICIWLPGLYGFSYNVISNAVYGNETWYNLIGIYLLKPVVAGLSIGSGGAGGMFAPAMKMGAMLGGMFGIVVHQFF
PLITATSGAYALVGMGALTAGVMRAPLTVILILFEITGQYEIVLPIMFAAVTSAVVARLAYRHSMETYVLEKQGIKVGFG
IALSVAEQVVVSDILDKKRTQFVSTTPMKKILEVFYSTPETNFLIVDKQGVFIGNISLDDIRILLKNGCNDDLIADDIVN
KNVPVLYTNSRLDEALKLFELSDYDILPVLDTKNNILQGVLRQEKAFASYRKQLNLYGSDYSDKSVHQGVK
>Mature_631_residues
MNILSHKKGRLARRIIAFFYILFRRSRYFKGSSQNFIKLTLEYILVQLNLNQDIPFLFVAVIVGLVTGYVAVLFHEAIKA
ISNFSFNDLRLLGDISFIEQYWVFFLPFIPAIGGLFVGLYNTFIIKKSSRHALASVIKSVAHNDGIIDRKLWFHKTITSV
VCIGTGGGGGREAPIVQVGSAIGSTIAQWLRFSPEKTRTLLGCGAAAGLAAVFNAPIGAVMFAIEVLLGDFSVKTFSPIV
IAAVIGTVLSRSFLGNRPTFDVPDYTLVSNIELLFYCVLGVLAGLSAVMFIKTYFAIEEWFDKLQIRRNLPVWIMPAIGG
FLSGIICIWLPGLYGFSYNVISNAVYGNETWYNLIGIYLLKPVVAGLSIGSGGAGGMFAPAMKMGAMLGGMFGIVVHQFF
PLITATSGAYALVGMGALTAGVMRAPLTVILILFEITGQYEIVLPIMFAAVTSAVVARLAYRHSMETYVLEKQGIKVGFG
IALSVAEQVVVSDILDKKRTQFVSTTPMKKILEVFYSTPETNFLIVDKQGVFIGNISLDDIRILLKNGCNDDLIADDIVN
KNVPVLYTNSRLDEALKLFELSDYDILPVLDTKNNILQGVLRQEKAFASYRKQLNLYGSDYSDKSVHQGVK

Specific function: Selective chloride channel [C]

COG id: COG0038

COG function: function code P; Chloride channel protein EriC

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the chloride channel (TC 2.A.49) family. ClcB subfamily [H]

Homologues:

Organism=Homo sapiens, GI4557473, Length=359, Percent_Identity=28.6908077994429, Blast_Score=92, Evalue=1e-18,
Organism=Homo sapiens, GI189217923, Length=359, Percent_Identity=28.6908077994429, Blast_Score=92, Evalue=1e-18,
Organism=Homo sapiens, GI189217921, Length=359, Percent_Identity=28.6908077994429, Blast_Score=92, Evalue=1e-18,
Organism=Escherichia coli, GI1786350, Length=449, Percent_Identity=27.8396436525612, Blast_Score=127, Evalue=3e-30,
Organism=Escherichia coli, GI87081943, Length=334, Percent_Identity=28.4431137724551, Blast_Score=108, Evalue=1e-24,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR014743
- InterPro:   IPR001807 [H]

Pfam domain/function: PF00654 Voltage_CLC [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 69288; Mature: 69288

Theoretical pI: Translated: 9.44; Mature: 9.44

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
3.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
3.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNILSHKKGRLARRIIAFFYILFRRSRYFKGSSQNFIKLTLEYILVQLNLNQDIPFLFVA
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHEEEHHEEEEECCCCCHHHHHH
VIVGLVTGYVAVLFHEAIKAISNFSFNDLRLLGDISFIEQYWVFFLPFIPAIGGLFVGLY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NTFIIKKSSRHALASVIKSVAHNDGIIDRKLWFHKTITSVVCIGTGGGGGREAPIVQVGS
HHHHEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCCHHHHHH
AIGSTIAQWLRFSPEKTRTLLGCGAAAGLAAVFNAPIGAVMFAIEVLLGDFSVKTFSPIV
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH
IAAVIGTVLSRSFLGNRPTFDVPDYTLVSNIELLFYCVLGVLAGLSAVMFIKTYFAIEEW
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FDKLQIRRNLPVWIMPAIGGFLSGIICIWLPGLYGFSYNVISNAVYGNETWYNLIGIYLL
HHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
KPVVAGLSIGSGGAGGMFAPAMKMGAMLGGMFGIVVHQFFPLITATSGAYALVGMGALTA
HHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH
GVMRAPLTVILILFEITGQYEIVLPIMFAAVTSAVVARLAYRHSMETYVLEKQGIKVGFG
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHH
IALSVAEQVVVSDILDKKRTQFVSTTPMKKILEVFYSTPETNFLIVDKQGVFIGNISLDD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCEEEECCCHHH
IRILLKNGCNDDLIADDIVNKNVPVLYTNSRLDEALKLFELSDYDILPVLDTKNNILQGV
HHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCHHHHHHH
LRQEKAFASYRKQLNLYGSDYSDKSVHQGVK
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MNILSHKKGRLARRIIAFFYILFRRSRYFKGSSQNFIKLTLEYILVQLNLNQDIPFLFVA
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHEEEHHEEEEECCCCCHHHHHH
VIVGLVTGYVAVLFHEAIKAISNFSFNDLRLLGDISFIEQYWVFFLPFIPAIGGLFVGLY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NTFIIKKSSRHALASVIKSVAHNDGIIDRKLWFHKTITSVVCIGTGGGGGREAPIVQVGS
HHHHEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCCHHHHHH
AIGSTIAQWLRFSPEKTRTLLGCGAAAGLAAVFNAPIGAVMFAIEVLLGDFSVKTFSPIV
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH
IAAVIGTVLSRSFLGNRPTFDVPDYTLVSNIELLFYCVLGVLAGLSAVMFIKTYFAIEEW
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FDKLQIRRNLPVWIMPAIGGFLSGIICIWLPGLYGFSYNVISNAVYGNETWYNLIGIYLL
HHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
KPVVAGLSIGSGGAGGMFAPAMKMGAMLGGMFGIVVHQFFPLITATSGAYALVGMGALTA
HHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH
GVMRAPLTVILILFEITGQYEIVLPIMFAAVTSAVVARLAYRHSMETYVLEKQGIKVGFG
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHH
IALSVAEQVVVSDILDKKRTQFVSTTPMKKILEVFYSTPETNFLIVDKQGVFIGNISLDD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCEEEECCCHHH
IRILLKNGCNDDLIADDIVNKNVPVLYTNSRLDEALKLFELSDYDILPVLDTKNNILQGV
HHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCHHHHHHH
LRQEKAFASYRKQLNLYGSDYSDKSVHQGVK
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: Cl Ion [Periplasm] [C]

Specific reaction: Cl Ion [Periplasm] = Cl Ion [Cytoplasm] [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11823852 [H]