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The map label for this gene is 78188864

Identifier: 78188864

GI number: 78188864

Start: 1227874

End: 1229610

Strand: Reverse

Name: 78188864

Synonym: Cag_0894

Alternate gene names: NA

Gene position: 1229610-1227874 (Counterclockwise)

Preceding gene: 78188865

Following gene: 78188862

Centisome position: 47.81

GC content: 30.74

Gene sequence:

>1737_bases
ATGATAAAAGCAATTTTAGAAAACAGAACACTTAAAAATATGGCTGACAAACATTTAATGACACCAAGCACAACAACTCT
CAGTGGGTTACTTGGCAATGGTTTAACATACAAAGTTCCTCTTTTTCAAAGAGATTACTCATGGAAAATTGACAACTGGA
CTGATCTATGGGAAGACATTAAAATTCTTTTAAATACGGGAAAAGATCATTACATGGGAGCTGTTGTACTTCAAAAAGTT
GGGGAAAAACAGTTTTTAATTATTGATGGACAGCAAAGATTTACAACATTGAGTCTTTTGGCACTTGCTACAATAAAAAA
AATACAAGATTTAATAGATGCAGGTATTGAGTCAGAAAATAATACTGAAAGAATTAATGAACTCAGAAGAGGATTTTTAG
GGCAAAAAGATCCTGCATCCTTACATTATTCGAGTAAACTGTTTCTTAACGAAAACAATGATCCATTTTACCAAAGAAAT
TTACTGCAATTAATTTCACCTCAAAATCAAAAAACGTTAATTGATTCAAATCGTTTATTGTGGCAAGGTTTTGATTTTTT
TTATAAACGGATTGGTGAACATTTTCATAATGCAACAGGTGCTGAATTAGCAACATTTCTTAGCAAATCAATTGGAGATA
AAACAATGTTTATCAAAATTGAGGTTGAGGATGAATTTAGTGCATATACTTTATTTGAAACTCTAAATTATAGAGGTGTT
GAGCTTACCGTAAGTGATTTATTAAAAAATTACTTGTTTTCATTAATTACACCTTCCGATTTACGAATTGCAAAAGAGAT
TTGGAAAAAAATAGCTACAAGTGTTGGTATGGAAAATTTTCCAATATTTCTACGGCACTTTTGGATTTCAAGAAAACCAC
TCGTGCGGCAAGAACAACTTTTTAAAACTATTAGAACTGAAGTTGCATCGAATCAACAAGTATTTGACTTATTGAACAAT
TTAGATGCTTATTCCGAAATGTATTTAGCACTACAAGACCCTTATAATATTAACTGGCAAGGTAACAGAGAAAGAATAAA
AAGAATTCGAGAGATGAAGTTGTTTGGAGTGAAACAACAATTGCCATTATTAATGGTAGCTAAAGAAAAATTCTCTGACC
AAGAATTCGACAAAACACTAAAAGTAATTTCAATTATTTCTTTCCGTTATAACGTTATTGGCAGCCGTCAAGCTAATAGA
ATGGAAGAAGTTTACAATATTGTTTCACAAAAAATATTTAACACAACAATAACCTCTGCACAAGGAGTATTTAATAATTT
AAAAGAACTATATATTTCAGATGCTGACTTTCGGAATGACTTTTCAACGCTGGAATTATACTCTTATGGTCAAAGCAAAA
AACTTGCAAGATATATTTTATTTGAGTTAGAAAATAATATGATGCAAGGTGGTGACAGAGACTATGAACTTGATCCTGCA
ACAATTGAACACATATTACCCGAAAATGCGGGTTCTCATTGGGATATAGATTTTCCTCAAATTATTCAACCAAGTTACAT
TTATAGATTAGGGAACTATACACTTTTAGAAGATCATTTAAATAGAGATTGTGAAACATTACTTTTTGATAAAAAGAAAC
CATTTTATGTAAGAAGCCAATATGAAATGGCAAAAGCGATCAATTATAATGAATGGAATCCTTTGACTTTGGATGCTCGA
CAAAGTGATTTTGCAAAAAAAGCAACATCAATATGGAGAATTTCATATGCTGACTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTACACTGCTTACTGACCTTGATAATGAAGCTGGGCACCAATTTTATAAAGCACATGGCTTTGTGCGCTCCAGCATGGTA
CCTTTCAGGTATGTTTGGGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACAACTGCCAACAAAGTATCGCCAAATAAGTATGTATCAAGCGATTATGTAAAGGGCTCCTCTAAAATCACATCCTCACC
CTGCAATGCGCACATTGTCG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 578; Mature: 578

Protein sequence:

>578_residues
MIKAILENRTLKNMADKHLMTPSTTTLSGLLGNGLTYKVPLFQRDYSWKIDNWTDLWEDIKILLNTGKDHYMGAVVLQKV
GEKQFLIIDGQQRFTTLSLLALATIKKIQDLIDAGIESENNTERINELRRGFLGQKDPASLHYSSKLFLNENNDPFYQRN
LLQLISPQNQKTLIDSNRLLWQGFDFFYKRIGEHFHNATGAELATFLSKSIGDKTMFIKIEVEDEFSAYTLFETLNYRGV
ELTVSDLLKNYLFSLITPSDLRIAKEIWKKIATSVGMENFPIFLRHFWISRKPLVRQEQLFKTIRTEVASNQQVFDLLNN
LDAYSEMYLALQDPYNINWQGNRERIKRIREMKLFGVKQQLPLLMVAKEKFSDQEFDKTLKVISIISFRYNVIGSRQANR
MEEVYNIVSQKIFNTTITSAQGVFNNLKELYISDADFRNDFSTLELYSYGQSKKLARYILFELENNMMQGGDRDYELDPA
TIEHILPENAGSHWDIDFPQIIQPSYIYRLGNYTLLEDHLNRDCETLLFDKKKPFYVRSQYEMAKAINYNEWNPLTLDAR
QSDFAKKATSIWRISYAD

Sequences:

>Translated_578_residues
MIKAILENRTLKNMADKHLMTPSTTTLSGLLGNGLTYKVPLFQRDYSWKIDNWTDLWEDIKILLNTGKDHYMGAVVLQKV
GEKQFLIIDGQQRFTTLSLLALATIKKIQDLIDAGIESENNTERINELRRGFLGQKDPASLHYSSKLFLNENNDPFYQRN
LLQLISPQNQKTLIDSNRLLWQGFDFFYKRIGEHFHNATGAELATFLSKSIGDKTMFIKIEVEDEFSAYTLFETLNYRGV
ELTVSDLLKNYLFSLITPSDLRIAKEIWKKIATSVGMENFPIFLRHFWISRKPLVRQEQLFKTIRTEVASNQQVFDLLNN
LDAYSEMYLALQDPYNINWQGNRERIKRIREMKLFGVKQQLPLLMVAKEKFSDQEFDKTLKVISIISFRYNVIGSRQANR
MEEVYNIVSQKIFNTTITSAQGVFNNLKELYISDADFRNDFSTLELYSYGQSKKLARYILFELENNMMQGGDRDYELDPA
TIEHILPENAGSHWDIDFPQIIQPSYIYRLGNYTLLEDHLNRDCETLLFDKKKPFYVRSQYEMAKAINYNEWNPLTLDAR
QSDFAKKATSIWRISYAD
>Mature_578_residues
MIKAILENRTLKNMADKHLMTPSTTTLSGLLGNGLTYKVPLFQRDYSWKIDNWTDLWEDIKILLNTGKDHYMGAVVLQKV
GEKQFLIIDGQQRFTTLSLLALATIKKIQDLIDAGIESENNTERINELRRGFLGQKDPASLHYSSKLFLNENNDPFYQRN
LLQLISPQNQKTLIDSNRLLWQGFDFFYKRIGEHFHNATGAELATFLSKSIGDKTMFIKIEVEDEFSAYTLFETLNYRGV
ELTVSDLLKNYLFSLITPSDLRIAKEIWKKIATSVGMENFPIFLRHFWISRKPLVRQEQLFKTIRTEVASNQQVFDLLNN
LDAYSEMYLALQDPYNINWQGNRERIKRIREMKLFGVKQQLPLLMVAKEKFSDQEFDKTLKVISIISFRYNVIGSRQANR
MEEVYNIVSQKIFNTTITSAQGVFNNLKELYISDADFRNDFSTLELYSYGQSKKLARYILFELENNMMQGGDRDYELDPA
TIEHILPENAGSHWDIDFPQIIQPSYIYRLGNYTLLEDHLNRDCETLLFDKKKPFYVRSQYEMAKAINYNEWNPLTLDAR
QSDFAKKATSIWRISYAD

Specific function: Unknown

COG id: COG1479

COG function: function code S; Uncharacterized conserved protein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 67588; Mature: 67588

Theoretical pI: Translated: 7.04; Mature: 7.04

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIKAILENRTLKNMADKHLMTPSTTTLSGLLGNGLTYKVPLFQRDYSWKIDNWTDLWEDI
CCHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHH
KILLNTGKDHYMGAVVLQKVGEKQFLIIDGQQRFTTLSLLALATIKKIQDLIDAGIESEN
HHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
NTERINELRRGFLGQKDPASLHYSSKLFLNENNDPFYQRNLLQLISPQNQKTLIDSNRLL
CHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCHH
WQGFDFFYKRIGEHFHNATGAELATFLSKSIGDKTMFIKIEVEDEFSAYTLFETLNYRGV
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCE
ELTVSDLLKNYLFSLITPSDLRIAKEIWKKIATSVGMENFPIFLRHFWISRKPLVRQEQL
EEEHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH
FKTIRTEVASNQQVFDLLNNLDAYSEMYLALQDPYNINWQGNRERIKRIREMKLFGVKQQ
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHH
LPLLMVAKEKFSDQEFDKTLKVISIISFRYNVIGSRQANRMEEVYNIVSQKIFNTTITSA
CCCCEEHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QGVFNNLKELYISDADFRNDFSTLELYSYGQSKKLARYILFELENNMMQGGDRDYELDPA
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHH
TIEHILPENAGSHWDIDFPQIIQPSYIYRLGNYTLLEDHLNRDCETLLFDKKKPFYVRSQ
HHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHCCCHHHEEECCCEEEHHHCCCCHHHHHCCCCCCEEEECH
YEMAKAINYNEWNPLTLDARQSDFAKKATSIWRISYAD
HHHHHHCCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHEEEEEECC
>Mature Secondary Structure
MIKAILENRTLKNMADKHLMTPSTTTLSGLLGNGLTYKVPLFQRDYSWKIDNWTDLWEDI
CCHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHH
KILLNTGKDHYMGAVVLQKVGEKQFLIIDGQQRFTTLSLLALATIKKIQDLIDAGIESEN
HHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
NTERINELRRGFLGQKDPASLHYSSKLFLNENNDPFYQRNLLQLISPQNQKTLIDSNRLL
CHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCHH
WQGFDFFYKRIGEHFHNATGAELATFLSKSIGDKTMFIKIEVEDEFSAYTLFETLNYRGV
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCE
ELTVSDLLKNYLFSLITPSDLRIAKEIWKKIATSVGMENFPIFLRHFWISRKPLVRQEQL
EEEHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH
FKTIRTEVASNQQVFDLLNNLDAYSEMYLALQDPYNINWQGNRERIKRIREMKLFGVKQQ
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHH
LPLLMVAKEKFSDQEFDKTLKVISIISFRYNVIGSRQANRMEEVYNIVSQKIFNTTITSA
CCCCEEHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QGVFNNLKELYISDADFRNDFSTLELYSYGQSKKLARYILFELENNMMQGGDRDYELDPA
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHH
TIEHILPENAGSHWDIDFPQIIQPSYIYRLGNYTLLEDHLNRDCETLLFDKKKPFYVRSQ
HHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHCCCHHHEEECCCEEEHHHCCCCHHHHHCCCCCCEEEECH
YEMAKAINYNEWNPLTLDARQSDFAKKATSIWRISYAD
HHHHHHCCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHEEEEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA