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The map label for this gene is yqfF [H]

Identifier: 78043665

GI number: 78043665

Start: 367440

End: 369530

Strand: Direct

Name: yqfF [H]

Synonym: CHY_0426

Alternate gene names: 78043665

Gene position: 367440-369530 (Clockwise)

Preceding gene: 78044880

Following gene: 78043035

Centisome position: 15.3

GC content: 40.94

Gene sequence:

>2091_bases
ATGGAAAGGTTAAAAAACAACCAAAAACTCCTCCGGGGATTGGTGTTTTTTGGTTTTTTTGTAGCCTTTCTCCTCTTAAT
GTTCCTGGAATTTATCCCGCATCGGGTAAATCTCCAGGTGGGTCAGGTAGCACCGGAAACTATTAAGGCTCCGCGAAGTA
TAGTTTTTGAAGACAAGGCCAAAACCGAAGAAGCGCGGGAGAAGGCCCGGAGCCAGGTACCAAAGGTTTATCTAATTAAT
CCCGAAACCAATGCGGCTATTTTAGGGGAAGTAAATAACTTTTTTTTAAATATAGAAAAAATCTTAAAGCAAAACTTGCC
TCCAAAGCAAAAGGAAAAGCAGATTATTAACGAATTACCCTTTTCCTTGCCTGCAGGGGTGGCTTACGATTTGGCCAGAA
TAAACCTTGAACGCTGGAAAGCAACCCAACGGGCGGCAACGGAAATTTTGGGTGAACTGTTAAAAAAGGAGATTACGCCA
GAAAATTTTACGGAAATTAAAGGAACCCTTACCGAGAAGGTTAACCGTTATAACTTAAGTTACCCGGAAAAAGAGGTTTT
AATTTTAAGTTTAAATTATTTTTTAAGACCCAATGCGGTATATGATCCGGAAGCCACGGAAAAACTTCGAGACCGTGCTG
CCCAGGCGGTACCCAAAGTGTGGGTTTCAATTAAGCAAAATCAGAAAATTATCGGAGAAGGGGAAATTGTTACTCCCGAG
CATTTAGCCAAATTGGAAGCTCTGGGGTTACTTAAACCAAGACCTTCATTTCGCAATTTAATTGGAGCGGTATTTCTTGT
ATTTTTTACCATGTTAACTCCTCTTTTTTACCTGTACTTACAGCGACGGGAAATTTTTGAAAATTTAAACTTACTGATTT
TATTGGGGATAATTTCCTTTTTTATCTTAGCATTAGCTAAAAGTATTTTAGCAATCAATGTGGGAGCTTTTCCGGAAATG
ACCCCGCTGGTGGGCTATGCTGTACCTTTAGGTGCAGCAACGATGTTAATTGCCATTTTAATTGACTTTAATCTGTCCCT
TTTGATGACGGCGCTTTTAGCTTTATTAATTGGTTTTGGTACCGAACTTAGCCTTAAGCTATCCATAGTATCTTTTTTTT
CTGGACTTGCCGGAGGTTTTGGGGTTTCTCATTTAAGCCAGCGCAAGGATTTAGCCCGGGCTGGAGTAAATATAGGTATT
GTAGCTTTAGTAGCAATTCTTGCTTTGGAACTTATAGATAAGACGCCTATAGGTACGGCTTTTTTAGCTGCATTGATTTT
TGGTCCAATAAATGGGATTTTAGCTGCCATTTTTACCAACGGCTTTTTACCCTATTTAGAAACGACTTTTAAAATTACTT
CAGCGGTAACTTTATTGGAATTAGCAACTCCTTCCCATCCCCTTTTAAAAAAGCTTTTAATGGAAGCACCGGGAACGTAC
CATCACAGTCTTTTGGTGGGGAATTTAGCGGAAGCGGCGGCGGATAAAGTAAATGCCAATAGCTTACTGGCCCGGGTGGG
GGCCTATTACCATGACATAGGTAAATTAAAACGACCGTACTTTTTTGTGGAAAATCAATTTGGTAGCGGTAACCCCCACG
AAAAACTTAATCCCAATTTAAGTACCTTAATTGTTACCTCCCATGTGAAGGATGGGGTGGAGCTGGCCCGGGAGTATAAA
TTACCCCAAATCGTTATCGATATTATCGAGCAGCACCATGGAACCAGCATCATAAAGTTTTTTTTCCAAAAGGCTATTGA
TATCAACGGACCGGAGGTAAATGCCGAGGATTTTCGCTATCCCGGTCCCAAGCCCAAAACCAAAGAAGCAGCTTTAGTAA
TGCTGGCCGATTCGGTAGAAGCGGCGGTGCGTTCGTTAAAATCTCCTACTCCCGGTCGTATAGAGGGATTGGTCCGAAAA
GTAATTAAGGACAAGCTTTTAGATGGACAGCTGGATGAGTCAAACCTAACTTTTCAGGATTTGCATAACATTGCTCAAGC
CTTTGATAAAGTATTATCGGGAATTTTCCATAACCGGGTGGAATATCCGGATATAAACGTGGAAGCTCTCAGAAAGGAGA
AAAAATCTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CATCCCTTAGTCCAGGAAATTATTGAGCAGTACGAAAAAGCCCGGCAGATCAAGGACAGGGAGGGAACGGGTCATTCTTA
AACTTAAAGCAAAGCAAATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
CGGAAATTACCAATCTTCAGGATAAAGTGGACGTGGATGAGACTTTGTTAAATATAATTACCCAGGCTGTGAGTTTAACA
TTAAACGAGGAAGGACGCGC

Product: HDIG domain-containing protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 696; Mature: 696

Protein sequence:

>696_residues
MERLKNNQKLLRGLVFFGFFVAFLLLMFLEFIPHRVNLQVGQVAPETIKAPRSIVFEDKAKTEEAREKARSQVPKVYLIN
PETNAAILGEVNNFFLNIEKILKQNLPPKQKEKQIINELPFSLPAGVAYDLARINLERWKATQRAATEILGELLKKEITP
ENFTEIKGTLTEKVNRYNLSYPEKEVLILSLNYFLRPNAVYDPEATEKLRDRAAQAVPKVWVSIKQNQKIIGEGEIVTPE
HLAKLEALGLLKPRPSFRNLIGAVFLVFFTMLTPLFYLYLQRREIFENLNLLILLGIISFFILALAKSILAINVGAFPEM
TPLVGYAVPLGAATMLIAILIDFNLSLLMTALLALLIGFGTELSLKLSIVSFFSGLAGGFGVSHLSQRKDLARAGVNIGI
VALVAILALELIDKTPIGTAFLAALIFGPINGILAAIFTNGFLPYLETTFKITSAVTLLELATPSHPLLKKLLMEAPGTY
HHSLLVGNLAEAAADKVNANSLLARVGAYYHDIGKLKRPYFFVENQFGSGNPHEKLNPNLSTLIVTSHVKDGVELAREYK
LPQIVIDIIEQHHGTSIIKFFFQKAIDINGPEVNAEDFRYPGPKPKTKEAALVMLADSVEAAVRSLKSPTPGRIEGLVRK
VIKDKLLDGQLDESNLTFQDLHNIAQAFDKVLSGIFHNRVEYPDINVEALRKEKKS

Sequences:

>Translated_696_residues
MERLKNNQKLLRGLVFFGFFVAFLLLMFLEFIPHRVNLQVGQVAPETIKAPRSIVFEDKAKTEEAREKARSQVPKVYLIN
PETNAAILGEVNNFFLNIEKILKQNLPPKQKEKQIINELPFSLPAGVAYDLARINLERWKATQRAATEILGELLKKEITP
ENFTEIKGTLTEKVNRYNLSYPEKEVLILSLNYFLRPNAVYDPEATEKLRDRAAQAVPKVWVSIKQNQKIIGEGEIVTPE
HLAKLEALGLLKPRPSFRNLIGAVFLVFFTMLTPLFYLYLQRREIFENLNLLILLGIISFFILALAKSILAINVGAFPEM
TPLVGYAVPLGAATMLIAILIDFNLSLLMTALLALLIGFGTELSLKLSIVSFFSGLAGGFGVSHLSQRKDLARAGVNIGI
VALVAILALELIDKTPIGTAFLAALIFGPINGILAAIFTNGFLPYLETTFKITSAVTLLELATPSHPLLKKLLMEAPGTY
HHSLLVGNLAEAAADKVNANSLLARVGAYYHDIGKLKRPYFFVENQFGSGNPHEKLNPNLSTLIVTSHVKDGVELAREYK
LPQIVIDIIEQHHGTSIIKFFFQKAIDINGPEVNAEDFRYPGPKPKTKEAALVMLADSVEAAVRSLKSPTPGRIEGLVRK
VIKDKLLDGQLDESNLTFQDLHNIAQAFDKVLSGIFHNRVEYPDINVEALRKEKKS
>Mature_696_residues
MERLKNNQKLLRGLVFFGFFVAFLLLMFLEFIPHRVNLQVGQVAPETIKAPRSIVFEDKAKTEEAREKARSQVPKVYLIN
PETNAAILGEVNNFFLNIEKILKQNLPPKQKEKQIINELPFSLPAGVAYDLARINLERWKATQRAATEILGELLKKEITP
ENFTEIKGTLTEKVNRYNLSYPEKEVLILSLNYFLRPNAVYDPEATEKLRDRAAQAVPKVWVSIKQNQKIIGEGEIVTPE
HLAKLEALGLLKPRPSFRNLIGAVFLVFFTMLTPLFYLYLQRREIFENLNLLILLGIISFFILALAKSILAINVGAFPEM
TPLVGYAVPLGAATMLIAILIDFNLSLLMTALLALLIGFGTELSLKLSIVSFFSGLAGGFGVSHLSQRKDLARAGVNIGI
VALVAILALELIDKTPIGTAFLAALIFGPINGILAAIFTNGFLPYLETTFKITSAVTLLELATPSHPLLKKLLMEAPGTY
HHSLLVGNLAEAAADKVNANSLLARVGAYYHDIGKLKRPYFFVENQFGSGNPHEKLNPNLSTLIVTSHVKDGVELAREYK
LPQIVIDIIEQHHGTSIIKFFFQKAIDINGPEVNAEDFRYPGPKPKTKEAALVMLADSVEAAVRSLKSPTPGRIEGLVRK
VIKDKLLDGQLDESNLTFQDLHNIAQAFDKVLSGIFHNRVEYPDINVEALRKEKKS

Specific function: Unknown

COG id: COG1480

COG function: function code R; Predicted membrane-associated HD superfamily hydrolase

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR011624
- InterPro:   IPR011621
- InterPro:   IPR003607
- InterPro:   IPR006675 [H]

Pfam domain/function: PF07698 7TM-7TMR_HD; PF07697 7TMR-HDED [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 77384; Mature: 77384

Theoretical pI: Translated: 9.60; Mature: 9.60

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
1.1 %Met     (Translated Protein)
1.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.1 %Met     (Mature Protein)
1.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MERLKNNQKLLRGLVFFGFFVAFLLLMFLEFIPHRVNLQVGQVAPETIKAPRSIVFEDKA
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCHHHHCCCHHHEECCHH
KTEEAREKARSQVPKVYLINPETNAAILGEVNNFFLNIEKILKQNLPPKQKEKQIINELP
HHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCC
FSLPAGVAYDLARINLERWKATQRAATEILGELLKKEITPENFTEIKGTLTEKVNRYNLS
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
YPEKEVLILSLNYFLRPNAVYDPEATEKLRDRAAQAVPKVWVSIKQNQKIIGEGEIVTPE
CCCCCEEEEEECHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCEECHH
HLAKLEALGLLKPRPSFRNLIGAVFLVFFTMLTPLFYLYLQRREIFENLNLLILLGIISF
HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
FILALAKSILAINVGAFPEMTPLVGYAVPLGAATMLIAILIDFNLSLLMTALLALLIGFG
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCC
TELSLKLSIVSFFSGLAGGFGVSHLSQRKDLARAGVNIGIVALVAILALELIDKTPIGTA
CCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH
FLAALIFGPINGILAAIFTNGFLPYLETTFKITSAVTLLELATPSHPLLKKLLMEAPGTY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCH
HHSLLVGNLAEAAADKVNANSLLARVGAYYHDIGKLKRPYFFVENQFGSGNPHEKLNPNL
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCH
STLIVTSHVKDGVELAREYKLPQIVIDIIEQHHGTSIIKFFFQKAIDINGPEVNAEDFRY
HEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCC
PGPKPKTKEAALVMLADSVEAAVRSLKSPTPGRIEGLVRKVIKDKLLDGQLDESNLTFQD
CCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHH
LHNIAQAFDKVLSGIFHNRVEYPDINVEALRKEKKS
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MERLKNNQKLLRGLVFFGFFVAFLLLMFLEFIPHRVNLQVGQVAPETIKAPRSIVFEDKA
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCHHHHCCCHHHEECCHH
KTEEAREKARSQVPKVYLINPETNAAILGEVNNFFLNIEKILKQNLPPKQKEKQIINELP
HHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCC
FSLPAGVAYDLARINLERWKATQRAATEILGELLKKEITPENFTEIKGTLTEKVNRYNLS
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
YPEKEVLILSLNYFLRPNAVYDPEATEKLRDRAAQAVPKVWVSIKQNQKIIGEGEIVTPE
CCCCCEEEEEECHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCEECHH
HLAKLEALGLLKPRPSFRNLIGAVFLVFFTMLTPLFYLYLQRREIFENLNLLILLGIISF
HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
FILALAKSILAINVGAFPEMTPLVGYAVPLGAATMLIAILIDFNLSLLMTALLALLIGFG
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCC
TELSLKLSIVSFFSGLAGGFGVSHLSQRKDLARAGVNIGIVALVAILALELIDKTPIGTA
CCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH
FLAALIFGPINGILAAIFTNGFLPYLETTFKITSAVTLLELATPSHPLLKKLLMEAPGTY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCH
HHSLLVGNLAEAAADKVNANSLLARVGAYYHDIGKLKRPYFFVENQFGSGNPHEKLNPNL
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCH
STLIVTSHVKDGVELAREYKLPQIVIDIIEQHHGTSIIKFFFQKAIDINGPEVNAEDFRY
HEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCC
PGPKPKTKEAALVMLADSVEAAVRSLKSPTPGRIEGLVRKVIKDKLLDGQLDESNLTFQD
CCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHH
LHNIAQAFDKVLSGIFHNRVEYPDINVEALRKEKKS
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8969508; 9384377 [H]