Definition Anabaena variabilis ATCC 29413 chromosome, complete genome.
Accession NC_007413
Length 6,365,727

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 75907960

Identifier: 75907960

GI number: 75907960

Start: 2172002

End: 2173981

Strand: Direct

Name: 75907960

Synonym: Ava_1739

Alternate gene names: NA

Gene position: 2172002-2173981 (Clockwise)

Preceding gene: 75907959

Following gene: 75907961

Centisome position: 34.12

GC content: 32.42

Gene sequence:

>1980_bases
ATGAAAGCTTCAGAAACTAAGTTACAGCAGATTATTGAAGGAGCAAAACAGTACCTTGTGCCTTTATTCCAACGACCTTA
CAGTTGGGACAAAGTTCAGTGGGAAGCATTATGGAGTGACATTGTCGAACTATATACGATGGATGCGCCGCACCCTCACT
TCATGGGATCTATTGTGACTATGCCAACCCAAGCTGTACCTGAAGGAGTAAGCAAATTCCTGCTGATTGATGGTCAACAA
CGATTAACAACAATATTTATTATCCTCTCAGCTTTGCGAGATAGAGCTAAGGAATTAGAGTTAAAACTAGCTGAAGAAAT
TAATCAAACTCTTTTAGTAAATCCTTTTAAAGAAGGATCAGATTATTACAAATTAGAACTAACTAGGTTAAAGTCAGATC
GTGAAGCATTTCATCATATTATTAATTCGGAATCACATATTAGTAGTGGGATTTCGCAATGTTATCTTTTCTTTCAAAAA
AAAATTATCCATAGTGGACTAGAACTTCAAAGAATAAAAAAAGTTATTTGTAGTAAACTTTCTCTGGTAAGTATTGTACT
AGACTTAGATGATAATCCCTATCTGGTTTTTGAAAGCTTGAATGCTAAAGGAATGCCTCTTACACAAGCTGATTTAATTC
GTAACTATTTATTTATGAGAATTGATATCAGTAATCAAGAATCAGTCTATACTGATTACTGGAAACCTATGCAGGAAATA
TTAAAAAATAATTTAACAGATTTTATTCGTCACTATCTTAATAAAAGTGGATTTGATGTCAAACAGAGTGAGATTTATTT
TGCAACCAAAGAACGAATTAGTAAAAGTGATTCTCTATCTTATTTGAAGGATTTATATATATTTGCAGAATACTATGCTA
GGCTCTTAGAACCTCAACGAGAACTCAATGAAAATATCAGAAAACATTTATACCGTCTTAATCGTTTAGACATTGCCACT
GTATATCCTTTTCTTCTTAACTGCTACGATGATTGGGTTCAATCTAAAATTACCGAAGAAGAGTTTATTTCAATTTTAAA
AATTATTGAAAATTTTTTGATACGACGTTTTATATGTAATGTTCAAACAAGAGGATTAAATAGAATATTTGCATTACTTT
ACTCAGAGGTTAGCAAAAGATCGAGTTTGGCTTCTGATGATTTTATCAAGCGTTTGAAATTAAGTCTTCAGAGCCGTAAT
TATCCGAAAGACGCAGAGTTTAAAGCTAGGTTAATTGATGTAAAGCTATATGGAGGTAATCGCTCTGAAAAGACAAAGCT
TATTCTTGAATCAATTGAGGAATCTTTTAAACATAAGGAAAAAGTGTCTTTCGATGAACTTTCTATTGAACATATTATGC
CACAAACTCTTAATGAATGGTGGCAAAAAAGTTTAGGAGAAGATTGGGCTATAACTCATGAATTATATTTGCATTCTTTA
GGAAATCTCACACTTACTGCATATAATCCTGAACTTTCCAATAATGATTTTCTATACAAAAAAACTCACTATAAGAATAG
CCATTTAGAGTTAAATAAATATTTTCACCATAAAGAATTTTGGCGAAGAGAGGATATTGAAGCACGAGCAGAATATCTTG
CTGAACGCGCTTTACAAATTTGGGATTATTTTGGCGAAGAGGAAGTAAATCCGTCGGAATCTAGTATTTTGACTGGTACT
ACTCCCAAATTACTGCATATATTTGGTCAAGAATATTCCGTTAAAAGCTGGCGGGATGTTTTAGAAACGACTTTAAATAC
ACTTTCTGATTTAGAGCCTGAGAAATTTAAAGAGATAATGCAGCAATTTCCTAGATTTATAGGAATTGATGAAAAAGATT
TTCGTAGTACCCGCAAACTTAAAAATGGAGTTTTTATTGAAGTTAATTTATCAGCTAAAGATATTGGTGCTTTCTGTAGG
AAAGCAATAGAAACAACAGAGTTATCAAGTGAGGAATGGTATGTTGAAACGGTCACTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTATTTTGCAGAATATTACATACTAATATTCTGGTTGATTTTGGGAATTATAACTCTACATTAAGGATTTATCCCAAAAG
CGACACAGGAGGCATCATCG

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTTGACGATCGCACTCAAACTAAAGCTAAAATAATGAAGCGTAGTCTTGTAAAAATGATGAGTAATGAAAATTAAAGCAG
TTATCTGGCAAGAAGATGAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 659; Mature: 659

Protein sequence:

>659_residues
MKASETKLQQIIEGAKQYLVPLFQRPYSWDKVQWEALWSDIVELYTMDAPHPHFMGSIVTMPTQAVPEGVSKFLLIDGQQ
RLTTIFIILSALRDRAKELELKLAEEINQTLLVNPFKEGSDYYKLELTRLKSDREAFHHIINSESHISSGISQCYLFFQK
KIIHSGLELQRIKKVICSKLSLVSIVLDLDDNPYLVFESLNAKGMPLTQADLIRNYLFMRIDISNQESVYTDYWKPMQEI
LKNNLTDFIRHYLNKSGFDVKQSEIYFATKERISKSDSLSYLKDLYIFAEYYARLLEPQRELNENIRKHLYRLNRLDIAT
VYPFLLNCYDDWVQSKITEEEFISILKIIENFLIRRFICNVQTRGLNRIFALLYSEVSKRSSLASDDFIKRLKLSLQSRN
YPKDAEFKARLIDVKLYGGNRSEKTKLILESIEESFKHKEKVSFDELSIEHIMPQTLNEWWQKSLGEDWAITHELYLHSL
GNLTLTAYNPELSNNDFLYKKTHYKNSHLELNKYFHHKEFWRREDIEARAEYLAERALQIWDYFGEEEVNPSESSILTGT
TPKLLHIFGQEYSVKSWRDVLETTLNTLSDLEPEKFKEIMQQFPRFIGIDEKDFRSTRKLKNGVFIEVNLSAKDIGAFCR
KAIETTELSSEEWYVETVT

Sequences:

>Translated_659_residues
MKASETKLQQIIEGAKQYLVPLFQRPYSWDKVQWEALWSDIVELYTMDAPHPHFMGSIVTMPTQAVPEGVSKFLLIDGQQ
RLTTIFIILSALRDRAKELELKLAEEINQTLLVNPFKEGSDYYKLELTRLKSDREAFHHIINSESHISSGISQCYLFFQK
KIIHSGLELQRIKKVICSKLSLVSIVLDLDDNPYLVFESLNAKGMPLTQADLIRNYLFMRIDISNQESVYTDYWKPMQEI
LKNNLTDFIRHYLNKSGFDVKQSEIYFATKERISKSDSLSYLKDLYIFAEYYARLLEPQRELNENIRKHLYRLNRLDIAT
VYPFLLNCYDDWVQSKITEEEFISILKIIENFLIRRFICNVQTRGLNRIFALLYSEVSKRSSLASDDFIKRLKLSLQSRN
YPKDAEFKARLIDVKLYGGNRSEKTKLILESIEESFKHKEKVSFDELSIEHIMPQTLNEWWQKSLGEDWAITHELYLHSL
GNLTLTAYNPELSNNDFLYKKTHYKNSHLELNKYFHHKEFWRREDIEARAEYLAERALQIWDYFGEEEVNPSESSILTGT
TPKLLHIFGQEYSVKSWRDVLETTLNTLSDLEPEKFKEIMQQFPRFIGIDEKDFRSTRKLKNGVFIEVNLSAKDIGAFCR
KAIETTELSSEEWYVETVT
>Mature_659_residues
MKASETKLQQIIEGAKQYLVPLFQRPYSWDKVQWEALWSDIVELYTMDAPHPHFMGSIVTMPTQAVPEGVSKFLLIDGQQ
RLTTIFIILSALRDRAKELELKLAEEINQTLLVNPFKEGSDYYKLELTRLKSDREAFHHIINSESHISSGISQCYLFFQK
KIIHSGLELQRIKKVICSKLSLVSIVLDLDDNPYLVFESLNAKGMPLTQADLIRNYLFMRIDISNQESVYTDYWKPMQEI
LKNNLTDFIRHYLNKSGFDVKQSEIYFATKERISKSDSLSYLKDLYIFAEYYARLLEPQRELNENIRKHLYRLNRLDIAT
VYPFLLNCYDDWVQSKITEEEFISILKIIENFLIRRFICNVQTRGLNRIFALLYSEVSKRSSLASDDFIKRLKLSLQSRN
YPKDAEFKARLIDVKLYGGNRSEKTKLILESIEESFKHKEKVSFDELSIEHIMPQTLNEWWQKSLGEDWAITHELYLHSL
GNLTLTAYNPELSNNDFLYKKTHYKNSHLELNKYFHHKEFWRREDIEARAEYLAERALQIWDYFGEEEVNPSESSILTGT
TPKLLHIFGQEYSVKSWRDVLETTLNTLSDLEPEKFKEIMQQFPRFIGIDEKDFRSTRKLKNGVFIEVNLSAKDIGAFCR
KAIETTELSSEEWYVETVT

Specific function: Unknown

COG id: COG1479

COG function: function code S; Uncharacterized conserved protein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 77647; Mature: 77647

Theoretical pI: Translated: 6.38; Mature: 6.38

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
1.4 %Met     (Translated Protein)
2.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
1.4 %Met     (Mature Protein)
2.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKASETKLQQIIEGAKQYLVPLFQRPYSWDKVQWEALWSDIVELYTMDAPHPHFMGSIVT
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCHHHH
MPTQAVPEGVSKFLLIDGQQRLTTIFIILSALRDRAKELELKLAEEINQTLLVNPFKEGS
CCCHHHHHHHHHEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCC
DYYKLELTRLKSDREAFHHIINSESHISSGISQCYLFFQKKIIHSGLELQRIKKVICSKL
CEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
SLVSIVLDLDDNPYLVFESLNAKGMPLTQADLIRNYLFMRIDISNQESVYTDYWKPMQEI
HHHHEEEECCCCCEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHH
LKNNLTDFIRHYLNKSGFDVKQSEIYFATKERISKSDSLSYLKDLYIFAEYYARLLEPQR
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHH
ELNENIRKHLYRLNRLDIATVYPFLLNCYDDWVQSKITEEEFISILKIIENFLIRRFICN
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VQTRGLNRIFALLYSEVSKRSSLASDDFIKRLKLSLQSRNYPKDAEFKARLIDVKLYGGN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCC
RSEKTKLILESIEESFKHKEKVSFDELSIEHIMPQTLNEWWQKSLGEDWAITHELYLHSL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHC
GNLTLTAYNPELSNNDFLYKKTHYKNSHLELNKYFHHKEFWRREDIEARAEYLAERALQI
CCEEEEEECCCCCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH
WDYFGEEEVNPSESSILTGTTPKLLHIFGQEYSVKSWRDVLETTLNTLSDLEPEKFKEIM
HHHCCCCCCCCCCCCEECCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
QQFPRFIGIDEKDFRSTRKLKNGVFIEVNLSAKDIGAFCRKAIETTELSSEEWYVETVT
HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECC
>Mature Secondary Structure
MKASETKLQQIIEGAKQYLVPLFQRPYSWDKVQWEALWSDIVELYTMDAPHPHFMGSIVT
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCHHHH
MPTQAVPEGVSKFLLIDGQQRLTTIFIILSALRDRAKELELKLAEEINQTLLVNPFKEGS
CCCHHHHHHHHHEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCC
DYYKLELTRLKSDREAFHHIINSESHISSGISQCYLFFQKKIIHSGLELQRIKKVICSKL
CEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
SLVSIVLDLDDNPYLVFESLNAKGMPLTQADLIRNYLFMRIDISNQESVYTDYWKPMQEI
HHHHEEEECCCCCEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHH
LKNNLTDFIRHYLNKSGFDVKQSEIYFATKERISKSDSLSYLKDLYIFAEYYARLLEPQR
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHH
ELNENIRKHLYRLNRLDIATVYPFLLNCYDDWVQSKITEEEFISILKIIENFLIRRFICN
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VQTRGLNRIFALLYSEVSKRSSLASDDFIKRLKLSLQSRNYPKDAEFKARLIDVKLYGGN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCC
RSEKTKLILESIEESFKHKEKVSFDELSIEHIMPQTLNEWWQKSLGEDWAITHELYLHSL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHC
GNLTLTAYNPELSNNDFLYKKTHYKNSHLELNKYFHHKEFWRREDIEARAEYLAERALQI
CCEEEEEECCCCCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH
WDYFGEEEVNPSESSILTGTTPKLLHIFGQEYSVKSWRDVLETTLNTLSDLEPEKFKEIM
HHHCCCCCCCCCCCCEECCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
QQFPRFIGIDEKDFRSTRKLKNGVFIEVNLSAKDIGAFCRKAIETTELSSEEWYVETVT
HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA