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The map label for this gene is yeaV [H]

Identifier: 59711728

GI number: 59711728

Start: 1235510

End: 1237462

Strand: Reverse

Name: yeaV [H]

Synonym: VF_1121

Alternate gene names: 59711728

Gene position: 1237462-1235510 (Counterclockwise)

Preceding gene: 59711731

Following gene: 59711720

Centisome position: 42.71

GC content: 42.75

Gene sequence:

>1953_bases
ATGAAAAAACACTTCGAGCTTATCGATAAACCCACCTTTTTCGGCGCAATCTTACTGCTTTGTGCGGTTGTAGTTCCTTT
ACTGGTATTCCCAGCAGAAGGTGCCGAGTGGATTGCCGTAGCTAAAACATTTATGACCGACAAACTGGGCTTTGCATATT
TAGGGCTAGGTTTAGCGGCATTTTTCTTCATGATCTACATCGTGTTCTCTGATATCGGCCAAATCAAACTGGGTGATCCA
GATGAAAAGCCTGAATTTGCACTTGCGTCTTGGGCGGCTATGCTATTTTGTGGTGGTATCGGTGCCAGTATTTTGTACTG
GGGTACGATTGAATGGGCATACTACTACCAAAACCCTCCGTTTCAATTAGAAGCTGGCAGTGAGGAAGCAGTACGTTGGG
CGGCGACTTATGGTCTTTTCCACTGGGGTCCAATTGCTTGGTGTATCTATATGATCCCTGCAATTCCAATTGCTTACTTC
TTCTACGTACGTAAACAACCTGTACTAAAAGTATCTGCTGCTTTAATGCCTGTTATTGGCGAAGCAAACAGCTTTGGTAA
ACTGGGTAAAGTTATTGATGTATTGTTTATCTTCGGTCTATTGGGCGGCGCAGCAACAACCTTAGGTTTAGCAGCACCAC
TTATCAACGAAGGTATTAGCTACCTATTTGGTATTCCTGCAACAACAGGTAGCCAGATTTTAGTACTTATGGTTTGTACC
GCTATCTTTGCTTACTCATCGTACATGGGTATGGACAAAGGCATTAAGATTTTAAGTAATATTAACTTCTGGGGTGCGTT
AGGTTTACTGCTGTTTGTATTAGTTTGCGGTCCAACCATCTTTATGTTGGAAACAGGCTTAGACTCAATCGGTCGTATGC
TATCTAACTTCTTTGTAATGGCGACATGGGCTGAACCGTTTGGCGGCATGGGTACCTTTGCGGATACACACTTCCCACAA
GACTGGACGATTTTCTACTGGGCATGGTGGCTAGTATTTGCACCAAGTATGGGTCTGTTCGTTGCGCGTATTTCACGCGG
AAGAACGATTAAACAGATGGTTTCAGGTGCAGTATTCTTCGGCTCTTTAGGCTGTGCAATGTACTTCATCATCCTTGGCA
ACTACGGTTTATCACTGCAATTATCTGGTGAATTAGACGTTGTTGGTATTCTTAATAGCGAAGGCGCAACTCGTGCTATC
TTCTCTGTTTTAGAACAACTGCCATTCAGCACTTTTGTGATTGCTGTGTTTACTTTGTTATGTGTGATTTTCACTGCAAC
AACGTTTGACTCTATCTCTTACATTTTAGCGTCAGTAGTACAAACGAACGTAACTGAAGATCCAATGCGTTGGAACCGTC
TGTTCTGGGCTTTCACTCTATCATTCATGCCATCTGCATTGATGTTTATGGGCGGCTTGGCAACACTACAAACGGCAGCG
ATTGTTGGTGGTTTACCACTATTAGTTATCGCTATCATGCTAATGATCTCTGGTGTTAAAGCAGCCATGCTGGATTTATC
ACACCAAGATAATTACGTTGATCCTGTTATCAACATTTCTGACTTACCAGATGTTGATCCATGGAGCAAAGAAGGCCAAG
CATTGGCACGCTTTGAACAGTTACGTGATAACGCAATTGAAGCAGCTGATCTTGAGCGTGAAGCGAACGATGCTATTTGG
ATGCTGAAAAAACAATTACGTAAAGAAGCATTAGCTCGTGGTGAATCAAGTGTTGATTTAGGTGATGCGCCTGATGAGAT
CATTGAAAAATTACGTCAACTAACTGATGACTCGACAAATGCTAAAGAAGCGAAATTAGCAGCGTCTGAGCTTGCTCAAG
AAGCACGTGTTGCCTTTGATGCACTGATGCGTCAGAAAGTTGAAGAAGAAACACTACAAGCAAATGAAGAAGCAAAATTG
GCGATCAAAACAAGATTGAACACGCCAAGCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TACTCTATTAATTTAAGTTGAACCCGTCTGAATTCCCTCAGCACGGGGAATTATTGGTGCGCGCACTTAATTAAATCTGT
TTTTATTACGGACAATAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACTTGCATTAACTCAAATGCTAAATATGAAAAAACCGCTGAACTTCCAGCGGTTTTTTTATGTCAATATAACTAATTAAC
GGCTCTCATTATTCAAAGAA

Product: transporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 650; Mature: 650

Protein sequence:

>650_residues
MKKHFELIDKPTFFGAILLLCAVVVPLLVFPAEGAEWIAVAKTFMTDKLGFAYLGLGLAAFFFMIYIVFSDIGQIKLGDP
DEKPEFALASWAAMLFCGGIGASILYWGTIEWAYYYQNPPFQLEAGSEEAVRWAATYGLFHWGPIAWCIYMIPAIPIAYF
FYVRKQPVLKVSAALMPVIGEANSFGKLGKVIDVLFIFGLLGGAATTLGLAAPLINEGISYLFGIPATTGSQILVLMVCT
AIFAYSSYMGMDKGIKILSNINFWGALGLLLFVLVCGPTIFMLETGLDSIGRMLSNFFVMATWAEPFGGMGTFADTHFPQ
DWTIFYWAWWLVFAPSMGLFVARISRGRTIKQMVSGAVFFGSLGCAMYFIILGNYGLSLQLSGELDVVGILNSEGATRAI
FSVLEQLPFSTFVIAVFTLLCVIFTATTFDSISYILASVVQTNVTEDPMRWNRLFWAFTLSFMPSALMFMGGLATLQTAA
IVGGLPLLVIAIMLMISGVKAAMLDLSHQDNYVDPVINISDLPDVDPWSKEGQALARFEQLRDNAIEAADLEREANDAIW
MLKKQLRKEALARGESSVDLGDAPDEIIEKLRQLTDDSTNAKEAKLAASELAQEARVAFDALMRQKVEEETLQANEEAKL
AIKTRLNTPS

Sequences:

>Translated_650_residues
MKKHFELIDKPTFFGAILLLCAVVVPLLVFPAEGAEWIAVAKTFMTDKLGFAYLGLGLAAFFFMIYIVFSDIGQIKLGDP
DEKPEFALASWAAMLFCGGIGASILYWGTIEWAYYYQNPPFQLEAGSEEAVRWAATYGLFHWGPIAWCIYMIPAIPIAYF
FYVRKQPVLKVSAALMPVIGEANSFGKLGKVIDVLFIFGLLGGAATTLGLAAPLINEGISYLFGIPATTGSQILVLMVCT
AIFAYSSYMGMDKGIKILSNINFWGALGLLLFVLVCGPTIFMLETGLDSIGRMLSNFFVMATWAEPFGGMGTFADTHFPQ
DWTIFYWAWWLVFAPSMGLFVARISRGRTIKQMVSGAVFFGSLGCAMYFIILGNYGLSLQLSGELDVVGILNSEGATRAI
FSVLEQLPFSTFVIAVFTLLCVIFTATTFDSISYILASVVQTNVTEDPMRWNRLFWAFTLSFMPSALMFMGGLATLQTAA
IVGGLPLLVIAIMLMISGVKAAMLDLSHQDNYVDPVINISDLPDVDPWSKEGQALARFEQLRDNAIEAADLEREANDAIW
MLKKQLRKEALARGESSVDLGDAPDEIIEKLRQLTDDSTNAKEAKLAASELAQEARVAFDALMRQKVEEETLQANEEAKL
AIKTRLNTPS
>Mature_650_residues
MKKHFELIDKPTFFGAILLLCAVVVPLLVFPAEGAEWIAVAKTFMTDKLGFAYLGLGLAAFFFMIYIVFSDIGQIKLGDP
DEKPEFALASWAAMLFCGGIGASILYWGTIEWAYYYQNPPFQLEAGSEEAVRWAATYGLFHWGPIAWCIYMIPAIPIAYF
FYVRKQPVLKVSAALMPVIGEANSFGKLGKVIDVLFIFGLLGGAATTLGLAAPLINEGISYLFGIPATTGSQILVLMVCT
AIFAYSSYMGMDKGIKILSNINFWGALGLLLFVLVCGPTIFMLETGLDSIGRMLSNFFVMATWAEPFGGMGTFADTHFPQ
DWTIFYWAWWLVFAPSMGLFVARISRGRTIKQMVSGAVFFGSLGCAMYFIILGNYGLSLQLSGELDVVGILNSEGATRAI
FSVLEQLPFSTFVIAVFTLLCVIFTATTFDSISYILASVVQTNVTEDPMRWNRLFWAFTLSFMPSALMFMGGLATLQTAA
IVGGLPLLVIAIMLMISGVKAAMLDLSHQDNYVDPVINISDLPDVDPWSKEGQALARFEQLRDNAIEAADLEREANDAIW
MLKKQLRKEALARGESSVDLGDAPDEIIEKLRQLTDDSTNAKEAKLAASELAQEARVAFDALMRQKVEEETLQANEEAKL
AIKTRLNTPS

Specific function: Unknown

COG id: COG1292

COG function: function code M; Choline-glycine betaine transporter

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the BCCT transporter (TC 2.A.15) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788102, Length=465, Percent_Identity=33.7634408602151, Blast_Score=288, Evalue=6e-79,
Organism=Escherichia coli, GI1786224, Length=462, Percent_Identity=33.7662337662338, Blast_Score=270, Evalue=2e-73,
Organism=Escherichia coli, GI1786506, Length=597, Percent_Identity=29.4807370184255, Blast_Score=240, Evalue=2e-64,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR000060
- InterPro:   IPR018093 [H]

Pfam domain/function: PF02028 BCCT [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 71432; Mature: 71432

Theoretical pI: Translated: 4.51; Mature: 4.51

Prosite motif: PS01303 BCCT

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.1 %Cys     (Translated Protein)
3.8 %Met     (Translated Protein)
4.9 %Cys+Met (Translated Protein)
1.1 %Cys     (Mature Protein)
3.8 %Met     (Mature Protein)
4.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKKHFELIDKPTFFGAILLLCAVVVPLLVFPAEGAEWIAVAKTFMTDKLGFAYLGLGLAA
CCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FFFMIYIVFSDIGQIKLGDPDEKPEFALASWAAMLFCGGIGASILYWGTIEWAYYYQNPP
HHHHHHHHHHCCCCEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHEEEEEEEEEEEECCCC
FQLEAGSEEAVRWAATYGLFHWGPIAWCIYMIPAIPIAYFFYVRKQPVLKVSAALMPVIG
EEEECCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHC
EANSFGKLGKVIDVLFIFGLLGGAATTLGLAAPLINEGISYLFGIPATTGSQILVLMVCT
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHH
AIFAYSSYMGMDKGIKILSNINFWGALGLLLFVLVCGPTIFMLETGLDSIGRMLSNFFVM
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCHHHHHHHHHHHEEE
ATWAEPFGGMGTFADTHFPQDWTIFYWAWWLVFAPSMGLFVARISRGRTIKQMVSGAVFF
EEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
GSLGCAMYFIILGNYGLSLQLSGELDVVGILNSEGATRAIFSVLEQLPFSTFVIAVFTLL
HHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
CVIFTATTFDSISYILASVVQTNVTEDPMRWNRLFWAFTLSFMPSALMFMGGLATLQTAA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
IVGGLPLLVIAIMLMISGVKAAMLDLSHQDNYVDPVINISDLPDVDPWSKEGQALARFEQ
HHCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
LRDNAIEAADLEREANDAIWMLKKQLRKEALARGESSVDLGDAPDEIIEKLRQLTDDSTN
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCC
AKEAKLAASELAQEARVAFDALMRQKVEEETLQANEEAKLAIKTRLNTPS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKKHFELIDKPTFFGAILLLCAVVVPLLVFPAEGAEWIAVAKTFMTDKLGFAYLGLGLAA
CCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FFFMIYIVFSDIGQIKLGDPDEKPEFALASWAAMLFCGGIGASILYWGTIEWAYYYQNPP
HHHHHHHHHHCCCCEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHEEEEEEEEEEEECCCC
FQLEAGSEEAVRWAATYGLFHWGPIAWCIYMIPAIPIAYFFYVRKQPVLKVSAALMPVIG
EEEECCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHC
EANSFGKLGKVIDVLFIFGLLGGAATTLGLAAPLINEGISYLFGIPATTGSQILVLMVCT
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHH
AIFAYSSYMGMDKGIKILSNINFWGALGLLLFVLVCGPTIFMLETGLDSIGRMLSNFFVM
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCHHHHHHHHHHHEEE
ATWAEPFGGMGTFADTHFPQDWTIFYWAWWLVFAPSMGLFVARISRGRTIKQMVSGAVFF
EEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
GSLGCAMYFIILGNYGLSLQLSGELDVVGILNSEGATRAIFSVLEQLPFSTFVIAVFTLL
HHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
CVIFTATTFDSISYILASVVQTNVTEDPMRWNRLFWAFTLSFMPSALMFMGGLATLQTAA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
IVGGLPLLVIAIMLMISGVKAAMLDLSHQDNYVDPVINISDLPDVDPWSKEGQALARFEQ
HHCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
LRDNAIEAADLEREANDAIWMLKKQLRKEALARGESSVDLGDAPDEIIEKLRQLTDDSTN
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCC
AKEAKLAASELAQEARVAFDALMRQKVEEETLQANEEAKLAIKTRLNTPS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11206551; 11258796 [H]