Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 59711492

Identifier: 59711492

GI number: 59711492

Start: 970974

End: 973427

Strand: Direct

Name: 59711492

Synonym: VF_0885

Alternate gene names: NA

Gene position: 970974-973427 (Clockwise)

Preceding gene: 59711491

Following gene: 59711493

Centisome position: 33.51

GC content: 40.51

Gene sequence:

>2454_bases
ATGTTATTTCCGGTAGCTAAAGCGCTTCTTGGACACTACCGTAAACATCCGTTGCAAATCTTTTTAGTGTGGCTTGGTTT
AACACTCGGAGTTGCTTTACTTGTTGGTGTTCTCGCGATAAACCATCACGCTAAAGTCAGTTATAGCGAAGGCGAAAAGC
TTTTCTCAAATCCTTTTCCTAACCGTATTCGCTCTATTCAAGATAATGTTGTTATCCCTCAGGCGTTTTATATTAACTTA
CGTCGGGCTGGCTACACCTCTTGCATGCCTATACAAACCTTGCATTTAGAAACCAATGAAAAGATTGATATCTCTATGGT
TGGTATCGATCCTATTGCGTTAATGCAGATTTCATCAGGGAACTTAGCAAACACGGACAATATGTTGTCTTTAATGCGTC
CTCCGTTCCCGGTATTGATCAGTAAGCCGCTAGCTTCGTATTTTAGCTTAAAAGATGGCGATTATATTGAGTTAAAAAAC
CAATCCAATATTGGCCCTGTTATTGTTGATAAACAAAATCGCTTGGCGGGCTCTCGACTGTTTTCAGATATCGCACTGAC
TAAGATGCTAGGCCATAAAGCGGGCTTTAATATCATTTTATGCGGAGCAATGTCAGAGCAAAAAAAAGAGCGTTTAGAGC
GAATGCTTCCTCGTGGATTGCAACTTGAAACGCATAAAGAATCGGGCTTAACGGCGTTAACGAATGCTTTTCACACGAAT
TTACTTGCGATGGGAATGCTCTCTTTTATCGTTGGTCTCTTTATTTTCTATCAAGCTATGTCGCTCTCTTTTGTGCAGAG
ACAGCCGTTGGTTGGGACGCTACGTCAAATTGGCGTATCCACAAAAGAGCTTATTTTAGCCATGAGCCTCGAAGTGATCA
TTTGGATCATTATTGGCTGGATAAGTGGTAACTTTTTTGGCTTATTGTTGGCGAATGAATTAATGCCGACGGTATCGAAC
AGTTTGTATTCTTTATATAACGCTGAAGTGGATTTATTAATCTCATGGAGTTGGGATTGGAGTTATCAAAGTCTGCTAAT
GGCCGTATTAGGGTGTGTATTAGCTTGTGGTTGGCCGTTGTATCGTCTTTTAACCATTGAGCCAATTCGCTTAACTGCTC
GTCTATCTTTAGCACGTTTTGCAGGCAAAGAGTTTGAAGTTCAAGCTATCATCGCTTGTGTGATTTTCGTTGCAGCTTAT
CTGATAAATTTATTACCTCATAGTCACAGAAATGGGTTTATGTTGATTGGCTTCTTAATGATAAGTATTGGGTTGTTAAC
CCCGTTTATTATTTGGAAGTTTTTTGATTGGCTCTCTTATACATTGCCATCAGCAAAAGCACGTTGGTTCTTCTCTGATT
CAGCAGCAAGCTTAAGTTATCGTGGTGTGGCGGCAATGGCCTTTATGCTTGCGCTAGCATCTAATATTGGCGTGGAAACC
ATGGTGGGCAGTTTTAGAGCAACCACTAACAATTGGTTAGAGCAACGCTTGGCTGCTGATATTTATATTGAACCAAGTAA
AGCGTCGGCTGGACGAATCAGTTATTGGTTAGAAAAACAACCTGAAGTGAAATCTGTGTGGCGTCAGTGGAAGATTGATT
ATCAAACAGAATTCGGCAATTTAGAGATCATCAGTACTGGTTCTACTGAGGGTGAGAAAAATGCGTTAACCATGAAAGTG
GCGATTCCTGATTACTGGTATTCACTTCACCATGGACGCAATGTATTAATCAGTGAATCCATGTCATTGAAATGGGACTT
AAAACCGGGTGATTACATCGATCTTCCTGCTCCTATGGGGAACAATTGGCAGATTTCTGGTGTGTATTATGATTACGGAA
ATCCGTATAACCAATTGTTGCTCTCTCATGGGACGTGGTTAAAGGCGTTTGGCGGTCAGGGTAAAACCGGGATTGGGGTT
GTGCTAACGGACCAAGCAAAAAGAACCGAATTAATTGGACGAGTATTAAAACAGTATCGATTATCTGCAGAGCAGGTTAG
CGATAATAATAATATTCAAATACAGGCAATGCGTGTGTTTGATAGAACATTTATTGTTACGGGAACCCTTGGTAATCTGA
CGTTAGTTATCGCTGTTTTTGGTCTGTTTTTTGCCACATTGGTTGGTGAAATATCACGACAAAGACAAACTGCATTATTG
CGATGTTTAGGACTGTCTGGCAAAGAGTTGGTGCTGCTTGGTGGCTTACAGTTGCTGGTTATTGGCTTATTTACCATTCT
TATTGCATTGCCGTTAGGGCTGATTTTGTCACAGCTATTGATTGATATTGTTATGAAATATGCTTTTGGTTGGACAATGG
AAATCCATTACTTCCCTAAAGAATACACCATTACGTTCTTATGGACTTTACTGGCTTTAACTGTTGCTGGTGCTGGAACC
ATTTGGAGAGTAACAAAGCGACAAGCCATTACTTCATTAAGGGAATCTTTGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTATCTCGTGATCTTCATTGCACACTTTTATTGGTGACTCACAGTGAGAAAGTGGCAGAGCATATGGATGGTTTAGTTAA
ACTTCAGGGAGGCTTACTGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGCAAAGCCAAAATAAAAAGAACAGTAGCTTGATAATATCAGTGCTGATTTTGATTGCTATTTTAGGTTGTGCTCTCGCT
TATTACTTTAATTGGCAGCA

Product: ABC transporter permease protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 817; Mature: 817

Protein sequence:

>817_residues
MLFPVAKALLGHYRKHPLQIFLVWLGLTLGVALLVGVLAINHHAKVSYSEGEKLFSNPFPNRIRSIQDNVVIPQAFYINL
RRAGYTSCMPIQTLHLETNEKIDISMVGIDPIALMQISSGNLANTDNMLSLMRPPFPVLISKPLASYFSLKDGDYIELKN
QSNIGPVIVDKQNRLAGSRLFSDIALTKMLGHKAGFNIILCGAMSEQKKERLERMLPRGLQLETHKESGLTALTNAFHTN
LLAMGMLSFIVGLFIFYQAMSLSFVQRQPLVGTLRQIGVSTKELILAMSLEVIIWIIIGWISGNFFGLLLANELMPTVSN
SLYSLYNAEVDLLISWSWDWSYQSLLMAVLGCVLACGWPLYRLLTIEPIRLTARLSLARFAGKEFEVQAIIACVIFVAAY
LINLLPHSHRNGFMLIGFLMISIGLLTPFIIWKFFDWLSYTLPSAKARWFFSDSAASLSYRGVAAMAFMLALASNIGVET
MVGSFRATTNNWLEQRLAADIYIEPSKASAGRISYWLEKQPEVKSVWRQWKIDYQTEFGNLEIISTGSTEGEKNALTMKV
AIPDYWYSLHHGRNVLISESMSLKWDLKPGDYIDLPAPMGNNWQISGVYYDYGNPYNQLLLSHGTWLKAFGGQGKTGIGV
VLTDQAKRTELIGRVLKQYRLSAEQVSDNNNIQIQAMRVFDRTFIVTGTLGNLTLVIAVFGLFFATLVGEISRQRQTALL
RCLGLSGKELVLLGGLQLLVIGLFTILIALPLGLILSQLLIDIVMKYAFGWTMEIHYFPKEYTITFLWTLLALTVAGAGT
IWRVTKRQAITSLRESL

Sequences:

>Translated_817_residues
MLFPVAKALLGHYRKHPLQIFLVWLGLTLGVALLVGVLAINHHAKVSYSEGEKLFSNPFPNRIRSIQDNVVIPQAFYINL
RRAGYTSCMPIQTLHLETNEKIDISMVGIDPIALMQISSGNLANTDNMLSLMRPPFPVLISKPLASYFSLKDGDYIELKN
QSNIGPVIVDKQNRLAGSRLFSDIALTKMLGHKAGFNIILCGAMSEQKKERLERMLPRGLQLETHKESGLTALTNAFHTN
LLAMGMLSFIVGLFIFYQAMSLSFVQRQPLVGTLRQIGVSTKELILAMSLEVIIWIIIGWISGNFFGLLLANELMPTVSN
SLYSLYNAEVDLLISWSWDWSYQSLLMAVLGCVLACGWPLYRLLTIEPIRLTARLSLARFAGKEFEVQAIIACVIFVAAY
LINLLPHSHRNGFMLIGFLMISIGLLTPFIIWKFFDWLSYTLPSAKARWFFSDSAASLSYRGVAAMAFMLALASNIGVET
MVGSFRATTNNWLEQRLAADIYIEPSKASAGRISYWLEKQPEVKSVWRQWKIDYQTEFGNLEIISTGSTEGEKNALTMKV
AIPDYWYSLHHGRNVLISESMSLKWDLKPGDYIDLPAPMGNNWQISGVYYDYGNPYNQLLLSHGTWLKAFGGQGKTGIGV
VLTDQAKRTELIGRVLKQYRLSAEQVSDNNNIQIQAMRVFDRTFIVTGTLGNLTLVIAVFGLFFATLVGEISRQRQTALL
RCLGLSGKELVLLGGLQLLVIGLFTILIALPLGLILSQLLIDIVMKYAFGWTMEIHYFPKEYTITFLWTLLALTVAGAGT
IWRVTKRQAITSLRESL
>Mature_817_residues
MLFPVAKALLGHYRKHPLQIFLVWLGLTLGVALLVGVLAINHHAKVSYSEGEKLFSNPFPNRIRSIQDNVVIPQAFYINL
RRAGYTSCMPIQTLHLETNEKIDISMVGIDPIALMQISSGNLANTDNMLSLMRPPFPVLISKPLASYFSLKDGDYIELKN
QSNIGPVIVDKQNRLAGSRLFSDIALTKMLGHKAGFNIILCGAMSEQKKERLERMLPRGLQLETHKESGLTALTNAFHTN
LLAMGMLSFIVGLFIFYQAMSLSFVQRQPLVGTLRQIGVSTKELILAMSLEVIIWIIIGWISGNFFGLLLANELMPTVSN
SLYSLYNAEVDLLISWSWDWSYQSLLMAVLGCVLACGWPLYRLLTIEPIRLTARLSLARFAGKEFEVQAIIACVIFVAAY
LINLLPHSHRNGFMLIGFLMISIGLLTPFIIWKFFDWLSYTLPSAKARWFFSDSAASLSYRGVAAMAFMLALASNIGVET
MVGSFRATTNNWLEQRLAADIYIEPSKASAGRISYWLEKQPEVKSVWRQWKIDYQTEFGNLEIISTGSTEGEKNALTMKV
AIPDYWYSLHHGRNVLISESMSLKWDLKPGDYIDLPAPMGNNWQISGVYYDYGNPYNQLLLSHGTWLKAFGGQGKTGIGV
VLTDQAKRTELIGRVLKQYRLSAEQVSDNNNIQIQAMRVFDRTFIVTGTLGNLTLVIAVFGLFFATLVGEISRQRQTALL
RCLGLSGKELVLLGGLQLLVIGLFTILIALPLGLILSQLLIDIVMKYAFGWTMEIHYFPKEYTITFLWTLLALTVAGAGT
IWRVTKRQAITSLRESL

Specific function: Unknown

COG id: COG0577

COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 91494; Mature: 91494

Theoretical pI: Translated: 9.46; Mature: 9.46

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
3.2 %Met     (Translated Protein)
3.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
3.2 %Met     (Mature Protein)
3.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLFPVAKALLGHYRKHPLQIFLVWLGLTLGVALLVGVLAINHHAKVSYSEGEKLFSNPFP
CCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCHHHCCCCC
NRIRSIQDNVVIPQAFYINLRRAGYTSCMPIQTLHLETNEKIDISMVGIDPIALMQISSG
HHHHHHHCCEECCCCEEEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEEEECCCCEEEEEECCC
NLANTDNMLSLMRPPFPVLISKPLASYFSLKDGDYIELKNQSNIGPVIVDKQNRLAGSRL
CCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCCEEECCCCHHHHHHH
FSDIALTKMLGHKAGFNIILCGAMSEQKKERLERMLPRGLQLETHKESGLTALTNAFHTN
HHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHH
LLAMGMLSFIVGLFIFYQAMSLSFVQRQPLVGTLRQIGVSTKELILAMSLEVIIWIIIGW
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISGNFFGLLLANELMPTVSNSLYSLYNAEVDLLISWSWDWSYQSLLMAVLGCVLACGWPL
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
YRLLTIEPIRLTARLSLARFAGKEFEVQAIIACVIFVAAYLINLLPHSHRNGFMLIGFLM
HHHHEECCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHH
ISIGLLTPFIIWKFFDWLSYTLPSAKARWFFSDSAASLSYRGVAAMAFMLALASNIGVET
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
MVGSFRATTNNWLEQRLAADIYIEPSKASAGRISYWLEKQPEVKSVWRQWKIDYQTEFGN
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCEEECCCC
LEIISTGSTEGEKNALTMKVAIPDYWYSLHHGRNVLISESMSLKWDLKPGDYIDLPAPMG
EEEEECCCCCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHCCCEEEEECCCCEEEECCCCCEEECCCCCC
NNWQISGVYYDYGNPYNQLLLSHGTWLKAFGGQGKTGIGVVLTDQAKRTELIGRVLKQYR
CCEEEEEEEEECCCCHHHHHHCCCCEEECCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHH
LSAEQVSDNNNIQIQAMRVFDRTFIVTGTLGNLTLVIAVFGLFFATLVGEISRQRQTALL
CCHHHCCCCCCEEEEEEEEECEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RCLGLSGKELVLLGGLQLLVIGLFTILIALPLGLILSQLLIDIVMKYAFGWTMEIHYFPK
HHHCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCC
EYTITFLWTLLALTVAGAGTIWRVTKRQAITSLRESL
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MLFPVAKALLGHYRKHPLQIFLVWLGLTLGVALLVGVLAINHHAKVSYSEGEKLFSNPFP
CCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCHHHCCCCC
NRIRSIQDNVVIPQAFYINLRRAGYTSCMPIQTLHLETNEKIDISMVGIDPIALMQISSG
HHHHHHHCCEECCCCEEEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEEEECCCCEEEEEECCC
NLANTDNMLSLMRPPFPVLISKPLASYFSLKDGDYIELKNQSNIGPVIVDKQNRLAGSRL
CCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCCEEECCCCHHHHHHH
FSDIALTKMLGHKAGFNIILCGAMSEQKKERLERMLPRGLQLETHKESGLTALTNAFHTN
HHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHH
LLAMGMLSFIVGLFIFYQAMSLSFVQRQPLVGTLRQIGVSTKELILAMSLEVIIWIIIGW
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISGNFFGLLLANELMPTVSNSLYSLYNAEVDLLISWSWDWSYQSLLMAVLGCVLACGWPL
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
YRLLTIEPIRLTARLSLARFAGKEFEVQAIIACVIFVAAYLINLLPHSHRNGFMLIGFLM
HHHHEECCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHH
ISIGLLTPFIIWKFFDWLSYTLPSAKARWFFSDSAASLSYRGVAAMAFMLALASNIGVET
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
MVGSFRATTNNWLEQRLAADIYIEPSKASAGRISYWLEKQPEVKSVWRQWKIDYQTEFGN
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCEEECCCC
LEIISTGSTEGEKNALTMKVAIPDYWYSLHHGRNVLISESMSLKWDLKPGDYIDLPAPMG
EEEEECCCCCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHCCCEEEEECCCCEEEECCCCCEEECCCCCC
NNWQISGVYYDYGNPYNQLLLSHGTWLKAFGGQGKTGIGVVLTDQAKRTELIGRVLKQYR
CCEEEEEEEEECCCCHHHHHHCCCCEEECCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHH
LSAEQVSDNNNIQIQAMRVFDRTFIVTGTLGNLTLVIAVFGLFFATLVGEISRQRQTALL
CCHHHCCCCCCEEEEEEEEECEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RCLGLSGKELVLLGGLQLLVIGLFTILIALPLGLILSQLLIDIVMKYAFGWTMEIHYFPK
HHHCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCC
EYTITFLWTLLALTVAGAGTIWRVTKRQAITSLRESL
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA