| Definition | Vibrio fischeri ES114 chromosome I, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_006840 |
| Length | 2,897,536 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 59710954
Identifier: 59710954
GI number: 59710954
Start: 376099
End: 377478
Strand: Reverse
Name: 59710954
Synonym: VF_0347
Alternate gene names: NA
Gene position: 377478-376099 (Counterclockwise)
Preceding gene: 59710955
Following gene: 59710953
Centisome position: 13.03
GC content: 36.88
Gene sequence:
>1380_bases ATGAAAATGAATACGGGCTTATATCTTCAAATCTACGCCATATTTACTCTTGTTTTTTGCGGTTCGACGCAATATTTCAC AGGTGTTTCTGCAGTTTTATGGTTGCCGTTTTTACTCGCTTTCGCCATGACGGGGTTATTATTACTACAAGTTCGTTATT CTCCCCTGAATTTAGACCATAAAGAAATGATCATATTGATACTCTTTCTTGGTTTTTTTGGCATTGCATTAGTTAGTACT TACTTACAAAACGGAGTTACGATAACAATCGTTGGTCTAAAGAATGAACTTGCACTCTCATTAATACTATTTTGTTTATT ACTTCGATTTTGTCGCGAATCACAAATCTATCGAGTCACGAAAACACTCTATTGGATTTTCTATGCTCAATTTCCCGTCG TCTTATATCAAGTGTTTGTTATTTTACCCCAGCGGGTTGCATCTGAAGGTGAGTTTGAAAAGTGGGATTCCGTCGTAGGA ACCTTTGGCGGCGACCCTATGGGGGGGGGAAATACCGCAGCGATGGGACTATTCTGTTTATTGATAATGCTATTAAAACT TTCAGAATATAAACACGGCTTAACAACAATAAAATCAACGATTTTACATATTGGTGCCGCGTTCACTCTCTGTATTTTAG GTGAGATTAAATTTGTTATTTTACTCTCCCCTATACTACTGGCTTATGTATGGCTTGCTCCAAGTTATATTAAGGGAATG AAAAGTTATGATATTAAAATTATCTTAGCTATTGTGAGTGGCATGCTACTACTTATGAGTATTGCTATCTTACTGCTTTC TCTTTCTTACTCATCCGCTTTTGGTAGTGATCCAACCAAAGGACCGTTAGATATATTTATTGATTCATTAGAATATATTT TTGATCCCAACTACATAATGCCATCAGGTGAGCTAGGTCGAATGACCACTATCTTCTTTTGGTTAGAGCATAACGATTTA TTCGGTTTACCAAGTACGCTATTTGGTTATGGATTAAATACCACAAACCACGGTAGTGCTGTAGCTCCCGGTTTTTTAAA TGTGGTTTTTAATGTCATTCTCGATTCAACAGCTCTTAGTGTTCTTTTATGGGAATTAGGCATCATAGGTACGCTTTTTT TCATTTCAATGACAATCTATATCCTTAAGGTCTGTAAACCTACCCCCTTATTTAATCGCAAGGATGTAGCCAAAGAAGAC ATCAGGTTAATGAGCTATCCACCAGCATTTAATGCATTTGCCATCGGGTGTTTATTAAGCCTTCCATATAGTCAAATATT GATGCTTGTTCCCATGCTTCAATTTCTTTTTTACTTATCATTAGGCTCAAACCTAGTGATCCGAAAATCACTGATCACGG CGGCAGAAAACCATGACTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CTGTTTTATTATTTGCGGTTTTATCCTTTATTCGTTACGCCTTTATTTATTTAAAAGTAAACAAAAGAGCACACCTTTTA GCTAAGGAAGATGCTTAATA
Downstream 100 bases:
>100_bases ACTTCCATTTATCTCAGTCATTATCAAGACTTATAATGAAGAAGCAGGCATAGAGAAAACTATCTCCAGCATCAAAAAAA ATATGGGGGTATACCCTCAT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 459; Mature: 459
Protein sequence:
>459_residues MKMNTGLYLQIYAIFTLVFCGSTQYFTGVSAVLWLPFLLAFAMTGLLLLQVRYSPLNLDHKEMIILILFLGFFGIALVST YLQNGVTITIVGLKNELALSLILFCLLLRFCRESQIYRVTKTLYWIFYAQFPVVLYQVFVILPQRVASEGEFEKWDSVVG TFGGDPMGGGNTAAMGLFCLLIMLLKLSEYKHGLTTIKSTILHIGAAFTLCILGEIKFVILLSPILLAYVWLAPSYIKGM KSYDIKIILAIVSGMLLLMSIAILLLSLSYSSAFGSDPTKGPLDIFIDSLEYIFDPNYIMPSGELGRMTTIFFWLEHNDL FGLPSTLFGYGLNTTNHGSAVAPGFLNVVFNVILDSTALSVLLWELGIIGTLFFISMTIYILKVCKPTPLFNRKDVAKED IRLMSYPPAFNAFAIGCLLSLPYSQILMLVPMLQFLFYLSLGSNLVIRKSLITAAENHD
Sequences:
>Translated_459_residues MKMNTGLYLQIYAIFTLVFCGSTQYFTGVSAVLWLPFLLAFAMTGLLLLQVRYSPLNLDHKEMIILILFLGFFGIALVST YLQNGVTITIVGLKNELALSLILFCLLLRFCRESQIYRVTKTLYWIFYAQFPVVLYQVFVILPQRVASEGEFEKWDSVVG TFGGDPMGGGNTAAMGLFCLLIMLLKLSEYKHGLTTIKSTILHIGAAFTLCILGEIKFVILLSPILLAYVWLAPSYIKGM KSYDIKIILAIVSGMLLLMSIAILLLSLSYSSAFGSDPTKGPLDIFIDSLEYIFDPNYIMPSGELGRMTTIFFWLEHNDL FGLPSTLFGYGLNTTNHGSAVAPGFLNVVFNVILDSTALSVLLWELGIIGTLFFISMTIYILKVCKPTPLFNRKDVAKED IRLMSYPPAFNAFAIGCLLSLPYSQILMLVPMLQFLFYLSLGSNLVIRKSLITAAENHD >Mature_459_residues MKMNTGLYLQIYAIFTLVFCGSTQYFTGVSAVLWLPFLLAFAMTGLLLLQVRYSPLNLDHKEMIILILFLGFFGIALVST YLQNGVTITIVGLKNELALSLILFCLLLRFCRESQIYRVTKTLYWIFYAQFPVVLYQVFVILPQRVASEGEFEKWDSVVG TFGGDPMGGGNTAAMGLFCLLIMLLKLSEYKHGLTTIKSTILHIGAAFTLCILGEIKFVILLSPILLAYVWLAPSYIKGM KSYDIKIILAIVSGMLLLMSIAILLLSLSYSSAFGSDPTKGPLDIFIDSLEYIFDPNYIMPSGELGRMTTIFFWLEHNDL FGLPSTLFGYGLNTTNHGSAVAPGFLNVVFNVILDSTALSVLLWELGIIGTLFFISMTIYILKVCKPTPLFNRKDVAKED IRLMSYPPAFNAFAIGCLLSLPYSQILMLVPMLQFLFYLSLGSNLVIRKSLITAAENHD
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 51165; Mature: 51165
Theoretical pI: Translated: 7.42; Mature: 7.42
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.5 %Cys (Translated Protein) 3.5 %Met (Translated Protein) 5.0 %Cys+Met (Translated Protein) 1.5 %Cys (Mature Protein) 3.5 %Met (Mature Protein) 5.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKMNTGLYLQIYAIFTLVFCGSTQYFTGVSAVLWLPFLLAFAMTGLLLLQVRYSPLNLDH CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCH KEMIILILFLGFFGIALVSTYLQNGVTITIVGLKNELALSLILFCLLLRFCRESQIYRVT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH KTLYWIFYAQFPVVLYQVFVILPQRVASEGEFEKWDSVVGTFGGDPMGGGNTAAMGLFCL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH LIMLLKLSEYKHGLTTIKSTILHIGAAFTLCILGEIKFVILLSPILLAYVWLAPSYIKGM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC KSYDIKIILAIVSGMLLLMSIAILLLSLSYSSAFGSDPTKGPLDIFIDSLEYIFDPNYIM HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEC PSGELGRMTTIFFWLEHNDLFGLPSTLFGYGLNTTNHGSAVAPGFLNVVFNVILDSTALS CCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH VLLWELGIIGTLFFISMTIYILKVCKPTPLFNRKDVAKEDIRLMSYPPAFNAFAIGCLLS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHH LPYSQILMLVPMLQFLFYLSLGSNLVIRKSLITAAENHD CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure MKMNTGLYLQIYAIFTLVFCGSTQYFTGVSAVLWLPFLLAFAMTGLLLLQVRYSPLNLDH CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCH KEMIILILFLGFFGIALVSTYLQNGVTITIVGLKNELALSLILFCLLLRFCRESQIYRVT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH KTLYWIFYAQFPVVLYQVFVILPQRVASEGEFEKWDSVVGTFGGDPMGGGNTAAMGLFCL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH LIMLLKLSEYKHGLTTIKSTILHIGAAFTLCILGEIKFVILLSPILLAYVWLAPSYIKGM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC KSYDIKIILAIVSGMLLLMSIAILLLSLSYSSAFGSDPTKGPLDIFIDSLEYIFDPNYIM HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEC PSGELGRMTTIFFWLEHNDLFGLPSTLFGYGLNTTNHGSAVAPGFLNVVFNVILDSTALS CCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH VLLWELGIIGTLFFISMTIYILKVCKPTPLFNRKDVAKEDIRLMSYPPAFNAFAIGCLLS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHH LPYSQILMLVPMLQFLFYLSLGSNLVIRKSLITAAENHD CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA