Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is secY [H]

Identifier: 58617337

GI number: 58617337

Start: 984384

End: 985682

Strand: Reverse

Name: secY [H]

Synonym: ERGA_CDS_06100

Alternate gene names: 58617337

Gene position: 985682-984384 (Counterclockwise)

Preceding gene: 58617338

Following gene: 58617336

Centisome position: 65.72

GC content: 28.79

Gene sequence:

>1299_bases
ATGGCTCTGCTGTCTTGGAATAAGGATAATTTATTAGGTAAGATTTGGTTTACGCTATTAGCTTTAATTATATATCGTTT
AGGTACATATATACCTATTCCAGGCATTAATCCAGATGTAATAGATGCAGTTATCTCAAAACATTCAGTGGGTGTTTTAG
GTATTTTTAATGTATTTTCTGGTGGTGCTTTAGGTAGAATGACAATTTTTGCCCTTAATGTTATGCCATATATAGTTTCT
TCTATAATTATGCAGTTACTTTCAGTTACAATTCCAAGATTGAATGAGATGAGACAAAGTGGTGAATTAGGTAGGGTAAA
GATTAATACTTATGTACGATATATAACTATTGTTTTCTGTTTAATTCAAGGTTCTATTATCTTGCTTGGGTTAGAAAAAA
TGAATACACAGACTAGTATTGTGGTAATTGATCCTGGTTTGTTATTTAGGGTAGTAGGTATTAGTAGCTTGTTAGGTGGC
ACAATGTTTCTACTCTGGTTAGGTGATAGTATAAATAAAAGGGGTATTGGTAATGGGATTTCTCTAATTATATTTACAGG
AATAATTGCAGAGTTACCAGGTTCTTTTTCTGCTATGTTTTTATTAGGTAAAAATGGCAATGTGCCAATATTTGTGATTT
TATTAATGATATTAATATTTTTTGCATTACTATTGTTAATCATTTTCGTTGAAAAATCTTATAGAAAAATTTTAGTACAA
TATCCAAAAAGGCAGGTTAAAAATAAATTATATAATACTGCATCTACATATGTTCCGCTAAAAATTAATATTTCTGGAGT
TATACCTCCTATTTTTGCAAATGCTTTACTGTTATCACCGATTACTGTTGCAAATTTTCATCAAGGTTCTCCATGGTCTG
ATTTTATACTTATGTATTTTTCATCTGGTAAGCTGTTGTATATAGTGTGTTATGCACTATTAATAGTGTTTTTTGCGTTT
TTTTATATGACATTTGTTTTTGATGCAAAAGAAACATCAGAATTGTTAAAGAAAAATGGGGGATTTGTTCCAGGTAAAAG
GCCAGGTAATAGTACTTGTGAGTATTTTAATTATGTAATGAAACGATTAACTGTTTTGGGATCAGTATATTTAACAGTTA
TTTGTATAGTTCCTGAGCTTATTAGGTATTATTATTCTATATCTTTTACTTTGGGGGGCACTAGTTTTCTAATAATAGTT
AATGTTATTATTGATACATTTTCTCAAATTCAAACACATTTGTATTCAAGTCGTTATAGTACATTAATTAAAAAGTCTGA
ATTATGGAAAATAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAAATCAGCAAAGTCACAGGTTACTTTATTGAATAGTCTTTCAGATAGTGAATCAAAATAACATTTTTAATATAAATTTA
GATAATCTTAGGTTATAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATATGTTGATATTTGGTCCACCTGGGTCTGGTAAGGGTACTCAGTGTCGTATTTTGTCAGAGATTTATCCTAGTATTTCT
GTTATTTCAACTGGGGATTT

Product: preprotein translocase subunit SecY

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 432; Mature: 431

Protein sequence:

>432_residues
MALLSWNKDNLLGKIWFTLLALIIYRLGTYIPIPGINPDVIDAVISKHSVGVLGIFNVFSGGALGRMTIFALNVMPYIVS
SIIMQLLSVTIPRLNEMRQSGELGRVKINTYVRYITIVFCLIQGSIILLGLEKMNTQTSIVVIDPGLLFRVVGISSLLGG
TMFLLWLGDSINKRGIGNGISLIIFTGIIAELPGSFSAMFLLGKNGNVPIFVILLMILIFFALLLLIIFVEKSYRKILVQ
YPKRQVKNKLYNTASTYVPLKINISGVIPPIFANALLLSPITVANFHQGSPWSDFILMYFSSGKLLYIVCYALLIVFFAF
FYMTFVFDAKETSELLKKNGGFVPGKRPGNSTCEYFNYVMKRLTVLGSVYLTVICIVPELIRYYYSISFTLGGTSFLIIV
NVIIDTFSQIQTHLYSSRYSTLIKKSELWKIK

Sequences:

>Translated_432_residues
MALLSWNKDNLLGKIWFTLLALIIYRLGTYIPIPGINPDVIDAVISKHSVGVLGIFNVFSGGALGRMTIFALNVMPYIVS
SIIMQLLSVTIPRLNEMRQSGELGRVKINTYVRYITIVFCLIQGSIILLGLEKMNTQTSIVVIDPGLLFRVVGISSLLGG
TMFLLWLGDSINKRGIGNGISLIIFTGIIAELPGSFSAMFLLGKNGNVPIFVILLMILIFFALLLLIIFVEKSYRKILVQ
YPKRQVKNKLYNTASTYVPLKINISGVIPPIFANALLLSPITVANFHQGSPWSDFILMYFSSGKLLYIVCYALLIVFFAF
FYMTFVFDAKETSELLKKNGGFVPGKRPGNSTCEYFNYVMKRLTVLGSVYLTVICIVPELIRYYYSISFTLGGTSFLIIV
NVIIDTFSQIQTHLYSSRYSTLIKKSELWKIK
>Mature_431_residues
ALLSWNKDNLLGKIWFTLLALIIYRLGTYIPIPGINPDVIDAVISKHSVGVLGIFNVFSGGALGRMTIFALNVMPYIVSS
IIMQLLSVTIPRLNEMRQSGELGRVKINTYVRYITIVFCLIQGSIILLGLEKMNTQTSIVVIDPGLLFRVVGISSLLGGT
MFLLWLGDSINKRGIGNGISLIIFTGIIAELPGSFSAMFLLGKNGNVPIFVILLMILIFFALLLLIIFVEKSYRKILVQY
PKRQVKNKLYNTASTYVPLKINISGVIPPIFANALLLSPITVANFHQGSPWSDFILMYFSSGKLLYIVCYALLIVFFAFF
YMTFVFDAKETSELLKKNGGFVPGKRPGNSTCEYFNYVMKRLTVLGSVYLTVICIVPELIRYYYSISFTLGGTSFLIIVN
VIIDTFSQIQTHLYSSRYSTLIKKSELWKIK

Specific function: Involved in protein export. Interacts with secA and secE to allow the translocation of proteins across the plasma membrane, by forming part of a channel [H]

COG id: COG0201

COG function: function code U; Preprotein translocase subunit SecY

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the secY/SEC61-alpha family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1789696, Length=418, Percent_Identity=44.7368421052632, Blast_Score=335, Evalue=3e-93,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002208
- InterPro:   IPR023201 [H]

Pfam domain/function: PF00344 SecY [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 48353; Mature: 48222

Theoretical pI: Translated: 10.09; Mature: 10.09

Prosite motif: PS00755 SECY_1 ; PS00756 SECY_2

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
2.8 %Met     (Translated Protein)
3.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
3.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MALLSWNKDNLLGKIWFTLLALIIYRLGTYIPIPGINPDVIDAVISKHSVGVLGIFNVFS
CCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHC
GGALGRMTIFALNVMPYIVSSIIMQLLSVTIPRLNEMRQSGELGRVKINTYVRYITIVFC
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHH
LIQGSIILLGLEKMNTQTSIVVIDPGLLFRVVGISSLLGGTMFLLWLGDSINKRGIGNGI
HHCCCEEEEEEECCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCCCCH
SLIIFTGIIAELPGSFSAMFLLGKNGNVPIFVILLMILIFFALLLLIIFVEKSYRKILVQ
HHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YPKRQVKNKLYNTASTYVPLKINISGVIPPIFANALLLSPITVANFHQGSPWSDFILMYF
HHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCEECCCCCCCHHHEEEEEE
SSGKLLYIVCYALLIVFFAFFYMTFVFDAKETSELLKKNGGFVPGKRPGNSTCEYFNYVM
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
KRLTVLGSVYLTVICIVPELIRYYYSISFTLGGTSFLIIVNVIIDTFSQIQTHLYSSRYS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TLIKKSELWKIK
HHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure 
ALLSWNKDNLLGKIWFTLLALIIYRLGTYIPIPGINPDVIDAVISKHSVGVLGIFNVFS
CEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHC
GGALGRMTIFALNVMPYIVSSIIMQLLSVTIPRLNEMRQSGELGRVKINTYVRYITIVFC
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHH
LIQGSIILLGLEKMNTQTSIVVIDPGLLFRVVGISSLLGGTMFLLWLGDSINKRGIGNGI
HHCCCEEEEEEECCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCCCCH
SLIIFTGIIAELPGSFSAMFLLGKNGNVPIFVILLMILIFFALLLLIIFVEKSYRKILVQ
HHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YPKRQVKNKLYNTASTYVPLKINISGVIPPIFANALLLSPITVANFHQGSPWSDFILMYF
HHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCEECCCCCCCHHHEEEEEE
SSGKLLYIVCYALLIVFFAFFYMTFVFDAKETSELLKKNGGFVPGKRPGNSTCEYFNYVM
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
KRLTVLGSVYLTVICIVPELIRYYYSISFTLGGTSFLIIVNVIIDTFSQIQTHLYSSRYS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TLIKKSELWKIK
HHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA