| Definition | Ehrlichia ruminantium str. Gardel, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_006831 |
| Length | 1,499,920 |
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The map label for this gene is 58617273
Identifier: 58617273
GI number: 58617273
Start: 884649
End: 888827
Strand: Reverse
Name: 58617273
Synonym: ERGA_CDS_05460
Alternate gene names: NA
Gene position: 888827-884649 (Counterclockwise)
Preceding gene: 58617274
Following gene: 58617272
Centisome position: 59.26
GC content: 27.18
Gene sequence:
>4179_bases ATGTTATTAGATAGTTCGTATAGTAGTAAATCATTAGTTGGTTTCTTATCTTCTGTACTTCAGACAGATAATCTAGAAGT AAAAACGAGGTTTTTAAATCTTGATATTTTCTACAGAGATAATACAGAAAGGAAAAGATTTTTAGATTTATTGCCTAGTG ATATTATTAAAGAAGATCCAGTTAATCATAAATTGACAATAAAAAAAGTAGATTTAGTTTTTTTTAGAAAAAAAGTTCAG AACCCTTTCCGTTATGCTACGTATGGTGGTGAATATAACATCAGATTGATGATGTACTTATTAGTTGAGGTGACTGATCT ATGGAAATTACATTGTGAGAATATTTATTATAATATAACAGGTCCTTATAAGCATGATGTACGTGAAAATTTTTATAAGT TAATTAATTATTTCTTTCGGAACGATGAGTTTTCCGGAAGAATGGAATCAACGTGTATCACTGATGTAATCCCTTTATGT TTCCCAAATCCAGAATTGTTAAGAAAAAAGATATGTATTTATGAAAATGGTATGTATGGATTTTTCTTGTGTGATACGAA AAAATTTGAGGATAGTGTATTATTTCAGGTAATTAAGAAAAAATTAAGTTTATTACAATCACAAATTGATAATCTATGTG ATGGTAATGAATTGTTAAAATTGTTAAATCAAAAGAAAAGTTTAAAGTTGTTTATTGATTATGTATTACGAATAGAGAAA AGTAGTATATTAGTTTTAAAGGTTCCATTTCATGTATTACATGCAACATTATCAATTCTCTCAAATGATGAGATAATACT AAAAGAAATTGAAAATCTGTTAAAAGAACGTCAACAATATGATATTACAAACAGTATTGTTTGTAAGTTTTTTCAAGATA AGAAAATAAAAATAGATTTTCTAGATATAAATGATGCACGAAATGTATATAAATCATTCTATAGTATAGAAAATAATTCA CCAGAAGTTATTTTAAGATCAGAAAAAGCTATATCTGACTTACATGCTGTAAAGTCCAATATTACAATAAATATTGATTT TTTTTCTGAGATTAGTCAGAACCGAGGTGTTTTACGTGCGCAACAGTATTTCAGAGGAATAACTGCACTGATAAATTCAG AAATTAATTTTTTAGAAAACTTTAAAGATGTTTTAACCATGGAAGACTTGAACTTCTTGTTAGAGGTGACTTTTCAAGAA GTACATCATGATATCAATGAATTACTGGTAATGTATGATTTTTTTATGCATAGGAAAATTGTTTATAGGAATCCAATATT AAAAGTTACAAGAAAGGAAGTTTCAGAATTAAAAAAATATGTAAGTGGTAGAGTGTTGTTATTGGATGAAATTGTTCGAT ATATGAATAATAATCTAAAGGTTATAGATTCAAATAAATACTTTATGAACTATTGGGTAATTTACTATATTGTTAGTAGC CATCATACGTTGAGTCTTGAATTTATTAAAAATGGGCAACTGTTACCGTCTATAAATGTTGTGCAGTTGTTAAAGTCTAT TGATTATGTTAATGGTAGATGGGTAACGTGTAAGAAAGAAAAGAATGAGTGGTTTTTGCATCAATTAAGATTGCATTCTT TAATGGATTATTTAGATATCAATATTGATTCATCAGATATTCCTGAGGAATTATGGGATGATAAGTTAAGTAATAGAGAT TTTTTTACTATTTTACAATCTATGATACGTGCTGTGAGAGTAGATAAGCAATATGTCTGTGATATTAAAATCAGTAGTTT TTTAAGGGTGTTGCAAATTTTATATAGAGTATTAAAATGCCTACCATTTTCTTCTTTCTTTATTTATTATGTTAATCCTG GTCGTTATCGTACTGTATCAGGTTATATAGGTAAAAATCTAAAAGAGGAATTGTATATAAAGAATAAACAAATTCCTGTT ACATCATTTTCAAATAGTGTTATAGAATCACTAAAATTAAATTTGTCACAACAAAGATTTGTTGAAAGTGATCATGAAGC CAAGTTTTTGAGTAGGAAATTTTGTAAAGCTCATAATATTTCAGGTAAATTGGAGAAAGTGAAAACAGTTTTATATTCTA ATAAGTTTGTTGCATATTTGCTTTTTATACTAACGTTTTTGATAATGCTAATAGTTACAGTTTGTGTAGTATTGTTAGGA CATTTCAATATTATATCTGGTATTTTTCTTGCTAGATTTATTGATGTAATACGAAGAGTATGTGATAGTTTATTTGTAGT ATCTGGGCTAGATACTTTTGTAGATAAAGTTAGGACTTTAATGTTAGATGTTATTGGCATTGTAGTTAGAGTTCTTGATT TTATTTTGTTGTGTGGGTTATTATCTGAGGTTATTAAATTGGTTATAAAAGGCATACGATTTGTATGCATATCTGTATAT AATGTTCTTCAAGAAGTGTGTAGATCACTTGTTACATATGGGTTAAAAGGTTCAATTATTATCTTATTGAATAAACTATT ATCTCTAAAGAGTGTTATAATTAAAGATTATGATCACTCAAATGAGAAGGAGGAACTGGACGTGTATGGTATGAGGAGGT ACCATACTGAATACAATATTGCAGAAATGTTGGAAGACATTTGTAATAAAGTTAATATTGATTTGCCAATATTATTAAGG ATTACTGAGATAACTAAGGAGTTATCATCTCAAATTAATCAAAATTTATATTATGGAAAACCAAGAATTGAGAATTTATT GAGAGATTTTGAGAATTATACTGCTAAGTTGCCTCAGGATATTATAAGTAATGTAAATTATCTGAAATTAAAATATGAGT TTTCTTATTTATTGAATAATTATATAAAAAACTTCAGCTATCATAATGATTGTAAGGGTGACTTGCCTAATATTCTAAAT AGTTTTCGAAGAAGAGAAGAAATCTATAATAAAATTACTTCTGTTAATTTACAAACTAAGTATTTCTCTAAAGGTTCATA CAGAACAATATGTACTGTAAGTGATGTTGAAAGTATTTTCGATAGGGTGCGTGATATTGGAAATGCTATAACAGTAGAAA CATTGAATATAAAAATTGCATCTTTGAAGTGGGCAATACATATGTTAAGTGTTTGTGATGTTTATAATATCAAGCGTAAT TCTGAATTAATATTTTTAAATACTAGGTTAGATAATATTGTAACAGTAGTATTATATGATTGCATTTTAAGATTAGAAAG TTATCGAAAACGCGTTCAATATGGTGAAGTGATTTCTACTAGTTTTGTAGATGTTGATATTGAGTGCAATTTTTCTTGTT ATATAAGAGATGTTTATTATCTTTTACAATCTGTAGACACTAGTATAATCTATAATGGTCAAATGAGGAGCATGAAAGTA TTTTTTGACACTTTTTTTGGCAATCACAACTTACTATTAAAAGAACCATCAGATCAAGCTAAAAATTTGGCACGGACAAT TAGAGTTGAAACTGGAACAATATCATGTTTTTCAAGATTTAAAGAGTATATTTGTGAAAGTATGGAATGTATTAAAAATC CAAAAGGTACTGTTTTTTCTTTTTTTATATACTATTTGATTCGCTTAACAAATTCTACTTCGTGTTTATTAAGTATTACT GAGCATGTCTCACAAATAATGGATCAGGTGTTAAATGTAATAGCAATAGAAGAGTTATATAAATATTTTACTCAAACTGA TTTTGGAAAGATATTATTACTTGAGTTTTATAAACAGGGTATGTTATTTCAAGACTTAACTTGTATGTTGGCTGAATTGA ATTTGGGGTTATTATGTGATGATGTGTGTGATGTACAAGATGAGTATTTGCCAATTTGTGATATTAATTATCTAATATAT TCTTCTTCTTTTCATAGGATCAATGAACCTCAATGGCGATTGTTAGAGTGTATTAATGGGTGTGCTAGATTAATATATGA AATGGTAGGATTAAAAATGGTGAAACATATTACTCATTGTTTTCGAGAGAAAGTAATATACAATATGGAGTCTTTCATAT TACATGAAAATATGGTATCTAATTCAATGTTAATGAGTGTTCAAGAATGTTTATCTACTAATGAGTTAAAGTGTGATATG AAAGAGGAAGTATCTTGTGCAAATGGTAGGAGTGATCAATTATTACTTGACCCTGATGGGGTATATCATATGTTGGGATT GAGTTTAGATTTTGATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CTATAGTTTTTAGATAAGATTAAGGTTGTTTATTCATCACTGTCATGCTTAATACTGTAATAACCTAAATATAGTTATCT ATATATTAGGTAATGATATT
Downstream 100 bases:
>100_bases TAAATATTACATATTATGTAATTCATGATATGTTGTTATAGGAATATTGATGGTGTATCTCCATGGTAGATGATAATAAT AAACTTGATACTGAATCTAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1392; Mature: 1392
Protein sequence:
>1392_residues MLLDSSYSSKSLVGFLSSVLQTDNLEVKTRFLNLDIFYRDNTERKRFLDLLPSDIIKEDPVNHKLTIKKVDLVFFRKKVQ NPFRYATYGGEYNIRLMMYLLVEVTDLWKLHCENIYYNITGPYKHDVRENFYKLINYFFRNDEFSGRMESTCITDVIPLC FPNPELLRKKICIYENGMYGFFLCDTKKFEDSVLFQVIKKKLSLLQSQIDNLCDGNELLKLLNQKKSLKLFIDYVLRIEK SSILVLKVPFHVLHATLSILSNDEIILKEIENLLKERQQYDITNSIVCKFFQDKKIKIDFLDINDARNVYKSFYSIENNS PEVILRSEKAISDLHAVKSNITINIDFFSEISQNRGVLRAQQYFRGITALINSEINFLENFKDVLTMEDLNFLLEVTFQE VHHDINELLVMYDFFMHRKIVYRNPILKVTRKEVSELKKYVSGRVLLLDEIVRYMNNNLKVIDSNKYFMNYWVIYYIVSS HHTLSLEFIKNGQLLPSINVVQLLKSIDYVNGRWVTCKKEKNEWFLHQLRLHSLMDYLDINIDSSDIPEELWDDKLSNRD FFTILQSMIRAVRVDKQYVCDIKISSFLRVLQILYRVLKCLPFSSFFIYYVNPGRYRTVSGYIGKNLKEELYIKNKQIPV TSFSNSVIESLKLNLSQQRFVESDHEAKFLSRKFCKAHNISGKLEKVKTVLYSNKFVAYLLFILTFLIMLIVTVCVVLLG HFNIISGIFLARFIDVIRRVCDSLFVVSGLDTFVDKVRTLMLDVIGIVVRVLDFILLCGLLSEVIKLVIKGIRFVCISVY NVLQEVCRSLVTYGLKGSIIILLNKLLSLKSVIIKDYDHSNEKEELDVYGMRRYHTEYNIAEMLEDICNKVNIDLPILLR ITEITKELSSQINQNLYYGKPRIENLLRDFENYTAKLPQDIISNVNYLKLKYEFSYLLNNYIKNFSYHNDCKGDLPNILN SFRRREEIYNKITSVNLQTKYFSKGSYRTICTVSDVESIFDRVRDIGNAITVETLNIKIASLKWAIHMLSVCDVYNIKRN SELIFLNTRLDNIVTVVLYDCILRLESYRKRVQYGEVISTSFVDVDIECNFSCYIRDVYYLLQSVDTSIIYNGQMRSMKV FFDTFFGNHNLLLKEPSDQAKNLARTIRVETGTISCFSRFKEYICESMECIKNPKGTVFSFFIYYLIRLTNSTSCLLSIT EHVSQIMDQVLNVIAIEELYKYFTQTDFGKILLLEFYKQGMLFQDLTCMLAELNLGLLCDDVCDVQDEYLPICDINYLIY SSSFHRINEPQWRLLECINGCARLIYEMVGLKMVKHITHCFREKVIYNMESFILHENMVSNSMLMSVQECLSTNELKCDM KEEVSCANGRSDQLLLDPDGVYHMLGLSLDFD
Sequences:
>Translated_1392_residues MLLDSSYSSKSLVGFLSSVLQTDNLEVKTRFLNLDIFYRDNTERKRFLDLLPSDIIKEDPVNHKLTIKKVDLVFFRKKVQ NPFRYATYGGEYNIRLMMYLLVEVTDLWKLHCENIYYNITGPYKHDVRENFYKLINYFFRNDEFSGRMESTCITDVIPLC FPNPELLRKKICIYENGMYGFFLCDTKKFEDSVLFQVIKKKLSLLQSQIDNLCDGNELLKLLNQKKSLKLFIDYVLRIEK SSILVLKVPFHVLHATLSILSNDEIILKEIENLLKERQQYDITNSIVCKFFQDKKIKIDFLDINDARNVYKSFYSIENNS PEVILRSEKAISDLHAVKSNITINIDFFSEISQNRGVLRAQQYFRGITALINSEINFLENFKDVLTMEDLNFLLEVTFQE VHHDINELLVMYDFFMHRKIVYRNPILKVTRKEVSELKKYVSGRVLLLDEIVRYMNNNLKVIDSNKYFMNYWVIYYIVSS HHTLSLEFIKNGQLLPSINVVQLLKSIDYVNGRWVTCKKEKNEWFLHQLRLHSLMDYLDINIDSSDIPEELWDDKLSNRD FFTILQSMIRAVRVDKQYVCDIKISSFLRVLQILYRVLKCLPFSSFFIYYVNPGRYRTVSGYIGKNLKEELYIKNKQIPV TSFSNSVIESLKLNLSQQRFVESDHEAKFLSRKFCKAHNISGKLEKVKTVLYSNKFVAYLLFILTFLIMLIVTVCVVLLG HFNIISGIFLARFIDVIRRVCDSLFVVSGLDTFVDKVRTLMLDVIGIVVRVLDFILLCGLLSEVIKLVIKGIRFVCISVY NVLQEVCRSLVTYGLKGSIIILLNKLLSLKSVIIKDYDHSNEKEELDVYGMRRYHTEYNIAEMLEDICNKVNIDLPILLR ITEITKELSSQINQNLYYGKPRIENLLRDFENYTAKLPQDIISNVNYLKLKYEFSYLLNNYIKNFSYHNDCKGDLPNILN SFRRREEIYNKITSVNLQTKYFSKGSYRTICTVSDVESIFDRVRDIGNAITVETLNIKIASLKWAIHMLSVCDVYNIKRN SELIFLNTRLDNIVTVVLYDCILRLESYRKRVQYGEVISTSFVDVDIECNFSCYIRDVYYLLQSVDTSIIYNGQMRSMKV FFDTFFGNHNLLLKEPSDQAKNLARTIRVETGTISCFSRFKEYICESMECIKNPKGTVFSFFIYYLIRLTNSTSCLLSIT EHVSQIMDQVLNVIAIEELYKYFTQTDFGKILLLEFYKQGMLFQDLTCMLAELNLGLLCDDVCDVQDEYLPICDINYLIY SSSFHRINEPQWRLLECINGCARLIYEMVGLKMVKHITHCFREKVIYNMESFILHENMVSNSMLMSVQECLSTNELKCDM KEEVSCANGRSDQLLLDPDGVYHMLGLSLDFD >Mature_1392_residues MLLDSSYSSKSLVGFLSSVLQTDNLEVKTRFLNLDIFYRDNTERKRFLDLLPSDIIKEDPVNHKLTIKKVDLVFFRKKVQ NPFRYATYGGEYNIRLMMYLLVEVTDLWKLHCENIYYNITGPYKHDVRENFYKLINYFFRNDEFSGRMESTCITDVIPLC FPNPELLRKKICIYENGMYGFFLCDTKKFEDSVLFQVIKKKLSLLQSQIDNLCDGNELLKLLNQKKSLKLFIDYVLRIEK SSILVLKVPFHVLHATLSILSNDEIILKEIENLLKERQQYDITNSIVCKFFQDKKIKIDFLDINDARNVYKSFYSIENNS PEVILRSEKAISDLHAVKSNITINIDFFSEISQNRGVLRAQQYFRGITALINSEINFLENFKDVLTMEDLNFLLEVTFQE VHHDINELLVMYDFFMHRKIVYRNPILKVTRKEVSELKKYVSGRVLLLDEIVRYMNNNLKVIDSNKYFMNYWVIYYIVSS HHTLSLEFIKNGQLLPSINVVQLLKSIDYVNGRWVTCKKEKNEWFLHQLRLHSLMDYLDINIDSSDIPEELWDDKLSNRD FFTILQSMIRAVRVDKQYVCDIKISSFLRVLQILYRVLKCLPFSSFFIYYVNPGRYRTVSGYIGKNLKEELYIKNKQIPV TSFSNSVIESLKLNLSQQRFVESDHEAKFLSRKFCKAHNISGKLEKVKTVLYSNKFVAYLLFILTFLIMLIVTVCVVLLG HFNIISGIFLARFIDVIRRVCDSLFVVSGLDTFVDKVRTLMLDVIGIVVRVLDFILLCGLLSEVIKLVIKGIRFVCISVY NVLQEVCRSLVTYGLKGSIIILLNKLLSLKSVIIKDYDHSNEKEELDVYGMRRYHTEYNIAEMLEDICNKVNIDLPILLR ITEITKELSSQINQNLYYGKPRIENLLRDFENYTAKLPQDIISNVNYLKLKYEFSYLLNNYIKNFSYHNDCKGDLPNILN SFRRREEIYNKITSVNLQTKYFSKGSYRTICTVSDVESIFDRVRDIGNAITVETLNIKIASLKWAIHMLSVCDVYNIKRN SELIFLNTRLDNIVTVVLYDCILRLESYRKRVQYGEVISTSFVDVDIECNFSCYIRDVYYLLQSVDTSIIYNGQMRSMKV FFDTFFGNHNLLLKEPSDQAKNLARTIRVETGTISCFSRFKEYICESMECIKNPKGTVFSFFIYYLIRLTNSTSCLLSIT EHVSQIMDQVLNVIAIEELYKYFTQTDFGKILLLEFYKQGMLFQDLTCMLAELNLGLLCDDVCDVQDEYLPICDINYLIY SSSFHRINEPQWRLLECINGCARLIYEMVGLKMVKHITHCFREKVIYNMESFILHENMVSNSMLMSVQECLSTNELKCDM KEEVSCANGRSDQLLLDPDGVYHMLGLSLDFD
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 163215; Mature: 163215
Theoretical pI: Translated: 7.49; Mature: 7.49
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
2.7 %Cys (Translated Protein) 2.2 %Met (Translated Protein) 4.9 %Cys+Met (Translated Protein) 2.7 %Cys (Mature Protein) 2.2 %Met (Mature Protein) 4.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLLDSSYSSKSLVGFLSSVLQTDNLEVKTRFLNLDIFYRDNTERKRFLDLLPSDIIKEDP CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHCCHHHHCCCC VNHKLTIKKVDLVFFRKKVQNPFRYATYGGEYNIRLMMYLLVEVTDLWKLHCENIYYNIT CCCEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECC GPYKHDVRENFYKLINYFFRNDEFSGRMESTCITDVIPLCFPNPELLRKKICIYENGMYG CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHEEECCCEE FFLCDTKKFEDSVLFQVIKKKLSLLQSQIDNLCDGNELLKLLNQKKSLKLFIDYVLRIEK EEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCC SSILVLKVPFHVLHATLSILSNDEIILKEIENLLKERQQYDITNSIVCKFFQDKKIKIDF CCEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCEEEEEE LDINDARNVYKSFYSIENNSPEVILRSEKAISDLHAVKSNITINIDFFSEISQNRGVLRA EECCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHHCCCCHHHH QQYFRGITALINSEINFLENFKDVLTMEDLNFLLEVTFQEVHHDINELLVMYDFFMHRKI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VYRNPILKVTRKEVSELKKYVSGRVLLLDEIVRYMNNNLKVIDSNKYFMNYWVIYYIVSS HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHEEEEEEECC HHTLSLEFIKNGQLLPSINVVQLLKSIDYVNGRWVTCKKEKNEWFLHQLRLHSLMDYLDI CCEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCC NIDSSDIPEELWDDKLSNRDFFTILQSMIRAVRVDKQYVCDIKISSFLRVLQILYRVLKC CCCCCCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH LPFSSFFIYYVNPGRYRTVSGYIGKNLKEELYIKNKQIPVTSFSNSVIESLKLNLSQQRF CCCCCEEEEEECCCCEEEECCHHCCCCHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHH VESDHEAKFLSRKFCKAHNISGKLEKVKTVLYSNKFVAYLLFILTFLIMLIVTVCVVLLG HCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HFNIISGIFLARFIDVIRRVCDSLFVVSGLDTFVDKVRTLMLDVIGIVVRVLDFILLCGL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LSEVIKLVIKGIRFVCISVYNVLQEVCRSLVTYGLKGSIIILLNKLLSLKSVIIKDYDHS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC NEKEELDVYGMRRYHTEYNIAEMLEDICNKVNIDLPILLRITEITKELSSQINQNLYYGK CCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCC PRIENLLRDFENYTAKLPQDIISNVNYLKLKYEFSYLLNNYIKNFSYHNDCKGDLPNILN 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PDB accession: NA
Resolution: NA
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Specific reaction: NA
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Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
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References: NA