| Definition | Ehrlichia ruminantium str. Gardel, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_006831 |
| Length | 1,499,920 |
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The map label for this gene is 58617266
Identifier: 58617266
GI number: 58617266
Start: 870999
End: 873464
Strand: Reverse
Name: 58617266
Synonym: ERGA_CDS_05390
Alternate gene names: NA
Gene position: 873464-870999 (Counterclockwise)
Preceding gene: 58617267
Following gene: 58617265
Centisome position: 58.23
GC content: 33.25
Gene sequence:
>2466_bases TTGATTATGCTAAAGGCTAGTAAAAAGTTAATATGTATATTAATGTTATTTTTAATCAATATTAACTTTATGTATGCTAA GCCTGCTTTTGCAGTAGAAGCTGAAAGTGAAAAAGTAGCAGTATATAGGACAACATTGGCTAGTAATCCTCTTTGTGCTG CAATAAATGAACATACTAAGTATATTGGAATTGCAGGATTTACTGCTGGTATTGCACTTATCATAGCAAGTATTCCAGTG TTTGCAACAGGACATTGGATTATTGGTTTGATTATGGTGGGTTCTGCATTTACATCTATTGCAGTAGCTATTACAAGAGC TACATCCTTTTTTGCTTGTAATTGGGCATTTGTACGTCATCCAGTTATGCGATTTGATGACTTTGATGTAAAGAAAACAG AAAAAACTACGACTAATACTAATAATATTACAGTAGGTGCTTATAAGGAATGTGCAGAACCTGAAGGTAAATATCCTGAT TGTGCTGATAATGATATAGGGTTAGAAGAAGAATATTTTAGGTGTATTGCTACTAAAAAACGTGATGGTACTGATGCATT TAGTTTAAAAGCTGCTAAAGATAAAGAACCTACTTGTCACTCTAGAAAATTTAAGAAAGCAACCAAATATAGTTGGCCTA AAAATCGAGTATCTAGTTCATCCTATATAGAAGTTTGTTATCGTAACCCGATAGGTATTAGTAATCCATTTGCTATGGTA AAGAATATAGGGCAAGCTATTTCTGGTGATATTGATGCTCTATTAAGATCTGGAGGTTATCCAAGGGAAGCTGATTATGG TGATTCTCAAATAAAAAGAGCAAAATATGCTTTACAAGGATCTGTTGAGTGTAAGGTTTTACGAGCTGGTCAAGAAGCTA CTATTCATACAATTACTTTTCGTGCAATAGAAAAAGCTGATAAGATTTGTGTACATGCTGTTAAGGGAGGGGGTGCACCT TTATGGCCTCATGCTGAGATTGGTTGTCATATGCGTCCTGGTGGACCACCAGCACCTATGTGTGATAAATCTGAAGCTAT AAAGTCAGAAACTGGTAAGATTATAGATTATGATAATTCTAAGTGTTATAGCTGTTATATAGATGATGCATGTACAGGTA AGGTTGGTGCTTATGTTAAGTCTATTTTTCCTGTAACTTCTACAATAGTTGCTTGTATAAAAGGTTCATTGAATAACATA TTAAACGGAACATGTAGTGCTGGTAGGGATAATAAGAGTCAAAAAGTTGGGTTTTTAAAAGTTGCTCAAGAAAAATTAAA AAAGGCTGTTATGGCAGTTTTAATATTAGCTCTAATATTATTTGCTATTAAAGCAGCTCTTGGTGGAATACAAAGTCCAG CTGAATTATATATGTTGATAATTAAGTTTTCTTTAGTAGTGTATTTTACTCAGGGTAATGCAATGTCTCATTATTATGAT CAGTTGGTAAAATTATCAATAGGTCTATCAGATATAGTATTAAGTGCAGGAGGTAAGCAGAGTATATGTGATTATAAGGA GTCAGATTATCCAAAAGGATATGAGTATATAGCTCCATGGGATAGGCTGGATTGTAGAGTACTGTTTTATCTTGGACAAC AATTAATTGGTGGGCCTGCTACTGTCCTACTTGGATTATTCATAACAGCAGGTATGTTTTTTGCTACTATGTTATTTAAT GTCAAAATGATGTTATGTTTGGTTGCAATTTTTGCCGTATTAATGTTGTTGTTTATTGTAATATGGTTAGTATATATATT TTTACTATCATTGATAGCCCTTACTATCCTAATATTAATTTCTCCACTTATGATTCCTATGGTATTATTTCAAGCTACAA AAGGATTTTTTGATGGGTGGATTAGGCAGTTAATGGTTTATAGTTTATATCCTGTTATATTGTTCGGTTTTCTAGCGTTG CTATTTACTGTGTTTGATAATTTATATTTTGAGGACCTTGAGTTTGAAAGGCATAAAGTTACAGTTATTGATGCTGAAAG AATTACTTTTAAATTAAAAAATCCAGATCAATGTAATAATTCAAAATATGATTATAACTTGGCTTGTATGTTTGGGAATA TGAAGTTTTTATCACAACCTGCATTTTTAGGGTTTAATGCTTATGCTCCTGATTTTAGACATGAAGCTGAGATGTTATGG ACTAAACTCTTAATGATGGTGTTAATAGGGTTTTTGTTTTATCATTTCTTATCTTCTATTTCTTATATTGCAGCTGAATT AGCAGGAGATCCAAGAGCTGGTCATGTTGGAGCATCGTTAAGTCCTAAAGCTATGATGGGTTCTGCAGTCAATCTTGCTG CTAAAGCACAGGGTGCTGGATTCAATAAGGCTAGGGATGCTATTAGTAATAAATTAGGAAATAATAAATCTGGAGGAGAT GGAGGTAAGGATGAAATATCTTCTGGATCTTCTAGATCATCTGGTGCGTCAGACAGTTCTTCATGA
Upstream 100 bases:
>100_bases TAAAAGAGGTAGGTGATGATCCAAATGTTTGGTTGCCTATATTTTATGAACGAGCGAAGTATGTATAAAAATTAATTATT GAATATTTTTAGTAAAAGAG
Downstream 100 bases:
>100_bases GTATTTTGATAATCGGTAAGAAGTAATAGAAGGAAACTTATAATGAAAATGTGTGTTTATTTAGTTTTTTAAAAGTTTGT AATATAGTGGGATATATTAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 821; Mature: 821
Protein sequence:
>821_residues MIMLKASKKLICILMLFLININFMYAKPAFAVEAESEKVAVYRTTLASNPLCAAINEHTKYIGIAGFTAGIALIIASIPV FATGHWIIGLIMVGSAFTSIAVAITRATSFFACNWAFVRHPVMRFDDFDVKKTEKTTTNTNNITVGAYKECAEPEGKYPD CADNDIGLEEEYFRCIATKKRDGTDAFSLKAAKDKEPTCHSRKFKKATKYSWPKNRVSSSSYIEVCYRNPIGISNPFAMV KNIGQAISGDIDALLRSGGYPREADYGDSQIKRAKYALQGSVECKVLRAGQEATIHTITFRAIEKADKICVHAVKGGGAP LWPHAEIGCHMRPGGPPAPMCDKSEAIKSETGKIIDYDNSKCYSCYIDDACTGKVGAYVKSIFPVTSTIVACIKGSLNNI LNGTCSAGRDNKSQKVGFLKVAQEKLKKAVMAVLILALILFAIKAALGGIQSPAELYMLIIKFSLVVYFTQGNAMSHYYD QLVKLSIGLSDIVLSAGGKQSICDYKESDYPKGYEYIAPWDRLDCRVLFYLGQQLIGGPATVLLGLFITAGMFFATMLFN VKMMLCLVAIFAVLMLLFIVIWLVYIFLLSLIALTILILISPLMIPMVLFQATKGFFDGWIRQLMVYSLYPVILFGFLAL LFTVFDNLYFEDLEFERHKVTVIDAERITFKLKNPDQCNNSKYDYNLACMFGNMKFLSQPAFLGFNAYAPDFRHEAEMLW TKLLMMVLIGFLFYHFLSSISYIAAELAGDPRAGHVGASLSPKAMMGSAVNLAAKAQGAGFNKARDAISNKLGNNKSGGD GGKDEISSGSSRSSGASDSSS
Sequences:
>Translated_821_residues MIMLKASKKLICILMLFLININFMYAKPAFAVEAESEKVAVYRTTLASNPLCAAINEHTKYIGIAGFTAGIALIIASIPV FATGHWIIGLIMVGSAFTSIAVAITRATSFFACNWAFVRHPVMRFDDFDVKKTEKTTTNTNNITVGAYKECAEPEGKYPD CADNDIGLEEEYFRCIATKKRDGTDAFSLKAAKDKEPTCHSRKFKKATKYSWPKNRVSSSSYIEVCYRNPIGISNPFAMV KNIGQAISGDIDALLRSGGYPREADYGDSQIKRAKYALQGSVECKVLRAGQEATIHTITFRAIEKADKICVHAVKGGGAP LWPHAEIGCHMRPGGPPAPMCDKSEAIKSETGKIIDYDNSKCYSCYIDDACTGKVGAYVKSIFPVTSTIVACIKGSLNNI LNGTCSAGRDNKSQKVGFLKVAQEKLKKAVMAVLILALILFAIKAALGGIQSPAELYMLIIKFSLVVYFTQGNAMSHYYD QLVKLSIGLSDIVLSAGGKQSICDYKESDYPKGYEYIAPWDRLDCRVLFYLGQQLIGGPATVLLGLFITAGMFFATMLFN VKMMLCLVAIFAVLMLLFIVIWLVYIFLLSLIALTILILISPLMIPMVLFQATKGFFDGWIRQLMVYSLYPVILFGFLAL LFTVFDNLYFEDLEFERHKVTVIDAERITFKLKNPDQCNNSKYDYNLACMFGNMKFLSQPAFLGFNAYAPDFRHEAEMLW TKLLMMVLIGFLFYHFLSSISYIAAELAGDPRAGHVGASLSPKAMMGSAVNLAAKAQGAGFNKARDAISNKLGNNKSGGD GGKDEISSGSSRSSGASDSSS >Mature_821_residues MIMLKASKKLICILMLFLININFMYAKPAFAVEAESEKVAVYRTTLASNPLCAAINEHTKYIGIAGFTAGIALIIASIPV FATGHWIIGLIMVGSAFTSIAVAITRATSFFACNWAFVRHPVMRFDDFDVKKTEKTTTNTNNITVGAYKECAEPEGKYPD CADNDIGLEEEYFRCIATKKRDGTDAFSLKAAKDKEPTCHSRKFKKATKYSWPKNRVSSSSYIEVCYRNPIGISNPFAMV KNIGQAISGDIDALLRSGGYPREADYGDSQIKRAKYALQGSVECKVLRAGQEATIHTITFRAIEKADKICVHAVKGGGAP LWPHAEIGCHMRPGGPPAPMCDKSEAIKSETGKIIDYDNSKCYSCYIDDACTGKVGAYVKSIFPVTSTIVACIKGSLNNI LNGTCSAGRDNKSQKVGFLKVAQEKLKKAVMAVLILALILFAIKAALGGIQSPAELYMLIIKFSLVVYFTQGNAMSHYYD QLVKLSIGLSDIVLSAGGKQSICDYKESDYPKGYEYIAPWDRLDCRVLFYLGQQLIGGPATVLLGLFITAGMFFATMLFN VKMMLCLVAIFAVLMLLFIVIWLVYIFLLSLIALTILILISPLMIPMVLFQATKGFFDGWIRQLMVYSLYPVILFGFLAL LFTVFDNLYFEDLEFERHKVTVIDAERITFKLKNPDQCNNSKYDYNLACMFGNMKFLSQPAFLGFNAYAPDFRHEAEMLW TKLLMMVLIGFLFYHFLSSISYIAAELAGDPRAGHVGASLSPKAMMGSAVNLAAKAQGAGFNKARDAISNKLGNNKSGGD GGKDEISSGSSRSSGASDSSS
Specific function: Unknown
COG id: COG3704
COG function: function code U; Type IV secretory pathway, VirB6 components
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the trbL/virB6 family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR007688 [H]
Pfam domain/function: PF04610 TrbL [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 90096; Mature: 90096
Theoretical pI: Translated: 8.71; Mature: 8.71
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
2.7 %Cys (Translated Protein) 3.3 %Met (Translated Protein) 6.0 %Cys+Met (Translated Protein) 2.7 %Cys (Mature Protein) 3.3 %Met (Mature Protein) 6.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIMLKASKKLICILMLFLININFMYAKPAFAVEAESEKVAVYRTTLASNPLCAAINEHTK CEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCEEEECCCCCEEEEEEHHCCCCCEEHHCCCCC YIGIAGFTAGIALIIASIPVFATGHWIIGLIMVGSAFTSIAVAITRATSFFACNWAFVRH EEEEHHHHHHHHHHHHHCCHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECHHHHHC PVMRFDDFDVKKTEKTTTNTNNITVGAYKECAEPEGKYPDCADNDIGLEEEYFRCIATKK CHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCC RDGTDAFSLKAAKDKEPTCHSRKFKKATKYSWPKNRVSSSSYIEVCYRNPIGISNPFAMV CCCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHH KNIGQAISGDIDALLRSGGYPREADYGDSQIKRAKYALQGSVECKVLRAGQEATIHTITF HHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCEEEEEHH RAIEKADKICVHAVKGGGAPLWPHAEIGCHMRPGGPPAPMCDKSEAIKSETGKIIDYDNS HHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCEEECCCC KCYSCYIDDACTGKVGAYVKSIFPVTSTIVACIKGSLNNILNGTCSAGRDNKSQKVGFLK CEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHH VAQEKLKKAVMAVLILALILFAIKAALGGIQSPAELYMLIIKFSLVVYFTQGNAMSHYYD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCHHHHHH QLVKLSIGLSDIVLSAGGKQSICDYKESDYPKGYEYIAPWDRLDCRVLFYLGQQLIGGPA HHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHH TVLLGLFITAGMFFATMLFNVKMMLCLVAIFAVLMLLFIVIWLVYIFLLSLIALTILILI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SPLMIPMVLFQATKGFFDGWIRQLMVYSLYPVILFGFLALLFTVFDNLYFEDLEFERHKV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEE TVIDAERITFKLKNPDQCNNSKYDYNLACMFGNMKFLSQPAFLGFNAYAPDFRHEAEMLW EEEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEEECCHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH TKLLMMVLIGFLFYHFLSSISYIAAELAGDPRAGHVGASLSPKAMMGSAVNLAAKAQGAG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCHHHHHHHCCCCC FNKARDAISNKLGNNKSGGDGGKDEISSGSSRSSGASDSSS CHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MIMLKASKKLICILMLFLININFMYAKPAFAVEAESEKVAVYRTTLASNPLCAAINEHTK CEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCEEEECCCCCEEEEEEHHCCCCCEEHHCCCCC YIGIAGFTAGIALIIASIPVFATGHWIIGLIMVGSAFTSIAVAITRATSFFACNWAFVRH EEEEHHHHHHHHHHHHHCCHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECHHHHHC PVMRFDDFDVKKTEKTTTNTNNITVGAYKECAEPEGKYPDCADNDIGLEEEYFRCIATKK CHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCC RDGTDAFSLKAAKDKEPTCHSRKFKKATKYSWPKNRVSSSSYIEVCYRNPIGISNPFAMV CCCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHH KNIGQAISGDIDALLRSGGYPREADYGDSQIKRAKYALQGSVECKVLRAGQEATIHTITF HHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCEEEEEHH RAIEKADKICVHAVKGGGAPLWPHAEIGCHMRPGGPPAPMCDKSEAIKSETGKIIDYDNS HHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCEEECCCC KCYSCYIDDACTGKVGAYVKSIFPVTSTIVACIKGSLNNILNGTCSAGRDNKSQKVGFLK CEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHH VAQEKLKKAVMAVLILALILFAIKAALGGIQSPAELYMLIIKFSLVVYFTQGNAMSHYYD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCHHHHHH QLVKLSIGLSDIVLSAGGKQSICDYKESDYPKGYEYIAPWDRLDCRVLFYLGQQLIGGPA HHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHH TVLLGLFITAGMFFATMLFNVKMMLCLVAIFAVLMLLFIVIWLVYIFLLSLIALTILILI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SPLMIPMVLFQATKGFFDGWIRQLMVYSLYPVILFGFLALLFTVFDNLYFEDLEFERHKV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEE TVIDAERITFKLKNPDQCNNSKYDYNLACMFGNMKFLSQPAFLGFNAYAPDFRHEAEMLW EEEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEEECCHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH TKLLMMVLIGFLFYHFLSSISYIAAELAGDPRAGHVGASLSPKAMMGSAVNLAAKAQGAG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCHHHHHHHCCCCC FNKARDAISNKLGNNKSGGDGGKDEISSGSSRSSGASDSSS CHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA