Definition Ehrlichia ruminantium str. Gardel, complete genome.
Accession NC_006831
Length 1,499,920

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The map label for this gene is 58617266

Identifier: 58617266

GI number: 58617266

Start: 870999

End: 873464

Strand: Reverse

Name: 58617266

Synonym: ERGA_CDS_05390

Alternate gene names: NA

Gene position: 873464-870999 (Counterclockwise)

Preceding gene: 58617267

Following gene: 58617265

Centisome position: 58.23

GC content: 33.25

Gene sequence:

>2466_bases
TTGATTATGCTAAAGGCTAGTAAAAAGTTAATATGTATATTAATGTTATTTTTAATCAATATTAACTTTATGTATGCTAA
GCCTGCTTTTGCAGTAGAAGCTGAAAGTGAAAAAGTAGCAGTATATAGGACAACATTGGCTAGTAATCCTCTTTGTGCTG
CAATAAATGAACATACTAAGTATATTGGAATTGCAGGATTTACTGCTGGTATTGCACTTATCATAGCAAGTATTCCAGTG
TTTGCAACAGGACATTGGATTATTGGTTTGATTATGGTGGGTTCTGCATTTACATCTATTGCAGTAGCTATTACAAGAGC
TACATCCTTTTTTGCTTGTAATTGGGCATTTGTACGTCATCCAGTTATGCGATTTGATGACTTTGATGTAAAGAAAACAG
AAAAAACTACGACTAATACTAATAATATTACAGTAGGTGCTTATAAGGAATGTGCAGAACCTGAAGGTAAATATCCTGAT
TGTGCTGATAATGATATAGGGTTAGAAGAAGAATATTTTAGGTGTATTGCTACTAAAAAACGTGATGGTACTGATGCATT
TAGTTTAAAAGCTGCTAAAGATAAAGAACCTACTTGTCACTCTAGAAAATTTAAGAAAGCAACCAAATATAGTTGGCCTA
AAAATCGAGTATCTAGTTCATCCTATATAGAAGTTTGTTATCGTAACCCGATAGGTATTAGTAATCCATTTGCTATGGTA
AAGAATATAGGGCAAGCTATTTCTGGTGATATTGATGCTCTATTAAGATCTGGAGGTTATCCAAGGGAAGCTGATTATGG
TGATTCTCAAATAAAAAGAGCAAAATATGCTTTACAAGGATCTGTTGAGTGTAAGGTTTTACGAGCTGGTCAAGAAGCTA
CTATTCATACAATTACTTTTCGTGCAATAGAAAAAGCTGATAAGATTTGTGTACATGCTGTTAAGGGAGGGGGTGCACCT
TTATGGCCTCATGCTGAGATTGGTTGTCATATGCGTCCTGGTGGACCACCAGCACCTATGTGTGATAAATCTGAAGCTAT
AAAGTCAGAAACTGGTAAGATTATAGATTATGATAATTCTAAGTGTTATAGCTGTTATATAGATGATGCATGTACAGGTA
AGGTTGGTGCTTATGTTAAGTCTATTTTTCCTGTAACTTCTACAATAGTTGCTTGTATAAAAGGTTCATTGAATAACATA
TTAAACGGAACATGTAGTGCTGGTAGGGATAATAAGAGTCAAAAAGTTGGGTTTTTAAAAGTTGCTCAAGAAAAATTAAA
AAAGGCTGTTATGGCAGTTTTAATATTAGCTCTAATATTATTTGCTATTAAAGCAGCTCTTGGTGGAATACAAAGTCCAG
CTGAATTATATATGTTGATAATTAAGTTTTCTTTAGTAGTGTATTTTACTCAGGGTAATGCAATGTCTCATTATTATGAT
CAGTTGGTAAAATTATCAATAGGTCTATCAGATATAGTATTAAGTGCAGGAGGTAAGCAGAGTATATGTGATTATAAGGA
GTCAGATTATCCAAAAGGATATGAGTATATAGCTCCATGGGATAGGCTGGATTGTAGAGTACTGTTTTATCTTGGACAAC
AATTAATTGGTGGGCCTGCTACTGTCCTACTTGGATTATTCATAACAGCAGGTATGTTTTTTGCTACTATGTTATTTAAT
GTCAAAATGATGTTATGTTTGGTTGCAATTTTTGCCGTATTAATGTTGTTGTTTATTGTAATATGGTTAGTATATATATT
TTTACTATCATTGATAGCCCTTACTATCCTAATATTAATTTCTCCACTTATGATTCCTATGGTATTATTTCAAGCTACAA
AAGGATTTTTTGATGGGTGGATTAGGCAGTTAATGGTTTATAGTTTATATCCTGTTATATTGTTCGGTTTTCTAGCGTTG
CTATTTACTGTGTTTGATAATTTATATTTTGAGGACCTTGAGTTTGAAAGGCATAAAGTTACAGTTATTGATGCTGAAAG
AATTACTTTTAAATTAAAAAATCCAGATCAATGTAATAATTCAAAATATGATTATAACTTGGCTTGTATGTTTGGGAATA
TGAAGTTTTTATCACAACCTGCATTTTTAGGGTTTAATGCTTATGCTCCTGATTTTAGACATGAAGCTGAGATGTTATGG
ACTAAACTCTTAATGATGGTGTTAATAGGGTTTTTGTTTTATCATTTCTTATCTTCTATTTCTTATATTGCAGCTGAATT
AGCAGGAGATCCAAGAGCTGGTCATGTTGGAGCATCGTTAAGTCCTAAAGCTATGATGGGTTCTGCAGTCAATCTTGCTG
CTAAAGCACAGGGTGCTGGATTCAATAAGGCTAGGGATGCTATTAGTAATAAATTAGGAAATAATAAATCTGGAGGAGAT
GGAGGTAAGGATGAAATATCTTCTGGATCTTCTAGATCATCTGGTGCGTCAGACAGTTCTTCATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAAAAGAGGTAGGTGATGATCCAAATGTTTGGTTGCCTATATTTTATGAACGAGCGAAGTATGTATAAAAATTAATTATT
GAATATTTTTAGTAAAAGAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTATTTTGATAATCGGTAAGAAGTAATAGAAGGAAACTTATAATGAAAATGTGTGTTTATTTAGTTTTTTAAAAGTTTGT
AATATAGTGGGATATATTAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 821; Mature: 821

Protein sequence:

>821_residues
MIMLKASKKLICILMLFLININFMYAKPAFAVEAESEKVAVYRTTLASNPLCAAINEHTKYIGIAGFTAGIALIIASIPV
FATGHWIIGLIMVGSAFTSIAVAITRATSFFACNWAFVRHPVMRFDDFDVKKTEKTTTNTNNITVGAYKECAEPEGKYPD
CADNDIGLEEEYFRCIATKKRDGTDAFSLKAAKDKEPTCHSRKFKKATKYSWPKNRVSSSSYIEVCYRNPIGISNPFAMV
KNIGQAISGDIDALLRSGGYPREADYGDSQIKRAKYALQGSVECKVLRAGQEATIHTITFRAIEKADKICVHAVKGGGAP
LWPHAEIGCHMRPGGPPAPMCDKSEAIKSETGKIIDYDNSKCYSCYIDDACTGKVGAYVKSIFPVTSTIVACIKGSLNNI
LNGTCSAGRDNKSQKVGFLKVAQEKLKKAVMAVLILALILFAIKAALGGIQSPAELYMLIIKFSLVVYFTQGNAMSHYYD
QLVKLSIGLSDIVLSAGGKQSICDYKESDYPKGYEYIAPWDRLDCRVLFYLGQQLIGGPATVLLGLFITAGMFFATMLFN
VKMMLCLVAIFAVLMLLFIVIWLVYIFLLSLIALTILILISPLMIPMVLFQATKGFFDGWIRQLMVYSLYPVILFGFLAL
LFTVFDNLYFEDLEFERHKVTVIDAERITFKLKNPDQCNNSKYDYNLACMFGNMKFLSQPAFLGFNAYAPDFRHEAEMLW
TKLLMMVLIGFLFYHFLSSISYIAAELAGDPRAGHVGASLSPKAMMGSAVNLAAKAQGAGFNKARDAISNKLGNNKSGGD
GGKDEISSGSSRSSGASDSSS

Sequences:

>Translated_821_residues
MIMLKASKKLICILMLFLININFMYAKPAFAVEAESEKVAVYRTTLASNPLCAAINEHTKYIGIAGFTAGIALIIASIPV
FATGHWIIGLIMVGSAFTSIAVAITRATSFFACNWAFVRHPVMRFDDFDVKKTEKTTTNTNNITVGAYKECAEPEGKYPD
CADNDIGLEEEYFRCIATKKRDGTDAFSLKAAKDKEPTCHSRKFKKATKYSWPKNRVSSSSYIEVCYRNPIGISNPFAMV
KNIGQAISGDIDALLRSGGYPREADYGDSQIKRAKYALQGSVECKVLRAGQEATIHTITFRAIEKADKICVHAVKGGGAP
LWPHAEIGCHMRPGGPPAPMCDKSEAIKSETGKIIDYDNSKCYSCYIDDACTGKVGAYVKSIFPVTSTIVACIKGSLNNI
LNGTCSAGRDNKSQKVGFLKVAQEKLKKAVMAVLILALILFAIKAALGGIQSPAELYMLIIKFSLVVYFTQGNAMSHYYD
QLVKLSIGLSDIVLSAGGKQSICDYKESDYPKGYEYIAPWDRLDCRVLFYLGQQLIGGPATVLLGLFITAGMFFATMLFN
VKMMLCLVAIFAVLMLLFIVIWLVYIFLLSLIALTILILISPLMIPMVLFQATKGFFDGWIRQLMVYSLYPVILFGFLAL
LFTVFDNLYFEDLEFERHKVTVIDAERITFKLKNPDQCNNSKYDYNLACMFGNMKFLSQPAFLGFNAYAPDFRHEAEMLW
TKLLMMVLIGFLFYHFLSSISYIAAELAGDPRAGHVGASLSPKAMMGSAVNLAAKAQGAGFNKARDAISNKLGNNKSGGD
GGKDEISSGSSRSSGASDSSS
>Mature_821_residues
MIMLKASKKLICILMLFLININFMYAKPAFAVEAESEKVAVYRTTLASNPLCAAINEHTKYIGIAGFTAGIALIIASIPV
FATGHWIIGLIMVGSAFTSIAVAITRATSFFACNWAFVRHPVMRFDDFDVKKTEKTTTNTNNITVGAYKECAEPEGKYPD
CADNDIGLEEEYFRCIATKKRDGTDAFSLKAAKDKEPTCHSRKFKKATKYSWPKNRVSSSSYIEVCYRNPIGISNPFAMV
KNIGQAISGDIDALLRSGGYPREADYGDSQIKRAKYALQGSVECKVLRAGQEATIHTITFRAIEKADKICVHAVKGGGAP
LWPHAEIGCHMRPGGPPAPMCDKSEAIKSETGKIIDYDNSKCYSCYIDDACTGKVGAYVKSIFPVTSTIVACIKGSLNNI
LNGTCSAGRDNKSQKVGFLKVAQEKLKKAVMAVLILALILFAIKAALGGIQSPAELYMLIIKFSLVVYFTQGNAMSHYYD
QLVKLSIGLSDIVLSAGGKQSICDYKESDYPKGYEYIAPWDRLDCRVLFYLGQQLIGGPATVLLGLFITAGMFFATMLFN
VKMMLCLVAIFAVLMLLFIVIWLVYIFLLSLIALTILILISPLMIPMVLFQATKGFFDGWIRQLMVYSLYPVILFGFLAL
LFTVFDNLYFEDLEFERHKVTVIDAERITFKLKNPDQCNNSKYDYNLACMFGNMKFLSQPAFLGFNAYAPDFRHEAEMLW
TKLLMMVLIGFLFYHFLSSISYIAAELAGDPRAGHVGASLSPKAMMGSAVNLAAKAQGAGFNKARDAISNKLGNNKSGGD
GGKDEISSGSSRSSGASDSSS

Specific function: Unknown

COG id: COG3704

COG function: function code U; Type IV secretory pathway, VirB6 components

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the trbL/virB6 family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR007688 [H]

Pfam domain/function: PF04610 TrbL [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 90096; Mature: 90096

Theoretical pI: Translated: 8.71; Mature: 8.71

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.7 %Cys     (Translated Protein)
3.3 %Met     (Translated Protein)
6.0 %Cys+Met (Translated Protein)
2.7 %Cys     (Mature Protein)
3.3 %Met     (Mature Protein)
6.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIMLKASKKLICILMLFLININFMYAKPAFAVEAESEKVAVYRTTLASNPLCAAINEHTK
CEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCEEEECCCCCEEEEEEHHCCCCCEEHHCCCCC
YIGIAGFTAGIALIIASIPVFATGHWIIGLIMVGSAFTSIAVAITRATSFFACNWAFVRH
EEEEHHHHHHHHHHHHHCCHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECHHHHHC
PVMRFDDFDVKKTEKTTTNTNNITVGAYKECAEPEGKYPDCADNDIGLEEEYFRCIATKK
CHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCC
RDGTDAFSLKAAKDKEPTCHSRKFKKATKYSWPKNRVSSSSYIEVCYRNPIGISNPFAMV
CCCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHH
KNIGQAISGDIDALLRSGGYPREADYGDSQIKRAKYALQGSVECKVLRAGQEATIHTITF
HHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCEEEEEHH
RAIEKADKICVHAVKGGGAPLWPHAEIGCHMRPGGPPAPMCDKSEAIKSETGKIIDYDNS
HHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCEEECCCC
KCYSCYIDDACTGKVGAYVKSIFPVTSTIVACIKGSLNNILNGTCSAGRDNKSQKVGFLK
CEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHH
VAQEKLKKAVMAVLILALILFAIKAALGGIQSPAELYMLIIKFSLVVYFTQGNAMSHYYD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCHHHHHH
QLVKLSIGLSDIVLSAGGKQSICDYKESDYPKGYEYIAPWDRLDCRVLFYLGQQLIGGPA
HHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHH
TVLLGLFITAGMFFATMLFNVKMMLCLVAIFAVLMLLFIVIWLVYIFLLSLIALTILILI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SPLMIPMVLFQATKGFFDGWIRQLMVYSLYPVILFGFLALLFTVFDNLYFEDLEFERHKV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEE
TVIDAERITFKLKNPDQCNNSKYDYNLACMFGNMKFLSQPAFLGFNAYAPDFRHEAEMLW
EEEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEEECCHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
TKLLMMVLIGFLFYHFLSSISYIAAELAGDPRAGHVGASLSPKAMMGSAVNLAAKAQGAG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCHHHHHHHCCCCC
FNKARDAISNKLGNNKSGGDGGKDEISSGSSRSSGASDSSS
CHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MIMLKASKKLICILMLFLININFMYAKPAFAVEAESEKVAVYRTTLASNPLCAAINEHTK
CEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCEEEECCCCCEEEEEEHHCCCCCEEHHCCCCC
YIGIAGFTAGIALIIASIPVFATGHWIIGLIMVGSAFTSIAVAITRATSFFACNWAFVRH
EEEEHHHHHHHHHHHHHCCHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECHHHHHC
PVMRFDDFDVKKTEKTTTNTNNITVGAYKECAEPEGKYPDCADNDIGLEEEYFRCIATKK
CHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCC
RDGTDAFSLKAAKDKEPTCHSRKFKKATKYSWPKNRVSSSSYIEVCYRNPIGISNPFAMV
CCCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHH
KNIGQAISGDIDALLRSGGYPREADYGDSQIKRAKYALQGSVECKVLRAGQEATIHTITF
HHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCEEEEEHH
RAIEKADKICVHAVKGGGAPLWPHAEIGCHMRPGGPPAPMCDKSEAIKSETGKIIDYDNS
HHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCEEECCCC
KCYSCYIDDACTGKVGAYVKSIFPVTSTIVACIKGSLNNILNGTCSAGRDNKSQKVGFLK
CEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHH
VAQEKLKKAVMAVLILALILFAIKAALGGIQSPAELYMLIIKFSLVVYFTQGNAMSHYYD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCHHHHHH
QLVKLSIGLSDIVLSAGGKQSICDYKESDYPKGYEYIAPWDRLDCRVLFYLGQQLIGGPA
HHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHH
TVLLGLFITAGMFFATMLFNVKMMLCLVAIFAVLMLLFIVIWLVYIFLLSLIALTILILI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SPLMIPMVLFQATKGFFDGWIRQLMVYSLYPVILFGFLALLFTVFDNLYFEDLEFERHKV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEE
TVIDAERITFKLKNPDQCNNSKYDYNLACMFGNMKFLSQPAFLGFNAYAPDFRHEAEMLW
EEEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEEECCHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCHHHHHHHCCCCC
FNKARDAISNKLGNNKSGGDGGKDEISSGSSRSSGASDSSS
CHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA