Definition Staphylococcus aureus subsp. aureus COL chromosome, complete genome.
Accession NC_002951
Length 2,809,422

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The map label for this gene is yjhR [C]

Identifier: 57652440

GI number: 57652440

Start: 84291

End: 87443

Strand: Direct

Name: yjhR [C]

Synonym: SACOL0076

Alternate gene names: 57652440

Gene position: 84291-87443 (Clockwise)

Preceding gene: 57652439

Following gene: 57652441

Centisome position: 3.0

GC content: 31.34

Gene sequence:

>3153_bases
ATGAGTCAATTGCTAAATGATACGTTATCGGCTTGGTTGTTAATTGAATCTTTAAGTCCAGGAGAAGTAAATTTTACAGC
GGAAGATATACTCTCAGCTGAACATTTTAAAAATGGTGCAAAGCAAGCACAACTTCAAAGTTTTGATGAATATTTTGAAA
TATGGAATGCTGAACGCTTTATTATATCAGAAGAAAAATCAGAGACTGGGGAACTTATATTTAAATTTTATAGACATTGC
TTCCGCTATAATGAAATTAATTTGAAAATTCAGGATATTTTTGATGATTATTCTGAGATTCATAATCCAAATGGGACACA
CTGTTATGGTTACACATTTAACACAGATAAACACGGCAAAGTGATAGTTGATTCTATACATATTCCGATGATTATGAGTG
CATTAAAAGAAATTGAAAAGAACAAAAATGCCAATATAGAAGAAAAATTTAATGATTCTGTTGAAAAATTTGTTCAAAAA
GTAAAAGAAATTTTAGCAGATGAACCAATTAATGAATTTAAATTGAAGAAGATGGACAAAGCTTATGATGAGTACTTTTC
TGTATTAAATTCAAAGAAAGATGGATTATTTGGACATTATGTAGCAATAGAATATGTGAAAGATAGTGATTTACCACAGC
CGGAATTTAACAGCTTCTTCATAAGTGATATTGAGAAAGCAAGAAAATCTCCCAACCAAACTTTAATTGATTACATTGAA
GGTGTAGAAGAAAGTCAGCGCATAGAAGTAGATGAAAATAAAGAAATGTTTGACAAATTTTTACATCCTTCACGTTTGCC
TGATGGACGATGGCCATCACAGACTGAGTTTAGATTGTCTTTAATGCAACAACTTGCTGTAAACCAAATTACGAGTGGTA
ATGAAAGAATAAGTTCAGTTAATGGGCCACCAGGTACAGGTAAGACTACTTTATTAAAAGATATATTTGCTCATCTAGTA
GTTGAAAGAGGTAAAGAGTTAGCTAAACTAAATAATCCTAAAGATGCATTTGTCAAAACAAAAATTCATGAAACGGATGA
TAAATACGTATACTTACTAAAGGAATCTATTGCCAAATATAAGATGGTAGTCGCATCTAGTAATAATGGAGCTGTTGAAA
ATATATCTAAAGATTTACCGAAAATTGAAGAAATTATAAGAAATCCCGAAAAATGTAAATTCCCTAAATATGAACAGAAT
TATGCAAATTTAGCACATGAATTAAAAGATTTTGCTGAAATAGCTGAAGATTTGATTGGTGAAAGTGCCTGGGGCTTATT
TTCTGGAGTTTTTGGTAAAAGTACTAATATTAACCAAGTATTGAGTCATATGTTAAAACAAGATGCGAATGATATTGGCT
TTGCTAAATTACTACAAAATGAGAATAATCGTATGAGTTATAACGAGTTAATGAGTGAATGGCAATCACATCAACGTGCA
TTTTTAGAAGAGTTGAGGCATGTTGAAATGTTAAAAGAAGAATCTATTAGAGCATATGATGTTTATAAAAATTGTGAGTC
TTTCTCTAAGATTGAACAGGTTATTAATAGTGAAAAAACAAGTATTGAAGAACAGGTATATCATTTAGATAATGAAACGT
TACGAGACAATAAAGAAATAGAAGATTTGGATAATCGAATTAATTATATTGTTAAGCAAATAGAAACTTTAAATGAGTTA
ATTAAATCCATCAAAGAAAGCAACAAAGGTTTTATTAACAAACTGAAAGCGATGTTTAATTCAGAAGAAGATGAAAGCTA
TAAAGATCATAATAAAGAGAAGCAACAATTATTAACACAACAGTTAGAGTTAGAGAAATGTAAAAAAAACAAACATGAAG
ACCTTGTTAGCAAACTAAAAGAAAAAGAGAAATTAATTAAACAATTAACTAAAGTACAGTTGCAATTAGACGAGTTAAAT
TCACAGTTACAAGAGTTAGAAGCATATCGTATTGAGTCAAAAATTACAATTCCAGAAAAAGATTTTTGGAGTGACAACAA
TTATGATGAGCGCCAAGTTACTAATCTGTGGACGAGTGACGAACTTCAATACAGACGTGCCATGCTCTTTTTAAGAGCAA
TGATATTGCATAAATTATTATTGATTGCTAATAATACAACTATTTATTATGCGATTAATGATTTTAAAGATAGAAGGAAA
TTAATTGATGCAAATCCAGATAAAGTACACAACGCATGGAATGTGATGCATTTAATATTTCCAGTAGTTAGTACGACGTT
TGCAAGCTTTAAATCTATGTATGGGGGCATACCAAAAGATTTCATAGACTACTTATTTATTGATGAAGCAGGACAAGCAA
TACCTCAAGCAGCTGTGGGAGCATTATATCGTTCAAAAAAAGTTGTAGCTGTAGGTGATCCGATTCAAATAGAACCGGTT
GTGACTTTAGAAAGTCATTTAATTGATAACATTCGTAAAAATTATCATGTTCCGGAATATCTAGTTTCTAAAGAAGCTTC
TGTGCAGTCTGTTGCAGACAACGCCAATCAATATGGTTTTTGGAAATCTGATGCTACTGATAGTAATCAAAAAACCTGGA
TAGGCATACCTTTATGGGTGCACAGACGATGTTTAAAACCTATGTTCACGATAGCTAACCAAATCGCTTATAATAATAAA
ATGGTGTTGCCAAGTAATATTACAAAAGTAGGTAAAACAGGTTGGTATGACGTTAAAGGAAACGCAGTTCAAAAACAATT
TGTGAAAGAGCATGGTGAAAAAGTAGTGGGATTATTAGCTGATGATTGGATTGAAGCAATTAAGGAAGGTAAAAATGAAC
CGAGCTCATTTGTAATATCGCCTTTTTCAGCAGTACAGCAACAGATTAAACGTATGTTAAAGCAACAACTACCGACTAGA
ATTGATATTGAACGTACAAAAATTAATCAATGGGTCGATAAATCCATTGGTACTGTTCATACTTTTCAAGGTAAAGAGGC
TCAGAAGGTGTATTTTGTAATAGGTACTGATAATACCCAAGATGGTGCTGTGAACTGGTCATGCGAAAAACCAAACTTGT
TAAACGTTGCAGTGACAAGAGCTAAGAAAGAGTTTTATGTAATTGGCGACATGCAAAGAATACAGATGAAACCATTTTAT
GAGACGATTTTTAAAGAAAGAAATGTAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATGATAATATATGAATATTTTTGAAAAAACACTAATATGATTAAATTATTTGTTAAAATAGCATTAAGTAAAAAACAAAT
AGGGAACAAGGTGGGATTTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
CATACAAAAAAGTATATAGAGGAAGTTATACATTTTAAAAGGAGCAAAATTGAATAATGGAGAAATTTAACAACTGGATA
TTAAATGCAATAAGTGGATC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Superfamily I DNA/RNA Helicase; DNA Helicase; Phospholipase D/Transphosphatidylase; Superfamily I DNA Helicase; Superfamily I DNA And RNA Helicase; DNA2/NAM7 Helicase Family Protein; DNA Helicase Superfamily I; I DNA Helicase; Superfamily I DNA And RNA Helicase And Helicase Subunits; DNA / RNA Helicase

Number of amino acids: Translated: 1050; Mature: 1049

Protein sequence:

>1050_residues
MSQLLNDTLSAWLLIESLSPGEVNFTAEDILSAEHFKNGAKQAQLQSFDEYFEIWNAERFIISEEKSETGELIFKFYRHC
FRYNEINLKIQDIFDDYSEIHNPNGTHCYGYTFNTDKHGKVIVDSIHIPMIMSALKEIEKNKNANIEEKFNDSVEKFVQK
VKEILADEPINEFKLKKMDKAYDEYFSVLNSKKDGLFGHYVAIEYVKDSDLPQPEFNSFFISDIEKARKSPNQTLIDYIE
GVEESQRIEVDENKEMFDKFLHPSRLPDGRWPSQTEFRLSLMQQLAVNQITSGNERISSVNGPPGTGKTTLLKDIFAHLV
VERGKELAKLNNPKDAFVKTKIHETDDKYVYLLKESIAKYKMVVASSNNGAVENISKDLPKIEEIIRNPEKCKFPKYEQN
YANLAHELKDFAEIAEDLIGESAWGLFSGVFGKSTNINQVLSHMLKQDANDIGFAKLLQNENNRMSYNELMSEWQSHQRA
FLEELRHVEMLKEESIRAYDVYKNCESFSKIEQVINSEKTSIEEQVYHLDNETLRDNKEIEDLDNRINYIVKQIETLNEL
IKSIKESNKGFINKLKAMFNSEEDESYKDHNKEKQQLLTQQLELEKCKKNKHEDLVSKLKEKEKLIKQLTKVQLQLDELN
SQLQELEAYRIESKITIPEKDFWSDNNYDERQVTNLWTSDELQYRRAMLFLRAMILHKLLLIANNTTIYYAINDFKDRRK
LIDANPDKVHNAWNVMHLIFPVVSTTFASFKSMYGGIPKDFIDYLFIDEAGQAIPQAAVGALYRSKKVVAVGDPIQIEPV
VTLESHLIDNIRKNYHVPEYLVSKEASVQSVADNANQYGFWKSDATDSNQKTWIGIPLWVHRRCLKPMFTIANQIAYNNK
MVLPSNITKVGKTGWYDVKGNAVQKQFVKEHGEKVVGLLADDWIEAIKEGKNEPSSFVISPFSAVQQQIKRMLKQQLPTR
IDIERTKINQWVDKSIGTVHTFQGKEAQKVYFVIGTDNTQDGAVNWSCEKPNLLNVAVTRAKKEFYVIGDMQRIQMKPFY
ETIFKERNVK

Sequences:

>Translated_1050_residues
MSQLLNDTLSAWLLIESLSPGEVNFTAEDILSAEHFKNGAKQAQLQSFDEYFEIWNAERFIISEEKSETGELIFKFYRHC
FRYNEINLKIQDIFDDYSEIHNPNGTHCYGYTFNTDKHGKVIVDSIHIPMIMSALKEIEKNKNANIEEKFNDSVEKFVQK
VKEILADEPINEFKLKKMDKAYDEYFSVLNSKKDGLFGHYVAIEYVKDSDLPQPEFNSFFISDIEKARKSPNQTLIDYIE
GVEESQRIEVDENKEMFDKFLHPSRLPDGRWPSQTEFRLSLMQQLAVNQITSGNERISSVNGPPGTGKTTLLKDIFAHLV
VERGKELAKLNNPKDAFVKTKIHETDDKYVYLLKESIAKYKMVVASSNNGAVENISKDLPKIEEIIRNPEKCKFPKYEQN
YANLAHELKDFAEIAEDLIGESAWGLFSGVFGKSTNINQVLSHMLKQDANDIGFAKLLQNENNRMSYNELMSEWQSHQRA
FLEELRHVEMLKEESIRAYDVYKNCESFSKIEQVINSEKTSIEEQVYHLDNETLRDNKEIEDLDNRINYIVKQIETLNEL
IKSIKESNKGFINKLKAMFNSEEDESYKDHNKEKQQLLTQQLELEKCKKNKHEDLVSKLKEKEKLIKQLTKVQLQLDELN
SQLQELEAYRIESKITIPEKDFWSDNNYDERQVTNLWTSDELQYRRAMLFLRAMILHKLLLIANNTTIYYAINDFKDRRK
LIDANPDKVHNAWNVMHLIFPVVSTTFASFKSMYGGIPKDFIDYLFIDEAGQAIPQAAVGALYRSKKVVAVGDPIQIEPV
VTLESHLIDNIRKNYHVPEYLVSKEASVQSVADNANQYGFWKSDATDSNQKTWIGIPLWVHRRCLKPMFTIANQIAYNNK
MVLPSNITKVGKTGWYDVKGNAVQKQFVKEHGEKVVGLLADDWIEAIKEGKNEPSSFVISPFSAVQQQIKRMLKQQLPTR
IDIERTKINQWVDKSIGTVHTFQGKEAQKVYFVIGTDNTQDGAVNWSCEKPNLLNVAVTRAKKEFYVIGDMQRIQMKPFY
ETIFKERNVK
>Mature_1049_residues
SQLLNDTLSAWLLIESLSPGEVNFTAEDILSAEHFKNGAKQAQLQSFDEYFEIWNAERFIISEEKSETGELIFKFYRHCF
RYNEINLKIQDIFDDYSEIHNPNGTHCYGYTFNTDKHGKVIVDSIHIPMIMSALKEIEKNKNANIEEKFNDSVEKFVQKV
KEILADEPINEFKLKKMDKAYDEYFSVLNSKKDGLFGHYVAIEYVKDSDLPQPEFNSFFISDIEKARKSPNQTLIDYIEG
VEESQRIEVDENKEMFDKFLHPSRLPDGRWPSQTEFRLSLMQQLAVNQITSGNERISSVNGPPGTGKTTLLKDIFAHLVV
ERGKELAKLNNPKDAFVKTKIHETDDKYVYLLKESIAKYKMVVASSNNGAVENISKDLPKIEEIIRNPEKCKFPKYEQNY
ANLAHELKDFAEIAEDLIGESAWGLFSGVFGKSTNINQVLSHMLKQDANDIGFAKLLQNENNRMSYNELMSEWQSHQRAF
LEELRHVEMLKEESIRAYDVYKNCESFSKIEQVINSEKTSIEEQVYHLDNETLRDNKEIEDLDNRINYIVKQIETLNELI
KSIKESNKGFINKLKAMFNSEEDESYKDHNKEKQQLLTQQLELEKCKKNKHEDLVSKLKEKEKLIKQLTKVQLQLDELNS
QLQELEAYRIESKITIPEKDFWSDNNYDERQVTNLWTSDELQYRRAMLFLRAMILHKLLLIANNTTIYYAINDFKDRRKL
IDANPDKVHNAWNVMHLIFPVVSTTFASFKSMYGGIPKDFIDYLFIDEAGQAIPQAAVGALYRSKKVVAVGDPIQIEPVV
TLESHLIDNIRKNYHVPEYLVSKEASVQSVADNANQYGFWKSDATDSNQKTWIGIPLWVHRRCLKPMFTIANQIAYNNKM
VLPSNITKVGKTGWYDVKGNAVQKQFVKEHGEKVVGLLADDWIEAIKEGKNEPSSFVISPFSAVQQQIKRMLKQQLPTRI
DIERTKINQWVDKSIGTVHTFQGKEAQKVYFVIGTDNTQDGAVNWSCEKPNLLNVAVTRAKKEFYVIGDMQRIQMKPFYE
TIFKERNVK

Specific function: Unknown

COG id: COG1112

COG function: function code L; Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasm [C]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 121732; Mature: 121600

Theoretical pI: Translated: 6.05; Mature: 6.05

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
2.0 %Met     (Translated Protein)
2.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
2.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSQLLNDTLSAWLLIESLSPGEVNFTAEDILSAEHFKNGAKQAQLQSFDEYFEIWNAERF
CCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEE
IISEEKSETGELIFKFYRHCFRYNEINLKIQDIFDDYSEIHNPNGTHCYGYTFNTDKHGK
EEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCC
VIVDSIHIPMIMSALKEIEKNKNANIEEKFNDSVEKFVQKVKEILADEPINEFKLKKMDK
EEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH
AYDEYFSVLNSKKDGLFGHYVAIEYVKDSDLPQPEFNSFFISDIEKARKSPNQTLIDYIE
HHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
GVEESQRIEVDENKEMFDKFLHPSRLPDGRWPSQTEFRLSLMQQLAVNQITSGNERISSV
CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCC
NGPPGTGKTTLLKDIFAHLVVERGKELAKLNNPKDAFVKTKIHETDDKYVYLLKESIAKY
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCCHHHHEEEEEECCCCCEEHHHHHHHHHE
KMVVASSNNGAVENISKDLPKIEEIIRNPEKCKFPKYEQNYANLAHELKDFAEIAEDLIG
EEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
ESAWGLFSGVFGKSTNINQVLSHMLKQDANDIGFAKLLQNENNRMSYNELMSEWQSHQRA
CHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
FLEELRHVEMLKEESIRAYDVYKNCESFSKIEQVINSEKTSIEEQVYHLDNETLRDNKEI
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCHH
EDLDNRINYIVKQIETLNELIKSIKESNKGFINKLKAMFNSEEDESYKDHNKEKQQLLTQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHH
QLELEKCKKNKHEDLVSKLKEKEKLIKQLTKVQLQLDELNSQLQELEAYRIESKITIPEK
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCC
DFWSDNNYDERQVTNLWTSDELQYRRAMLFLRAMILHKLLLIANNTTIYYAINDFKDRRK
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LIDANPDKVHNAWNVMHLIFPVVSTTFASFKSMYGGIPKDFIDYLFIDEAGQAIPQAAVG
HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALYRSKKVVAVGDPIQIEPVVTLESHLIDNIRKNYHVPEYLVSKEASVQSVADNANQYGF
HHHHCCEEEEECCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCC
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CCCCCCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCHHHCCCCCEECCC
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
IDIERTKINQWVDKSIGTVHTFQGKEAQKVYFVIGTDNTQDGAVNWSCEKPNLLNVAVTR
EEHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCCCCEEECCCCCCEEHHHHHH
AKKEFYVIGDMQRIQMKPFYETIFKERNVK
CCCCEEEECCHHHHHCCHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure 
SQLLNDTLSAWLLIESLSPGEVNFTAEDILSAEHFKNGAKQAQLQSFDEYFEIWNAERF
CHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEE
IISEEKSETGELIFKFYRHCFRYNEINLKIQDIFDDYSEIHNPNGTHCYGYTFNTDKHGK
EEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCC
VIVDSIHIPMIMSALKEIEKNKNANIEEKFNDSVEKFVQKVKEILADEPINEFKLKKMDK
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CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCCHHHHEEEEEECCCCCEEHHHHHHHHHE
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EEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
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HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCHH
EDLDNRINYIVKQIETLNELIKSIKESNKGFINKLKAMFNSEEDESYKDHNKEKQQLLTQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHH
QLELEKCKKNKHEDLVSKLKEKEKLIKQLTKVQLQLDELNSQLQELEAYRIESKITIPEK
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCC
DFWSDNNYDERQVTNLWTSDELQYRRAMLFLRAMILHKLLLIANNTTIYYAINDFKDRRK
CCCCCCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHHHH
LIDANPDKVHNAWNVMHLIFPVVSTTFASFKSMYGGIPKDFIDYLFIDEAGQAIPQAAVG
HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALYRSKKVVAVGDPIQIEPVVTLESHLIDNIRKNYHVPEYLVSKEASVQSVADNANQYGF
HHHHCCEEEEECCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCC
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CCCCCCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCHHHCCCCCEECCC
NAVQKQFVKEHGEKVVGLLADDWIEAIKEGKNEPSSFVISPFSAVQQQIKRMLKQQLPTR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
IDIERTKINQWVDKSIGTVHTFQGKEAQKVYFVIGTDNTQDGAVNWSCEKPNLLNVAVTR
EEHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCCCCEEECCCCCCEEHHHHHH
AKKEFYVIGDMQRIQMKPFYETIFKERNVK
CCCCEEEECCHHHHHCCHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA