| Definition | Staphylococcus aureus subsp. aureus COL chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002951 |
| Length | 2,809,422 |
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The map label for this gene is sraP [H]
Identifier: 57652394
GI number: 57652394
Start: 2748105
End: 2754890
Strand: Reverse
Name: sraP [H]
Synonym: SACOL2676
Alternate gene names: 57652394
Gene position: 2754890-2748105 (Counterclockwise)
Preceding gene: 57652395
Following gene: 57652393
Centisome position: 98.06
GC content: 38.49
Gene sequence:
>6786_bases ATGAGTAAAAGACAGAAAGCATTTCATGACAGCTTAGCAAACGAAAAAACAAGAGTAAGACTTTATAAATCTGGAAAAAA TTGGGTAAAATCCGGAATTAAAGAAATAGAAATGTTCAAAATTATGGGGCTACCATTTATTAGTCATAGTTTAGTGAGTC AAGATAATCAAAGCATTAGTAAAAAAATGACGGGATACGGACTGAAAACTACGGCGGTTATTGGTGGTGCATTCACGGTA AATATGTTGCATGACCAGCAAGCTTTTGCGGCTTCTGATGCACCATTAACTTCTGAATTAAACACACAAAGTGAAACAGT AGGTAATCAAAACTCAACGACAATCGAAGCATCAACATCAACAGCCGATTCCACAAGTGTAACGAAAAATAGTAGTTCGG TACAAACATCAAATAGTGACACAGTCTCAAGTGAAAAGTCTGAAAAGGTCACTTCGACAACTAATAGTACAAGCAATCAA CAAGAGAAATTGACATCTACATCAGAATCAACATCCTCAAAGAATACTACATCAAGTTCTGATACTAAATCTGTAGCTTC AACTTCAAGTACAGAACAACCAATTAATACATCAACAAATCAAAGTACTGCATCAAATAACACTTCACAAAGCACAACGC CATCTTCGGTCAACTTAAACAAAACTAGCACAACGTCAACTAGCACCGCACCAGTAAAACTTCGAACTTTCAGTCGCTTA GCTATGTCAACATTTGCGTCAGCAGCGACGACAACCGCAGTAACTGCTAATACAATTACAGTTAATAAAGATAACTTAAA ACAATATATGACAACGTCAGGTAATGCTACCTATGATCAAAGTACCGGTATTGTGACGTTAACACAGGATGCATACAGCC AAAAAGGTGCTATTACATTAGGAACACGTATTGACTCTAATAAGAGTTTTCATTTTTCTGGAAAAGTAAATTTAGGTAAC 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ACATCACTTTCAACATCTGACTCAATGAGCGGAAGCGTATCAGTTTCAACATCGACAAGTTTAAGTGACTCAATATCAGG TTCAACAAGTGTAAGTGACTCGAGCTCAACAAGCACATCTACATCATTAAGTGATTCAATGTCACAAAGCCAGTCAACAA GTACAAGTGCATCTGGTTCCTTAAGTACATCGATATCAACATCAATGTCAATGAGTGCTAGTACATCGTCATCACAAAGC ACATCGGTGTCGACATCATTATCAACATCAGACAGTATCAGTGATTCTACTTCAATAAGTATCAGTGGTTCACAAAGTAC AGTAGAATCAGAATCTACAAGTGATTCAACTTCTATCAGTGACTCAGAATCATTGAGTACATCAGATTCAGACTCGACAT CGACAAGTACATCGGACTCAACAAGTGGTTCAACTTCAACAAGCATATCTGAATCATTAAGTACGTCTGGTTCAGGTTCA ACGAGCGTATCTGACTCAACATCAATGAGTGAATCTAATTCATCGAGTGTTTCAATGTCACAAGACAAATCCGACTCAAC ATCAATTAGTGACTCAGAATCAGTGTCAACAAGCACATCAACGTCATTGAGCACATCCGATTCGACAAGCACATCCGAAT CACTGAGTACATCTATGTCTGGTTCACAAAGCATTTCTGACTCAACATCAACAAGTATGTCCGGCTCAACAAGTACATCT GAATCTAACTCAATGCATCCGTCAGACTCAATGAGTATGCATCATACTCACAGCACGAGCACATCTCGCTTATCAAGTGA AGCAACAACGAGCACGAGTGAATCTCAGTCTACATTAAGTGCAACATCTGAAGTGACTAAACATAATGGCACACCAGCAC AAAGTGAAAAAAGATTGCCAGATACAGGTGACTCAATAAAACAAAATGGATTACTAGGTGGCGTTATGACATTATTAGTT GGTTTAGGTTTAATGAAGAGAAAGAAAAAGAAAGATGAAAATGATCAAGATGATTCTCAAGCATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ACAAAATGAGTATTTTTGTATCAAAAAAGAGTTGTATTAAATTGAATAGTGGCATATATTATAATCTAATGAATGTAAAG ATAATACAAGGAGTTATTAC
Downstream 100 bases:
>100_bases ATTGAATTTATAGCTGGCTAAAATTAAAAAGACTGAGGCACCAATCACTAGAAAAATCGATATAGGATTTTAATAATTAG TGATGAACCCTTAGTCTTTT
Product: LPXTG cell wall surface anchor family protein
Products: NA
Alternate protein names: Staphylococcus aureus surface protein A [H]
Number of amino acids: Translated: 2261; Mature: 2260
Protein sequence:
>2261_residues MSKRQKAFHDSLANEKTRVRLYKSGKNWVKSGIKEIEMFKIMGLPFISHSLVSQDNQSISKKMTGYGLKTTAVIGGAFTV NMLHDQQAFAASDAPLTSELNTQSETVGNQNSTTIEASTSTADSTSVTKNSSSVQTSNSDTVSSEKSEKVTSTTNSTSNQ QEKLTSTSESTSSKNTTSSSDTKSVASTSSTEQPINTSTNQSTASNNTSQSTTPSSVNLNKTSTTSTSTAPVKLRTFSRL AMSTFASAATTTAVTANTITVNKDNLKQYMTTSGNATYDQSTGIVTLTQDAYSQKGAITLGTRIDSNKSFHFSGKVNLGN KYEGHGNGGDGIGFAFSPGVLGETGLNGAAVGIGGLSNAFGFKLDTYHNTSKPNSAAKANADPSNVAGGGAFGAFVTTDS YGVATTYTSSSTADNAAKLNVQPTNNTFQDFDINYNGDTKVMTVKYAGQTWTRNISDWIAKSGTTNFSLSMTASTGGATN LQQVQFGTFEYTESAVTQVRYVDVTTGKDIIPPKTYSGNVDQVVTIDNQQSALTAKGYNYTSVDSSYASTYNDTNKTVKM TNAGQSVTYYFTDVKAPTVTVGNQTIEVGKTMNPIVLTTTDNGTGTVTNTVTGLPSGLSYDSATNSIIGTPTKIGQSTVT VVSTDQANNKSTTTFTINVVDTTAPTVTPIGDQSSEVYSPISPIKIATQDNSGNAVTNTVTGLPSGLTFDSTNNTISGTP TNIGTSTISIVSTDASGNKTTTTFKYEVTRNSMSDSVSTSGSTQQSQSVSTSKADSQSASTSTSGSIVVSTSASTSKSTS VSLSDSVSASKSLSTSESNSVSSSTSTSLVNSQSVSSSMSDSASKSTSLSDSISNSSSTEKSESLSTSTSDSLRTSTSLS DSLSMSTSGSLSKSQSLSTSISGSSSTSASLSDSTSNAISTSTSLSESASTSDSISISNSIANSQSASTSKSDSQSTSIS LSTSDSKSMSTSESLSDSTSTSGSVSGSLSIAASQSVSTSTSDSMSTSEIVSDSISTSGSLSASDSKSMSVSSSMSTSQS GSTSESLSDSQSTSDSDSKSLSQSTSQSGSTSTSTSTSASVRTSESQSTSGSMSASQSDSMSISTSFSDSTSDSKSASTA SSESISQSASTSTSGSVSTSTSLSTSNSERTSTSMSDSTSLSTSESDSISESTSTSDSISEAISASESTFISLSESNSTS DSESQSASAFLSESLSESTSESTSESVSSSTSESTSLSDSTSESGSTSTSLSNSTSGSTSISTSTSISESTSTFKSESVS TSLSMSTSTSLSDSTSLSTSLSDSTSDSKSDSLSTSMSTSDSISTSKSDSISTSTSLSGSTSESKSDSTSMSISMSQSTS GSTSTSTSTSLSDSTSTSLSLSASMNQSGVDSNSASQSASNSTSTSTSESDSQSTSSYTSQSTSQSESTSTSTSLSDSTS ISKSTSQSGSVSTSASLSGSESESDSQSISTSASESTSESASTSLSDSTSTSNSGSASTSTSLSNSASASESDLSSTSLS DSTSASMQSSESDSQSTSASLSDSLSTSTSNRMSTIASLSTSVSTSESGSTSESTSESDSTSTSLSDSQSTSRSTSASGS ASTSTSTSDSRSTSASTSTSMRTSTSDSQSMSLSTSTSTSMSDSTSLSDSVSDSTSDSTSASTSGSMSVSISLSDSTSTS TSASEVMSASISDSQSMSESVNDSESVSESNSESDSKSMSGSTSVSDSGSLSVSTSLRKSESVSESSSLSCSQSMSDSVS TSDSSSLSVSTSLRSSESVSESDSLSDSKSTSGSTSTSTSGSLSTSTSLSGSESVSESTSLSDSISMSDSTSTSDSDSLS GSISLSGSTSLSTSDSLSDSKSLSSSQSMSGSESTSTSVSDSQSSSTSNSQFDSMSISASESDSMSTSDSSSISGSNSTS TSLSTSDSMSGSVSVSTSTSLSDSISGSTSVSDSSSTSTSTSLSDSMSQSQSTSTSASGSLSTSISTSMSMSASTSSSQS TSVSTSLSTSDSISDSTSISISGSQSTVESESTSDSTSISDSESLSTSDSDSTSTSTSDSTSGSTSTSISESLSTSGSGS TSVSDSTSMSESNSSSVSMSQDKSDSTSISDSESVSTSTSTSLSTSDSTSTSESLSTSMSGSQSISDSTSTSMSGSTSTS ESNSMHPSDSMSMHHTHSTSTSRLSSEATTSTSESQSTLSATSEVTKHNGTPAQSEKRLPDTGDSIKQNGLLGGVMTLLV GLGLMKRKKKKDENDQDDSQA
Sequences:
>Translated_2261_residues MSKRQKAFHDSLANEKTRVRLYKSGKNWVKSGIKEIEMFKIMGLPFISHSLVSQDNQSISKKMTGYGLKTTAVIGGAFTV NMLHDQQAFAASDAPLTSELNTQSETVGNQNSTTIEASTSTADSTSVTKNSSSVQTSNSDTVSSEKSEKVTSTTNSTSNQ QEKLTSTSESTSSKNTTSSSDTKSVASTSSTEQPINTSTNQSTASNNTSQSTTPSSVNLNKTSTTSTSTAPVKLRTFSRL AMSTFASAATTTAVTANTITVNKDNLKQYMTTSGNATYDQSTGIVTLTQDAYSQKGAITLGTRIDSNKSFHFSGKVNLGN KYEGHGNGGDGIGFAFSPGVLGETGLNGAAVGIGGLSNAFGFKLDTYHNTSKPNSAAKANADPSNVAGGGAFGAFVTTDS YGVATTYTSSSTADNAAKLNVQPTNNTFQDFDINYNGDTKVMTVKYAGQTWTRNISDWIAKSGTTNFSLSMTASTGGATN LQQVQFGTFEYTESAVTQVRYVDVTTGKDIIPPKTYSGNVDQVVTIDNQQSALTAKGYNYTSVDSSYASTYNDTNKTVKM TNAGQSVTYYFTDVKAPTVTVGNQTIEVGKTMNPIVLTTTDNGTGTVTNTVTGLPSGLSYDSATNSIIGTPTKIGQSTVT VVSTDQANNKSTTTFTINVVDTTAPTVTPIGDQSSEVYSPISPIKIATQDNSGNAVTNTVTGLPSGLTFDSTNNTISGTP TNIGTSTISIVSTDASGNKTTTTFKYEVTRNSMSDSVSTSGSTQQSQSVSTSKADSQSASTSTSGSIVVSTSASTSKSTS VSLSDSVSASKSLSTSESNSVSSSTSTSLVNSQSVSSSMSDSASKSTSLSDSISNSSSTEKSESLSTSTSDSLRTSTSLS DSLSMSTSGSLSKSQSLSTSISGSSSTSASLSDSTSNAISTSTSLSESASTSDSISISNSIANSQSASTSKSDSQSTSIS LSTSDSKSMSTSESLSDSTSTSGSVSGSLSIAASQSVSTSTSDSMSTSEIVSDSISTSGSLSASDSKSMSVSSSMSTSQS GSTSESLSDSQSTSDSDSKSLSQSTSQSGSTSTSTSTSASVRTSESQSTSGSMSASQSDSMSISTSFSDSTSDSKSASTA SSESISQSASTSTSGSVSTSTSLSTSNSERTSTSMSDSTSLSTSESDSISESTSTSDSISEAISASESTFISLSESNSTS DSESQSASAFLSESLSESTSESTSESVSSSTSESTSLSDSTSESGSTSTSLSNSTSGSTSISTSTSISESTSTFKSESVS TSLSMSTSTSLSDSTSLSTSLSDSTSDSKSDSLSTSMSTSDSISTSKSDSISTSTSLSGSTSESKSDSTSMSISMSQSTS GSTSTSTSTSLSDSTSTSLSLSASMNQSGVDSNSASQSASNSTSTSTSESDSQSTSSYTSQSTSQSESTSTSTSLSDSTS ISKSTSQSGSVSTSASLSGSESESDSQSISTSASESTSESASTSLSDSTSTSNSGSASTSTSLSNSASASESDLSSTSLS DSTSASMQSSESDSQSTSASLSDSLSTSTSNRMSTIASLSTSVSTSESGSTSESTSESDSTSTSLSDSQSTSRSTSASGS ASTSTSTSDSRSTSASTSTSMRTSTSDSQSMSLSTSTSTSMSDSTSLSDSVSDSTSDSTSASTSGSMSVSISLSDSTSTS TSASEVMSASISDSQSMSESVNDSESVSESNSESDSKSMSGSTSVSDSGSLSVSTSLRKSESVSESSSLSCSQSMSDSVS TSDSSSLSVSTSLRSSESVSESDSLSDSKSTSGSTSTSTSGSLSTSTSLSGSESVSESTSLSDSISMSDSTSTSDSDSLS GSISLSGSTSLSTSDSLSDSKSLSSSQSMSGSESTSTSVSDSQSSSTSNSQFDSMSISASESDSMSTSDSSSISGSNSTS TSLSTSDSMSGSVSVSTSTSLSDSISGSTSVSDSSSTSTSTSLSDSMSQSQSTSTSASGSLSTSISTSMSMSASTSSSQS TSVSTSLSTSDSISDSTSISISGSQSTVESESTSDSTSISDSESLSTSDSDSTSTSTSDSTSGSTSTSISESLSTSGSGS TSVSDSTSMSESNSSSVSMSQDKSDSTSISDSESVSTSTSTSLSTSDSTSTSESLSTSMSGSQSISDSTSTSMSGSTSTS ESNSMHPSDSMSMHHTHSTSTSRLSSEATTSTSESQSTLSATSEVTKHNGTPAQSEKRLPDTGDSIKQNGLLGGVMTLLV GLGLMKRKKKKDENDQDDSQA >Mature_2260_residues SKRQKAFHDSLANEKTRVRLYKSGKNWVKSGIKEIEMFKIMGLPFISHSLVSQDNQSISKKMTGYGLKTTAVIGGAFTVN MLHDQQAFAASDAPLTSELNTQSETVGNQNSTTIEASTSTADSTSVTKNSSSVQTSNSDTVSSEKSEKVTSTTNSTSNQQ EKLTSTSESTSSKNTTSSSDTKSVASTSSTEQPINTSTNQSTASNNTSQSTTPSSVNLNKTSTTSTSTAPVKLRTFSRLA MSTFASAATTTAVTANTITVNKDNLKQYMTTSGNATYDQSTGIVTLTQDAYSQKGAITLGTRIDSNKSFHFSGKVNLGNK YEGHGNGGDGIGFAFSPGVLGETGLNGAAVGIGGLSNAFGFKLDTYHNTSKPNSAAKANADPSNVAGGGAFGAFVTTDSY GVATTYTSSSTADNAAKLNVQPTNNTFQDFDINYNGDTKVMTVKYAGQTWTRNISDWIAKSGTTNFSLSMTASTGGATNL QQVQFGTFEYTESAVTQVRYVDVTTGKDIIPPKTYSGNVDQVVTIDNQQSALTAKGYNYTSVDSSYASTYNDTNKTVKMT NAGQSVTYYFTDVKAPTVTVGNQTIEVGKTMNPIVLTTTDNGTGTVTNTVTGLPSGLSYDSATNSIIGTPTKIGQSTVTV VSTDQANNKSTTTFTINVVDTTAPTVTPIGDQSSEVYSPISPIKIATQDNSGNAVTNTVTGLPSGLTFDSTNNTISGTPT NIGTSTISIVSTDASGNKTTTTFKYEVTRNSMSDSVSTSGSTQQSQSVSTSKADSQSASTSTSGSIVVSTSASTSKSTSV SLSDSVSASKSLSTSESNSVSSSTSTSLVNSQSVSSSMSDSASKSTSLSDSISNSSSTEKSESLSTSTSDSLRTSTSLSD SLSMSTSGSLSKSQSLSTSISGSSSTSASLSDSTSNAISTSTSLSESASTSDSISISNSIANSQSASTSKSDSQSTSISL STSDSKSMSTSESLSDSTSTSGSVSGSLSIAASQSVSTSTSDSMSTSEIVSDSISTSGSLSASDSKSMSVSSSMSTSQSG STSESLSDSQSTSDSDSKSLSQSTSQSGSTSTSTSTSASVRTSESQSTSGSMSASQSDSMSISTSFSDSTSDSKSASTAS SESISQSASTSTSGSVSTSTSLSTSNSERTSTSMSDSTSLSTSESDSISESTSTSDSISEAISASESTFISLSESNSTSD SESQSASAFLSESLSESTSESTSESVSSSTSESTSLSDSTSESGSTSTSLSNSTSGSTSISTSTSISESTSTFKSESVST SLSMSTSTSLSDSTSLSTSLSDSTSDSKSDSLSTSMSTSDSISTSKSDSISTSTSLSGSTSESKSDSTSMSISMSQSTSG STSTSTSTSLSDSTSTSLSLSASMNQSGVDSNSASQSASNSTSTSTSESDSQSTSSYTSQSTSQSESTSTSTSLSDSTSI SKSTSQSGSVSTSASLSGSESESDSQSISTSASESTSESASTSLSDSTSTSNSGSASTSTSLSNSASASESDLSSTSLSD STSASMQSSESDSQSTSASLSDSLSTSTSNRMSTIASLSTSVSTSESGSTSESTSESDSTSTSLSDSQSTSRSTSASGSA STSTSTSDSRSTSASTSTSMRTSTSDSQSMSLSTSTSTSMSDSTSLSDSVSDSTSDSTSASTSGSMSVSISLSDSTSTST SASEVMSASISDSQSMSESVNDSESVSESNSESDSKSMSGSTSVSDSGSLSVSTSLRKSESVSESSSLSCSQSMSDSVST SDSSSLSVSTSLRSSESVSESDSLSDSKSTSGSTSTSTSGSLSTSTSLSGSESVSESTSLSDSISMSDSTSTSDSDSLSG SISLSGSTSLSTSDSLSDSKSLSSSQSMSGSESTSTSVSDSQSSSTSNSQFDSMSISASESDSMSTSDSSSISGSNSTST SLSTSDSMSGSVSVSTSTSLSDSISGSTSVSDSSSTSTSTSLSDSMSQSQSTSTSASGSLSTSISTSMSMSASTSSSQST SVSTSLSTSDSISDSTSISISGSQSTVESESTSDSTSISDSESLSTSDSDSTSTSTSDSTSGSTSTSISESLSTSGSGST SVSDSTSMSESNSSSVSMSQDKSDSTSISDSESVSTSTSTSLSTSDSTSTSESLSTSMSGSQSISDSTSTSMSGSTSTSE SNSMHPSDSMSMHHTHSTSTSRLSSEATTSTSESQSTLSATSEVTKHNGTPAQSEKRLPDTGDSIKQNGLLGGVMTLLVG LGLMKRKKKKDENDQDDSQA
Specific function: Mediates binding to human platelets, possibly through a receptor-ligand interaction. Probably associated with virulence in endovascular infection [H]
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Secreted, cell wall; Peptidoglycan-anchor. Note=Possibly exported by the accessory SecA2/SecY2 system [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the SraP family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR015919 - InterPro: IPR008985 - InterPro: IPR019948 - InterPro: IPR019931 - InterPro: IPR022263 - InterPro: IPR001899 [H]
Pfam domain/function: PF00746 Gram_pos_anchor [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 227019; Mature: 226888
Theoretical pI: Translated: 3.98; Mature: 3.98
Prosite motif: PS50847 GRAM_POS_ANCHORING
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 2.3 %Met (Translated Protein) 2.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 2.3 %Met (Mature Protein) 2.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSKRQKAFHDSLANEKTRVRLYKSGKNWVKSGIKEIEMFKIMGLPFISHSLVSQDNQSIS CCHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCHHHHH KKMTGYGLKTTAVIGGAFTVNMLHDQQAFAASDAPLTSELNTQSETVGNQNSTTIEASTS HHHHCCCCEEEEEECCEEEEEEEECCHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCEEEEECCC TADSTSVTKNSSSVQTSNSDTVSSEKSEKVTSTTNSTSNQQEKLTSTSESTSSKNTTSSS CCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCC DTKSVASTSSTEQPINTSTNQSTASNNTSQSTTPSSVNLNKTSTTSTSTAPVKLRTFSRL CHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHH AMSTFASAATTTAVTANTITVNKDNLKQYMTTSGNATYDQSTGIVTLTQDAYSQKGAITL HHHHHHHHHHHEEEEEEEEEECHHHHHHHHHCCCCCCEECCCCEEEEEHHHHCCCCCEEE GTRIDSNKSFHFSGKVNLGNKYEGHGNGGDGIGFAFSPGVLGETGLNGAAVGIGGLSNAF EEEECCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCC GFKLDTYHNTSKPNSAAKANADPSNVAGGGAFGAFVTTDSYGVATTYTSSSTADNAAKLN CEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCEEEEECCCCCCCCCEEEE VQPTNNTFQDFDINYNGDTKVMTVKYAGQTWTRNISDWIAKSGTTNFSLSMTASTGGATN 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