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The map label for this gene is ydfJ [H]

Identifier: 57652288

GI number: 57652288

Start: 2626696

End: 2629185

Strand: Reverse

Name: ydfJ [H]

Synonym: SACOL2566

Alternate gene names: 57652288

Gene position: 2629185-2626696 (Counterclockwise)

Preceding gene: 57652290

Following gene: 57652287

Centisome position: 93.58

GC content: 33.57

Gene sequence:

>2490_bases
TTGGCAAAATTTTTATATAAGATGGGGACATTCATCGCAAAACATAAATGGTCCGCGGTCATTGCATGGATAGTGATTGT
AGCTGCAATATTGATACCACTTGCTACAAATGCACCGAAATTTGACAATGATATTAAAATGACAGGATTAGAGTCGTTAG
ATACGAATAAAAAGATTGAAAAACATTTTAATCAAGATAGTGAAAAGGCACAAATACGTGTTGTCTTTAAGACGACTAAA
GATGATGGTATTGTGCAACCGAACATTACTAAAGATATTAAGAAAACGTTAGATGATATTAAAAAAGATGACAAGCACAT
TGATAAAATATCAGATCCTTATGAAAATAAGCAAATTAGTAAAGATAAAACAACTGCATTTGCAGATATCACATATGACG
TTAGTCAAACATCTTTAAAAGATGGCTCTAGAGATAATGTTAAAAGTCATTTGAAAGACTTACGTGACAATCATAATGTA
CAAACAGAGTTAACTGGTACAGGAATGACATCTACAGAAGTAGGCGGTAATTCTGAACTAGTTGGTATTATTGTTGCATT
TGTTGTACTGTTAATCACATTCGGTTCAGTCATTGCTGCAGGATTACCAATTATAAGTGCATTGATTGGTCTAGCCTCTG
GTGTAGGTATTATCAGTTTGTTAACTTATGCATTCGATATACCAAATGTCACACTGACATTAGCCGTAATGATTGGACTA
GCAGTTGGTATCGATTATGCATTATTTATTTTATTCAGATATCGACAAGTTATGAAAACTGAAACAGATTACATTAAAGG
CATTGGTCTTGCAATAGGAACAGCAGGTAGTGCAGTTGTTTTTGCTGGTGTAACAGTTGTAATTGCAGTATGTGGTTTAT
CATTAGTAGGCATTGACTTCTTAGCGGTAATGGGATTTGCTTCGGCAATTAGTGTTGTTTTTGCAGTACTTAGCGCTTTA
ACTTTATTACCTGCATTAATAAGCATTTTCCATAAACGCATTAAAGTGAATAAATTACAGTCTAAATTCAAAAAAGATAT
TGATACGCCATGGTCTAAATTTATTACAGGAAATGCACTTGCGGCAGTATTACTAGGTTTAATCATATTAGTAGCAGCTG
CAATACCAGTTAGTCATATGCGACTTGGTATTCCAGATGACGGTGTTAAACCAGCAGATTCTACACAGAAAAAAGCTTAC
GATATTATCTCGGATAAATTTGGTGAAGGATTTAATGGCCAAATACCGATGTTGATAAATGTGAAAGATAAAAAGGATGA
TCCACAAGGATTACAACAAGATTTACAGTCTGTATATAAAGATATTAAAGATAAGAAAAATGTAGATATCGTTACGCCAC
CACAAATGAGTAAAGATAATGATTACGCTTTGATGGTCGTGATACCTAAGCAAGGGCCTAATGCAGAGAGTACAAATGAT
TTAGTGCATGATTTACGAGATTATCATAAAGATGCACAAGATAAATATGGGTTCAAAACGGAGATTTCGGGACAAAGTGT
CATTAATATTGATATGTCTAAAAAGTTAAATGAGGCGATACCTTTATTTGCCTCAGTCATTGTTGTATTAGCATTTTTCT
TATTAATGATTGTCTTCCGTTCAATTCTAATACCATTAAAAGCAGTTTTAGGATTCGTCTTGTCATTAATGGCAACATTA
GGATTTACAACATTAGTAATGCAAGATGGTTTTATGAAAGGTCTGTTTGGTATTGAAACGACAGGACCAATGCTAGCATT
TTTACCGGTTATTACTATAGGTATCTTATTTGGATTAGCGATGGATTATGAAGTCTTCCTTATGTCGCGAATTCATGAAG
AATATAGTAAAACAGGGGATAATGATTATTCTATCAAAGTAGGATTGAAAGAAAGCGGTCCTGTTATTGTAGCAGCTGCA
TTAATTATGTTTAGTGTCTTCTTTGCGTTTGTATTCCAAGAAGATGTCATGATTAAATCAATGGGTATGGCATTAGCGTT
TGGTGTACTCTTTGATGCCTTCGTAGTCAGAATGATGTTAATTCCTGCATTAACGAAATTGTTTGGAAAAGGTTCGTGGT
ATTTACCAGCATGGTTGAATCGCATTATTCCACGAGTTGATATTGAAGGACATGCACTTGAAAAATATAAAACGGTTGAA
TCACAGGAATCTGAAGCTAAAGATAGTAAGGAAACATACGACACAACCTTTAAAGTATATCCACAAGGTGCAACAAATGT
ATCGAAACATCAAGATGCACATGGGCAAGATGATGCACATTCAATAGTACTAGATGATAAAACGATGGCATTGTACCAAG
AAGTGAAACAGCAATCAGCAAGTTCATTGTTCTTATATGATGCTTTAATAGATTATCAAAACAAGCATCAACTAAATTCA
AAACAACAAGCAACGAATATAGAACAGTTGAATAAAAATATTGAAAAGCTCAATCAATTGTTAGAAAAAAATCTACGAAA
TAAATCATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTGATTCTTTAAGAGGTCGGGGATAGATACTATAATCGAACAATAATCTACACTGTATATTTAAACTATAACGTTGATT
TTAAAAGGAGGCAATATACT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATAACATGTACATGCCTCCGCTTTAAATGTCTATCAATGACATTTGAAGCGGAGGTTTTTTGCATGGAAGTGATTATAC
AAAACATTTTTGCAATGTCA

Product: MmpL efflux pump

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 829; Mature: 828

Protein sequence:

>829_residues
MAKFLYKMGTFIAKHKWSAVIAWIVIVAAILIPLATNAPKFDNDIKMTGLESLDTNKKIEKHFNQDSEKAQIRVVFKTTK
DDGIVQPNITKDIKKTLDDIKKDDKHIDKISDPYENKQISKDKTTAFADITYDVSQTSLKDGSRDNVKSHLKDLRDNHNV
QTELTGTGMTSTEVGGNSELVGIIVAFVVLLITFGSVIAAGLPIISALIGLASGVGIISLLTYAFDIPNVTLTLAVMIGL
AVGIDYALFILFRYRQVMKTETDYIKGIGLAIGTAGSAVVFAGVTVVIAVCGLSLVGIDFLAVMGFASAISVVFAVLSAL
TLLPALISIFHKRIKVNKLQSKFKKDIDTPWSKFITGNALAAVLLGLIILVAAAIPVSHMRLGIPDDGVKPADSTQKKAY
DIISDKFGEGFNGQIPMLINVKDKKDDPQGLQQDLQSVYKDIKDKKNVDIVTPPQMSKDNDYALMVVIPKQGPNAESTND
LVHDLRDYHKDAQDKYGFKTEISGQSVINIDMSKKLNEAIPLFASVIVVLAFFLLMIVFRSILIPLKAVLGFVLSLMATL
GFTTLVMQDGFMKGLFGIETTGPMLAFLPVITIGILFGLAMDYEVFLMSRIHEEYSKTGDNDYSIKVGLKESGPVIVAAA
LIMFSVFFAFVFQEDVMIKSMGMALAFGVLFDAFVVRMMLIPALTKLFGKGSWYLPAWLNRIIPRVDIEGHALEKYKTVE
SQESEAKDSKETYDTTFKVYPQGATNVSKHQDAHGQDDAHSIVLDDKTMALYQEVKQQSASSLFLYDALIDYQNKHQLNS
KQQATNIEQLNKNIEKLNQLLEKNLRNKS

Sequences:

>Translated_829_residues
MAKFLYKMGTFIAKHKWSAVIAWIVIVAAILIPLATNAPKFDNDIKMTGLESLDTNKKIEKHFNQDSEKAQIRVVFKTTK
DDGIVQPNITKDIKKTLDDIKKDDKHIDKISDPYENKQISKDKTTAFADITYDVSQTSLKDGSRDNVKSHLKDLRDNHNV
QTELTGTGMTSTEVGGNSELVGIIVAFVVLLITFGSVIAAGLPIISALIGLASGVGIISLLTYAFDIPNVTLTLAVMIGL
AVGIDYALFILFRYRQVMKTETDYIKGIGLAIGTAGSAVVFAGVTVVIAVCGLSLVGIDFLAVMGFASAISVVFAVLSAL
TLLPALISIFHKRIKVNKLQSKFKKDIDTPWSKFITGNALAAVLLGLIILVAAAIPVSHMRLGIPDDGVKPADSTQKKAY
DIISDKFGEGFNGQIPMLINVKDKKDDPQGLQQDLQSVYKDIKDKKNVDIVTPPQMSKDNDYALMVVIPKQGPNAESTND
LVHDLRDYHKDAQDKYGFKTEISGQSVINIDMSKKLNEAIPLFASVIVVLAFFLLMIVFRSILIPLKAVLGFVLSLMATL
GFTTLVMQDGFMKGLFGIETTGPMLAFLPVITIGILFGLAMDYEVFLMSRIHEEYSKTGDNDYSIKVGLKESGPVIVAAA
LIMFSVFFAFVFQEDVMIKSMGMALAFGVLFDAFVVRMMLIPALTKLFGKGSWYLPAWLNRIIPRVDIEGHALEKYKTVE
SQESEAKDSKETYDTTFKVYPQGATNVSKHQDAHGQDDAHSIVLDDKTMALYQEVKQQSASSLFLYDALIDYQNKHQLNS
KQQATNIEQLNKNIEKLNQLLEKNLRNKS
>Mature_828_residues
AKFLYKMGTFIAKHKWSAVIAWIVIVAAILIPLATNAPKFDNDIKMTGLESLDTNKKIEKHFNQDSEKAQIRVVFKTTKD
DGIVQPNITKDIKKTLDDIKKDDKHIDKISDPYENKQISKDKTTAFADITYDVSQTSLKDGSRDNVKSHLKDLRDNHNVQ
TELTGTGMTSTEVGGNSELVGIIVAFVVLLITFGSVIAAGLPIISALIGLASGVGIISLLTYAFDIPNVTLTLAVMIGLA
VGIDYALFILFRYRQVMKTETDYIKGIGLAIGTAGSAVVFAGVTVVIAVCGLSLVGIDFLAVMGFASAISVVFAVLSALT
LLPALISIFHKRIKVNKLQSKFKKDIDTPWSKFITGNALAAVLLGLIILVAAAIPVSHMRLGIPDDGVKPADSTQKKAYD
IISDKFGEGFNGQIPMLINVKDKKDDPQGLQQDLQSVYKDIKDKKNVDIVTPPQMSKDNDYALMVVIPKQGPNAESTNDL
VHDLRDYHKDAQDKYGFKTEISGQSVINIDMSKKLNEAIPLFASVIVVLAFFLLMIVFRSILIPLKAVLGFVLSLMATLG
FTTLVMQDGFMKGLFGIETTGPMLAFLPVITIGILFGLAMDYEVFLMSRIHEEYSKTGDNDYSIKVGLKESGPVIVAAAL
IMFSVFFAFVFQEDVMIKSMGMALAFGVLFDAFVVRMMLIPALTKLFGKGSWYLPAWLNRIIPRVDIEGHALEKYKTVES
QESEAKDSKETYDTTFKVYPQGATNVSKHQDAHGQDDAHSIVLDDKTMALYQEVKQQSASSLFLYDALIDYQNKHQLNSK
QQATNIEQLNKNIEKLNQLLEKNLRNKS

Specific function: Unknown

COG id: COG2409

COG function: function code R; Predicted drug exporters of the RND superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the mmpL family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004869
- InterPro:   IPR000731 [H]

Pfam domain/function: PF03176 MMPL [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 91293; Mature: 91161

Theoretical pI: Translated: 7.29; Mature: 7.29

Prosite motif: PS50156 SSD

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
3.1 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
3.0 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MAKFLYKMGTFIAKHKWSAVIAWIVIVAAILIPLATNAPKFDNDIKMTGLESLDTNKKIE
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEECCCHHCCCCHHHH
KHFNQDSEKAQIRVVFKTTKDDGIVQPNITKDIKKTLDDIKKDDKHIDKISDPYENKQIS
HHCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
KDKTTAFADITYDVSQTSLKDGSRDNVKSHLKDLRDNHNVQTELTGTGMTSTEVGGNSEL
CCCCCEEEEEEECCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCHH
VGIIVAFVVLLITFGSVIAAGLPIISALIGLASGVGIISLLTYAFDIPNVTLTLAVMIGL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
AVGIDYALFILFRYRQVMKTETDYIKGIGLAIGTAGSAVVFAGVTVVIAVCGLSLVGIDF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAVMGFASAISVVFAVLSALTLLPALISIFHKRIKVNKLQSKFKKDIDTPWSKFITGNAL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCHHHH
AAVLLGLIILVAAAIPVSHMRLGIPDDGVKPADSTQKKAYDIISDKFGEGFNGQIPMLIN
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEE
VKDKKDDPQGLQQDLQSVYKDIKDKKNVDIVTPPQMSKDNDYALMVVIPKQGPNAESTND
ECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCHHH
LVHDLRDYHKDAQDKYGFKTEISGQSVINIDMSKKLNEAIPLFASVIVVLAFFLLMIVFR
HHHHHHHHHHCHHHCCCCEEECCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SILIPLKAVLGFVLSLMATLGFTTLVMQDGFMKGLFGIETTGPMLAFLPVITIGILFGLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MDYEVFLMSRIHEEYSKTGDNDYSIKVGLKESGPVIVAAALIMFSVFFAFVFQEDVMIKS
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MGMALAFGVLFDAFVVRMMLIPALTKLFGKGSWYLPAWLNRIIPRVDIEGHALEKYKTVE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHH
SQESEAKDSKETYDTTFKVYPQGATNVSKHQDAHGQDDAHSIVLDDKTMALYQEVKQQSA
HHHHHHHCCHHHHCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHH
SSLFLYDALIDYQNKHQLNSKQQATNIEQLNKNIEKLNQLLEKNLRNKS
CHHHHHHHHHHCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure 
AKFLYKMGTFIAKHKWSAVIAWIVIVAAILIPLATNAPKFDNDIKMTGLESLDTNKKIE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEECCCHHCCCCHHHH
KHFNQDSEKAQIRVVFKTTKDDGIVQPNITKDIKKTLDDIKKDDKHIDKISDPYENKQIS
HHCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
KDKTTAFADITYDVSQTSLKDGSRDNVKSHLKDLRDNHNVQTELTGTGMTSTEVGGNSEL
CCCCCEEEEEEECCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCHH
VGIIVAFVVLLITFGSVIAAGLPIISALIGLASGVGIISLLTYAFDIPNVTLTLAVMIGL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
AVGIDYALFILFRYRQVMKTETDYIKGIGLAIGTAGSAVVFAGVTVVIAVCGLSLVGIDF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAVMGFASAISVVFAVLSALTLLPALISIFHKRIKVNKLQSKFKKDIDTPWSKFITGNAL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCHHHH
AAVLLGLIILVAAAIPVSHMRLGIPDDGVKPADSTQKKAYDIISDKFGEGFNGQIPMLIN
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEE
VKDKKDDPQGLQQDLQSVYKDIKDKKNVDIVTPPQMSKDNDYALMVVIPKQGPNAESTND
ECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCHHH
LVHDLRDYHKDAQDKYGFKTEISGQSVINIDMSKKLNEAIPLFASVIVVLAFFLLMIVFR
HHHHHHHHHHCHHHCCCCEEECCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SILIPLKAVLGFVLSLMATLGFTTLVMQDGFMKGLFGIETTGPMLAFLPVITIGILFGLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MDYEVFLMSRIHEEYSKTGDNDYSIKVGLKESGPVIVAAALIMFSVFFAFVFQEDVMIKS
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MGMALAFGVLFDAFVVRMMLIPALTKLFGKGSWYLPAWLNRIIPRVDIEGHALEKYKTVE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHH
SQESEAKDSKETYDTTFKVYPQGATNVSKHQDAHGQDDAHSIVLDDKTMALYQEVKQQSA
HHHHHHHCCHHHHCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHH
SSLFLYDALIDYQNKHQLNSKQQATNIEQLNKNIEKLNQLLEKNLRNKS
CHHHHHHHHHHCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]