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The map label for this gene is pepF [H]

Identifier: 57650193

GI number: 57650193

Start: 1013082

End: 1014890

Strand: Direct

Name: pepF [H]

Synonym: SACOL1005

Alternate gene names: 57650193

Gene position: 1013082-1014890 (Clockwise)

Preceding gene: 57650192

Following gene: 57650197

Centisome position: 36.06

GC content: 32.12

Gene sequence:

>1809_bases
ATGAGTCAACAATTATCGAGAGAAGAACAGGAACGTAAATATCCTGAATATACATGGGACTTAACAACAATTTTCAAAGA
TGATGAAGCTTTTGAGGCTGCATTTAAAGAAGTTGAAAATGAGTTAGGCAAAGAAGAACAATTTAAAGGACACATTGGTG
ATAGTGCTGAGACATTATACAATGCGTTAGAATTAGAAGATACATTAGGTACTAAATTAGAAAAAGTATATGTATACGCG
CACCTAAAACAAGACCAAGATACAACGAACGACAAGTATACTGGTATGGAGTCAAGAGCACATCAATTAATTATTAAATT
TAGCTCGGCATGGAGTTTCTTAGTGCCAGAGATTTTACAAATTGATGAAGATAAAATTCAATCATTTGTAAATTCATATG
ATAAATTACAAAAATTCGCATTTGATTTGAAGTTGATTAATGAAAAACGTCCTCATATTTTAGATGCTGAAACTGAAAAG
TTATTAACAGAAGCGCAGGACGCGTTATCAACGCCATCAAATGTATACGGTATGTTTAGCAACGCTGATTTAGTATTTGA
AGATGCGATAGATAAAGATGGAAATGCACACCCGTTAACACAAGGTACATTTATTAAGTATTTAGAAACAGATGATCGCA
AACTAAGAGAAAGTGCTTTTAGAAATGTATATAAAGCATATGGTGCTCATAATAATACGCTTGGCGCTACGCTAGCAGGT
GAAGTGAAGAAAAATGTATTTAATGCTCGTACACACAATTACAAAACTGCAAGAGAAAAAGCATTGAGTAATAATCATAT
TCCAGAAAATGTATATGACAATCTAGTAAAAACTGTACATAAATATTTACCATTGCTACATAGATATACTGAATTGCGCA
AAGAATTGCTAGGTTTAGATGACTTGAAAATGTATGATTTATATACACCATTAATTAAAGATATTAAGTTTGAAATGCCT
TATGAAGAAGCTAAAGAGTGGATGTTAAAAGCATTAGAACCAATGGGTGAAGAATATTTAAATGTAGTTAAAGAAGGCTT
AAACAATCGTTGGGTCGATGTCTATGAGAATAAAGGTAAACGTTCAGGTGGCTATTCATCAGGTGCACATTTAACTAATC
CATTTATTCTACTTAACTGGTCTAATACTATTTCAGACTTATACACATTAGTTCATGAATTTGGGCATTCAGCACATAGT
TACTTCAGTAGAAAATTCCAACCGTCAAATTCTAGTGACTACACTATTTTTGTCGCTGAAGTTGCATCAACTTGTAACGA
AGCACTTTTAAGTGATTATATGGATAAACATCTTGATGATGAAAAACGCTTATTATTATTAAACCAAGAATTAGAACGTT
TCAGAGCTACATTATTCCGACAAACAATGTTCGCAGAATTTGAGCATAAAATTCATGCAATTGAAGAAGCAGGTGAACCA
TTAACGCCAACTAGAATGAATGAAGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGA
TATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAATTATTATGTATATCAATACGCAACTGGTTACAGTGCAG
CTCAAAGCTTAAGTCATCAAATTTTAACAGAAGGTAAGCCAGCAGTAGATAGATATATTAATGAATTCTTGAAAAAAGGT
AGCTCAAATTATCCAATTGAGATATTAAAAAATGCTGGTGTAGATATGACAACACCTGAACCAATTGAACAAGCTTGTGA
AGTTTTTGAACAAAAATTGAACGCTTTTGAAAAATTAATGAAAGCTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTATTTAAATATTTGTTCAGATAAAGGTAATGACGTGCAAATTTTGTTCTAAAATGAGAAAATTATATCAATTATATTT
TATTAGGAGGTTTACTACAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TACTATTGTATTCGCTTACATTATGAACAGATTGTGACAATTTAAATTAAGTACTATTAAAAGGTTGAAATGGTAGAGAT
AGCATGTTATATTATGAACA

Product: oligoendopeptidase F

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 602; Mature: 601

Protein sequence:

>602_residues
MSQQLSREEQERKYPEYTWDLTTIFKDDEAFEAAFKEVENELGKEEQFKGHIGDSAETLYNALELEDTLGTKLEKVYVYA
HLKQDQDTTNDKYTGMESRAHQLIIKFSSAWSFLVPEILQIDEDKIQSFVNSYDKLQKFAFDLKLINEKRPHILDAETEK
LLTEAQDALSTPSNVYGMFSNADLVFEDAIDKDGNAHPLTQGTFIKYLETDDRKLRESAFRNVYKAYGAHNNTLGATLAG
EVKKNVFNARTHNYKTAREKALSNNHIPENVYDNLVKTVHKYLPLLHRYTELRKELLGLDDLKMYDLYTPLIKDIKFEMP
YEEAKEWMLKALEPMGEEYLNVVKEGLNNRWVDVYENKGKRSGGYSSGAHLTNPFILLNWSNTISDLYTLVHEFGHSAHS
YFSRKFQPSNSSDYTIFVAEVASTCNEALLSDYMDKHLDDEKRLLLLNQELERFRATLFRQTMFAEFEHKIHAIEEAGEP
LTPTRMNEEYAKLNKLYFGDSVETDEDISKEWSRIPHFYMNYYVYQYATGYSAAQSLSHQILTEGKPAVDRYINEFLKKG
SSNYPIEILKNAGVDMTTPEPIEQACEVFEQKLNAFEKLMKA

Sequences:

>Translated_602_residues
MSQQLSREEQERKYPEYTWDLTTIFKDDEAFEAAFKEVENELGKEEQFKGHIGDSAETLYNALELEDTLGTKLEKVYVYA
HLKQDQDTTNDKYTGMESRAHQLIIKFSSAWSFLVPEILQIDEDKIQSFVNSYDKLQKFAFDLKLINEKRPHILDAETEK
LLTEAQDALSTPSNVYGMFSNADLVFEDAIDKDGNAHPLTQGTFIKYLETDDRKLRESAFRNVYKAYGAHNNTLGATLAG
EVKKNVFNARTHNYKTAREKALSNNHIPENVYDNLVKTVHKYLPLLHRYTELRKELLGLDDLKMYDLYTPLIKDIKFEMP
YEEAKEWMLKALEPMGEEYLNVVKEGLNNRWVDVYENKGKRSGGYSSGAHLTNPFILLNWSNTISDLYTLVHEFGHSAHS
YFSRKFQPSNSSDYTIFVAEVASTCNEALLSDYMDKHLDDEKRLLLLNQELERFRATLFRQTMFAEFEHKIHAIEEAGEP
LTPTRMNEEYAKLNKLYFGDSVETDEDISKEWSRIPHFYMNYYVYQYATGYSAAQSLSHQILTEGKPAVDRYINEFLKKG
SSNYPIEILKNAGVDMTTPEPIEQACEVFEQKLNAFEKLMKA
>Mature_601_residues
SQQLSREEQERKYPEYTWDLTTIFKDDEAFEAAFKEVENELGKEEQFKGHIGDSAETLYNALELEDTLGTKLEKVYVYAH
LKQDQDTTNDKYTGMESRAHQLIIKFSSAWSFLVPEILQIDEDKIQSFVNSYDKLQKFAFDLKLINEKRPHILDAETEKL
LTEAQDALSTPSNVYGMFSNADLVFEDAIDKDGNAHPLTQGTFIKYLETDDRKLRESAFRNVYKAYGAHNNTLGATLAGE
VKKNVFNARTHNYKTAREKALSNNHIPENVYDNLVKTVHKYLPLLHRYTELRKELLGLDDLKMYDLYTPLIKDIKFEMPY
EEAKEWMLKALEPMGEEYLNVVKEGLNNRWVDVYENKGKRSGGYSSGAHLTNPFILLNWSNTISDLYTLVHEFGHSAHSY
FSRKFQPSNSSDYTIFVAEVASTCNEALLSDYMDKHLDDEKRLLLLNQELERFRATLFRQTMFAEFEHKIHAIEEAGEPL
TPTRMNEEYAKLNKLYFGDSVETDEDISKEWSRIPHFYMNYYVYQYATGYSAAQSLSHQILTEGKPAVDRYINEFLKKGS
SNYPIEILKNAGVDMTTPEPIEQACEVFEQKLNAFEKLMKA

Specific function: Unknown

COG id: COG1164

COG function: function code E; Oligoendopeptidase F

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the peptidase M3B family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001567
- InterPro:   IPR004438
- InterPro:   IPR013647 [H]

Pfam domain/function: PF01432 Peptidase_M3; PF08439 Peptidase_M3_N [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 69820; Mature: 69689

Theoretical pI: Translated: 4.92; Mature: 4.92

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
2.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
2.0 %Met     (Mature Protein)
2.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSQQLSREEQERKYPEYTWDLTTIFKDDEAFEAAFKEVENELGKEEQFKGHIGDSAETLY
CCCHHHHHHHHHCCCCCEEEHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCHHHHHH
NALELEDTLGTKLEKVYVYAHLKQDQDTTNDKYTGMESRAHQLIIKFSSAWSFLVPEILQ
HHHHHHHHHCCHHHHEEEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
IDEDKIQSFVNSYDKLQKFAFDLKLINEKRPHILDAETEKLLTEAQDALSTPSNVYGMFS
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEEECC
NADLVFEDAIDKDGNAHPLTQGTFIKYLETDDRKLRESAFRNVYKAYGAHNNTLGATLAG
CCCEEEHHCCCCCCCCCCCCCCCEEHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHH
EVKKNVFNARTHNYKTAREKALSNNHIPENVYDNLVKTVHKYLPLLHRYTELRKELLGLD
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
DLKMYDLYTPLIKDIKFEMPYEEAKEWMLKALEPMGEEYLNVVKEGLNNRWVDVYENKGK
CHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHCCCCC
RSGGYSSGAHLTNPFILLNWSNTISDLYTLVHEFGHSAHSYFSRKFQPSNSSDYTIFVAE
CCCCCCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEHHH
VASTCNEALLSDYMDKHLDDEKRLLLLNQELERFRATLFRQTMFAEFEHKIHAIEEAGEP
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
LTPTRMNEEYAKLNKLYFGDSVETDEDISKEWSRIPHFYMNYYVYQYATGYSAAQSLSHQ
CCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
ILTEGKPAVDRYINEFLKKGSSNYPIEILKNAGVDMTTPEPIEQACEVFEQKLNAFEKLM
HHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KA
CC
>Mature Secondary Structure 
SQQLSREEQERKYPEYTWDLTTIFKDDEAFEAAFKEVENELGKEEQFKGHIGDSAETLY
CCHHHHHHHHHCCCCCEEEHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCHHHHHH
NALELEDTLGTKLEKVYVYAHLKQDQDTTNDKYTGMESRAHQLIIKFSSAWSFLVPEILQ
HHHHHHHHHCCHHHHEEEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
IDEDKIQSFVNSYDKLQKFAFDLKLINEKRPHILDAETEKLLTEAQDALSTPSNVYGMFS
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEEECC
NADLVFEDAIDKDGNAHPLTQGTFIKYLETDDRKLRESAFRNVYKAYGAHNNTLGATLAG
CCCEEEHHCCCCCCCCCCCCCCCEEHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHH
EVKKNVFNARTHNYKTAREKALSNNHIPENVYDNLVKTVHKYLPLLHRYTELRKELLGLD
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
DLKMYDLYTPLIKDIKFEMPYEEAKEWMLKALEPMGEEYLNVVKEGLNNRWVDVYENKGK
CHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHCCCCC
RSGGYSSGAHLTNPFILLNWSNTISDLYTLVHEFGHSAHSYFSRKFQPSNSSDYTIFVAE
CCCCCCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEHHH
VASTCNEALLSDYMDKHLDDEKRLLLLNQELERFRATLFRQTMFAEFEHKIHAIEEAGEP
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
LTPTRMNEEYAKLNKLYFGDSVETDEDISKEWSRIPHFYMNYYVYQYATGYSAAQSLSHQ
CCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
ILTEGKPAVDRYINEFLKKGSSNYPIEILKNAGVDMTTPEPIEQACEVFEQKLNAFEKLM
HHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KA
CC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]