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The map label for this gene is yjbQ [H]

Identifier: 57238691

GI number: 57238691

Start: 1741214

End: 1742389

Strand: Reverse

Name: yjbQ [H]

Synonym: CJE1852

Alternate gene names: 57238691

Gene position: 1742389-1741214 (Counterclockwise)

Preceding gene: 57238692

Following gene: 57238690

Centisome position: 98.01

GC content: 30.27

Gene sequence:

>1176_bases
TTGCATCAGAGTGTCATTGATCCACAAGGTTTAATTGATCTAAAAATTCTTATTGTTATAGCTTTATGCTTACTTTTTTC
TCCGCATATTGCAAAAATTTTACGCTTGCCTCTTTCAGCTACTGAAATTATTTTAGGGGCAATAATAGCATATTTTGGTT
TCATAGGAAAAAGTGAAAATTTTGCACTTTTAGCCAATGTAGGTTTTTATTATCTAATGTTTATAGCGGGTATGGAGGTA
AATTTAAGAGCCTTTTTTAATATGGATAAAGAAATCGCCAAAAAAAGTTTTTTTTATATTTTTTTACTTTACGCTTTATC
TTCTCTTATAGTATGGATTTTTGGACTTTCTTTAGTATTTGTTATCATTATACCTGTGATGAGTGTAGGGCTTTTATCTT
TGCTTTTTAAGGATTTTGGAAAAGAGTGTTATTGGCTAAATATTGCTATGATAGTGGCTACTTTAGCTGAGGTGATTTCT
ATTGTGCTTTTGACTATAGCGGGAGCTTTTTTGCGCGAAGGAACAGGTATTATTGATGTAGCGCAAAGTATTTTATATCT
TAATATCTTTTTGGGACTTTGTTTGCTCGGATTTAAAATGCTTGGTGTGCTTTTTTGGTGGTATCCTCAGCTTAAAGTTG
TGCTTATGCCATGGGAAGATAAAAATGAAAAAGATATAAGATTTTGTATGGCCATTTTTATACTGATCATTGTTGCTATG
GTTATTACAAAACTTGAAATCGTTCTTGGTTCTTTTATAGCAGGCTCATTTATAGCTACTTTTTTTGATCATAAAAAAGA
TCTTGAGCATAAGCTTTCTACTTTTGGACATGGGTTTTTGATCCCTATTTTTTTTATCCATATAGGTTCAACCTTTGATC
TTAAAATGATTTTAGATTATAAAATCGTTTTACAAGCATTTTTACTTATGTTTGTTATGGTGGGTTTAAGAATTTTATGT
GCAAGTGTTTTTTTAAAAAGAATTGGTTTTAAAAATATGATTTTATTTGGTCTTAGTCATTCTATGCCTTTAACCTTGCT
TATAGCAACAGCTACTTTGGGTTATTCGGGCAAGGTTATTGATGAGAAGCTTTATTCAGCACTTATTTTAACAGCGTTGT
TTGAGGCTATTATTGTTATGAGTATGATCAAATTTCTTTCTAATTCTAAAAAATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CAAGCAGGTGCTGGGGCTATTGTTATAGGGGATTATTTAACCACTAAAGGTGAAGAACCAAGTCAAGATATAATAAAATT
AAAAGAAATGGGATTTACTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAGTTACTTTTTTACTCAAAAAAGCAAACAAAATCTTAAAAATTTAATAATAAAAAAACTCATAATCGTCCTTTTTTGTT
AGAATTAATAAAAGTAACAA

Product: sodium/hydrogen exchanger family protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 391; Mature: 391

Protein sequence:

>391_residues
MHQSVIDPQGLIDLKILIVIALCLLFSPHIAKILRLPLSATEIILGAIIAYFGFIGKSENFALLANVGFYYLMFIAGMEV
NLRAFFNMDKEIAKKSFFYIFLLYALSSLIVWIFGLSLVFVIIIPVMSVGLLSLLFKDFGKECYWLNIAMIVATLAEVIS
IVLLTIAGAFLREGTGIIDVAQSILYLNIFLGLCLLGFKMLGVLFWWYPQLKVVLMPWEDKNEKDIRFCMAIFILIIVAM
VITKLEIVLGSFIAGSFIATFFDHKKDLEHKLSTFGHGFLIPIFFIHIGSTFDLKMILDYKIVLQAFLLMFVMVGLRILC
ASVFLKRIGFKNMILFGLSHSMPLTLLIATATLGYSGKVIDEKLYSALILTALFEAIIVMSMIKFLSNSKK

Sequences:

>Translated_391_residues
MHQSVIDPQGLIDLKILIVIALCLLFSPHIAKILRLPLSATEIILGAIIAYFGFIGKSENFALLANVGFYYLMFIAGMEV
NLRAFFNMDKEIAKKSFFYIFLLYALSSLIVWIFGLSLVFVIIIPVMSVGLLSLLFKDFGKECYWLNIAMIVATLAEVIS
IVLLTIAGAFLREGTGIIDVAQSILYLNIFLGLCLLGFKMLGVLFWWYPQLKVVLMPWEDKNEKDIRFCMAIFILIIVAM
VITKLEIVLGSFIAGSFIATFFDHKKDLEHKLSTFGHGFLIPIFFIHIGSTFDLKMILDYKIVLQAFLLMFVMVGLRILC
ASVFLKRIGFKNMILFGLSHSMPLTLLIATATLGYSGKVIDEKLYSALILTALFEAIIVMSMIKFLSNSKK
>Mature_391_residues
MHQSVIDPQGLIDLKILIVIALCLLFSPHIAKILRLPLSATEIILGAIIAYFGFIGKSENFALLANVGFYYLMFIAGMEV
NLRAFFNMDKEIAKKSFFYIFLLYALSSLIVWIFGLSLVFVIIIPVMSVGLLSLLFKDFGKECYWLNIAMIVATLAEVIS
IVLLTIAGAFLREGTGIIDVAQSILYLNIFLGLCLLGFKMLGVLFWWYPQLKVVLMPWEDKNEKDIRFCMAIFILIIVAM
VITKLEIVLGSFIAGSFIATFFDHKKDLEHKLSTFGHGFLIPIFFIHIGSTFDLKMILDYKIVLQAFLLMFVMVGLRILC
ASVFLKRIGFKNMILFGLSHSMPLTLLIATATLGYSGKVIDEKLYSALILTALFEAIIVMSMIKFLSNSKK

Specific function: Probable Na(+)/H(+) antiporter [H]

COG id: COG0475

COG function: function code P; Kef-type K+ transport systems, membrane components

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 RCK N-terminal domain [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR006153
- InterPro:   IPR016040
- InterPro:   IPR006037
- InterPro:   IPR003148 [H]

Pfam domain/function: PF00999 Na_H_Exchanger; PF02080 TrkA_C; PF02254 TrkA_N [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 43979; Mature: 43979

Theoretical pI: Translated: 9.06; Mature: 9.06

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
4.3 %Met     (Translated Protein)
5.6 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
4.3 %Met     (Mature Protein)
5.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]